SEM - molekylärpatologi (dem sista 2 fallen ej med)

Question 1

Malignt melanom
1. Vilka 2 gener förutom BRAF screenas med molekylärpatologisk analys vid malignt melanom
2. Oftast sitter mutationen på kodon 600. Vilket läkemedel finns för patienter med V600- BRAF mutation?
3. Eftersom det finns behandling för BRAF-mutation, vad kallas då denna mutation för något om den föreligger?

Answer 1

1. NRAS, CKIT
2. Vemurafenib
3. Positiv prediktor

Question 2

Hodgkins lymfom
1. Vilka 2 molekylära analyser genomförs i regel förutom KRAS?
2. KRAS-mutation och dem andra 2 är en negativ prediktor vid lymfom. Varför?
3. Vilken typ av molekylärpatologisk metod används för dessa gener (och för CKIT vid malignt melanom exempelvis)

Answer 2

1. NRAS, BRAF
2. Aktiverande mutationer i KRAS, NRAF och BRAF är negativa prediktorer. Det finns behandling som blockerar signaltransduktionen för proliferation men endast på EGFR-receptorn. Eftersom alla dessa 3 proteiner är nedströms om EGFR kommer inte medicinsk behandling hjälpa
3. NGS

Question 3

Vid adenocarcinom i lunga analyseras förutom BRAF, RAS, EGFR etc (med NGS) - ALK, RET och ROS1.

1. Varför används nanostring/RNA-hybridisering som metod för molekylärpatologisk diagnostik av ALK-genen?

Answer 3

1. ALK kan bilda en fusionsgen med EML4. EML4-ALK aktiveras utan att binda till en ligand. Detta är en translokation av två gener.

Med nanostring skapar man prober (färgade sakerna som är ovan schematiska bilden) som adhererar till ALK 5-prim ände. Vid en fusionsgen med ALK, försvinner 5-primänden och därmed kan man misstänka att det kan finnas en fusionsgen med ALK.

Proberna märks med färger - vilket apparaten kan detektera och sedan tolka utifrån för att ge data som sedan människa analyserar.

ALK-fusion är en positiv prediktor - finns behandling

Question 4

Är cancer som orsakats av BRCA-mutaiton en positiv prediktor?

Vilken molekylärpatologisk metod används för BRCA-analys?

Answer 4

Ja. Finns PARP-hämmare. PARP är ett enzym som är viktigt vid reparation av dubbelsträngsbrott. Celler med BRCA-mutation kan inte hantera DSB utan PARP-enzymet typ, vet inte exakt hur det funkar.

BRCA är en tumörsupressorgen - muterad BRCA ger därmed okontrollerad celproliferaiton.

NGS

Question 5

Vid t.ex. trippelnegativ bröstcancer utförs en NGS-genpanel som tävker över 500 DNA och 55 RNA-gener.

Läs igenom bara :)