Réplication et réparation de l'ADN Flashcards

1
Q

Quels sont les bases azotées de l’ADN?

A

Adenine, Thymine, Cytosine, Guanine

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Q

Quels sont les azotées de l’ARN?

A

Adenine, Uracil, Cytosine, Guamine

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3
Q

Quels sont les deux acides nucléiques?

A

ADN, ARN

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4
Q

De quoi sont composé les nucléoside?

A

De base azotée et pentose

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5
Q

De quoi sont composé les nucléotides?

A

Nucléosides, (PO4)2-

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6
Q

Quelles sont les liaisons entre le pentose et les phosphates?

A

Liaison phosphoester.

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7
Q

Quelles sont les liaisons entre le pentose et la base azotée?

A

Liaison glycosidique.

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8
Q

À quelle famille de bases azotées font partie A et G?

A

Purines.

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9
Q

À quelle famille de bases azotées font partie U, T et C?

A

Pyrimidines.

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10
Q

Quelle est l’unité de base de l’ADN?

A

Les nucléotides.

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11
Q

Combien d’atomes de carbone possède les purines dans leur deux cycles?

A

9

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12
Q

Combien d’atomes de carbone possède les pyrimidines dans leur cycle?

A

6

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13
Q

Quel atome fait la liaison glycosidique entre le sucre et les purines? les pyrimidines?

A

C1’->N9, C1’->N1

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14
Q

Quels sont les deux différents pentose?

A

Béta-D-ribofuranose et le 2-deoxy-béta-D-ribofuranose

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15
Q

Comment compte-on les carbones pour les pentoses?

A

de 1’ à 5’

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16
Q

Quel est la différence entre le ribose et le 2-deoxyribose?

A

Le ribose à un groupement OH sur le carbone 2 alors que le 2-déoxyribose à un H.

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17
Q

Sous quelle forme sera le résidu de phosphate H3PO4 dans la cellule?

A

HPO4 2-

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18
Q

Qu’est-ce que le phosphate forme avec les groupement OH 2’(seulement sur ARN), 3’, 5’?

A

Des esters.

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19
Q

Comment nommet–on les purines lorsquelles sont sous formes de nucloéoside? les pyrimidines?

A

Osine, idine ou pour les deux «ylate»

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20
Q

Qu’est-ce qu’une liaison phosphoanhydre?

A

Liaison d’un 2e ou 3e phosphate sur les nucléotides qui est riche en énergie.

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21
Q

Quelles sont les principales fonctions des nucléotides?

A

Transfert un groupe phosphate à différents substrats, énergie.

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22
Q

L’ADN et l’ARN sont quel type de polymère?

A

Linéaire.

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23
Q

V/F La longueur de l’ADN et de l’ARN est théoriquement limité.

A

Faux

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24
Q

Par quelle direction sont synthétisé les acides nucléiques ?

A

5’ phosphate libre-> 3’ OH libre

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25
Q

Combien il y a des charges négative par nucléosides?

A

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26
Q

Combien de charge négative sont à l’extrémité 5’?

A

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27
Q

V/F Les chaîne d’acide nucléique peuvent être linéaire.

A

Vrai

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28
Q

Quelle est la structure de l’ADN?

A

2 brins antiparallèles appariés (forme d’hélice)

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29
Q

De quoi est composé le squelette de l’ADN?

A

De sucres et de phosphates

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30
Q

À combien équivaut le ration de purine/pyrimidine? Selon quelle règle?

A

1, de Chargaff

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31
Q

V/F A=T et G=C.

A

Vrai

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32
Q

Qu’a permis de déterminé Chargaff?

A

La structure de l’ADN.

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33
Q

Qu’est-ce qui permet le pairage des purines et pyrimidines?

A

La présence de dipôle

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34
Q

Combien de lien vont faire A et T? A et U? G et C?

A

2,2,3

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35
Q

De combien est le diamètre d’une paire de base (AT)(GC)?

A

1.08 nm

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36
Q

Pourquoi Watson et Crick ont-ils gagné un prix nobel?

A

Pour avoir découvert la structure en forme de double hélice de l’ADN.

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37
Q

À quel règle correspond la structure de double hélice?

A

La règle de la main droite.

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38
Q

Quel ADN retrouve-t-on le plus souvent?

A

L’ADN-B

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39
Q

Le centre de l’hélice de l’ADN est hydrophobe ou hydrophile?

A

Hydrophobe

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40
Q

Quel est la spécificité de l’ADN-B?

A

Elle possède un sillon mineur et un majeur.

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41
Q

Dans la double hélice les bases sont elles verticales ou perpendiculaires à la page?

A

Perpendiculaire.

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42
Q

Dans quel milieu est favorisé l’hélice B?

A

En milieu aqueux

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43
Q

À quoi correspond la forme A de l’ADN?

A

La forme déshydratée.

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44
Q

Quels sont les caractéristiques de ADN-Z?

A

Elles n’a pas de sillon et respecte la règle de la main gauche.

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45
Q

Quels sont les caractéristiques de ADN-A?

A

Elle est plus compacte et les sillons sont égaux, 11 base/ tours

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46
Q

Combien de base par tour possède l’ADN-B?

A

10-10,5

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47
Q

Combien il a-t-il d’espace entre les pb de l’ADN-B?

A

0.34nm

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48
Q

Quelles forces stabilisent l’ADN-B?

A

Effet hydrophobe, Van der Waals, pont-H, ponts salins.

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49
Q

À quoi correspond la température de fusion (TM)?

A

La température à laquelle les deux brins se sépare (50% 2brins et 50% simple brin)

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50
Q

Comment détermine-t-on la TM de l’ADN?

A

Grâce à l’absorbance qui augmente lorsque l’ADN est sous forme de simple brin.

51
Q

V/F Une molécule formé de A et de T à une TM plus petite.

A

Vrai

52
Q

Quelle est la structure quaternaire de l’ADN?

A

La chromatine

53
Q

Qu’est-ce que le nucléosome?

A

1er niveau d’enroulement, histones (H2A, H2B, H3, H4)+ADN

54
Q

Quel est la facteur de condensation du nucléosome?

A

10X

55
Q

Qu’est-ce qui se passe avec la chromatine en milieu de faible force ionique?

A

Une décondensation

56
Q

Que représente la chromatine?

A

2e niveau de condensation 4X de type solénoïde, 6 nucléosome par tour.

57
Q

Qu’est ce qui stabilise la chromatine?

A

H1

58
Q

Après la chromatine, l’ADN peut encore de condenser de quelle manière?

A

En formant des boucle accrochée à des protéines (pas histone) + formant des mini-bandes de 18 loupes.

59
Q

Quel est le facteur d’enroulement des mini-bandes et de boucle pour l’ADN?

A

200X

60
Q

Qu’est-ce qu’un chromosome?

A

Empilement des mini-bandes par des complexes de protéines et d’ARN

61
Q

Combien y a-t-il de paire de chromosomes chez l’humain?

A

23

62
Q

Quelles est la particularité des cellules souches?

A

Elles se divise pratiquement jusqu’à l’infini.

63
Q

V/F L’ADN peut être réparé.

A

Vrai

64
Q

Que deviennent la majorité des cellules souches?

A

Des cellules spécialisée.

65
Q

Combien de nucléotides compose notre génome?

A

3.3 milliards

66
Q

Quels sont les deux rôles de l’ADN?

A

Stabilité de l’information génétique et transmission.

67
Q

Nomme moi une différence dans la fabrication de ARN entre les humains et les virus.

A

Les virus peuvent contourner le processus avec une enzyme qui convertit l’ARN en ADN.

68
Q

Quelle est la molécule effectrice de la vie?

A

Les protéines.

69
Q

En quoi la structure de l’ADN est favorable à la protection de l’info génétique?

A

La réplication est fidèle, les mécanisme de réplication est efficaces, transfert de l’info à l’ARN.

70
Q

Quels sont les trois postula de l’ADN?

A

Semi-conservative, conservative, dispersive

71
Q

Quel postulat Watson et Crick ont proposer?

A

la semi-conservation, un brin fille et un brin mère.

72
Q

Quel expérience confirme l’hypothèse de Watson et Crick?

A

L’expérience de Meselson-Stahl.

73
Q

Par quel enzyme la synthèse de l’ADN est-elle catalysée?

A

ADN polymérase.

74
Q

Dans quel sens se forme l’ADN?

A

5’->3’

75
Q

De quoi a-t-on besoin pour la synthèse de l’ADN?

A

ADN polymérase, désoxynucléoside %’-triphosphates (dNTPs), Amorce (ARN)

76
Q

Quel étape effectue les hélicases?

A

La séparation des deux brins de la double hélice.

77
Q

Où s’initie le déroulement de l’ADN?

A

Aux origines de réplications.

78
Q

Dans Ecoli quel type de protéines s’attache au ORIc et produit une dénaturation?

A

le poduit du gène dnaA.

79
Q

Quels sont les origines de réplication des procaryotes?

A

ORIc

80
Q

Quels sont les complexes de reconnaissances des origines de réplication des eucaryotes?

A

ORC

81
Q

À quoi s’associe les ORC?

A

Aux ORIs et à des protéines pour recruté les hélicase (MCM).

82
Q

Combien de complexes protéiques possèdent les ORC?

A

6

83
Q

V/F Les procaryote ont plusieurs site de réplication.

A

Faux

84
Q

V/F La réplication chez les eucaryote et les procaryotes se fait dans les deux sens.

A

Vrai

85
Q

Quel processus de réplication de l’ADN est le plus lent les procaryotes ou les eucaryotes?

A

Les eucaryotes 50-100 nucléotides/sec par apport au procaryotes 500-1000 nucléotides/sec.

86
Q

Une photo présentant plusieurs bulles de réplication représentes quel type de cellule?

A

Eucaryotes.

87
Q

Quelle enzyme règle le problème de surenroulement?

A

Les Topoisomérase.

88
Q

Quels sont les avantages de l’utilisation d’amorce d’ARN?

A

Il peut facilement être reconnu comme non-ADN.

89
Q

V/F L’amorce est ajouté avec un contrôle qualité.

A

Faux

90
Q

Quel sont les enzymes de la réplication chez les procaryotes?

A

ADN polymérase I, II, III

91
Q

Que permet l’ADN polymérase I?

A

Répare ADN + synthèse 1 brin

92
Q

Que permet l’ADN polymérase II?

A

Réparation ADN

93
Q

Que permet l’ADN polymérase III?

A

Composant du réplicateur et enzyme principale de la réplication, assure l’élongation.

94
Q

Quel sont les enzymes de la réplication chez les eucaryotes?

A

ADN polymérase (alpha, béta…) min 4 et chez l’humain plus de 14.

95
Q

Que permet l’ADN polymérase béta?

A

réparation

96
Q

Que permet l’ADN polymérase gamma?

A

réplication ADN mitochondrial.

97
Q

De quelle manière se fait la synthèse du brin retardé?

A

Discontinu.

98
Q

Comment se nomme les fragments d’ADN du brin retardé?

A

Fragments d’Okazaki.

99
Q

La synthèse des amorces d’ARN est catalysée par quel enzyme chez les procaryotes?

A

La primase

100
Q

La synthèse des amorces d’ARN est catalysée par quel enzyme chez les eucaryotes?

A

Rnase H

101
Q

Par quelle enzyme sont relié les fragments d’Okazaki?

A

ADN ligase

102
Q

Quels sont les deux domaines de la Rnase H?

A

HBD et catalytique (H-domain)

103
Q

Que fait l’activité de la 3’-5’ exonucléase?

A

Quand il y a une synthèse lors de la réplication, la polymérase recule, enlève le nucléotide et reprend.

104
Q

V/F il y a plus d’erreur dans la synthèse de l’ARN que dans celle de l’ADN.

A

Vrai

105
Q

Comment termine la réplication de l’ADN chez le procaryotes?

A

En inhibant l’activité des hélicases du réplicateur.

106
Q

Où se termine la réplication de l’ADN chez les procaryotes?

A

Dans une zone opposée à l’origine de réplication, où il y a la fixation d’une protéine de fixation au terminateur (prot tus).

107
Q

Chez les eucaryotes, quand survient la terminaison de la réplication de l’ADN?

A

Lors de la rencontre des réplisomes de deux origines différentes.

108
Q

Comment est la structure de l’ADN des procaryotes?

A

Petit et circulaire.

109
Q

À quoi attribut-on la lenteur de la réplication de l’ADN chez les eucaryotes?

A

Au fait qu’il soit compacté sur la chromatine. (Histone)

110
Q

Que ce passe-t-il lors d’une accumulation de mutation?

A

Un cancer.

111
Q

Quels sont les voies de réparation de l’ADN?

A

BER, NER, NHEJ, HR

112
Q

Que corrige la réparation par excision de base (BER)?

A

Les lésions les plus fréquentes.

113
Q

Que corrige la réparation par excision de nucléotide (NER)?

A

La deuxième forme la plus fréquente. UV et radicaux libre.

114
Q

Que corrige la réparation par les jonctions des extrémités (NHEJ)?

A

Les cassures double-brin.

115
Q

Que corrige la réparation par les recombinaison homologue (HR)?

A

Les molécules d’ADN cassées.

116
Q

Que provoque les rayons UV sur l’ADN?

A

Une dimérisation des thymine qui empêche la réplication à cause d’une distorsion du brin matrice.

117
Q

Avec quoi répare-t-on l’ADN modifié par les rayon UV?

A

Photolyase qui se fixe sur l’ADN en face du dimère de thymine.

118
Q

Comment fonctionne la réparation par excision de base (BER)?

A

ADN glycosylase catalyse l’élimination de bases altérés par hydrolyse de la liaison N-glycosidique.

119
Q

Que forme la désamination hydrolytique de la cytosine?

A

L’uracile.

120
Q

Quel est le rôle de ku?

A

Recrutement des exonucléases et des polymérases qui font le rognage et l’allongement des brins.

121
Q

Comment fonctionne la réparation par jonction des extrémités non-homologue (NHEJ)?

A

ku, ADN ligase

122
Q

De quoi a-t-on besoin pour la recombinaison homologue?

A

d’un autre molécule d’ADN double brin homologue.

123
Q

Nomme moi un défaut de réparation.

A

Mutation de BRCA1/2.