7. Fylogenetisk diversitet af mikroorganismer - prokaryoter

Question 1

Hvilken af følgende lister de prokaryote taksonomiske niveauer i korrekt rækkefølge, startende fra domæne?

Answer 1

Domæne (Domain), Række (Phylum), Klasse (Class), Orden (Order), Familie (Family), Slægt (Genus), Art (Species)

Question 2

Hvilket af følgende mikroorganismer er obligat patogen?

a.
Pseudomonas aeruginosa

b.
Burkholderia cepacia

c.
Candida albicans

d.
Neisseria gonorrhoeae

e.
Staphylococcus aureus

Answer 2

Neisseria gonorrhoeae

Question 3

Hvilket genetisk element bruges mest til at undersøge den fylogenetiske diversitet blandt bakterier, og hvordan?

Answer 3

16S rRNA-genet bruges til at bestemme fylogenetiske relationer blandt bakterier, da det er konserveret på tværs af arter, men også har variable regioner, der muliggør differentiering.

Question 4

Hvilket af følgende bakterielle rækker (phyla) er kendt som den største og mest forskelligartede gruppe af bakterier?

Answer 4

Proteobacteria (Pseudomonadota)

Question 5

Hvilken klasse tilhører bakterien Escherichia coli?

Answer 5

Gammaproteobacteria

Question 6

Staphylococcus aureus er en bakterie, der findes naturligt på huden og i næseborene hos cirka 30% af alle mennesker uden at forårsage sygdom. Under normale omstændigheder lever den harmløst som en del af vores mikrobiota. Imidlertid kan S. aureus under særlige forhold, såsom svækkelse af immunsystemet, sår, eller ved brug af medicinske indgreb som katetre, forårsage alvorlige infektioner, herunder bylder, lungebetændelse, og sepsis. Hvad betegner man S. aureus som, når den forårsager sygdom under disse forhold?

Answer 6

Opportunistisk patogen

Question 7

Hvilken række (phylum) rummer den største funktionelle diversitet og har også de fleste kultiverede repræsentanter?

Answer 7

Proteobacteria

Question 8

Chemolitotrof oxidation af ammoniak ses hos medlemmer af

Answer 8

Nitrosomonas og Nitrosospira

Question 9

Hvilken/hvilke egenskab(er) adskiller Actinobacteria fra Firmicutes?

Answer 9

Relativt G+C-indhold i deres genomer

Question 10

En fugtig vatpind, der gnides på en persons underarm og derefter på en agarplade med vækstmedie med 7,5 % NaCl, vil sandsynligvis resultere i isolering af ________ spp.

Answer 10

Staphylococcus

Question 11

Hvilken gruppe af bakterier mangler cellevægge?

Answer 11

Mycoplasma

Question 12

Archaea er

Answer 12

en gruppe af diverse mikroorganismer, der lever i næsten alle miljøer på Jorden, herunder tarmen hos mennesker og andre pattedyr.

Question 13

De fleste halofile arkæer bruger følgende som elektrondonorer:

Answer 13

Aminosyrer og organiske syrer

Question 14

Metanogener

Answer 14

producerer metan som en del af deres energimetabolisme.

Question 15

Hvad beskriver bedst metanogener?

Answer 15

De er en divers gruppe, der er spredt over mindst otte ordner.

Question 16

De fleste kendte metanogener er ikke-halofile

Answer 16

mesofiler

Question 17

Hvilke af følgende er IKKE substrater for metanogener?

Answer 17

Glukose og sucrose

Question 18

Hvilken arkæisk række indeholder mange ekstreme halofiler, metanogener, nogle marine hypertermofiler samt Thermoplasma?

Answer 18

Euryarchaeota

Question 19

Mange arkæiske hypertermofiler er ________; dog er Staphylothermus en kemoorganotrof.

Answer 19

chemolitotrofer

Question 20

Laboratorieisolering af Nanoarchaeum equitans kræver tilstedeværelsen af

Answer 20

Ignicoccus

Question 21

Nitrificerende Thaumarchaeota kan udkonkurrere nitrificerende bakterier i sure miljøer, fordi Thaumarchaeota

Answer 21

er tilpasset til meget lave NH₃-koncentrationer.

Question 22

Nitrificerende arkæer som Nitrosopumilus maritimus bruger ________ som eneste kulstofkilde og er i stand til at opnå tilstrækkelig energi ved aerob oxidation af ________.

Answer 22

CO₂ / ammoniak

Question 23

Du har fået opgivet en ny bakterie, med det meget opfindsomme navn “Desulfunybaktus”. Uden at vide mere, hvad ville du gætte på, at denne organisme er i stand til?

Answer 23

At reducere sulfat

Question 24

Du får opgivet endnu en organisme, denne gang kaldet “Haloborgensis”. Hvor forventer du at finde denne?

Answer 24

I bassiner til saltudvinding

Question 25

Hvilket af følgende udsagn om artsbegreber passer ikke på prokaryoter?

Answer 25

Prokaryoter kan let opdeles i arter baseret på deres morfologi, da deres udseende ofte er meget forskelligt.

Question 26

Hvilken pathway til produktion af metan er mest udbredt blandt metanogener

Answer 26

CO2-reduktions pathway

Question 27

Hvad betyder “DIET” i forbindelse med mikrobiel omdannelse af metan, og hvilke organismer kan deltage i denne process?

Answer 27

Direct interspecies electron transfer; udføres imellem ANME og SRB.

Question 28

Den største kilde til udledning af den potente drivhusgas metan er landbruget. Hvad er en af hovedårsagerne til dette?

Answer 28

Fordi metan udledes fra drøvtyggende dyr som køer og får under deres fordøjelsesproces.

Question 29

Ikke alle mikroorganismer kan kultiveres. Alligevel har man indenfor de sidste årtier været i stand til at finde stor diversitet blandt prokaryoter. Hvad er hovedårsagen til dette?

Answer 29

Fordi sekventering af fylogenetiske fingerprint sekvenser har gjort det muligt at identificere mikroorganismer uden at skulle kultivere dem i laboratoriet.

Question 30

Hvad skyldes den rødlige farve i hypersaline miljøer

Answer 30

bacteriorhodopsin i halofile arkæer