7. Fylogenetisk diversitet af mikroorganismer - prokaryoter Flashcards
Hvilken af følgende lister de prokaryote taksonomiske niveauer i korrekt rækkefølge, startende fra domæne?
Domæne (Domain), Række (Phylum), Klasse (Class), Orden (Order), Familie (Family), Slægt (Genus), Art (Species)
Hvilket af følgende mikroorganismer er obligat patogen?
a.
Pseudomonas aeruginosa
b.
Burkholderia cepacia
c.
Candida albicans
d.
Neisseria gonorrhoeae
e.
Staphylococcus aureus
Neisseria gonorrhoeae
Hvilket genetisk element bruges mest til at undersøge den fylogenetiske diversitet blandt bakterier, og hvordan?
16S rRNA-genet bruges til at bestemme fylogenetiske relationer blandt bakterier, da det er konserveret på tværs af arter, men også har variable regioner, der muliggør differentiering.
Hvilket af følgende bakterielle rækker (phyla) er kendt som den største og mest forskelligartede gruppe af bakterier?
a.
Actinobacteria
b.
Firmicutes
c.
Bacteroidetes
d.
Cyanobacteria
e.
Proteobacteria (Pseudomonadota)
Proteobacteria (Pseudomonadota)
Hvilken klasse tilhører bakterien Escherichia coli?
a.
Gammaproteobacteria
b.
Alphaproteobacteria
c.
Actinobacteria
d.
Bacilli
e.
Enterobacteriales
Gammaproteobacteria
Staphylococcus aureus er en bakterie, der findes naturligt på huden og i næseborene hos cirka 30% af alle mennesker uden at forårsage sygdom. Under normale omstændigheder lever den harmløst som en del af vores mikrobiota. Imidlertid kan S. aureus under særlige forhold, såsom svækkelse af immunsystemet, sår, eller ved brug af medicinske indgreb som katetre, forårsage alvorlige infektioner, herunder bylder, lungebetændelse, og sepsis. Hvad betegner man S. aureus som, når den forårsager sygdom under disse forhold?
Opportunistisk patogen
Hvilken række (phylum) rummer den største funktionelle diversitet og har også de fleste kultiverede repræsentanter?
a.
Actinobacteria
b.
Bacteroidetes
c.
Firmicutes
d.
Proteobacteria
Proteobacteria
Chemolitotrof oxidation af ammoniak ses hos medlemmer af
a.
Nitrosomonas
b.
Nitropseudomonas
c.
Nitrosomonas og Nitrosospira
d.
Nitrosomonas, Nitrosospira og Nitropseudomonas
Nitrosomonas og Nitrosospira
Hvilken/hvilke egenskab(er) adskiller Actinobacteria fra Firmicutes?
a.
Fravær/tilstedeværelse af en cellevæg
b.
Evnen til at producere endosporer
c.
Mobilitet og evne til chemotaxis
d.
Relativt G+C-indhold i deres genomer
Relativt G+C-indhold i deres genomer
En fugtig vatpind, der gnides på en persons underarm og derefter på en agarplade med vækstmedie med 7,5 % NaCl, vil sandsynligvis resultere i isolering af ________ spp.
a.
Clostridium
b.
Halobacterium
c.
Sarcina
d.
Staphylococcus
Staphylococcus
Hvilken gruppe af bakterier mangler cellevægge?
Mycoplasma
Archaea er
en gruppe af diverse mikroorganismer, der lever i næsten alle miljøer på Jorden, herunder tarmen hos mennesker og andre pattedyr.
De fleste halofile arkæer bruger følgende som elektrondonorer:
a.
Aminosyrer og organiske syrer
b.
Kulhydrater
c.
Lipider
d.
Nukleinsyrer
Aminosyrer og organiske syrer
Metanogener
producerer metan som en del af deres energimetabolisme.
Hvad beskriver bedst metanogener?
a.
De er en monofyletisk gruppe.
b.
De er fylogenetisk ens.
c.
De er en divers gruppe, der er spredt over mindst otte ordner.
d.
De er en funktionelt, men ikke fylogenetisk, divers gruppe.
De er en divers gruppe, der er spredt over mindst otte ordner.
De fleste kendte metanogener er ikke-halofile
a.
psykrofiler
b.
mesofiler
c.
termofiler
d.
ekstremofiler
mesofiler
Hvilke af følgende er IKKE substrater for metanogener?
- Acetat og pyrovat
- Kuldioxid, CO og format
- Glukose og sucrose
- Methanol og methylamin
Glukose og sucrose
Hvilken arkæisk række indeholder mange ekstreme halofiler, metanogener, nogle marine hypertermofiler samt Thermoplasma?
a.
Crenarchaeota
b.
Euryarchaeota
c.
Nanoarchaeota
d.
Thaumarchaeota
Euryarchaeota
Mange arkæiske hypertermofiler er ________; dog er Staphylothermus en kemoorganotrof.
a.
chemolitotrofer
b.
mixotrofer
c.
parasitter
d.
fotoheterotrofer
chemolitotrofer
Laboratorieisolering af Nanoarchaeum equitans kræver tilstedeværelsen af
a. fedtsyrer
b. ilt
c. Ignicoccus
d. sollys
Ignicoccus
Nitrificerende Thaumarchaeota kan udkonkurrere nitrificerende bakterier i sure miljøer, fordi Thaumarchaeota
er tilpasset til meget lave NH₃-koncentrationer.
Nitrificerende arkæer som Nitrosopumilus maritimus bruger ________ som eneste kulstofkilde og er i stand til at opnå tilstrækkelig energi ved aerob oxidation af ________.
a.
CO₂ / NO
b.
sukker / ammoniak
c.
CO₂ / ammoniak
d.
organiske syrer / NO
CO₂ / ammoniak
Du har fået opgivet en ny bakterie, med det meget opfindsomme navn “Desulfunybaktus”. Uden at vide mere, hvad ville du gætte på, at denne organisme er i stand til?
a.
At oxidere ammoniak
b.
At oxidere sulfat
c.
At oxidere sulfid
d.
At reducere sulfat
e.
At reducere nitrogen
At reducere sulfat
Du får opgivet endnu en organisme, denne gang kaldet “Haloborgensis”. Hvor forventer du at finde denne?
a.
I marine miljøer
b.
I bassiner til saltudvinding
c.
I varme kilder
d.
I have hvor der er sket olieudslip
I bassiner til saltudvinding
Hvilket af følgende udsagn om artsbegreber passer ikke på prokaryoter?
Prokaryoter kan let opdeles i arter baseret på deres morfologi, da deres udseende ofte er meget forskelligt.
Hvilken pathway til produktion af metan er mest udbredt blandt metanogener
a.
Acetoclastisk pathway
b.
Dismutation pathway
c.
Methylotrofisk pathway
d.
CO2-reduktions pathway
CO2-reduktions pathway
Hvad betyder “DIET” i forbindelse med mikrobiel omdannelse af metan, og hvilke organismer kan deltage i denne process?
a.
Dissimilatory ion exchange transfer; udføres imellem methanogener og fermenterende bakterier.
b.
Dissimilatory interspecies electron transfer; udføres imellem hydrogenotrofiske methanogener og acetogene bakterier.
c.
Direct intracellular energy transfer; udføres imellem metanotrofe bakterier og SRB.
d.
Direct interspecies electron transfer; udføres imellem ANME og SRB.
Direct interspecies electron transfer; udføres imellem ANME og SRB.
Den største kilde til udledning af den potente drivhusgas metan er landbruget. Hvad er en af hovedårsagerne til dette?
a.
Fordi metan frigives, når vådområder omlægges til landbrugsproduktion, hvilket skaber anaerobe forhold i jorden, der fremmer metanproduktion.
b.
Fordi metan udledes fra drøvtyggende dyr som køer og får under deres fordøjelsesproces.
c.
Fordi metan dannes, når træer og planter forbrændes under landbrugsarbejde.
d.
Fordi metan kan dannes som et biprodukt under chemolitotrofiske processer i jorden, hvor øget brug af gødning fører til højere nitrogenindhold, der fremmer mikrobiel aktivitet.
Fordi metan udledes fra drøvtyggende dyr som køer og får under deres fordøjelsesproces.
Ikke alle mikroorganismer kan kultiveres. Alligevel har man indenfor de sidste årtier været i stand til at finde stor diversitet blandt prokaryoter. Hvad er hovedårsagen til dette?
Fordi sekventering af fylogenetiske fingerprint sekvenser har gjort det muligt at identificere mikroorganismer uden at skulle kultivere dem i laboratoriet.
Hvad skyldes den rødlige farve i hypersaline miljøer
a.
ANME, som kan oxidere metan ved brug af natrium-ioner
b.
Svovlbakterier, der findes i den anoxiske del af sådanne miljøer
c.
bacteriorhodopsin i halofile arkæer
d.
cartenoider i halofile arkæer
bacteriorhodopsin i halofile arkæer
Hvad er acetogenese, og hvilken rolle spiller det?
Anaerob respiration hvor CO2 reduceres til acetat, vigtig for carbonfiksering i anaerobe miljøer.
Hvad er methanogenese og hvilke organismer udfører det?
Anaerob respiration hvor CO2 reduceres til methan. Udføres af methanogene arkæer.
Hvad er methanotrofi og dens betydning for miljøet?
Oxidation af methan. Reducerer methan-koncentrationen i miljøet. Udføres af methanotrofe bakterier.
Hvad er Lactic acid bacteria karakteriseret ved?
Producerer mælkesyre gennem fermentering..
Hvad er karakteristisk for Proteobacteria?
En meget divers gruppe med stor metabolisk diversitet. Inkluderer både patogener og miljømæssigt vigtige bakterier.
Hvad er Pseudomonas?
En slægt af gram-negative bakterier kendt for deres metaboliske alsidighed.
Hvad er specielt ved Spirochetes?
Spiralformede bakterier med unik bevægelsesmåde. Nogle er sygdomsfremkaldende.
Hvad er Cyanobacteria?
Bakterier der udfører oxygænfotosyntese. Vigtige nitrogen-fiksere.
Hvad er Euryarchaeota karakteriseret ved?
En divers gruppe af arkæa der inkluderer methanogener og halofiler.
Hvad er kendetegnende for Crenarchaeota?
Arkæa, mange er hypertermofiler der findes i varme miljøer.
Hvad er DPANN superphylum?
En gruppe af arkæa med nanobakterier der ofte lever som symbionter.
Hvad er TACK superphylum kendt for?
Indeholder forskellige arkæer, herunder Thaumarchaeota der er vigtige for nitrifikation.
Hvad er de centrale forskelle mellem acetogenese og methanogenese?
Begge er former for anaerob respiration, men acetogenese producerer acetat, mens methanogenese producerer methan.
Nævn et par eksempler på de mest betydningsfulde bakteriegrupper?
F.eks. Proteobacteria for deres diversitet, og Cyanobacteria for fotosyntese og nitrogenfiksering.
Hvad er nogle af de vigtigste forskelle på Arkæer og Bakterier?
Arkæer kan indeholde methanogener og trives i ekstreme miljøer, mens bakterier inkluderer en bred vifte af metaboliske strategier og habitater.
