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Biochimie > Métabolisme des composés azotés > Flashcards

Métabolisme des composés azotés Flashcards

1
Q

Quelle est la source la plus importante d’azote pour l’homme ?

A

Le groupe amino des acides aminés

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Q

Qu’est-ce qu’une réaction de transamination ?

A

C’est la réaction qui permet de redistribuer les groupements NH2 pour synthétiser les différents acides aminés à partir des acides alpha cétoniques correspondant.

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3
Q

Décrivez la réaction inverse de la transamination ?

A

Réaction de catabolisme pour récupérer ces acides alpha cétoniques et obtenir de l’énergie.

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4
Q

Qu’est-ce que les réactions de transamination impliquent toujours ?

A

Un acide aminé donneur de groupement NH2 et un cétoacide comme receveur.

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5
Q

Par rapport au cétoacide et à l’acide aminé, que leurs arrivent-ils après une réaction de transamination ?

A

Le cétoacide devient un acide aminé alors que l’acide aminé devient un cétoacide.

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6
Q

Qu’est-ce que les transaminases utilisent comme coenzyme ?

A

Le pyridoxal-phosphate (dérivé de la vitamine B6)

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7
Q

Décrivez l’action du GPT.

A

Le glutamate donne un groupe amine à la pyruvate qui devient de l’alamine alors que le glutamate devient alpha-cétoglutarate.

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8
Q

Décrivez l’action du GOT.

A

Le glutamate donne un groupe amine à la OAA qui devient de l’asparatate alors que le glutamate devient alpha-cétoglutarate.

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9
Q

Décrivez la réaction de transamination générale.

A

alpha-cétoacide devient acide aminé alors que glutamate devient alpha-cétoglutarate.

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10
Q

Comment sont synthétisé la proline, lysine et thréonine ?

A

Par déshydrogénase

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11
Q

Que signifie acide aminé essentiel et combien sont-ils ?

A

Ce sont des acides aminés que le corps n’arrive pas ou en trop petite quantité à synthétiser. 10

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12
Q

Les acides aminés sont formé à partir…

A

d’intermédiaires de la glycolyse, du cycle de Krebs et de la voie des pentoses phosphates.

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13
Q

D’où provient habituellement le groupement amino ?

A

Du glutamate ou de la glutamine.

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14
Q

Quels sont les acides aminés essentiels ?

A

MET, LEU, VAL, LYS, ILE, PHE, TRY, HIS, THR

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15
Q

Pourquoi est-ce que l’arginine est considérée comme un acide aminé essentiel ?

A

Parce que les humains n’arrivent pas a en synthétiser suffisamment.

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16
Q

Pourquoi est-ce que la méthionine est considérée comme une acide aminé essentiel ?

A

Parce qu’elle est requise pour la synthèse de la cystéine, phénylalanine et tyrosine.

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17
Q

Décrivez l’action de l’asparagine synthétase.

A

La glutamine donne son groupement amine avec l’action d’une molécule d’ATP à l’aspartate qui devient asparagine alors que glutamine devient glutamate.

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18
Q

Décrivez la genèse de la serine.

A

3-phosphoglycérate, un intermédiaire de la glycolyse, donne un atome d’hydrogène à NAD+ qui devient NADH pour devenir 3-phospho-hydroxypyruvate. Il reçoit ensuite un groupement amine du glutamate. Finalement, le groupement phosphate se détache pour former la sérine.

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19
Q

La sérine est essentielle pour la synthèse de quels acides aminés (2) ?

A

Glycine, cystéine

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20
Q

Comment se forme la glycine ?

A

À partir de la sérine, le THF lui prend un atome de carbone.

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21
Q

Qu’est-ce qu’une déficience en PAH cause ?

A

Une maladie génétique nommé phénylcétonurie = retardement mental

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22
Q

Est-ce que la phénylcétonurie est diagnostiquée avec un dépistage néonatal systématique ?

A

oui

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23
Q

Comment forme-t-on la tyrosine ?

A

À partir de phénylalanine dont l’enzyme est la phénylalanine hydrosylase

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24
Q

Quels sont les trois pyrimidines ?

A

Cytosine, thymine et uracil.Q

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25
Q

Quels sont les deux purines ?

A

Adénine et guanine

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26
Q

De quoi est composé un nucléotide ?

A

Un nucléotide est composé par une base azotée liée par une liaison glycosidique au ribose qui est phosphorylé à la position 5’.

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27
Q

Pourquoi n’y a-t-il pas vraiment de réel besoin alimentaire pour des purine et pyrimidine ?

A

Parce que l’on recycle celles que l’on a déjà

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28
Q

Lors de la synthèse de novo acides nucléiques, qu’est-ce qui est utilisé ?

A

Des acides aminés et des sucres

29
Q

Qu’est-ce que le phosphoribosyl-1-pyrophosphate ?

A

Formé à partir d’une ribose du cycle des pentoses phosphates, elle est synthétisée par la PRPP synthétase. Elle est essentielle a la récupération et la synthèse des novo des acides nucléiques.

30
Q

Qu’est-ce qui inhibe le PRPP synthétase ?

A

Les purines et les pyrimidines.

31
Q

Combien d’étapes, avec combien d’ATP et quel substance connexe est générée avec la synthèse des purines ?

A

11 étapes, 6 ATP, IMP

32
Q

Combien d’étapes, avec combien d’ATP et quel substance connexe est générée avec la synthèse des pyrimidines ?

A

6 étapes, 2 ATP, UMP

33
Q

De quoi est-ce que l’AMP et le GMP dérivent ?

A

De l’IMP

34
Q

Comment se forme l’IMP ?

A

Par assemblage de la base purique sur une molécule de ribose-5’-phosphate activé en utilisant la glutamine, la glycine, l’aspartate, le bicarbonate et des groupements formyles

35
Q

De quoi a-t-on besoin pour produire l’UMP ?

A

De glutamine, aspartate et bicarbonate.

36
Q

Comment forme-t-on le CTP à partir d’UMP ?

A

L’UMP est phosphorylé en UDP, puis en UTP par les kinases. La CTP synthase catalyse l’amination de l’UTP en CTP

37
Q

Quels sont les principales différences en entre la fabrication des purines et pyrimidines

A

Sur PRPP vs base avant et après conjugaison au PRPP. DGQ vs DQ. FTH et HCO3- vs HCO3-. 6 ATP vs 2 ATP.

38
Q

Quel est la relation entre les pyrimidines de novo et la mitochondrie ?

A

Une étape de sa synthèse se fait dans la mithocondrie.

39
Q

Quels sont les deux enzymes responsables de la récupération (salvage) des purines ?

A

1- APRT convertit l’adénine en AMP 2- (HGPRT) converti l’hypoxanthine en IMP et guanine en GMP.

40
Q

Quels sont les rapports de la formation de nouveaux acides nucléiques entre la synthèse de novo contre la récupération ?

A

10% vs 90%

41
Q

Qu’est-ce que le syndrome de Lesh-Nyhan ?

A

La déficience de HGPRT qui cause un retard mental et l’automutilation

42
Q

Quel est la différence structurelle entre l’ADN et l’ARN ?

A

La présence de ribose et la présence de thymine

43
Q

Comment forme-t-on les dNTPs ?

A

Par la conversion de NTPs avec la ribonucléotide réductase de classe 1 pour les mammifères. On utilise le NADPH comme source de pouvoir réducteur.

44
Q

Par quoi est régulé la production de dNTPs ?

A

dATP (-) inhibe et ATP (+) catalyse

45
Q

Comment se forme la thymine ?

A

À partir d’UMP et de l’enzyme et de thymidylate synthétase. L’enzyme fait la méthylation de dUMP pour produire dTMP. On utilise el THF comme source de carbone en le transformant en DHF. LE DHDFR permet la régénération du cofacteur THF.

46
Q

Qu’est-ce que le méthotrexate ?

A

Un inhibiteur de DHDFR qui agit contre le cancer.

47
Q

Lorsque les purines ne peuvent pas être récupérée elles produisent de…

A

l’acide urique

48
Q

Lorsque les pyrymidines ne peuvent pas être récupérée elles produisent de…

A

la bêta alanine

49
Q

Qu’est-ce que la maladie de la goutte ?

A

C’est l’accumulation d’acide urique dans les articulation. Elle se soigne avec des médicaments ou la diète = boire du lait comme source de protéine.

50
Q

Comment est-ce que les bactéries se débarrassent de l’ammoniac ?

A

Ils le catabolisent en NH2, nitrites et nitrates avec production d’énergie.

51
Q

Comment est-ce que les poissons se débarrassent de l’ammoniac ?

A

Ils l’urinent directement

52
Q

Comment est-ce que les mamifères et poissons cartilagineux se débarrassent de l’ammoniac ?

A

En le transformant en urée 80% et puis l’urinant

53
Q

Comment est-ce que les oiseaux, insectes et reptiles terrestres se débarrassent de l’ammoniac ?

A

En le transformant en acide urique

54
Q

À partir des acides aminés, comment évacue-t-on l’ammoniac ?

A

1- On détache les groupements d’ammoniac et on récupère la chaîne carbonée pour l’énergie. 2- L’ammoniac est produit dans les reins et éliminé dans le foie pour nous protéger de sa toxicité.

55
Q

Qu’arrive-t-il à l’ammoniac produit dans d’autres tissus que les reins (sauf musculaire)?

A

Il est transporté au foie sous forme de glutamate (tissus non musculaire)

56
Q

Comment se débarrasse-t-on de l’ammoniac lorsqu’il est produit dans les tissus musculaires ?

A

Il est d’abord concentré en glutamate puis transféré à l’alanine pour le transport au foie. Au foie, le regroupement NH2 est retransféré au glutamate et au cycle de l’urée.

57
Q

Durant le cycle de l’urée, combien de réactions sont faites dans le foie ?

A

4

58
Q

Combien d’atomes d’azotes sont éliminés par tour ?

A

2

59
Q

Combien et quels liaisons sont consommés dans le cycle de l’urée ?

A

4 liaisons riches en énergie et 2 atomes d’azote

60
Q

Le cycle de l’urée s’associe avec le cycle de l’acide citrique via quelles composantes ?

A

fumarate (directe), oxaloacétate et l’alpha-cétoglutarate (indirecte, via aspartate)

61
Q

L’activité du cycle de l’urée est contrôle par quelle réaction qui est elle même régulée par quelle enzyme ?

A

La CPS, n-acétylglutamate

62
Q

Comment le n-acétylglutamate se frome-t-il ?

A

Il est fait à partir du glutamate et acétyl-CoA par la NAG synthase, une enzyme activée par glutamate et arginine.

63
Q

Quels sont les effets neurotoxiques de l’ammoniac ?

A

Augmentation du pH sanguin et stimulation du récepteur NMDA. Aussi, pour se défendre, les cellules du cerveau vont transformer l’ammoniac en glutamate déshydrogénase entraînant une perte dans le cerveau d’alpha cétoglutarate. Cela entraîne une chute d’OAA et finalement un arrêt du cycle de Krebs.

64
Q

Pourquoi est-ce que l’augmentation de glutamate dans le cerveau est problématique ?

A

Le glutamate se transforme en glutamine et ainsi vide les réserve de glutamate qui est nécessaire pour les neurotransmetteurs et puisqu’il est un précurseur de la synthèse gamma-aminobutyrate, GABA, un autre neurotransmetteur.

65
Q

Pourquoi est-ce que l’ammoniac peut provoquer un œdème cérébral.

A

Parce que les cellules gliales utilisent le glutamine pour contrôler leur volume et ainsi ils explosent créant un oedème.

66
Q

Qu’est-ce que les acides aminés glycogéniques ?

A

Produisent pyruvate ou des intermédiaires du cycle de krebs et s’il n’y a pas de glucose ils peuvent produire la glucogénèse.

67
Q

Qu’est-ce que les acides aminés cétogéniques ?

A

Produisent des corps cétoniques

68
Q

Qu’est-ce que les acides aminés amphiboliques ?

A

lorsqu’ils sont à la fois glucoformateurs et cétogéniques

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