Diverse ekstra spørgsmål

Question 1

Hvad er de tre grundlæggende former (morfologier) for bakterier?

Answer 1

De tre grundlæggende former er:
■ Kokker (Cocci): Kugleformede eller sfæriske
■ Baciller (Bacilli): Stavformede
■ Spiraler (Spirilla): Spiralformede eller snoede

Question 2

Hvordan beskriver man kokker, der sidder sammen i klynger?

Answer 2

Kokker der sidder sammen i klynger kaldes stafylokokker (fra græsk staphylē, “klase af druer”).

Question 3

Hvordan beskriver man kokker, der sidder sammen i kæder?

Answer 3

Kokker der sidder sammen i kæder kaldes streptokokker (fra græsk streptos, “let at dreje” eller “bøjelig”).

Question 4

Hvad betyder præfiksene diplo- og tetrad i forbindelse med bakterieform?

Answer 4

Præfikset diplo- betyder to, såsom diplokokker er kokker, der sidder parvis.
Præfikset tetrad- betyder fire, såsom tetrakokker der ligger i grupper af fire.

Question 5

Hvad betyder det at nogle bakterieformer er pleomorfe?

Answer 5

Nogle bakterier er pleomorfe, hvilket betyder, at de kan have varierende former afhængigt af miljøforholdene eller deres livscyklus. Fx Mycoplasma.

Question 6

Hvordan beskriver man baciller?

Answer 6

Baciller er stavformede bakterier. De kan forekomme enkeltvis eller i kæder. Nogle baciller er spore-dannende.

Question 7

Hvad er en coccobacillus?

Answer 7

En coccobacillus er en bakterie, der er meget kort og tyk stavformet; en form der ligger et sted imellem kokker og baciller.

Question 8

Hvilke former for spiraler findes der?

Answer 8

Der er flere former for spiralformede bakterier, herunder:
- Spiriller: Stive, spiralformede bakterier.
- Spirocheter: Fleksible, spiralformede bakterier, der har en speciel type flagel kaldet en aksialfilament.

Question 9

Hvad er en kemoorganoheterotrof

Answer 9

Energi fra organiske kemiske forbindelser og carbon fra organiske carbonforbindelser

Question 10

Hvad er en kemoorganoautotrof

Answer 10

Energi fra organiske kemiske forbindelser og carbon fra uorganiske carbonforbindelser

Question 11

Hvad er en kemolitoheterotrof?

Answer 11

Energi fra uorganiske kemiske forbindelser og carbon fra organiske carbonforbindelser

Question 12

Hvad er en kemolitoautotrof?

Answer 12

Energi fra uorganiske kemiske forbindelser og carbon fra uorganiske carbonforbindelser

Question 13

Hvad er en fotoheterotrof?

Answer 13

Energi fra lys og carbon fra organiske carbonforbindelser

Question 14

Hvad er en fotoautotrof?

Answer 14

Energi fra lys og carbon fra uorganiske carbonforbindelser

Question 15

Escherichia coli (E. coli)

Answer 15

En stavformet bakterie, der findes i tarmen hos mennesker og dyr. E. coli er en modelorganisme i biologisk forskning. Nogle stammer er patogene og kan forårsage sygdom. E. coli er også brugt i LTEE (long-term evolution experiment) studier. Har en betydelig rolle i studier af genregulering og metabolisme.

Question 16

Bacillus subtilis

Answer 16

En stavformet, spore-dannende bakterie, der findes i jord og planter. Den er kendt for sin evne til at danne endosporer, og er en modelorganisme for studier af celledifferentiering og sporedannelse. B. subtilis anvendes i studier af naturlig kompetence.

Question 17

Azotobacter chroococcum

Answer 17

En stor, jordlevende bakterie der er aerob og kvælstoffikserende. Azotobacter danner også cyster, som er hvileceller. A. chroococcum blev isoleret af Martinus Beijerinck ved hjælp af berigelseskultur.

Question 18

Streptococcus pneumoniae

Answer 18

En kok der er en patogen bakterie der forårsager lungebetændelse og andre infektioner. Var en central organisme i Griffiths eksperiment der demonstrerede transformation. S. pneumoniae har forskellige stammer med forskellig virulens.

Question 19

Aliivibrio fischeri

Answer 19

En gram-negativ bakterie der lever i symbiose med marine dyr og er kendt for sin bioluminescens. A. fischeri er modelorganisme for quorum sensing. Den er især kendt for dens symbiotiske forhold med den hawaiianske bobtail-blæksprutte.

Question 20

Salmonella enterica

Answer 20

En stavformet, gram-negativ bakterie der er en patogen der forårsager salmonellose, en form for fødevareforgiftning. Salmonella har en kompleks type III sekretionsmekanisme der tillader den at invadere værtsceller.

Question 21

Pseudomonas aeruginosa

Answer 21

En stavformet, gram-negativ bakterie der er opportunistisk patogen der kan forårsage infektioner i lunger, blod og andre organer. Den er kendt for at danne biofilm og er resistent over for flere antibiotika. P. aeruginosa studeres i forbindelse med kemotaksi og binding til værtsceller.

Question 22

Mycobacterium tuberculosis

Answer 22

En stavformet bakterie med en kompleks cellevæg, der forårsager tuberkulose. M. tuberculosis er en intracellulær patogen med en langsom vækst.

Question 23

Clostridium botulinum

Answer 23

En stavformet, spore-dannende bakterie der producerer det stærke botulinumtoksin. C. botulinum er en anaerob og forårsager botulisme, en alvorlig form for madforgiftning.

Question 24

Desulfovibrio desulfuricans

Answer 24

En sulfatreducerende bakterie der er en anaerob og almindelig i marine miljøer. D. desulfuricans er vigtig i svovlkredsløbet og kan producere H2S. Den er også kendt for horisontal genoverførsel via genoverførselsagenter (GTAs).

Question 25

Nitrosomonas

Answer 25

En kemolitoautotrof der er ammoniakoxiderende og vigtig i nitrogenkredsløbet. Nitrosomonas oxiderer ammoniak til nitrit. Findes ofte i miljøer med højt indhold af ammoniak, som spildevandsanlæg og jord.

Question 26

Sulfolobus

Answer 26

En hypertermofil og acidofil archaeon der oxiderer svovl. Sulfolobus lever i vulkanske miljøer med høje temperaturer og lav pH. Den er vigtig i forskningen af ekstremofile organismer.

Question 27

Geobacter

Answer 27

En anaerob bakterie der reducerer jern og andre metaller og oxiderer organiske forbindelser fuldstændigt til CO2. Geobacter er kendt for at have elektrisk ledende pili og er vigtig i bioremediering.

Question 28

Thiomargarita namibiensis

Answer 28

En af de største kendte bakterier, der lagrer nitrat i en stor vakuole. T. namibiensis oxiderer svovl og lever i marine sedimenter.

Question 29

Dehalococcoides

Answer 29

En anaerob, organohalid-respirerende bakterie, der reducerer chlorerede opløsningsmidler som tetrachlorethylen (PCE) og trichlorethylen (TCE). Dehalococcoides er central i bioremediering af forurenet jord.

Question 30

Hvad er Gram-farvning, og hvad bruges den til?

Answer 30

Gram-farvning er en differentialfarvning, der bruges til at klassificere bakterier som enten Gram-positive (lilla) eller Gram-negative (pink) baseret på deres cellevægsstruktur. Denne farvning er vigtig for identifikation og klassifikation af bakterier.

Question 31

Hvad er forskellen på endosporer og vegetative celler?

Answer 31

Endosporer er resistente, hvilende strukturer, der dannes af visse bakterier under ugunstige forhold. Vegetative celler er de metabolisk aktive celler, der vokser og deler sig under gunstige forhold. Endosporer er meget modstandsdygtige over for varme, udtørring og kemikalier.

Question 32

Hvad er bakteriel transformation?

Answer 32

Bakteriel transformation er en form for horisontal genoverførsel, hvor bakterier optager frit DNA fra omgivelserne. Dette DNA kan integreres i bakteriens eget genom og ændre dens egenskaber. Kompetence er evnen til at optage DNA.

Question 33

Hvad er bakteriel transduktion?

Answer 33

Bakteriel transduktion er en form for horisontal genoverførsel, hvor en bakteriofag (virus) overfører DNA fra en bakteriecelle til en anden. Der er to former: generel transduktion, hvor tilfældigt DNA overføres og specialiseret transduktion hvor DNA fra en specifik region af værtens kromosom overføres.

Question 34

Hvad er bakteriel konjugation?

Answer 34

Bakteriel konjugation er en form for horisontal genoverførsel, hvor DNA overføres direkte fra en donorcelle til en modtagercelle via en pilus eller en lignende struktur. Dette kræver celle-til-celle kontakt.

Question 35

Hvad er forskellen på lytisk og lysogen cyklus for bakteriofager?

Answer 35

I den lytiske cyklus inficerer bakteriofagen en bakteriecelle, replikerer sig selv og lyserer (ødelægger) cellen for at frigive nye viruspartikler. I den lysogene cyklus integreres bakteriofagens DNA i bakteriens genom og forbliver latent (som et profag) uden at dræbe cellen, men profagen kan senere aktiveres og gå ind i den lytiske cyklus.

Question 36

Hvad er quorum sensing?

Answer 36

Quorum sensing er en form for celle-til-celle kommunikation i bakterier, hvor de udskiller og opfanger signalmolekyler for at koordinere adfærd i en population. Dette giver bakterier mulighed for at udføre aktiviteter som biofilmdannelse, kun når de er i en tilstrækkelig høj tæthed.

Question 37

Hvad er en biofilm?

Answer 37

En biofilm er en fællesskabsstruktur bestående af mikroorganismer indlejret i en selvproduceret matrix. Biofilm er ofte mere resistente over for antibiotika og immunsystemet end fritlevende celler.

Question 38

Hvad er betydningen af 16S rRNA i mikrobiologi?

Answer 38

16S rRNA er et ribosomalt RNA molekyle, der findes i alle bakterier og archaea, og som bruges til fylogenetisk analyse. Forskelle i 16S rRNA-sekvensen kan bruges til at identificere og klassificere forskellige mikroorganismer. FISH metoden bruger 16S rRNA som mål.

Question 39

Hvad er metagenomik?

Answer 39

Metagenomik er studiet af genetisk materiale direkte fra miljøprøver. Det giver mulighed for at undersøge mikrobielle samfund uden at skulle dyrke de enkelte organismer i laboratoriet. Metagenomik har revolutioneret studiet af mikrobiel diversitet.

Question 40

Hvad er CARD-FISH?

Answer 40

CARD-FISH (Catalyzed Reporter Deposition FISH) er en metode til at forstærke signalet fra FISH, hvilket gør det muligt at detektere mRNA og andre sjældne nukleinsyrer i celler.

Question 41

Hvad er PCR?

Answer 41

PCR (Polymerase Chain Reaction) er en teknik der bruges til at amplificere (kopiere) specifikke DNA sekvenser. PCR bruges meget indenfor forskning og diagnostik.

Question 42

Hvad er et genchip?

Answer 42

Et genchip (også kaldet DNA microarray) er en lille overflade der indeholder tusindvis af DNA fragmenter i kendt rækkefølge, som bruges til at analysere genekspression eller genomiske variationer. De bruges til at sammenligne genomer og identificere forskelle i sekvenser.

Question 43

Hvad er de vigtigste elementer i et to-komponent reguleringssystem?

Answer 43

Et to-komponent reguleringssystem består af en sensor kinase og en respons regulator. Sensor kinasen registrerer miljøændringer og overfører et fosfat til respons regulatoren, som aktiverer eller hæmmer genekspression.

Question 44

Hvad er forskellen på aktiv og passiv immunitet?

Answer 44

Aktiv immunitet opnås, når kroppen selv producerer antistoffer som respons på en infektion eller vaccination. Passiv immunitet opnås, når kroppen modtager antistoffer fra en anden kilde, såsom fra en mor til et barn eller via en antistof-indsprøjtning. Aktiv immunitet er ofte mere langvarig, hvorimod passiv immunitet er mere kortvarig.

Question 45

Hvad er en termofil?

Answer 45

En termofil er en mikroorganisme, der trives ved høje temperaturer, typisk mellem 45°C og 80°C. Hypertermofiler trives ved endnu højere temperaturer, over 80°C, og findes ofte i hydrotermiske kilder og vulkanske områder. Thermus aquaticus er en termofil, som er vigtig pga dens DNA polymerase der bruges i PCR. Sulfolobus er et eksempel på en hypertermofil archaea.

Question 46

Hvad er en psykrofil?

Answer 46

En psykrofil er en mikroorganisme, der trives ved lave temperaturer, typisk under 20°C, og med et optimum ved 15°C eller lavere. Psykrofiler findes ofte i kolde miljøer, såsom dybhavet og permafrost. Nogle alger kan være psykrofile.

Question 47

Hvad er en mesofil?

Answer 47

En mesofil er en mikroorganisme, der trives ved moderate temperaturer, typisk mellem 20°C og 45°C, med en optimal vækst omkring 37°C. Mange humane patogener er mesofile, da de vokser godt ved menneskets kropstemperatur. Escherichia coli er en mesofil bakterie.

Question 48

Hvad er en acidofil?

Answer 48

En acidofil er en mikroorganisme, der trives i sure miljøer med lav pH-værdi, typisk under pH 5,5. Nogle acidofile er også termofile, såsom Thermoplasma. Svovloxiderende bakterier er ofte acidofile. Nitrosotalea devanaterra er en acidofil, der trives i sur jord.

Question 49

Hvad er en neutrofil?

Answer 49

En neutrofil er en mikroorganisme, der trives ved en neutral pH-værdi, typisk omkring pH 7. De fleste mikroorganismer og humane patogener er neutrofile. Escherichia coli er et eksempel på en neutrofil bakterie.

Question 50

Hvad er en alkalifil?

Answer 50

En alkalifil er en mikroorganisme, der trives i basiske eller alkaliske miljøer med høj pH-værdi, typisk over pH 8,5. Alkalifile bakterier findes ofte i miljøer med højt indhold af karbonat, såsom sodasøer.

Question 51

Hvad er en halofil?

Answer 51

En halofil er en mikroorganisme, der trives i miljøer med høj saltkoncentration, typisk over 0,2 M NaCl. Ekstreme halofiler kræver endnu højere saltkoncentrationer for at vokse. Mange halofile archaea findes i salt søer og saltminer. Haloquadratum er et eksempel på en halofil archaea. Halorubrum er en anden ekstrem halofil.

Question 52

Hvad er en osmotolerant mikroorganisme?

Answer 52

En osmotolerant mikroorganisme er i stand til at tåle og vokse over et bredt område af osmotisk tryk. De er mere fleksible end halofiler og ikke-halofile organismer. Mange svampe er osmotolerante og kan overleve i miljøer med varierende salt- eller sukkerkoncentrationer.

Question 53

Hvad er en piezofil/barofil?

Answer 53

En piezofil, også kendt som en barofil, er en mikroorganisme, der trives ved højt hydrostatisk tryk, typisk fundet i dybhavet. Ekstreme piezofiler kræver meget højt tryk for vækst. Disse organismer har tilpasninger til at modstå det store tryk.

Question 54

Hvad er en aerob?

Answer 54

En aerob er en mikroorganisme, der kræver ilt til vækst og metabolisme. Obligate aerobe kan kun vokse i tilstedeværelse af ilt, hvorimod fakultative aerobe også kan vokse under anaerobe forhold. Bacillus subtilis er en obligat aerob.

Question 55

Hvad er en anaerob?

Answer 55

En anaerob er en mikroorganisme, der ikke kræver ilt for vækst og metabolisme. Obligate anaerober kan ikke vokse i nærvær af ilt, mens aerotolerante anaerober kan tolerere ilt, men ikke bruge det, og fakultative anaerober kan vokse både med og uden ilt, men foretrækker ilt. Clostridium botulinum er en obligat anaerob.

Question 56

Hvad er en mikroaerofil?

Answer 56

En mikroaerofil er en mikroorganisme, der kræver lave niveauer af ilt for vækst og er hæmmet af høje iltkoncentrationer. Disse organismer findes ofte i overgangszoner mellem aerobe og anaerobe miljøer.

Question 57

Hvad er forskellen på mikrobiom og mirkobiota?

Answer 57

De to betegnelser betyder næsten det samme, dog henviser mikrobiota direkte til mikroorganismerne, mens mikrobiom til både mikroorganismerne og de arveanlæg, som de tilsammen indeholder.