Sección I Flashcards

1
Q
  1. La propensión de los átomos de agua a formar enlaces de
    hidrógeno entre sí es el factor primario del cual dependen todas
    las propiedades del agua que siguen, EXCEPTO:
    A. Su punto de ebullición atípicamente alto.
    B. Su calor de vaporización alto.
    C. Su tensión de superficie alta.
    D. Su capacidad para disolver hidrocarburos.
    E. Su expansión en el momento de la congelación.
A

D- Su capacidad para disolver hidrocarburos.

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2
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:

A. Las cadenas laterales de los aminoácidos cisteína y metionina
absorben luz visible.
B. La glicina a menudo está presente en regiones donde un
polipéptido forma una flexión aguda, lo cual revierte
la dirección del mismo.
C. Los polipéptidos se nombran como derivados del residuo
aminoacilo C terminal.
D. Los átomos de C, N, O y H de un enlace peptídico son
coplanares.
E. Un pentapéptido lineal contiene cuatro enlaces peptídicos.

A

A. Las cadenas laterales de los aminoácidos cisteína y metionina absorben luz visible.

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3
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Los amortiguadores del tejido de seres humanos son
bicarbonato, proteínas y ortofosfato.
B. Un ácido débil o una base débil muestra su mayor capacidad
amortiguadora cuando el pH es igual a su pKa más o menos una unidad de pH.
C. El pH isoeléctrico (pI) de la lisina puede calcularse usando
la fórmula (pK2+ pK3)/2.
D. La movilidad de un ácido débil monofuncional en un
campo eléctrico de corriente directa alcanza su máximo
cuando el pH de su ambiente circunvecino es igual a su pKa.
E. En aras de la sencillez, la fuerza de las bases débiles por lo general se expresa como la pKa de sus ácidos conjugados.

A

D. La movilidad de un ácido débil monofuncional en un campo eléctrico de corriente directa alcanza su máximo cuando D

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4
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Los amortiguadores del tejido de seres humanos son
bicarbonato, proteínas y ortofosfato.
B. Un ácido débil o una base débil muestra su mayor capacidad
amortiguadora cuando el pH es igual a su pKa
más o menos
una unidad de pH.
C. El pH isoeléctrico (pI) de la lisina puede calcularse usando
la fórmula (pK2+ pK3/2.)
D. La movilidad de un ácido débil monofuncional en un campo eléctrico de corriente directa alcanza su máximo cuando el pH de su ambiente circunvecino es igual a su pKa.
E. En aras de la sencillez, la fuerza de las bases débiles por lo general se expresa como la pKa de sus ácidos conjugados.

A

C. El pH isoeléctrico (pI) de la lisina puede calcularse usando la fórmula (pK2+ pK3/2.)

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5
Q
  1. De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
    A. Para calcular la Keq, la constante de equilibrio para una reacción, se divide la tasa inicial de reacción hacia adelante (índice1) por la velocidad inicial de la reacción
    reversa (índice–1).
    B. La presencia de una enzima no tiene efectos sobre la Keq.
    C. Para una reacción conducida a temperatura constante, la
    fracción de las moléculas de reactante potenciales que poseen suficiente energía cinética para exceder la energía
    de activación de la reacción es una constante.
    D. Las enzimas y otros catalíticos disminuyen la energía
    de activación de reacciones.
    E. El signo algebraico de ΔG, el cambio de energía libre de Gibbs
    para una reacción, indica la dirección en la cual procederá
    una reacción.
A

A. Para calcular la Keq, la constante de equilibrio para una reacción, se divide la tasa inicial de reacción hacia adelante (índice1) por la velocidad inicial de la reacción reversa (índice–1).A

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6
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Como se usa en bioquímica, la concentración de estado
estándar para productos y reactantes que no son protones es
1 molar.
B. ΔG es una función del logaritmo de Keq.
C. Como se usa en cinética de reacción, el término
“espontaneidad” se refiere a que si la reacción como está
escrita es favorecida para que proceda de izquierda a derecha.
D. ΔGo
denota un cambio de la energía libre que
acompaña la transición desde el estado estándar hacia
el equilibrio.
E. En el momento en que se alcanza equilibrio, las tasas de
la reacción hacia adelante y reversa disminuyen a cero

A

E. En el momento en que se alcanza equilibrio, las tasas de la reacción hacia adelante y reversa disminuyen a cero

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7
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Las enzimas disminuyen la energía de activación para una
reacción.
B. Otro medio mediante el cual las enzimas disminuyen la
energía de activación es al desestabilizar intermediarios
de estado de transición.
C. Los residuos histidilo de sitio activo a menudo ayudan a
la catálisis al actuar como donadores de protones o como
aceptores de los mismos.
D. Algunas enzimas emplean catálisis covalente para
proporcionar una vía de reacción única.
E. La presencia de una enzima no tiene efectos sobre el ΔGo

A

B. Otro medio mediante el cual las enzimas disminuyen la
energía de activación es al desestabilizar intermediarios
de estado de transición.

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7
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Para casi todas las enzimas, la relación de [S] y la tasa de reacción inicial, vi , da una curva hiperbólica.
B. Cuando [S] es mucho más bajo que Km, el término Km + [S] en la ecuación de Michaelis­Menten se aproxima mucho a Km. En estas condiciones, la tasa de catálisis es una función lineal de [S].
C. Las concentraciones molares de sustrato y productos son iguales cuando la tasa de una reacción catalizada por enzima alcanza la mitad de su máximo potencial (Vmáx/2).
D. Se dice que una enzima ha quedado saturada con sustrato cuando el aumento sucesivo de [S] no produce un incremento importante de vi
.
E. Cuando se hacen mediciones de tasa de estado estable,
la concentración de sustratos debe exceder mucho la
del catalítico enzimático.

A

A. Para casi todas las enzimas, la relación de [S] y la tasa de reacción inicial, vi , da una curva hiperbólica.

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8
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Ciertas enzimas monoméricas muestran cinética de tasa
inicial sigmoidea.
B. La ecuación de Hill se usa para realizar análisis cuantitativo
de conducta cooperativa de enzimas o proteínas de
transporte, como hemoglobina o calmodulina.
C. Para una enzima que muestra unión cooperativa de sustrato,
se dice que un valor de n (el coeficiente de Hill) de más
de la unidad muestra cooperatividad positiva.
D. Se dice que una enzima que cataliza una reacción entre dos
o más sustratos opera mediante un mecanismo secuencial
si los sustratos deben unirse en un orden fijo.
E. Los grupos prostéticos permiten a las enzimas añadir
capacidades más allá de las proporcionadas por cadenas
laterales de aminoácidos

A

C. Para una enzima que muestra unión cooperativa de sustrato, se dice que un valor de n (el coeficiente de Hill) de más de la unidad muestra cooperatividad positiva.

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9
Q

. De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. IC50 es un término operacional sencillo para expresar la
potencia de un inhibidor.
B. En los gráficos de Lineweaver­Burk y de Dixon se emplean
versiones reordenadas de la ecuación de Michaelis­Menten
para generar representaciones lineales de conducta
e inhibición cinéticas.
C. Un gráfico de 1/vi
en contraposición con 1/[S] puede usarse
para evaluar el tipo de un inhibidor y la magnitud del mismo.
D. Los inhibidores simples no competitivos disminuyen la Km
aparente para un sustrato.
E. Los inhibidores no competitivos típicamente tienen poca o
ninguna semejanza estructural con el o los sustratos de una
reacción catalizada por enzima

A

D. Los inhibidores simples no competitivos disminuyen la Km
aparente para un sustrato.

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10
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Para una enzima dada, las concentraciones intracelulares
de sus sustratos tienden a estar cerca de sus valores de Km.
B. El secuestro de ciertas vías dentro de orgánulos intracelulares
facilita la tarea de la regulación metabólica.
C. El paso más temprano en una vía bioquímica en la cual puede
ejercerse con eficiencia control regulador es el primer paso
comprometido.
D. Regulación por retroacción se refiere al control alostérico
de un paso temprano en una vía bioquímica por el o los
productos finales de esa vía.
E. El control metabólico es más eficaz cuando uno de los pasos
rápidos en una vía es establecido como objetivo para
regulación.

A

E. El control metabólico es más eficaz cuando uno de los pasos
rápidos en una vía es establecido como objetivo para
regulación.

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11
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Un objetivo importante de la proteómica es identificar todas
las proteínas presentes en una célula en diferentes
condiciones, así como sus estados de modificación.
B. La espectrometría de masa ha remplazado en su mayor parte
al método de Edman para la secuenciación de péptidos
y proteínas.
C. El reactivo de Sanger fue una mejoría del de Edman porque el
primero genera un amino terminal nuevo, lo que permite que
tengan lugar varios ciclos de secuenciación consecutivos.
D. Puesto que la masa es una propiedad universal de todos los
átomos y moléculas, la espectrometría de masa es ideal para
la detección de modificaciones postraduccionales en proteínas.
E. Los espectrómetros de masa de tiempo de vuelo aprovechan
la relación F = ma.

A

B. La espectrometría de masa ha remplazado en su mayor parte
al método de Edman para la secuenciación de péptidos
y proteínas.

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12
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. La cromatografía de intercambio iónico separa proteínas con
base en el signo y la magnitud de su carga a un pH dado.
B. La electroforesis en gel bidimensional separa proteínas en
primer lugar con base en sus valores de pI, y en segundo lugar
con base en su proporción entre carga y masa usando SDS.
C. La cromatografía de afinidad explota la selectividad de
interacciones entre proteína y ligando para aislar una proteína
específica a partir de una mezcla compleja.
D. Muchas proteínas recombinantes son expresadas con un
dominio adicional fusionado a su N o C terminal. Un
componente común de estos dominios de fusión es un sitio
de unión a ligando diseñado expresamente para facilitar
la purificación mediante cromatografía de afinidad.
E. La espectrometría de masa en tándem permite analizar
péptidos derivados de mezclas de proteína complejas sin su
separación previa

A

C. La cromatografía de afinidad explota la selectividad de
interacciones entre proteína y ligando para aislar una proteína
específica a partir de una mezcla compleja.

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13
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. El plegamiento de proteína es auxiliado por la intervención
de proteínas auxiliares especializadas llamadas chaperones.
B. El plegamiento de proteína tiende a ser molecular, con áreas
de estructura secundaria local que se forman primero
y después muestran coalescencia hacia un glóbulo fundido.
C. El plegamiento de proteína es impulsado ante todo por las
propiedades termodinámicas de las moléculas de agua que
rodean el polipéptido naciente.
D. La formación de enlaces S­S en una proteína madura es
facilitada por la enzima proteína disulfuro isomerasa.
E. Sólo algunas proteínas poco comunes, como el colágeno,
requieren procesamiento postraduccional mediante
proteólisis parcial para alcanzar su conformación madura.

A

E. Sólo algunas proteínas poco comunes, como el colágeno,
requieren procesamiento postraduccional mediante
proteólisis parcial para alcanzar su conformación madura.

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14
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Las modificaciones postraduccionales de proteínas pueden
afectar tanto su función como su destino metabólico.
B. El estado conformacional natural suele ser aquel que es
favorecido termodinámicamente.
C. Las estructuras tridimensionales complejas de casi todas las
proteínas se forman y estabilizan por los efectos acumulativos
de un gran número de interacciones débiles.
D. Los científicos de investigación emplean disposiciones de
genes para la detección, con alta capacidad de procesamiento,
de la presencia de proteínas y el nivel de expresión de las
mismas.
E. Los ejemplos de interacciones débiles que estabilizan el
plegamiento de proteína son enlaces de hidrógeno, puentes
de sal y fuerzas de van der Waals.

A

D. Los científicos de investigación emplean disposiciones de
genes para la detección, con alta capacidad de procesamiento,
de la presencia de proteínas y el nivel de expresión de las
mismas.

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15
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Los cambios de configuración involucran la rotura de enlaces
covalentes.
B. Los cambios de conformación involucran la rotación de uno
o más enlaces únicos.
C. El gráfico de Ramachandran ilustra el grado al cual el
obstáculo estérico limita los ángulos permisibles de los
enlaces únicos en el esqueleto de un péptido o una
proteína.
D. La formación de una hélice α es estabilizada mediante los
enlaces de hidrógeno entre cada oxígeno carboxilo unido
a péptido y el grupo N­H del siguiente enlace peptídico.
E. En una hoja β los grupos R de residuos adyacentes apuntan
en direcciones opuestas respecto al plano de la hoja.

A

E. En una hoja β los grupos R de residuos adyacentes apuntan
en direcciones opuestas respecto al plano de la hoja.

16
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. El descriptor α2
β2
γ3
denota una proteína con siete
subunidades de tres tipos diferentes.
B. Las asas son regiones extendidas que conectan regiones
adyacentes de estructura secundaria.
C. Más de la mitad de los residuos en una proteína típica reside
en hélices α u hojas β.
D. Casi todas las hojas β tienen un giro diestro.
E. Los priones son virus que causan enfermedades del
plegamiento de proteína que atacan el cerebro.

A

D. Casi todas las hojas β tienen un giro diestro.

17
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. El efecto Bohr se refiere a la liberación de protones que
ocurre cuando el oxígeno se une a la desoxihemoglobina.
B. Poco después del nacimiento del lactante humano, hay
inducción rápida de la síntesis de la cadena α hasta que
comprende 50% del tetrámero de hemoglobina.
C. La cadena β de la hemoglobina fetal está presente durante
toda la gestación.
D. Las talasemias son defectos genéticos debidos a falta parcial
o total de las cadenas α o β de la hemoglobina.
E. La conformación tensa de la hemoglobina es estabilizada por
varios puentes de sal que se forman entre las subunidades.

A

B. Poco después del nacimiento del lactante humano, hay
inducción rápida de la síntesis de la cadena α hasta que
comprende 50% del tetrámero de hemoglobina.

18
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. El obstáculo estérico por la histidina E7 desempeña un papel
crucial en el debilitamiento de la afinidad de la hemoglobina
por el monóxido de carbono (CO).
B. La anhidrasa carbónica desempeña un papel crucial en
la respiración en virtud de su capacidad para desintegrar
2,3­bisfosfoglicerato en los pulmones.
C. La hemoglobina S se distingue por una mutación genética
que sustituye Glu6 en la subunidad β con Val, lo que crea un
parche pegajoso en la superficie.
D. La oxidación del hierro hem desde el estado +2 hacia el
estado +3 suprime la capacidad de la hemoglobina para
unirse al oxígeno.
E. Las diferencias funcionales entre la hemoglobina y la
mioglobina reflejan en un alto grado diferencias de su
estructura cuaternaria.

A

B. La anhidrasa carbónica desempeña un papel crucial en
la respiración en virtud de su capacidad para desintegrar
2,3 ­bisfosfoglicerato en los pulmones.

19
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. La red de transmisión de carga de la tripsina hace del sitio
activo de la serina un nucleófilo fuerte.
B. La constante de Michaelis es la concentración de sustrato
a la cual la tasa de la reacción es la mitad del máximo.
C. Durante reacciones de transaminación, ambos sustratos
están unidos a la enzima antes de que uno u otro producto
se libere.
D. Los residuos de histidina actúan como ácidos y como bases
durante la catálisis por una aspartato proteasa.
E. Muchas coenzimas y cofactores se derivan de vitaminas

A

C. Durante reacciones de transaminación, ambos sustratos
están unidos a la enzima antes de que uno u otro producto

20
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Las enzimas interconvertibles desempeñan papeles clave en
redes reguladoras integradas.
B. La fosforilación de una enzima a menudo altera su eficiencia
catalítica.
C. Los “segundos mensajeros” actúan como extensiones
o sustitutivos intracelulares para hormonas e impulsos
nerviosos que actúan sobre receptores de superficie celular.
D. La capacidad de las proteína cinasas para catalizar la reacción
inversa que elimina el grupo fosfato es clave para la
versatilidad de este mecanismo regulador molecular.
E. La activación de zimógeno mediante proteólisis parcial es
irreversible en condiciones fisiológicas

A

D. La capacidad de las proteína cinasas para catalizar la reacción
inversa que elimina el grupo fosfato es clave para la
versatilidad de este mecanismo regulador molecular

21
Q
  1. De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
    A. La HapMap Database se enfoca en la ubicación y la identidad
    de polimorfismos de nucleótido único en seres humanos.
    B. Genbank es un depósito de datos sobre los resultados
    fenotípicos de deleciones (knockouts) de gen en seres humanos.
    C. La Protein Database o PDB almacena las estructuras
    tridimensionales de proteínas según se determina mediante
    cristalografía de rayos X o espectroscopia por resonancia
    magnética nuclear (NMR).
    D. El objetivo del proyecto ENCODE es identificar todos
    los elementos funcionales del genoma.
    E. BLAST compara secuencias de proteína y nucleótidos a fin
    de identificar áreas de similitud.
A

B. Genbank es un depósito de datos sobre los resultados
fenotípicos de deleciones (knockouts) de gen en seres humanos.

22
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Un obstáculo importante para el diseño de fármacos
auxiliado por computadora son las demandas extraordinarias
de capacidad de cálculo requeridas para permitir que las
proteínas y los ligandos tengan un grado realista de
flexibilidad conformacional.
B. La flexibilidad conformacional se necesita para permitir que
el ligando y la proteína influyan uno sobre el otro como se
describe mediante el modelo de cerradura y llave de Fischer
para la unión entre proteína y ligando.
C. La construcción de una célula virtual proporcionaría un
medio para detectar con rapidez y eficiencia muchos efectos
indeseables de fármacos potenciales sin la necesidad
de pruebas de laboratorio caras.
D. La biología de sistemas pone de relieve la manera en la cual
las conexiones entre unidades enzimáticas o unidades
de otros tipos en una célula afectan su desempeño.
E. Los biólogos de sistemas a menudo emplean la lógica
simbólica de programas de computadora y circuitos
electrónicos para describir las interacciones entre proteínas,
genes y metabolitos.

A

B. La flexibilidad conformacional se necesita para permitir que
el ligando y la proteína influyan uno sobre el otro como se
describe mediante el modelo de cerradura y llave de Fischer
para la unión entre proteína y ligando.

23
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Las representaciones GRASP ponen de relieve áreas de
la superficie de una proteína que poseen carácter positivo
o negativo local.
B. Las simulaciones de dinámica molecular buscan reconstruir
los tipos de movimiento y el rango de este último por los
cuales pasan las proteínas flexibles desde el punto de vista
conformacional.
C. Los investigadores usan programas de esfera giratoria para
localizar indentaciones y hendiduras sobre la superficie de
una proteína, porque éstas representan sitios probables para
el ataque por proteasas.
D. Las simulaciones de acoplamiento molecular a menudo
restringen la rotación libre a sólo un pequeño grupo de
enlaces en un ligando para hacer que coincidan con el poder
de cálculo disponible.
E. Discernir las relaciones evolutivas entre proteínas constituye
uno de los medios más eficaces de predecir las funciones
probables de un polipéptido recién descubierto.

A

C. Los investigadores usan programas de esfera giratoria para
localizar indentaciones y hendiduras sobre la superficie de
una proteína, porque éstas representan sitios probables para
el ataque por proteasas.