Selvstudie 1. Virus Flashcards

1
Q

Beskriv kort de to måder en bakteriofag kan skabe en infektion når den er inde i dens værtscelle

A

Enten sker der en virulent infektion hvor værtens metabolisme bruges til at replikere virusen og cellen dør, ellers sker der en lysogen infektion hvor virus genomet integreres i værtens genom og værtscellen ikke dør

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hvor kommer den “konvolut” der omgiver dyrevirus fra?

A

Fra værtens membran som de bliver dækket af på vej ud af værtscellen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvordan ser et-trins vækstkurven for virusreplikation ud og hvorfor er den anderledes end den for bakterier?

A

Flad først og stiger brat til sidst. Skyldes at der først ses virus når de frigives fra værtscellen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hvad kræves for at bakteriofagen T4 kan binde til en E. coli celle, og hvilke barrierer skal brydes før de frigives?

A

Lipopolysaccharider (LPS) fungerer som receptor. Bakterie cellen kan forsvare sig ved hjælp af CRISPR, toxin-antitoxin moduler og restriktions endonukleaser. Før nye bakteriofager frigives skal virionen samles, som kræver at DNA pakkes i fagens hoved.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvilken type protein kræves for at bakteriofag lambda forbliver i et lysogenisk stadie?

A

Et repressor protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvordan spredes virioner gennem cellerne i en plante-vært, og hvorfor kræver plantevirus at værten skades for infektion?

A

Virioner spredes gennem plasmodesmata ved hjælp af bevægelsesproteiner, og når de når det vaskulære system kan hele planten inficeres.
Planten skal skades forud for infektion pga. dens tykke cellevæg

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvad er en virion?

A

En virion er en komplet viruspartikel, der består af et nukleinsyre-genom (DNA eller RNA) omgivet af en proteinkappe kaldet en capsid.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hvad er en capsid og en capsomer?

A

En capsid er den proteinkappe, der omgiver virusets genom. En capsomer er en protein-subunit, der udgør capsiden.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvad er lytisk replikation, og hvordan adskiller det sig fra andre former for virusreplikation?

A

Lytisk replikation er en virusreplikationscyklus, der fører til lyse (sprængning) af værts cellen og frigivelse af nye virioner. Andre former for virusreplikation, som lysogeni, involverer ikke nødvendigvis ødelæggelse af værten.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Nævn de fem trin i den lytiske replikationscyklus for en virus.

A

De fem trin er: 1) Attachment (adsorption) af virion til værts celle, 2) Penetration af viralt nukleinsyre, 3) Syntese af viralt nukleinsyre og protein, 4) Assembly (samling) af nye virioner, og 5) Cell lysis og frigivelse af virioner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvad er en permissiv vært?

A

En permissiv vært er en celle, der understøtter den komplette replikationscyklus for en virus.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvad er en bakteriofag?

A

En bakteriofag er en virus, der inficerer bakterier.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvilken bakteriofag bruges som model for lytisk replikation i kapitel 5?

A

Bakteriofagen T4 bruges som model for at forstå lytisk replikation.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvad er burst size?

A

Burst size er det antal virioner, der frigives fra en enkelt inficeret celle efter lytisk replikation.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvad menes med den latente periode i en virus livscyklus?

A

Den latente periode er tidsrummet mellem virusinfektion og fremkomsten af nye virioner. Denne periode inkluderer både eclipse (perioden hvor virus ikke er påviselig) og den tidlige modningsfase.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvordan foregår attachment (adsorption) af en bakteriofag til en værts celle?

A

Bakteriofager binder til specifikke receptorer på overfladen af værts cellen, som kan være forskellige strukturer som flageller, pili, eller lipopolysaccharider (LPS). For eksempel binder T4-fagen til LPS på E. coli.

17
Q

Hvordan trænger en bakteriofags nukleinsyre ind i værts cellen?

A

Ved bakteriofager injiceres kun nukleinsyren ind i værts cellen. Proteinkappen (capsid) forbliver udenfor.

18
Q

Hvad er funktionen af T4 lysozym i T4-fagens infektion af E. coli?

A

T4 lysozym bruges til at nedbryde en lille del af peptidoglykan laget i E. colis cellevæg, hvilket gør det muligt for fagens nukleinsyre at passere ind i cellen.

19
Q

Hvad er proheads, og hvad er deres rolle i T4-fagens replikation?

A

Proheads er forstadier til bakteriofagens hoved. De indeholder midlertidige “stillads-proteiner” og de strukturelle proteiner som den færdige capsid indeholder. Under DNA pakningen udvides proheadet, og stillads-proteinerne smides ud.

20
Q

Hvordan pakkes DNA ind i T4-fagens capsid?

A

T4 DNA pumpes ind i proheadet under tryk ved hjælp af ATP. En pakningsmotor bruges til at presse DNA’et ind. Når hovedet er fyldt, smides pakningsmotoren væk, og capside forsegles.

21
Q

Hvad er forskellen mellem tidlige proteiner og sene proteiner i en virusreplikationscyklus?

A

Tidlige proteiner er nødvendige for nukleinsyrereplikation og transkription, mens sene proteiner bruges til strukturelle komponenter og frigivelse af nye virioner.