Séance 2 : Immunoprécipitation et structure des immunoglobulines Flashcards

1
Q

Décrire l’immunoprécipitation.

A

Permet d’aller chercher par liaison Ac-Ag une protéine ou un peptide en particulier dans un mélange complexe de protéines

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2
Q

Comment se fait la précipitation du complexe Ag-Ac?

A

À l’aide de billes recouvertes de protéines qui ont une grande affinité pour les immunoglobulines : permet de les imobiliser sur les billes

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3
Q

Comment sépare-t-on ensuite le complexe Ag-Ac du mélange de protéines?

A

On retire les billes par centrifugation ou magnétisme : complexe Ag-Ac fixé sur les billes donc en enlevant le surnageant après la centrifugation ou le magnétisme, on enlève le mélange de protéines sans enlever la protéine spécifique qu’on veut

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4
Q

Quelles sont les protéines d’immobilisation possibles à mettre sur les billes?

A

Protéine A de Staphylococcus aureus
Protéine G de Streptococcus sp.
Ac anti-immunoglobulines

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Q

Quelles protéines d’immobilisation, antisérum et mélange de protéines ont été utilisés pour l’expérience dans le laboratoire?

A

Protéine A
Antisérum de lapin anti-pyruvate kinase
Mélange de protéines extraites de muscle de poulet

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6
Q

Que contient le témoin Ag seul?

A

200 ul d’extrait brut de muscle de poulet

10 ul de billes

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7
Q

Que contient le témoin Ac seul?

A

5 ul d’Antisérum anti-PK
200 ul de tampon Tris
10 ul de billes

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8
Q

Que permet l’électrophorèse en gel de polyacrylamide-SDS (SDS-PAGE)?

A

Permet de séparer les différentes protéines d’un échantillon

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9
Q

Comment dénature-t-on les échantillons avant de les déposer sur gel?

A

Chauffage à 95C en présence de détergent (SDS) et un agent réducteur des ponts disulfures (b-mercaptoéthanol)

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10
Q

Que permet le b-mercaptoéthanol?

A

Dissocier les sous-unités

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11
Q

Que permet le SDS?

A

Se lie aux sous-unités protéiques réduites en qté environ proportionnelle au poids moléculaire : donne une charge négative nette importante (rend la charge intrinsèque de la protéine insignifiante)
Protéines chargées négativement se séparent selon leur poids moléculaire

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12
Q

Vers quelle électrode migrent les protéines après le traitement?

A

Électrode chargée positivement

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13
Q

À quoi est inversement proportionnelle la vitesse de migration des polypeptides à travers le gel poreux de polyacrylamide?

A

Taille du polypeptide

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14
Q

Quel colorant a été utilisé dans le protocole réalisé en laboratoire pour visualiser les protéines dans le gel?

A

Colorant de type «trihalo»

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15
Q

Avec quoi réagit le colorant de type «trihalo»?

A

AA tryptophane

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16
Q

Comment le colorant permet-il de détecter les protéines dans le gel (à part du fait qu’il réagit avec les aa tryptophane?)?

A

Activé par les UV : permet de détecter les protéines dans le gel

17
Q

Que permet le traitement à la chaleur (préparation des échantillons au SDS-PAGE)?

A

Dénaturer les protéines et assurer une liaison optimale du SDS

18
Q

Quand faut-il arrêter le gel????

A

Quand le bleu de bromophénol atteint la fin du gel!!!!!!!! (pas comme on a fait lol) (en plus j’avais surligné «fin du gel» dans mon cahier sad Josianne noises)

19
Q

De combien de chaînes polypeptidiques sont composés les Ac?

A

4 : 2 lourdes, et 2 légères

20
Q

Entre quels poids moléculaires varient les chaînes lourdes?

A

entre 53 et 75 kDa

21
Q

Quel facteur fait varier le poids moléculaire des chaînes lourdes?

A

Le type d’Ig : IgG, IgM, IgD, IgA ou IgE

22
Q

Quel est le poids moléculaire des chaînes légères?

A

Environ 25 kDa

23
Q

Entre quels poids moléculaires varient le poids total des Ig?

A

Entre 150 et 970 kDa

24
Q

Comment les chaînes lourdes et légères sont-elles maintenues ensemble?

A

Par des liaisons covalentes des ponts disulfures

25
Q

Qu’est-ce qui diffère entre les isotypes d’Ig (IgG, IgM, IgD, IgA ou IgE)?

A

Le nombre et le positionnement des ponts disulfures entre les chaînes, le nombre d’oligosaccharides attachés aux chaînes lourdes et la taille des chaînes lourdes

26
Q

Sous quelle forme sont retrouvés les IgG?

A

Monomères

27
Q

Sous quelle forme sont retrouvés les IgM?

A

Pentamères

28
Q

Combien de sites de liaison à l’Ag les IgM offrent-ils?

A

10

29
Q

Comment ont été mises en évidence les différences entre les IgG et les IgM dans le protocole réalisé en labo?

A

Par séparation sur gel de polyacrylamide en conditions natives et en conditions dénaturantes