Réplication et réparation de l'ADN Flashcards
Quels sont les bases azotées de l’ADN?
Adenine, Thymine, Cytosine, Guanine
Quels sont les azotées de l’ARN?
Adenine, Uracil, Cytosine, Guamine
Quels sont les deux acides nucléiques?
ADN, ARN
De quoi sont composé les nucléoside?
De base azotée et pentose
De quoi sont composé les nucléotides?
Nucléosides, (PO4)2-
Quelles sont les liaisons entre le pentose et les phosphates?
Liaison phosphoester.
Quelles sont les liaisons entre le pentose et la base azotée?
Liaison glycosidique.
À quelle famille de bases azotées font partie A et G?
Purines.
À quelle famille de bases azotées font partie U, T et C?
Pyrimidines.
Quelle est l’unité de base de l’ADN?
Les nucléotides.
Combien d’atomes de carbone possède les purines dans leur deux cycles?
9
Combien d’atomes de carbone possède les pyrimidines dans leur cycle?
6
Quel atome fait la liaison glycosidique entre le sucre et les purines? les pyrimidines?
C1’->N9, C1’->N1
Quels sont les deux différents pentose?
Béta-D-ribofuranose et le 2-deoxy-béta-D-ribofuranose
Comment compte-on les carbones pour les pentoses?
de 1’ à 5’
Quel est la différence entre le ribose et le 2-deoxyribose?
Le ribose à un groupement OH sur le carbone 2 alors que le 2-déoxyribose à un H.
Sous quelle forme sera le résidu de phosphate H3PO4 dans la cellule?
HPO4 2-
Qu’est-ce que le phosphate forme avec les groupement OH 2’(seulement sur ARN), 3’, 5’?
Des esters.
Comment nommet–on les purines lorsquelles sont sous formes de nucloéoside? les pyrimidines?
Osine, idine ou pour les deux «ylate»
Qu’est-ce qu’une liaison phosphoanhydre?
Liaison d’un 2e ou 3e phosphate sur les nucléotides qui est riche en énergie.
Quelles sont les principales fonctions des nucléotides?
Transfert un groupe phosphate à différents substrats, énergie.
L’ADN et l’ARN sont quel type de polymère?
Linéaire.
V/F La longueur de l’ADN et de l’ARN est théoriquement limité.
Faux
Par quelle direction sont synthétisé les acides nucléiques ?
5’ phosphate libre-> 3’ OH libre
Combien il y a des charges négative par nucléosides?
1
Combien de charge négative sont à l’extrémité 5’?
2
V/F Les chaîne d’acide nucléique peuvent être linéaire.
Vrai
Quelle est la structure de l’ADN?
2 brins antiparallèles appariés (forme d’hélice)
De quoi est composé le squelette de l’ADN?
De sucres et de phosphates
À combien équivaut le ration de purine/pyrimidine? Selon quelle règle?
1, de Chargaff
V/F A=T et G=C.
Vrai
Qu’a permis de déterminé Chargaff?
La structure de l’ADN.
Qu’est-ce qui permet le pairage des purines et pyrimidines?
La présence de dipôle
Combien de lien vont faire A et T? A et U? G et C?
2,2,3
De combien est le diamètre d’une paire de base (AT)(GC)?
1.08 nm
Pourquoi Watson et Crick ont-ils gagné un prix nobel?
Pour avoir découvert la structure en forme de double hélice de l’ADN.
À quel règle correspond la structure de double hélice?
La règle de la main droite.
Quel ADN retrouve-t-on le plus souvent?
L’ADN-B
Le centre de l’hélice de l’ADN est hydrophobe ou hydrophile?
Hydrophobe
Quel est la spécificité de l’ADN-B?
Elle possède un sillon mineur et un majeur.
Dans la double hélice les bases sont elles verticales ou perpendiculaires à la page?
Perpendiculaire.
Dans quel milieu est favorisé l’hélice B?
En milieu aqueux
À quoi correspond la forme A de l’ADN?
La forme déshydratée.
Quels sont les caractéristiques de ADN-Z?
Elles n’a pas de sillon et respecte la règle de la main gauche.
Quels sont les caractéristiques de ADN-A?
Elle est plus compacte et les sillons sont égaux, 11 base/ tours
Combien de base par tour possède l’ADN-B?
10-10,5
Combien il a-t-il d’espace entre les pb de l’ADN-B?
0.34nm
Quelles forces stabilisent l’ADN-B?
Effet hydrophobe, Van der Waals, pont-H, ponts salins.
À quoi correspond la température de fusion (TM)?
La température à laquelle les deux brins se sépare (50% 2brins et 50% simple brin)
Comment détermine-t-on la TM de l’ADN?
Grâce à l’absorbance qui augmente lorsque l’ADN est sous forme de simple brin.
V/F Une molécule formé de A et de T à une TM plus petite.
Vrai
Quelle est la structure quaternaire de l’ADN?
La chromatine
Qu’est-ce que le nucléosome?
1er niveau d’enroulement, histones (H2A, H2B, H3, H4)+ADN
Quel est la facteur de condensation du nucléosome?
10X
Qu’est-ce qui se passe avec la chromatine en milieu de faible force ionique?
Une décondensation
Que représente la chromatine?
2e niveau de condensation 4X de type solénoïde, 6 nucléosome par tour.
Qu’est ce qui stabilise la chromatine?
H1
Après la chromatine, l’ADN peut encore de condenser de quelle manière?
En formant des boucle accrochée à des protéines (pas histone) + formant des mini-bandes de 18 loupes.
Quel est le facteur d’enroulement des mini-bandes et de boucle pour l’ADN?
200X
Qu’est-ce qu’un chromosome?
Empilement des mini-bandes par des complexes de protéines et d’ARN
Combien y a-t-il de paire de chromosomes chez l’humain?
23
Quelles est la particularité des cellules souches?
Elles se divise pratiquement jusqu’à l’infini.
V/F L’ADN peut être réparé.
Vrai
Que deviennent la majorité des cellules souches?
Des cellules spécialisée.
Combien de nucléotides compose notre génome?
3.3 milliards
Quels sont les deux rôles de l’ADN?
Stabilité de l’information génétique et transmission.
Nomme moi une différence dans la fabrication de ARN entre les humains et les virus.
Les virus peuvent contourner le processus avec une enzyme qui convertit l’ARN en ADN.
Quelle est la molécule effectrice de la vie?
Les protéines.
En quoi la structure de l’ADN est favorable à la protection de l’info génétique?
La réplication est fidèle, les mécanisme de réplication est efficaces, transfert de l’info à l’ARN.
Quels sont les trois postula de l’ADN?
Semi-conservative, conservative, dispersive
Quel postulat Watson et Crick ont proposer?
la semi-conservation, un brin fille et un brin mère.
Quel expérience confirme l’hypothèse de Watson et Crick?
L’expérience de Meselson-Stahl.
Par quel enzyme la synthèse de l’ADN est-elle catalysée?
ADN polymérase.
Dans quel sens se forme l’ADN?
5’->3’
De quoi a-t-on besoin pour la synthèse de l’ADN?
ADN polymérase, désoxynucléoside %’-triphosphates (dNTPs), Amorce (ARN)
Quel étape effectue les hélicases?
La séparation des deux brins de la double hélice.
Où s’initie le déroulement de l’ADN?
Aux origines de réplications.
Dans Ecoli quel type de protéines s’attache au ORIc et produit une dénaturation?
le poduit du gène dnaA.
Quels sont les origines de réplication des procaryotes?
ORIc
Quels sont les complexes de reconnaissances des origines de réplication des eucaryotes?
ORC
À quoi s’associe les ORC?
Aux ORIs et à des protéines pour recruté les hélicase (MCM).
Combien de complexes protéiques possèdent les ORC?
6
V/F Les procaryote ont plusieurs site de réplication.
Faux
V/F La réplication chez les eucaryote et les procaryotes se fait dans les deux sens.
Vrai
Quel processus de réplication de l’ADN est le plus lent les procaryotes ou les eucaryotes?
Les eucaryotes 50-100 nucléotides/sec par apport au procaryotes 500-1000 nucléotides/sec.
Une photo présentant plusieurs bulles de réplication représentes quel type de cellule?
Eucaryotes.
Quelle enzyme règle le problème de surenroulement?
Les Topoisomérase.
Quels sont les avantages de l’utilisation d’amorce d’ARN?
Il peut facilement être reconnu comme non-ADN.
V/F L’amorce est ajouté avec un contrôle qualité.
Faux
Quel sont les enzymes de la réplication chez les procaryotes?
ADN polymérase I, II, III
Que permet l’ADN polymérase I?
Répare ADN + synthèse 1 brin
Que permet l’ADN polymérase II?
Réparation ADN
Que permet l’ADN polymérase III?
Composant du réplicateur et enzyme principale de la réplication, assure l’élongation.
Quel sont les enzymes de la réplication chez les eucaryotes?
ADN polymérase (alpha, béta…) min 4 et chez l’humain plus de 14.
Que permet l’ADN polymérase béta?
réparation
Que permet l’ADN polymérase gamma?
réplication ADN mitochondrial.
De quelle manière se fait la synthèse du brin retardé?
Discontinu.
Comment se nomme les fragments d’ADN du brin retardé?
Fragments d’Okazaki.
La synthèse des amorces d’ARN est catalysée par quel enzyme chez les procaryotes?
La primase
La synthèse des amorces d’ARN est catalysée par quel enzyme chez les eucaryotes?
Rnase H
Par quelle enzyme sont relié les fragments d’Okazaki?
ADN ligase
Quels sont les deux domaines de la Rnase H?
HBD et catalytique (H-domain)
Que fait l’activité de la 3’-5’ exonucléase?
Quand il y a une synthèse lors de la réplication, la polymérase recule, enlève le nucléotide et reprend.
V/F il y a plus d’erreur dans la synthèse de l’ARN que dans celle de l’ADN.
Vrai
Comment termine la réplication de l’ADN chez le procaryotes?
En inhibant l’activité des hélicases du réplicateur.
Où se termine la réplication de l’ADN chez les procaryotes?
Dans une zone opposée à l’origine de réplication, où il y a la fixation d’une protéine de fixation au terminateur (prot tus).
Chez les eucaryotes, quand survient la terminaison de la réplication de l’ADN?
Lors de la rencontre des réplisomes de deux origines différentes.
Comment est la structure de l’ADN des procaryotes?
Petit et circulaire.
À quoi attribut-on la lenteur de la réplication de l’ADN chez les eucaryotes?
Au fait qu’il soit compacté sur la chromatine. (Histone)
Que ce passe-t-il lors d’une accumulation de mutation?
Un cancer.
Quels sont les voies de réparation de l’ADN?
BER, NER, NHEJ, HR
Que corrige la réparation par excision de base (BER)?
Les lésions les plus fréquentes.
Que corrige la réparation par excision de nucléotide (NER)?
La deuxième forme la plus fréquente. UV et radicaux libre.
Que corrige la réparation par les jonctions des extrémités (NHEJ)?
Les cassures double-brin.
Que corrige la réparation par les recombinaison homologue (HR)?
Les molécules d’ADN cassées.
Que provoque les rayons UV sur l’ADN?
Une dimérisation des thymine qui empêche la réplication à cause d’une distorsion du brin matrice.
Avec quoi répare-t-on l’ADN modifié par les rayon UV?
Photolyase qui se fixe sur l’ADN en face du dimère de thymine.
Comment fonctionne la réparation par excision de base (BER)?
ADN glycosylase catalyse l’élimination de bases altérés par hydrolyse de la liaison N-glycosidique.
Que forme la désamination hydrolytique de la cytosine?
L’uracile.
Quel est le rôle de ku?
Recrutement des exonucléases et des polymérases qui font le rognage et l’allongement des brins.
Comment fonctionne la réparation par jonction des extrémités non-homologue (NHEJ)?
ku, ADN ligase
De quoi a-t-on besoin pour la recombinaison homologue?
d’un autre molécule d’ADN double brin homologue.
Nomme moi un défaut de réparation.
Mutation de BRCA1/2.
