Smistamento delle proteine Flashcards
Come si sono evoluti gli organelli citoplasmatici?
Inizialmente vi era un batterio con una membrana plasmatica e il DNA. Da una parte alcune cellule procariote sono entrate in simbiosi con il batterio, dando origine ai cloroplasti o ai mitocondri, dall’altra, grazie all’invaginazione della membrana plasmatica si sono formati altre membrane come la membrana nucleare, l’apparato del Golgi, il RE ecc.
Come vengono riconosciute le proteine che devono essere trasportate?
Queste proteine hanno una specifica sequenza segnale specifica costituita da 15 a 60 residui amminoacidici, solitamente vicini all’N-terminale (ad es. per le proteine che sono indirizzate al RE hanno una sequenza di 5-10 amminoacidi idrofobici sull’N-terminale). Queste sequenze non sono però sempre rilegate all’N-terminale, ma possono essere anche vicino al C-terminale o in altre parti della proteina e possono essere anche più sequenze diverse. Una volta portata all’organello corretto, la sequenza viene eliminata da unapeptidasi del segnale
Spiega come viene importata una proteina nel nucleo.
Le importine legano una proteina e la trasportano all’interno del nucleo. Una volta giunta nel nucleo, una RAN GTPasi si lega all’importina e legandosi ad essa, induce un cambiamento conformazionale che induce il rilascio della proteina. Il recettore di importazione vuoto viene poi trasportato di nuovo nel citosol dove una Ran-GAP, induce una defosforilazione della Ran, convertendola in Ran-GDP che rilascia quindi l’importina nel nucleo, capace di legarsi ora ad un’altra proteina
Qual è il ruolo di GEF
GEF, nelle proteine GTPasiche, ha il compito di ATTIVARE il GDP in GTP, fosforilando la molecola.
Cosa sono i recettori di importazione nucleare?
Sono recettori che possono legare e trasportare delle proteine specifiche all’interno del nucleo. Un esempio sono le importine (P.S. esistono anche i recettori di esportazione nucleare)
Questi recettori possono anche ricorrere a determinate proteine adattatrici che facilitano il legame con la proteina
Qual è la sequenza segnale per l’importazione nei mitocondri?
alfa elica anfipatica con residui da un lato a carica negativa e dall’ altro positiva
A cosa servono le proteine Hsp70?
Le Hsp70 sia citosoliche che mitocondriali sono proteine che permettono il mantenimento di una struttura non ripiegata della proteina prima e dopo che passi attraverso il complesso TIM e TOM. L’attacco e il rilascio della proteina avviene attraverso l’idrolisi di ATP
A cosa serve la differenza di potenziale tra la membrana interna del mitocondrio e la matrice intermembrana?
E’ utile per continuare e facilitare la traslocazione della proteina attraverso il traslocatore TIM
Le proteine per il mitocondrio vengono tutte direttamente trasportate nella matrice?
No, alcune proteine hanno una sequenza di stop di trasferimento, verosimilmente subito dopo la sequenza segnale, che, letta dal traslocatore TIM, blocca la traslocazione della proteina, che, una volta tagliata la sequenza di stop, rimane nello spazio intermembrana. In altre situazioni, la sequenza di stop non viene tagliata e la proteina rimane “intrappolata” nello spazio intermembrana. Altre volte la proteina passa direttamente attraverso TOM e TIM e poi, una volta che si trova nella matrice mitocondriale, attraverso la sequenza specifica, viene ri-trasferita nello spazio intermembrana
Cosa significa che per il RE l’importazione è cotraduzionale?
Che l’importazione nel RE della proteina avviene quando i ribosomi, che si sono legati al RE la stanno ancora traducendo, mentre questa sta già entrando nella membrana, a differenza di altre importazioni (es. nucleo, mitocondri…) che sono invece POST-TRADUZIONALI
Cosa sono le SRP?
Sono le particelle di riconoscimento del segnale, che riconoscono appunto il segnale su una proteina che il ribosoma sta traducendo. Si legano a questa sequenza e bloccano quindi la traduzione, perchè hanno una forma a bastoncino che si avvolge attorno al ribosoma (questa pausa evita anche che la proteina continuando ad essere allungata, formi una struttura compatta). A questo punto le Srp portano la proteina-ribosoma nei pressi del mitocondrio dove si lega ad un recettore per la Srp che la trasferisce ad un traslocatore.
Quali tipi di ribosomi esistono?
Non esistono ribosomi di diverso tipo, si diversificano solo a seconda della proteina che stanno sintetizzando.
