Semaine 1: Structure ADN et ARN

Question 1

Angle entre 2 paires de bases

Answer 1

36 degrés

Question 2

Nombre de paires de bases / tour

Answer 2

10

Question 3

Caractéristiques ADN-B

Answer 3

Physiologique

10 pb/tour

Question 4

Caractéristiques ADN-A

Answer 4

Milieux de faible concentration en eau
11 pb/tour
Grand sillon + étroit
Petit sillon + large et - profond

Question 5

Caractéristiques ADN-Z

Answer 5

Répétition purines/pyrimidines
Grand et petit sillon se confondent
12 pb/tour

Question 6

De quoi dépend Tm?

Answer 6

• Contenu en bases GC

- Force ionique de la solution

Question 7

Si [sels] augmente, Tm…

Answer 7

Augmente

Question 8

De quelles 2 composantes l’enlacement est-il la somme?

Answer 8

Torsions + Supertours

Question 9

Supertour plectonémique

Answer 9

Enroulement de l,axe longitudinal sur lui-même

Question 10

Supertour toroïdal

Answer 10

Enroulement de l’axe longitudinal autour d’un cylindre imaginaire

Question 11

2 types de supertours

Answer 11

• Plectonémiques

- Toroïdaux

Question 12

DnaseI

Answer 12

Élimine le surenroulement en coupant 1 lien phosphodiester et en permettant aux 2 brins de tourner l’un autour de l’autre

Question 13

Quelle enzyme peut modifier le nb d’enlacements?

Answer 13

Topoisomérase

Question 14

Topoisomérase I…

Answer 14

• Modifie lk d’un facteur 1
• Coupure transitoire d’un seul brin
• Pas d’ATP utilisé

Question 15

Topoisomérase II…

Answer 15

• Modifie lk de facteur II
• Coupure transitoire des deux brins
• Utilise ATP

Question 16

Utilités autres de Topoisomérases

Answer 16

• Réplication ADN plasmidique ( type I ou II)
• Séparation des chromatides soeurs (type II)
• Démêlage de noeuds (type II)

Question 17

Comment topo coupent ADN?

Answer 17

1- Attaque de liaison phosphodiester par tyrosine attaché au site actif de topo
2- Topo se lie via tyrosine à une des 2 extrémités de ADN coupé
3- Groupement phosphotyrosyle conserve énergie du groupe phosphodiester clivé
4- Ressoudage des 2 extrémités
5- Topo libérée

Question 18

Quelle paire de base existe dans l’ARN et non dans l’ADN?

Answer 18

G : U

Question 19

Quelles structures d’ordre supérieur un même brin d’ADN peut-il former?

Answer 19

• Épingle à cheveu
• Hernies
• Simples boucles
• Tétra-boucles
• Pseudo-Noeud

Question 20

Quel triplet de base ARN est possible?

Answer 20

U : A : U

Question 21

Quel est le nom d’un ARN qui agit comme enzyme?

Answer 21

Ribozyme

Question 22

Quelle est la fonction de la Rnase P?

Answer 22

Ribonucléase impliquée dans la production des ARNt à partir de longs ARN.

Question 23

Quel est le rôle de la partie protéique du ribozyme?

Answer 23

Faciliter la liaison substrat-ARN en neutralisant les charges négatives du squelette sucre-phosphate.

Question 24

Qu’est-ce que le ribozyme à tête de marteau?

Answer 24

Ribonucléase séquence-spécifique de certains agents infectieux des plantes, les viroïdes, qui requièrent leur auto-clivage pour se propager.

Question 25

Que se passe-t-il avec un viroïde dans une cellule?

Answer 25

Il est répliqué plusieurs fois sous la forme d’un long ARN unique. Les copies isolées sont séparées par clivage par ribozyme à tête de marteau, une séquence près de chaque point de clivage.

Question 26

De quoi est composé le coeur catalytique du ribozyme?

Answer 26

Trois tiges en double hélice (I,II et III) qui entourent ribonucléotides non-hélicoïdaux.

Question 27

Que se passe-t-il avec l’ARN à pH élevé?

Answer 27

• Groupements OH-2’ lentement déprotonés
• Attaque nucléophile de O- sur phosphate 3’ adjacent
• Clivage de la chaîne en produisant un groupement cyclique 2’,3’-phosphate sur une extrémité et un groupement libre 5’-OH sur l’autre