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Biologie moléculaire > Début de la transcription > Flashcards

Début de la transcription Flashcards

1
Q

Vrai ou faux; L’ARN messager est une copie directe du gène.

A

Vrai.

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Q

Vrai ou faux: L’ARN messager est fait à partir du brin matrice du gène.

A

Faux, il est fait à partir du brin complémentaire du gène.

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3
Q

Dans quel(s) sens peuvent être codés les gènes?

A

Les gènes peuvent être codés dans les deux sens.

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4
Q

Combien d’introns ont les virus?

A

Ils en ont aucun.

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5
Q

Comment la polymérase fait-elle pour coder des gènes superposés?

A

Elle a une fonction en elle qui la rend capable d’initier la transcription .

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6
Q

Que veut-dire UTR?

A

Signifie Untranslated.

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7
Q

Le 5’ 3’ UTR codent quoi?

A

Ils ne codent pas, tout simplement.

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8
Q

Vrai ou faux; une amorce est toujours selon ARN.

A

Faux, elle peut être ADN ou ARN.

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9
Q

Vrai ou faux; Tous les gènes sont codés dans le même sens.

A

Faux, pas toujours.

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10
Q

Vrai ou faux; La polymérase peut initier la transcription uniquement un gène à la fois.

A

Faux, elle peut initier la transcription plusieurs gène à la fois (gènes superposés).

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11
Q

Comment fonctionne l’ARN polymérase?

A

Génère un brin d’ARN complémentaire à un brin d’ADN, elle n’a pas besoin d’amorce (similaire à ADN polymérase).

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12
Q

L’ARN polymérase fait beaucoup d’erreurs. Est-ce grave?

A

Non, parce que ce n’est pas transmissible à la génération suivante et il a pleins d’autres copies qui sont correctes.

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13
Q

Lors de la transcription, le nouveau brin se détache immédiatement du brin parental. Cela permet quoi au niveau des enzymes?

A

Plusieurs enzymes peuvent transcrire le même gène en même temps.

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14
Q

Nommez une différence fondamentale entre la réplication et la transcription.

A

Lors de la réplication, tout le génome y passait mais, lors de la transcription, ce n’est que des sections (gènes).

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15
Q

Vrai ou faux; Le brin d’ARN est une copie complémentaire du brin qui fait face au gène.

A

Vrai, elle est identique à la séquence du gène (mais en ARN donc T=U).

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16
Q

Nommez deux différences majeures entre la transcription chez les procaryotes et chez les eucaryotes.

A

1- La transcription chez les procaryotes est instantanée. Celle chez les eucaryotes se fait à l’intérieur du noyau donc la nouvelle ARN ne sert à rien tant qu’elle n’est pas sortie du noyau (processus long)

2- Chez les procaryotes, dès que les nouveaux ARN sont produits,ils peuvent être transcrits, pas chez les eucaryotes.

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17
Q

Vrai ou faux; La transcription est beaucoup plus complexe chez les procaryotes que chez les eucaryotes.

A

Faux, le processus est plus complexe chez les eucaryotes.

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18
Q

Pourquoi la transcription chez les procaryotes se fait-elle si rapidement?

A

Parce que l’ARN est déjà dans le cytoplasme. Donc, la transcription et traduction sont couplées.

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19
Q

Lors de l’initiation de la transcription, que ce passe-t-il?

A

ARN polymérase se fixe au promoteur; elle fait l’édition et déroule les brins.

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20
Q

Dans quel sens se dirige l’initiation de la transcription?

A

Se dirige vers l’aval.

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21
Q

Nommez les trois étapes de la transcription.

A

1- Initiation
2- Élongation
3- Terminaison

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22
Q

Pourquoi lors de l’initiation de la transcription, l’ARN polymérase n’a pas d’hélicase avec elle?

A

Parce que l’ARN polymérase a elle-même une fonction hélicase (ouverture de l’hélice).

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23
Q

Lors de l’élongation de la transcription, que ce passe-t-il?

A

La bulle de transcription progresse vers l’aval.

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24
Q

Lors de la terminaison de la transcription, que ce passe-t-il?

A

L’ARN est relâché et la polymérase décroche.

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25
Q

Quelle est la fonction du facteur σ70?

A

Lie le promoteur à la séquence consensus et rend la polymérase holoenzyme active (permet de passer d’un système fermé à un système ouvert).

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26
Q

Vrai ou faux; Le facteur σ70 lie un promoteur bactérien.

A

Vrai.

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27
Q

Qu’est-ce que la séquence consensus du promoteur?

A

C’est un modèle théorique idéal pour un promoteur.

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28
Q

Que ce passe-t-il dans la boîte TATA du promoteur?

A

C’est à cet endroit que la polymérase va ouvrir les brins pour débuter la transcription (commence un peu plus loin).

29
Q

Vrai ou faux; Plus on a de différences avec le promoteur consensus plus le promoteur est fort.

A

Faux, plus de différences=promoteur plus faible.

30
Q

Nomme un rôle important du σ70.

A

Va recruter la polymérase.

31
Q

Si on dit que le complexe ADN/ARN polymérase est fermé, cela réfère au fait que les deux brins d’ADN…

A

N’ont pas été séparés. Diapo 12

32
Q

Quelle est la séquence reconnue par du σ70?

A

Entre le nucléotide -35 et -10.

33
Q

Vrai ou faux; La polymérase se lie selon le domaine C-terminal.

A

Faux, elle se lie selon le domaine N-terminal.

34
Q

Ou se produit la séparation des brins (melting)?

A

Se fait entre le nucléotide -11 et +3. Diapo 13.

35
Q

L’initiation de la transcription se fait avec ou sans amorces?

A

Elle se fait sans amorce.

36
Q

Est-ce que l’ARN polymérase est efficace ?

A

Non, sans amorce mais peu efficace

37
Q

Quels sont les trois mécanismes d’initiation de la transcription ?

A
  1. Excursion transitoire
  2. Chenille
  3. Compressions
38
Q

En quoi consiste le mécanisme d’initiation de la transcription selon le modèle de l’excursion transitoire ?

A
  • La polymérase se déplace le long de l’ADN
  • Propose des cycles transitoires de transcription de l’ARN polymérase vers l’avant et l’arrière.
  • Ainsi, la polymérase se détacherait du promoteur et se déplacerait sur une courte distance de la matrice ADN, synthétisant un court transcrit, puis retournerait à sa position initiale sur le promoteur.
39
Q

En quoi consiste le mécanisme d’initiation de la transcription selon le modèle de la chenille ?

A
  • La partie antérieure de l’enzyme se déplace le long de l’ADN, mais grâce à une région élastique dans l’enzyme, sa partie postérieure peut rester immobile sur le promoteur.
  • Suppose l’existence d’un élément flexible de la polymérase qui permettrait à un module à l’avant de l’enzyme , contenant le site actif, de se déplacer vers l’aval, en synthétisant un court transcrit avant de se rétracter dans le corps de l’enzyme restée sur le promoteur.
40
Q

En quoi consiste le mécanisme d’initiation de la transcription selon le modèle de la compression ?

A
  • L’enzyme reste immobile et tire l’ADN en son sein.
  • Propose que l’ADN en aval de la polymérase fixée sur le promoteur soit tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme. L’ADN s’accumulerait sous forme de boucles simples brins.
41
Q

Vrai ou faux.

Au début de la transcription, l’ARN polymérase reste immobile et tire l’ADN en son sein.

A

Vrai

42
Q

Combien a-t-il d’étapes en phase d’élongation ?

A

4

43
Q

Décrire les étapes de l’élongation.

A

A. 0 (avant translocation)
B. +1 (après la translocation vers l’avant)
C. +1 (après la translocation et liaison d’un NTP)
D. -1 (après le retour en arrière)
Diapo 16

44
Q

Quels sont les deux types de correction possible lors de l’élongation ?

A
  • Correction hydrolytique

- Correction pyrophospholytique

45
Q

En quoi consiste la correction hydrolytique ?

A

Activité correctrice d’une ARN polymérase en phase d’élongation de la transcription, impliquant le clivage d’un segment d’un à quelques nucléotides contenant un nucléotide erroné.

46
Q

En quoi consiste la correction pyrophospholytique ?

A

Fonction correctrice de l’ARN polymérase où l’enzyme utilise son centre actif dans une réaction inversée pour catalyser l’enlèvement d’un ribonucléotide incorrect par incorporation de PPi, lui permettant ensuite d’incorporer un autre nucléotide à cette position dans la chaine d’ARN naissante. (ENLÈVEMENT D’UN NUCLÉOTIDE)

47
Q

Quels sont les deux sortes de terminateurs chez les procaryotes ?

A
  1. Rho-dépendant

2. Rho-indépendant

48
Q

Qu’est-ce que Rho ?

A
  • Une multiprotéine contenant 6 sous-unités identiques, l’ARN passe en son centre.
  • Rho reconnait un site rut
  • Rho ne peut lier l’ARN sur lequel il y a déjà des ribosomes
49
Q

En quoi consiste le terminateur Rho-dépendant ?

A

Se dit un terminateur d’un gène bactérien qui provoque la terminaison de la transcription en faisant intervenir le facteur Rho

50
Q

En quoi consiste le terminateur Rho-indépendant ?

A
  • Se dit un terminateur d’un gène bactérien qui provoque la terminaison de la transcription sans intervention du facteur Rho.
  • Aussi appeler terminateur intrinsèque
  • C’est la structure secondaire qui va faire décrocher l’ARN polymérase.
51
Q

Décrire le site rut.

A

Des sites d’environ 40 nt ne formant pas de structure secondaire et riche en C

52
Q

Qu’est-ce que la régulation de la transcription chez les procaryotes ?

A
  • C’est l’ensemble des mécanismes qui vont augmenter ou diminuer le niveau de l’expression d’un gène en fonction des besoins cellulaires.
  • Dans le cas des bactéries, les conditions du milieu vont êtres perçues et communiquées à des protéines régulatrice (qui lie l’ADN) qui sont des régulateurs positifs (activateurs) ou négatifs (répresseurs)
53
Q

Pourquoi contrôler l’expression au niveau de la transcription ?

A

Car c’est le plus énergiquement efficace et que l’on ne doit agit que sur une molécule, l’ADN

54
Q

Vrai ou faux.

S’il y a un répresseur et un activateur, c’est généralement l’activateur qui gagne.

A

Faux, c’est le répresseur qui gagne

55
Q

Comment se nomme le site lié par le répresseur ?

A

Opérateur

56
Q

Qu’est-ce qu’un répresseur ?

A

Protéine qui inhibe la transcription d’un gène en interagissant sur des séquences spécifiques d’ADN

57
Q

Qu’est-ce qu’un activateur ?

A

Protéine qui active la transcription d’un gène en interagissant au niveau des séquences spécifiques d’ADN avec l’ARN polymérase ou d’autres facteurs de transcription en favorisant la formation du complexe de transcription

58
Q

Quelles sont les deux types d’agissement d’un activateur ?

A
  1. Recrute la polymérase, donc lie l’ADN en premier
  2. Activateur allostérique, lie après la polymérase et active la transcription.
    ET LES DEUX FAÇONS PEUVENT SE FAIRE À DISTANCE
59
Q

En quoi consiste la régulation du métabolisme du lactose chez E.Coli ?

A
  • L’opéron lac code pour un messager polycistronique : Code pour plusieurs gènes à la fois (spécifique des procaryotes)
60
Q

Quels sont les 3 gènes dans la régulation du métabolisme du lactose chez E.Coli ? Décrire.

A
  1. LacZ : Encode un beta-galactosidase (brise un lien entre les deux glucoses)
  2. LacY : Encode une lactose permease (permet au lactose d’entrer dans la cellule)
  3. LacA : Encode une thiogalactoside transacetylase.
61
Q

Vrai ou faux.
Les gènes régulation du métabolisme du lactose chez E.Coli sont codés sur le même ARNm mais ils ne sont pas traduisent sur le même ribosomes

A

Vrai

62
Q

En quoi consiste l’opéron lactose ?

A
  • Est régulé par un activateur, CAP

- Et un répression LacI (codés sur un autre ARNm)

63
Q

Comment l’expression des gènes lac est contrôler ?

A

La présence ou l’absence de glucose et de lactose contrôle le niveau d’expression des gènes lac.

64
Q

Décrire l’expression des gènes lac en présence de glucose et de lactose.

A

Transcription au niveau basal

65
Q

Décrire l’expression des gènes lac en présence de glucose et en absence de lactose.

A

Pas de transcription

66
Q

Décrire l’expression des gènes lac en absence de glucose et en présence de lactose.

A

Activation de la transcription

67
Q

Vrai ou faux.

La présence du répresseur empêche la polymérase de se lier à l’ADN

A

VRai

68
Q

Comment fonctionne l’activateur CAP ?

A

CAP interagit avec la polymérase pour l’attirer au promoteur

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