RNA dan Transkripsi RNA Flashcards
Jelaskan Central Dogma!
DNA >< RNA > Protein
Transkripsi, Translasi
Reverse Traskripsi
Virus merupakan obligat seluler benar atau tidak?
Benar, dia hanya bisa bereplikasi di dalam sel makhluk hidup
Ciri RNA!
- Single stranded
- Gugus OH pada gula nomor 2
- Gula Ribosa
- Basa nitrogen, Purin : Adenin Guanin
Pirimidin : Sitosin Urasil - Nukleotida : Gula pentosa, fosfat, basa nitrogen
Sebutkan macam-macam RNA!
- Transfer RNA > kecil > membawa asam amino ke ribosom
- Ribosomal RNA > variasi > bergabung dengan ribosom
- Messenger RNA > variasi > membawa sequence asam amino
- Small nuclear RNA > kecil > mRNA dibuat jadi matang pada eukariot (karena ada intron dan ekson (splicing))
- Small interfering RNA > kecil > mempengaruhi ekspresi gen untuk knock out gen pada studi
- Micro RNA > kecil > mempengaruhi ekspresi gen dan penting untuk pertumbuhan dan perkembangan
Enzim yang mengkatalisis sintesis RNA digunakan enzim…
RNA Polimerase
Tempat duduk dan meninggalkan RNA polimerase adalah…
Promotor dan terminator
Tempat terjadinya trankripsi dari RNA adalah…
Transcription unit
Sebutkan tahapan transkripsi!
- Inisiasi
- Elongasi
- Terminasi
DNA yang menjadi template adalah ujung … ke ujung …
3’ ke 5’
kalau misal di soal templatenya si reagen coding atau dari 5’ ke 3’ maka dia ga di transkripsi
Penambahan basa di gugus…
Nomor 3
Muatan DNA adalah…
Negatif dari fosfatnya
Tahapan transkripsi pada prokariotik!
- Binding RNA polimerase dan DNA mulai unwinding
- Inisiasi dari sintesis RNA
- Elongasi dari RNA
- Terminasi dari sintesis RNA
Ciri promotor sebagai tempat duduk dari RNA polimerase!
TTGACG TATAAT (TATA BOX)
(-35 Region) (-10 Region) +1 (Transcription start site)
Sigma Factor
General feature RNA sintesis!
- DNA-dependent RNA polymerase
- Bahan baku berupa ATP, GTP, CTP, UTP, Mg2+ (kofaktor shg enzim dalam keadaan optimum)
- Primer isn’t needed in RNA synthesis, but DNA template
- Yang dipakai DNA template itu dari ujung 3’ ke 5’
- Jadi RNA yang terbentuk itu dari ujung 5’ ke 3’
Pembetukan RNA dengan…
Purin : Adenin dan Guanin
+1 sama dengan start codon?
Bukan
Sigma factor dilepaskan ketika…
Sudah mulai sintesis RNA
Bentuk terminasi prokariot adalah…
- Rho-independent (Palindrom, membentuk hair pin)
- G-C rich stem and loop
- sequence of 4-6 residues uracil in the RNA - Rho-dependent (hair pin)
- ga banyak residu urasil
Regulasi transkripsi RNA pada prokariot…
- Alternative Factor Sigma
(Middle, gp28: late, gp33 and gp34) - Operon
Set dari gen yang dikontorl menggunakan satu promotor
Dalam keadaan tidak ada lactose (inducer) maka operon lac…
Off jadi gabisa trankripsi karena di operator ada represor yang harus berikatan dengan lactose biar si RNA polymerase bisa mentranskripsi
Kalau di eukariot apakah ada faktor transkripsi?
Ya, ada
Yang terjadi pada daerah promotor eukariot!
- TATAA box
- TFIID
- TFIIA dan TFIIB
- Pol II (RNA Polimarase) dan TFIIF
- TFIIE dan TFIIH (PIC)
- Unwinding
- BEH out
Kecepatan transkripsi pada eukaritot adalah…
40 nukleotida per sekon
Jelaskan penambahan cap!
- 5’ itu 5’ cap
- 3’ itu poly-A tail
Untuk memfasilitasi pre mRNA ke sitoplasma
Melindungi mRNA dari enzim hidrolitik
Membantu mRNA berikatan dengan ribosom pd 5’ end
RNA splicing yang dibuang adalah…
Intron
Splicing di carry oleh…
Spliceosome yaitu gabungan protein dan small nuclear RNA
Yang memotong intron adalah…
Ribozim
Regulasi transkripsi RNA pada eukariot adalah…
- Enhancers
2. Silencers
Contoh enhancers…
CRE CBP
