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Biochimie > Réplication et réparation de l'ADN > Flashcards

Réplication et réparation de l'ADN Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qui est nécessaire pour les cellules filles après la division cellulaire ?

A

Une copie intacte et parfaite du génome

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Q

Quelles sont les grandes étapes (3) de la formation d’une protéine depuis l’ADN ?

A

La réplication, la transcription et la traduction

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3
Q

Est-ce que l’ADN a la capacité de se répliquer par lui-même ?

A

oui

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4
Q

Quels sont les rôles (2) de l’ADN ?

A

Maintenir de façon stable l’information génétique et transmettre le matériel génétique de façon fidèle aux cellules filles.

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5
Q

Pourquoi est-ce que la forme de double hélice de l’ADN est favorable pour assurer ses fonctions ? (3)

A

Permet de répliquer de façon fidèle, permet les mécanismes de réparation et permet le transfert de l’information à l’ARN.

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6
Q

La réplication de l’ADN est semi-conservative, conservative ou dispersive ?

A

Semi-concervative

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7
Q

Comment fonctionne la semi-conservativité de l’ADN ?

A

Le double brin est séparé en deux pour former deux matrices qui seront séparées pour former le matériel génétique des deux cellules filles. Pour chaque ADN, on a donc un brin de la cellule mère et un brin fille.

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8
Q

Comment a-t-on prouvé que la réplication de l’ADN était semi-conservative ?

A

Par la croissance de colonies E.coli qui trouvait leur azote que sous la forme d’azote N15. En remplaçant ensuite l’azote N15 par N14, on a pu déterminer en pesant le matériel générique, que la masse était un intermédiaire entre N14 et N15 50/50, indiquant la réplication semi-conservative. Plus de générations avec de moins en moins de N15 prouvent les résultats.

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9
Q

Dans quel sens est-ce que l’ADN polymérase polymérise l’ADN ?

A

5’ à 3’

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10
Q

Par quoi est-ce que la réplication de l’ADN est catalysé ?

A

Par les ADN polymérases

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11
Q

Qu’est-ce que les ADN polymérases nécessitent pour commencer la polymérisation ?

A

Une amorce d’ARN

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12
Q

Qu’est-ce que l’ADN polymérase assemble ?

A

Les désoxynucléotides A, T, C et G

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13
Q

Où se trouve l’origine de réplication chez les bactéries ?

A

Sur une séquence de nucléotides spécifiques : Oric

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14
Q

Où se trouve l’origine de réplication chez les eucaryotes complexes ?

A

Plutôt variable, semble dépendre plutôt de la structure de la chromatine (semble correspondre à des régions dépourvus de nucléosomes)

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15
Q

Qu’est-ce qu’une hélicase ?

A

Une enzyme séparant les deux brins d’ADN pour former la fourche de réplication.

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16
Q

Qu’est-ce que l’enzyme dnaA permet aux procaryotes ?

A

Elle s’attache à l’origine de réplication Oric, dénature de façon localisée la séquence pour permettre aux réplicateurs de s’attacher.

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17
Q

Dans quel sens est-ce que les procaryotes répliquent leur ADN/ARN ?

A

Les deux

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18
Q

Qu’est-ce que l’ORC ?

A

Le Complexe d’Origine de Réplication est un complexe protéine de 6 sous unités liant les origines de réplications en s’associant avec d’autres protéines pour recruter l’hélicase comme le MCM

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19
Q

Combien d’origine de réplication ont les procaryotes ?

A

une

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20
Q

Combien d’origine de réplication ont les eucaryotes ?

A

Plusieurs

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21
Q

Quel est l’avantage d’avoir plusieurs origines de réplication chez la cellule eucaryote ?

A

Augmenter la vitesse de réplication de l’ADN

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22
Q

Quel est le rôle de topoisomérase ?

A

Lorsque l’hélicase sépare les brins d’ADN, l’enzyme fait des torsions et du sur enroulement que la topoisomérase se charge de désenrouler. Elle coupe un brin, fait sa rotation et répare la coupure qu’elle a fait.

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23
Q

Quand est-ce que la réplication de l’ADN arrête chez les procaryotes ?

A

Quand les deux fourches de réplications se rencontrent.

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24
Q

Quel est le rôle de la primase ?

A

Ajouter l’amorce d’ARN nécessaire aux ADN polymérases.

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25
Q

Est-ce que l’amorce ajoutée par la primase subie un contrôle qualité et pourquoi ?

A

Non, parce qu’elle sera retirée par la suite

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26
Q

Quel ADN polymérase commence la polymérisation ?

A

ADN polymérase alpha

27
Q

Quel ADN polymérase remplace l’ADN polymérase alpha au cours de la polymérisation ?

A

ADN polymérase delta

28
Q

Comment appel-t-on le brin polymérisé dans la direction de la fourche de réplication ?

A

Le brin continu ou avancé

29
Q

Comment appel-t-on le brin polymérisé dans la direction inverse de la fourche de réplication ?

A

Le brin discontinu ou retardé

30
Q

Quelles sont les trois types d’ADN polymérase chez E.coli ?

A

1,2 et 3

31
Q

Quelle est la spécificité de l’ADN polymérase 1 ?

A

L’enzyme répare l’ADN et prend part à la synthèse de l’un des brins au cours de la réplication.

32
Q

Quelle est la spécificité de l’ADN polymérase 2 ?

A

Collabore à la réplication de l’ADN

33
Q

Quelle est la spécificité de l’ADN polymérase 3 ?

A

Composante clef du réplicateur et enzyme principale de la réplication de l’ADN, assure l’élongation de la chaîne au cours de sa réplication.

34
Q

Sachant qu’il existe énormément de types d’ADN polymérase chez les mammifères, quel est le rôle d’un grande partie d’entre eux ?

A

Réparer l’ADN

35
Q

Quel type de liaison y a-t-il entre les nucléotides et quel groupement sort pour former cette liaison ?

A

Phosphodiester, un groupement phosphate

36
Q

Comment appel-t-on les fragments discontinues de la synthèse discontinue du brin retardé ?

A

Les fragments d’Okazaki

37
Q

Que fait-on avec le brin retardé lorsque la fourche de réplication s’éloigne ?

A

On met une nouvelle amorce prêt de la fourche

38
Q

Quel est le rôle de la RNase H ?

A

Retirer les amorces d’ARN

39
Q

Comment fait la RNase H pour détecter les amorces d’ARN ?

A

Elle détecte la conformation du brin. La conformation ADN-ADN est différence de celle ADN-ARN.

40
Q

Comment fait-on pour boucher les intersections entre les fragments d’Okazaki ?

A

On utilise l’ADN polymérase delta pour boucher la majorité des trous.

41
Q

Comment fait-on pour lier la petite intersection (Nick) entre deux fragments d’Okazaki ?

A

Avec une enzyme nommée ADN ligase

42
Q

L’hybride ADN/ARN est reconnu par quel groupement de l’enzyme RNAse H ?

A

HBD

43
Q

Quel domaine de la RNAse H détruit l’amorce d’ARN ?

A

Le domaine H

44
Q

Est-ce que l’ADN subit un contrôle qualité ?

A

oui

45
Q

Comment est-ce que l’ADN polymérase peut corriger les erreurs de la réplication ?

A

L’ADN polymérase polymérise les nucléotides complémentaires au brin d’ADN matrice. Si elle a fait un erreur, elle devrait s’en rendre compte et la corrigée avec son domaine 3’-5’ exonucléase lui permettant de reculer pour enlever le nucléotide mal placé et mettre le bon.

46
Q

Qu’est-ce que le site de terminaison chez les procaryotes ?

A

Comme pour l’origine de réplication Oric, il y a un séquence de nucléotide à l’opposé de Oric signalant aux enzymes d’arrêter la réplication. Si elle n’était pas là, la réplication se ferait à l’infini !

47
Q

Est-ce que le sur enroulement chez les eucaryotes et procaryote est différent ?

A

oui

48
Q

Que se passe-t-il au niveau des histones concernant la réplication de l’ADN ?

A

Il faut enlever les histones pour permettre à l’ADN polymérase de passer. C’est une restriction structurelle que les procaryotes n’ont pas à se préoccuoper.

49
Q

Pourquoi est-ce que la production d’histone augmente durant la polymérisation d’un nouveau brin d’ADN ?

A

Il faut impacter le nouveau brin d’ADN, il faut donc beaucoup d’histones !

50
Q

Quelle est la seule macromolécule que la cellule peut réparer ? Pourquoi ?

A

L’ADN, si on réparait toutes les autres macromolécules, on utiliserait une quantité d’énergie énorme. À la place, on dégrade les protéines par exemple pour en former de nouvelles fonctionnelles. De plus, la stabilité de l’ADN est primordial à l’activité de toute la cellule comparer à d’autres macromolécules.

51
Q

Comment se forme un cancer ?

A

Un cancer se forme après plusieurs mutations sur le génome d’une même cellule.

52
Q

Pourquoi est-ce que l’altération de l’ADN est inévitable ? - Quels sont les trois causes d’altération de l’ADN ?

A

Les erreurs de l’ADN polymérase, le métabolisme cellulaire notamment les rejets oxygénés de la mitochondrie interagissent avec l’ADN et les agents environnementaux comme la lumières, agents chimiques ou radioactivité.

53
Q

Comment est-ce que la lumière peut causer des mutations génétiques sur l’ADN ?

A

Les rayons UV donnent juste assez d’énergie pour produire une liaison covalente entre deux molécules de thymine continues. Cette liaison rend la réplication de l’ADN impossible par la torsion qu’elle cause a la conformation.

54
Q

Quelle enzyme répare les dimères de thymine ?

A

L’ADN photolyase.

55
Q

Quel type d’énergie la photolyase utilise-t-elle pour réparer l’ADN ?

A

La lumière

56
Q

Comment fonctionne la réparation par excision de base (BER) ?

A

La DNA glyxosylase retire la base endommagée créant un site abasique. Elle va ensuite recruter une endonucléase qui coupe la liaison phosphodiester à la ribose abasique. L’ADN polymérase et ligase viennent réparer le trou.

57
Q

Qu’arrive-t-il fréquemment à la cytosine créant ainsi une erreur dans l’ADN ?

A

En contact avec l’eau, le solvant du corps humain, elle se transforme en uracile qui ne doit pas être présent dans l’ADN ?

58
Q

En quoi le changement cystéine - uracil est un problème ?

A

Lorsque l’on voudra répliquer l’ADN, la base complémentaire ne sera pas la bonne étant donné que la bas complémentaire de U n’est pas la même que C.

59
Q

Quelle enzyme se charge de retirer les groupements uracile sur l’ADN ?

A

L’uracile-ADN polymérase

60
Q

Comment se fait la réparation de l’ADN avec uracile ?

A

L’uracile-ADN glycosidase va détecter et retirer la base créant un site abasique. Elle va ensuite recruter une enzyme endonucléase pour couper la liaison phosphodiester. Finalement, l’ADN polymérase et ligase vont boucher le trou.

61
Q

Comment est-ce que la cellule répare un ADN double brin cassé ?

A

L’enzyme Ku recrute des exonucléases et des polymérases qui font le rognage et allongement des brins. L’ADN ligase finit la réparation.

62
Q

Comment fait on une recombinaison homologue ?

A

Les exonucléases vont enlever les nucléotides pour généré une extrémité qui pourra envahir le complexe de la chromatide sœur pour l’utiliser comme gabarit pour régénérer le bris.

63
Q

Qu’est-ce que BRCA 1/2 ?

A

C’est une enzyme permettant la recombinaison homologue des sous unités de l’ADN. Lorsqu’ils ne sont pas présent, à cause d’une mutation par exemple, il devient bien plus difficile de réparer l’ADN et l’individu devient bien plus sensible au cancer.

64
Q

Nommez en placez en ordre les 6 étapes de la réplication de l’ADN pour un organisme eucaryote.

A

1- fixation au complexe d’origine de réplication 2- formation de la fourche de réplication avec l’hélicase H 3- la primase met l’amorce 4- ADN polymérase catalyse la polymérisions 5- RNAse H retire l’amorce 6- ADN ligase ferme les Nicks

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