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Génétique moléculaire > Réplication de l'ADN > Flashcards

Réplication de l'ADN Flashcards

1
Q

Vrai ou faux. Toutes les cellules du corps humain ont le même code génétique.

A

Vrai

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Q

Combien il y a-t-il environ de cellules dans le corps humain?

A

50-75 milliards

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3
Q

Quel type d’ADN sert de moule pour le brin fille complémentaire?

A

L’ADN mère

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4
Q

Quels sont les 4 critères de la réplication de l’ADN?

A
  • Complexe - plusieurs protéines impliquées
  • Hautement spécialisée
  • Vitesse impressionnante
  • Fidélité quasi parfaite
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Q

Quelles sont les 2 choses principales que nécessite la réplication de l’ADN?

A

dNTP et jonction amorce:matrice

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6
Q

Quel est le rôle de l’ADN polymérase?

A

L’appariement correct des bases

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7
Q

À quoi compare-t-on l’ADN polymérase?

A

À une main

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8
Q

Que contient la paume de la main de l’ADN polymérase?

A

2 ions métalliques divalents qui modifient l’environnement chimique du 3’OH et du dNTP

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9
Q

Quels sont les rôles des ions métalliques de l’ADN polymérase?

A

Un des ions réduit le 3’OH en 3’O- et l’autre stabilise les phosphates β et γ

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10
Q

Quel est le rôle des exonucléases?

A

Excise les nucléotides mal appariés dans l’ADN polymérase

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11
Q

Comment fonctionne le mécanisme de l’exonucléase?

A
  1. Synthèse d’ADN lente ou nulle
  2. Excision des nucléotides mal appariés
  3. Reprise de la synthèse de l’ADN.
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12
Q

Quel est l’effet des mésappariements des paires de base dans l’ADN polymérase?

A

Ils ralentissent la catalyse et vont diminuer l’affinité de l’ADN polymérase pour la jonction amorce:matrice, l’amorce sort du site actif et se lie à l’exonucléase et l’ADN mésapparié est enlevé.

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13
Q

Quel est le rôle des doigts de la main de l’ADN polymérase?

A

Lors d’un appariment correct, les doigts se referment sur le dNTP, rapprochant le nucléotide des ions métalliques et augmentant la vitesse de catalyse

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14
Q

Pourquoi les doigts de la main induisent une rotation de 90 degrés entre la première et la deuxième base de la matrice ?

A

Cela empêche tout apparement d’un dNTP avec la deuxième base.

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15
Q

Quel est le rôle du pouce de l’ADN polymérase?

A

Il maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale et il permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat.

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16
Q

Vrai ou faux. Le pouce aide à la catalyse

A

Faux

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17
Q

Qu’est-ce que l’ADN polymérase processive?

A

À chaque liaison à son substrat, l’ADN polymérase catalyse l’ajout de plusieurs nucléotides

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18
Q

Quel est l’étape limitante à la réaction avec l’ADN polymérase?

A

La liaison de la polymérase à sa jonction amorce:matrice.

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19
Q

Comment se nomme l’endroit où l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaire?

A

La fourche de réplication

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20
Q

Vrai ou faux. Dans la cellule, les 2 brins d’ADN ne sont pas répliqués simultanément.

A

Faux, ils le sont.

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21
Q

Qu’est-ce que le fragment d’Okazaki?

A

Les fragments d’Okazaki sont de courts segments d’ADN synthétisés de manière discontinue sur le brin retardé lors de la réplication de l’ADN.

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22
Q

Pourquoi existe-t-il des fragments d’Okazaki?

A

Lors de la réplication de l’ADN, l’enzyme ADN polymérase ne peut ajouter des nucléotides que dans la direction 5’ → 3’. Or, comme l’ADN est antiparallèle, un des brins (le brin avancé) est synthétisé de manière continue, tandis que l’autre (le brin retardé) doit être synthétisé en petits fragments, appelés fragments d’Okazaki.

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23
Q

Qu’est-ce que la primase?

A

Elle ajoute une amorce d’ARN sur le brin retardé pourque l’ADN polymérase puisse synthétiser un fragment d’Okazaki

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24
Q

Vrai ou faux. L’ARN polymérase utilise la primase pour fabriquer des amorces longues sur la matrice monocaténaire.

A

Faux, ce sont des courtes.

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25
Quel est le rôle de RNase H dans l'élimination des amorces d'ARN?
Dégrade spécifiquement les ARN appariés à l'ADN et enlève tout sauf le dernier nucléotide.
26
Quel est le rôle de l'exonucléase 5' dans la dégradation des amorces d'ARN?
Il enlève le dernier ribonucléotide.
27
Quel est le rôle de l'ADN polymérase dans la dégradation des amorces d'ARN?
Elle remplit la brèche créée.
28
Quel est le rôle de l'ADN ligase dans la dégradation des amorces d'ARN?
Elle répare la césure.
29
Quel est le rôle de l'hélicase?
Elles cassent les liaisons hydrogènes entres les bases azotées de l'ADN permettant aux brins de se séparer.
30
Quel source d'énergie utilise l'hélicase?
ATP
31
Vrai ou faux. L'hélicase est un hexamère sous forme d'anneau
Vrai
32
Quel est le rôle des SSB?
Ce sont des protéines se liant sur l'ADN simple brin pour la stabiliser. Elle empêche le réappariment, la dégradation et la formation de boucles.
33
Que veut-on dire par "liaison coopérative" pour la SSB?
La liaison d'une SSB facilite la liaison d'une autrs SSB
34
Quel est le rôle des topoisomérases?
Elles coupent l'ADN et font passer les brins dans la coupure et élimine donc le surrenroulement généré par l'hélicase.
35
Vrai ou faux. L'ADN polymérase peut seulement allonger le 3'OH d'une amorce appariée à une matrice monocaténaire.
Vrai
36
Quels sont les rôles de Pol α/primase?
Initiation des brins neufs Primase fait l'amorce Pol α commence la réplication
37
Quels sont les rôles de Pol δ et ε?
Prennent le relais de pol α Pol δ – Brin discontinu Pol ε – Brin continu
38
Que veut-on dire par processivité d'une enzyme?
C'est la capacité d'une enzyme à ajouter des nucléotides successifs sans se détacher du brin d'ADN.
39
Quels sont les processivités de Pol α/primase et de Pol δ et ε?
Pol α/primase - Processivité faible Pol δ et ε - Processivité élevée
40
Qu'est-ce que l'anneau coulissant?
C'est une protéine qui augmente la processivité en se liant fortement à l'ADN polymérase et qui encercle la double hélice.
41
Aux combiens de pb se détache l'ADN polymérase?
À toutes les 20-100 pb.
42
Sous quelle condition l'ADN polymérase a une forte affinité avec l'anneau coulissant?
Si l'ADN polymérase est dans une jonction amorce:matrice.
43
Vrai ou faux. Si l'ADN polymérase se détache, l'anneau coulissant reste avec elle.
Faux, l'anneau coulissant reste pour recruter d'autres protéines.
44
Qu'est-ce qui témoigne de l'importance des anneaux coulissant?
Ils sont retrouvés chez les procaryotes, les eucaryotes et les virus et leur fonction et structure est conservée chez chaque espèce.
45
Comment sont placés les anneaux coulissants?
Déposés sur l'ADN par des poseurs d'anneaux coulissants à chaque jonction amorce:matrice
46
De quoi est composé l'holoenzyme?
Protéine t, noyau de l'ADN pol III, domaine flexible, complexe y (poseur d'anneaux coulissants) et anneau coulissant.
47
Quels sont les étapes du fonctionnement de l'holoenzyme ?
1. Une amorce ARN commence un nouveau fragment d'Okasaki 2. La polymérase du brin disconstinu prolonge le fragment d'Okazaki précédent 3. Une fois que le fragment d'Okazaki est complet, l'ADN polymérase quitte l'ADN et l'anneau coulissant et la primase se détache. 4. Un anneau coulissant est déposé au niveau de la nouvelle amorce ARN. 5. L'ADN polymérase se lie au nouvel anneau coulissant et commence une nouvelle synthèse d'ADN.
48
Qu'est-ce que le réplisome?
Le réplisome est un complexe multiprotéique qui assure la réplication de l’ADN de manière coordonnée et efficace.
49
De quoi est composé le réplisome?
De l'hélicase, qui se lie via les sous-unité tau, et de la primase qui se lie faiblement à l'hélicase à toutes les secondes.
50
Comment est formé initialement une fourche de réplication?
La double hélice est ouverte pour fixer l'hélicase (au niveau inerne des chromosomes)
51
Où débute la réplication?
À l'origine de réplication
52
Vrai ou faux. Le nombre d'origine de réplication varie selon les espèces.
Vrai.
53
Vrai ou faux. Il y a un seul origine de réplication par chromosome.
Faux, il peut y en avoir une à plusieurs selon les espèces.
54
Quelles sont les 2 composantes de l'initiation?
Le réplicateur et l'initiateur
55
Qu'est-ce que le réplicateur?
Séquence d'ADN suffisante pour l'initiation de la réplication, inclus des séquences de fixation de l'initiateur et des séquences facilement déroulées (A/T riche)
56
Qu'est-ce que l'initiateur?
Protéine qui reconnaît spécifiquement une séquence du réplicateur, active l'initiation de la réplication.
57
Quels sont les rôles de l'initiateur?
Lient l'ADN aux réplicateurs, recrutent les protéines nécessaires à l'initiation de la réplication et déforment ou dénaturent parfois la région adjacente à leur site de liaison.
58
Quels sont les 2 évènements qui inicient la réplication chez les eucaryotes?
La sélection des réplicateurs et activation des origines de réplication.
59
Que se passe-t-il lors de la sélection des réplicateurs?
Se passe en phase G1, identifie les séquences qui dirigent l'initiation et assemblage d'un complexe de protéines sur chaque réplicateur.
60
Que se passe-t-il lors de l'activation des origines de réplication?
En phase S, sépare des brins aux réplicateurs et recrute les ADN polymérase.
61
Comment se forme le préréplicatif (pre-RC)?
Reconnaissance du réplicateur par l'initiateur (ORC), ORC recrute 2 poseurs d'hélicases (Cdc6 et Cdt1) et ce complexe recrute l'ADN hélicase.
62
L'assemblage des fourches se fait à quelle phase de la division cellulaire?
À l'entrée de la phase S
63
Comment se fait l'assemblage des fourches?
Par la phosphorylation des pre-RC et d'autre protéines par Cdk et Ddk et recrutement des ADN polymérase.
64
Que se passe-t-il si l'activité de Cdk est basse?
La formation de pré-RC est possible mais elle ne sera pas activée.
65
Que se passe-t-il si l'activité de Cdk est élevée?
La formation de nouveau pré-RC est impossible, mais les pré-RC déjà positionnés sont activés.
66
Que doit-on faire pour avoir un chromosome linéaire?
Sur le brin discontinu, on doit enlever les amorces d'ARN. Possède quelques nucléotides seulement.
67
Qu'est-ce qu'un télomère?
Les extrémités des chromosomes, ce sont des séquences courtes répétées des milliers de fois
68
Quelle séquence de télomère est répétée chez l'humain?
5'TTAGGG
69
Quelle structure les télomères recrutent-elles?
Télomérases.
70
Qu'est-ce qu'une télomérase?
ADN polymérase qui n'a pas besoin de matrice exogène. Elle alonge l'extrémité 3'
71
Que contient une télomérase?
Un ribonucléoprotéine (ARN qui sert de matrice) qui forme une fonction amorce:matrice pour la TERT. TERT : Sous-unité catalytique, réverse transcriptase et rétro-transcrit l'ARN en ADN.
72
Quelles sont les étapes de l'extension des télomères?
1. La télomérase allonge l'extrémité 3' du télomère 2. L'extension 3' sert de matrice pour la synthèse d'un nouveau fragment d'Okazaki 3. Réparation du fragment d'Okazaki 4. Extension du télomère en conservant un dépassement en 3'
73
Quelle protéine inhibe la télomérase?
Les protéines liants l'ADNdb télomérique.
74
Vrai ou faux. Plus il y a de protéins lian l'ADNdb télomérique, plus la télomérase est inhibée.
Vrai
75
Qu'est-ce qu'une boucle T?
Structure formée aux extrémités des chromosomes linéaires, au niveau des télomères. Elle joue un rôle crucial dans la protection de l’ADN télomérique contre la dégradation et la fusion avec d’autres chromosomes.
76
Comment se forme une boucle T?
1. Les télomères sont constitués de séquences répétées riches en guanine (ex. : TTAGGG chez l’humain). 2. La partie simple brin de l’extrémité 3’ des télomères se replie sur elle-même, formant une structure en boucle. 3. La boucle est stabilisée par des protéines spécifiques du complexe Shelterin, notamment la protéine TRF2, qui empêche la reconnaissance de l’extrémité télomérique comme une cassure de l’ADN.
77

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