Chromatine et nucléosomes Flashcards
1
Q
Vrai ou faux. Dans la cellule, l’ADN est associé à des protéines.
A
Faux.
2
Q
Quels sont les rôles de l’empaquetage de l’ADN en chromosome?
A
- Donne une forme compacte à l’ADN.
- Protège de certaines altérations
- Transmis de façon efficace aux 2 cellules filles quand la cellule se divise.
- Confère une organisation générale particulière à chaque molécule d’ADN : gouverne l’expression des gènes et la recombinaison
3
Q
Comment se nomment les complexes d’ADN associés à ses protéines dans les cellules eucaryotes?
A
Chromatine
4
Q
Qu’est-ce qu’une histone?
A
protéine essentielle dans la structure et la régulation de l’ADN dans les cellules eucaryotes.
5
Q
Quel est le rôle de l’histone?
A
Compaction de l’ADN
6
Q
Combien de pb par jeu haploïde de chromosomes contient la cellule humaine?
A
3 x 10^9 pb
7
Q
Quel est l’espace moyen entre chaque pb d’un jeu haploïde de chromosomes?
A
0,34 nm
8
Q
Qu’est-ce que la première compaction de l’ADN?
A
Association d’histones régulièrement disposées le long de l’ADN pour former des nucléosomes.
9
Q
Quelle est la conséquence de la formation des nucléosomes?
A
Réduit jusqu’à 10 000 fois la longueur d’une molécule d’ADN et limite son accessibilité
10
Q
Par qui se fait le remaniement local de certains nucléosomes et que cela permet-il?
A
C’est effectué par des enzymes qui modifient et remodèlent les nucléosomes et cela permet à des régions spécifiqus de l’ADN d’intéragir avec d’autres protéines.
11
Q
Vrai ou faux. Les chromosomes peuvent être ciruclaires ou linéaires.
A
Vrai, il a longtemps été considéré que les cellules procaryotes possédaient un unique chromosome circulaire et que les cellules eucaryites renfermaient plusieurs chromosomes linéaires, mais au sait aujourd’hui que c’est faux.
12
Q
Quelle espèce a exceptionnellement plusieurs milliers de chromosomes?
A
macronoyau protozoaire Tetrahymena.
13
Q
Combien de chromosomes possède le macronoyau du protozoaire Tetrahymena thermophila?
A
225, et le nombre de copies par chromosomes varie entre 10 et 10 000.
14
Q
Vrai ou faux. Le nombre de chromosomes dans une cellule varie constamment.
A
Faux, c’est maintenu constant.
15
Q
Combien de copies complète de leurs chromosomes possèdent généralemet les cellules procaryotes?
A
Une seule
16
Q
Vrai ou faux. Les cellules procaryotes ont des plasmides.
A
Vrai
17
Q
Dans quoi sont empaquetés les copies de chromosomes dans les cellules procaryotes?
A
Dans les nucléoïdes.
18
Q
Quelle est la composition d’un nucléoïde?
A
60% ADN et 40% ARN/protéines.
19
Q
Qu’est-ce qu’un plasmide?
A
Petits ADN circulaires qui ne sont généralement pas essentiels à la bactérie.
20
Q
Quelle caractéristique utile confère les plasmides aux bactéries?
A
Résistance aux antibiotiques.
21
Q
Comment nomme-t-on 2 copies d’un chromosome?
A
Homologues
22
Q
Qu’est-ce que le mégacaryocyte?
A
C’est un polyploïde spécialisée (cellule géante) de la moelle hématopoïétique.
23
Q
Combien de copies de chaque chromosome possède le mégacaryocyte?
A
28
24
Q
Quel est le rôle des mégacaryocytes?
A
Responsable production plaquettes sanguines dépourvues
de chromosomes
(cytoplasme se fragmente en milliers de plaquettes sanguines
= thrombopoïèse = en 4 à 5 jours).
25
Vrai ou faux. En devenant polyploïdes, les mégacaryocytes diminuent leur niveau d'activité métabolique.
Faux. Elles maintiennent une niveau d'activité métabolique très élevée.
26
Vrai ou faux. La taille du génome corrèle parfaitement avec la complexité de l'organisme.
Faux
27
Vrai ou faux. Le nombre de gènes corrèle parfaitement avec la complexité d'un organisme.
Vrai.
28
Pour quoi code le génome d'E. coli?
Pour des protéines ou ARN non-codants essentiels (ARNm et ARNt)
29
À quoi sont dédiés la majorité des séquences non-codantes d'E.coli?
À la régulation de la transcription génique.
30
Qu'est-ce qu'un opéron?
C'est un site d'initiation de la transcription souvent utilisé pour contrôler l'expression de plusieurs gènes.
31
Vrai ou faux. Les organismes les plus complexes ont une densité génique plus faible.
Vrai.
32
Qu'est-ce que la densité génique?
Nombre de gènes par mégabase (1 000 000 pb) de l'ADN génomique.
33
Qu'est-ce que le Saccharomyces cerevisiae?
C'est un eucaryote unicellulaire simple avec une densité génique près de celle des eucaryotes.
34
Pourquoi la densité génique est-elle plus faible chez les eucaryotes?
La taille des gènes augmente et c'est aussi le cas pour les séquences d'ADN entre les gènes (régions intergéniques)
35
Vrai ou faux. Les gènes sont une grande partie de l'ADN des chromosomes eucaryotes.
Faux, ce n'est qu'une petite partie.
36
Pourquoi les gènes codants les protéines portent souvent des régions codantes discontinues chez les eucaryotes?
Parce que les gènes sont fragmentés par des introns qui sont éliminés de l'ARN après la transcription par épissage de l'ARN.
37
Quelle est la proportion de la région codante d'un gène chez l'humain?
1,3 kb pour un total de 27kb (taille moyenne d'un gène humain)
38
Vrai ou faux. Moins il y a d'introns, plus la densité géniques est grande chez les eucaryotes.
Vrai.
39
Que contient le génome humain outre les introns et les régions codantes?
Des séquences inergéniques
40
Que font les séquences intergéniques?
Elles sont responsables de la diminution de la densité génique. Ce sont des régions qui ne codent ni des gènes ni des ARN non-codants. Correspond à 60% de tout le génome humain.
41
Quels sont les 2 types de séquences intergéniques?
Les séquences répétées et les séquences uniques (régulatrices)
42
Quel est le pourcentage de gènes dans le génome humain?
1,5%
43
Qu'est-ce qu'un pseudogène?
Un pseudogène est une séquence d’ADN qui ressemble à un gène fonctionnel mais qui a perdu sa capacité à coder une protéine en raison de mutations.
44
Comment sont formés les pseudogènes complexes?
Une enzyme virale, la transcriptase inverse (Ti), copie l'ARNm cellulaires en ADNc lors d'une infection qui peut s'intégrer au génome de l'hôte
45
Pourquoi les pseudogènes ne sont-ils pas exprimés?
Parce qu'ils sont dépourvus de séquences régulatrices initiatruces de la transcription.
46
Vrai ou faux. Environ 50% du génome humain est composé de séquences d'ADN qui se répètent de nombreuses fois.
Vrai.
47
Qu'est-ce que l'ADN microsatellite?
Séquences de très petite taille (moins de 13pb) répétés en tandem
48
Quel est le type d'ADN microsatellite le plus commun?
La répétition de dinucléotides provenant de la difficulté rencontrée par la polymérase lors de la duplication de l'ADN.
49
Quelle est la proportion d'ADN microsatellite dans le génome humain?
3 à 5 %
50
Qu'est-ce que l'ADN répétée dispersées.
Ce sont des séquences plus grandes que l'ADN microsatellites (plus de 100pb)
51
Comment l'ADN répétée dispersées est placée dans le génome?
En simple copies dispersées sur l'ensemble du génome ou regroupées en plusieurs copies légèrements espacées
52
D'où proviennent les séquences d'ADN répétées dispersées?
D'éléments transposables.
53
Quelle est la proportion de séquences d'ADN répétées dispersées dans le génome humain?
45%
54
Qu'est-ce que l'ADN minisatellite?
Séquences de taille intermédiaire (10-60pb) généralement riche en GC et répétés en tandem
55
Vrai ou faux. L'ADN minisatellite est très stable.
Faux. Le taux de mutation est très élevée donc très instable.
56
Qu'est-ce qu'un transposon?
Séquences qui peuvent sauter d'un emplcameent à un autre du génome (transposition)
57
Vrai ou faux. Un transposon laisse la copie originale à son site initiale.
Vrai
58
Par qui ont été découvert les éléments transposables?
Par Barbara McClintock
59
Vrai ou faux. On retrouve souvent des éléments transposables dans les cellules humaines.
Faux, c'est rare.
60
Retrouve-t-on des séquences intergéniques ailleurs que dans le génome humain?
Oui, on peut en retrouver chez les végétaux et les bactéries.
61
Quel est le rôle des séquences intergéniques?
Pourrait conférer un avantage sélectif à l'organisme qui le contient.
62
Que retrouve-t-on dans l'ADN des chromosomes eucaryotes qui ne sont pas des gènes ni des séquences régulatrices?
Origines de réplication, centromères et télomères.
63
Quel est le rôle de l'origine de réplication?
Dirigent la réplication de l'ADN chromosomique
64
Quel est le rôle des centromères?
Orientent la ségrégation des chromosomes entre 2 cellules filles.
65
Quel est le rôle des télomères?
Protègent et répliques les extrémités des chromosomes linéaires
66
Combien il y a-t-il d'origines de réplication chez les eucaryotes et les procaryotes?
Eucaryotes : 1 site/30 ou 40 kb
Procaryotes : 1 seul site
67
Qu'est-ce qu'un kinétochore?
Complexe protéique très élaboré.
68
Qui guide la formation des kinétochores?
Le centromère
69
Que sont les microtubules?
Structures cylindriques creuses constituées de tubuline, une protéine globulaire.
70
Quel est le rôle des microtubules?
Séparent les 2 copies de chromosomes.
71
Vrai ou faux. Chaque centromère porte un kinétochore qui intéragit avec 20 à 40 microtubules.
Vrai
72
Quelles sont les 2 régions des kinétochores?
Région externe (intéragit avec les microtubules) et région interne (étroitement associé à l'ADN)
73
De combien de protéines différentes sont constitués les kinétochores?
Au moins 45
74
Qu'est-ce que le fuseau mitotique?
Le fuseau mitotique est une structure dynamique formée principalement de microtubules, qui permet la séparation des chromosomes lors de la mitose et de la méiose.
75
Quelles sont les 2 protéines qui génèrent la force pour déplacer les chromosomes lors de la mitose?
La dynéine et la kinésine
76
Quelle protéine contrôle l'attachement des microtubules et la tension entr eles kinétochores soeurs?
MAD2
77
Qu'est-ce que le point de contrôle tubulaire?
Empêche l'anaphase tant que tous les chromosomes ne sont pas attachés au microtubules (fuseau mitotique).
78
Que se passerait-il s'il n'y avais pas de centromères?
Les chromosomes répliqués se répartieraient de manière aléatoire.
79
Pourquoi est-ce problématique s'il y a plusieurs centromères?
Cela devient problématique si les kinétochores du même chromosome attachés à des filaments se dirigent dans des direction opposées, cassant les chromosomes.
80
Vrai ou faux. La taille et la composiion du centromère varient selon les organismes.
Vrai. Plus petit chez les eucaryotes simples et plus grand chez les eucaryotes complexes.
81
Quelles sont les 2 fonctions importantes des protéines recrutées par les télomères?
1. Rôle de protection. Les protéines vont reconnaître l'extrémité naturelle du chromosome et la distinguer des sites potentiels de cassure de l'ADN et les extrémités libres d'ADN sont des sites pour la recombinaison et la dégradation. Les télomères protègent contre cess 2 processus.
2. Les télomères possèdent des origines de réplication spécialisées qui permettent à la cellule de répliquer les extrémités de ces chromosome, recrutant la télomérase.
82
Quelle est la grosse différence entre un télomère et l'ensemble restante du chromosome?
Une portion du télomère est un simple brin riche en TG
83
Vrai ou faux. La taille du télomère augmente avec l'âge.
Faux, elle décroit.
84
Vrai ou faux. La duplication et la ségrégation des chromosomes eucaryotes ont lieu à des phases distinctes du cycle cellulaire.
Vrai.
85
Qu'est-ce que le cycle cellulaire?
C'est l'ensemble des évènements nécessaires à un cycle de division cellulaire.
86
Vrai ou faux. Chez les eucaryotes, le nombre de chromosomes change entre les cellules filles et les cellules mères lors de la mitose.
Faux. Le même nombre de chromosome est maintenue.
87
Quelles sont les 4 phases du cycle cellulaire mitotique d'une cellule eucaryote?
1. Phase G1 :Préparation pour la division cellulaire.
2. Phase S : Réplication de l'ADN
3. Phase G2 : Préparation pour la ségrégation des chromosomes
4. Phase M : Ségrégation des chromosomes (mitose)
88
Dans quelle phase se déroule la réplication des chromosomes?
Pendant la phase S
89
Qu'est-ce qu'un chromatide?
Chaque chromosome dupliqué
90
Qu'est-ce que des chromatides soeurs?
2 chromatides d'une même paire.
91
Quel est le rôle de la cohésine?
Maintient l'association des chromatides soeurs et maintient les chromosomes attachés jusqu'à leur ségrégation.
92
À quoi sont attachées les microtubules?
Aux centrosomes
93
Qu'est-ce qui remplace les centrosomes dans les levures et champignons?
Le corps organisateur du fuseau mitotique.
94
Quels sont les évènements majeurs à la mitose?
L'assemblage du kinétochore à chaque centromère et la cohésion entre chromatides ainsi que la protéolyse de la cohésine.
95
Qu'est-ce que la protéolyse de la cohésine?
La protéolyse de la cohésine est un processus essentiel en mitose et en méiose, permettant la séparation des chromatides sœurs ou des chromosomes homologues en dégradant la cohésine, une protéine qui maintient ces structures ensemble.
96
Vrai ou faux. Les chromosomes sont très compactes lors de la ségrégation.
Vrai.
97
Quel état facilite la ségrégation des chromosomes et pourquoi?
L'état condensé car les chromosomes sont entièrement démêlés les uns des autres.
98
Pourquoi est-il nécessaire que les chromosomes soient moins compacts lors de l'interphase?
Parce que la réplication de l'ADN nécessite le désassemblage et le réassemblage des protéines associées à chaque chromosome et la transcription génétique requiert la modification des structures associées aux régions qui portent des gènes régulés durant le cycle cellulaie.
99
Quelle protéine est impliquée dans la cohésion des chromatides soeurs et la condensation des chromosomes ?
SMC
100
Qu'est-ce que la SMC?
C'est une protéine très allongée, associées par paires qui forment des complexes multiprotéiques avec des protéines non-SMC.
101
Quel est le rôle de la SMC?
Elle enlace ensemble les 2 hélices de l'ADN (chromatides soeurs) après la réplication
102
De quoi est composée la cohésine?
De 2 protéines SMC (Smc1 et Smc3) et 2 protéines non-SMC (Scc1 et Scc3)
103
Quel est le rôle de Smc 1 et Smc 3 dans la cohésine?
Dimérisent en présence d'ATP pour former l'anneau.
104
Quel est le rôle de Scc1 et Scc3 dans la cohésine?
Ils lient les domaines ATPase de Smc1 et Smc3 pour stabiliser l'anneau.
105
Par quoi est provoqué l'ouverture des anneaux de cohésine?
Par une enzyme qui vient cliver l'anneau, la non-SMC.
106
Quel est le rôle de la condensine?
Elle aide à plier et à structurer les chromosomes en connectant des régions éloignées d'un même chromosome pour le condenser.
107
Qu'est-ce que la prophase?
C'est la condensation des chromosomes. À la fin, les enveloppes nucléaires se romptent et les cellules entrent en métaphase.
108
Que se passe-t-il lors de la métaphase?
Le fuseau mitotique prend forme et les kinétochores des chromatides soeurs se fixent aux micro-tubules. La ségrégation des chromosomes débute par la protéolyse de la cohésine.
109
Qu'est-ce que l'attachement bivalent?
Permettent aux microtubules d'exercer une tension sur les paires de chromatides en tirant les chromatides soeurs dans les direction opposées.
110
Qu'est-ce que l'attachement monovalent?
Fixation d'une seule des 2 chromatides ou de la fixation des 2 aux microtibules liés au même centrosome. Il n'y a aucune tension sur les chromatides.
111
Quelles sont les phases de la mitose dans l'ordre?
Prophase, métaphase, anaphase et télophase.
112
Que se passe-t-il lors de l'anaphase?
Les chromatides soeurs perdent leur cohésion et elles se séparent, tirées par les 2 extrémités de la cellule.
113
Que se passe-t-il lors de la téplophase?
L'enveloppe nucléaore se reforme autour de chaque jeu de chromosomes ségrégés.
114
Qu'est-ce que la cytokinèse?
La fin de la division cellulaire (mitose) pendant laqulle le cytoplasme est divisé.
115
Quelle sont les 2 étapes entre la réplication et la ségrégation?
G1 et G2, ou phases de transition
116
Quels sont les rôles des phases G1 et G2?
Permettent à la cellule de préparer l'étape suivante et de vérifier si la phase précédente a été correctement accomplie.
117
Que doit faire la cellule avant d'entamer la phase S (G1)?
Elle doit atteindre une certaine taille et un certain niveau de synthèse protéique suffisant pour fournir des protéines et nutriments pour la synthèse de l'ADN.
118
Que se passe-t-il si l'ADN d'une cellule est endommagée?
Le système de surveillance interrompt son cycle en G1 avant la phase S ou en G2 avant la mitose.
119
Que permet le système de surveillance des cellules?
Permet la réparation des erreurs avant de reprendre le cycle cellulaire, ce qui prévient les conséquences de l'apparition d'anomalies chromosomiques.
120
Vrai ou faux. La méiose augmente le nombre de chromosomes parentaux.
Faux, elle le réduit.
121
Que se passe-t-il lors du cycle cellulaire méitoque?
Production de cellules filles contenant 2 fois moins de chromosomes que la cellule mère.
122
Vrai ou faux. Il y a une seule phase de réplication d'ADn et 2 ségrégations chromosomiques successives lors de la méiose.
Vrai
123
Quelle condition doit être remplis avant la réplication de l'ADN lors de la méiose?
Les cellules doivent être diploïdes.
124
Que se passe-t-il après la phase S de la méiose?
Les paires de chromatides soeurs s'associent entre elles et recombinent, créant des liens indispensables à la cohésion des paires de chromatides soeurs au cours de la ségrégation chromosomique.
125
Vrai ou faux. La mitose a plus de ségrégations que la méiose.
Faux, l'inverse.
126
Que se passe-t-il lors de la méiose I?
Les paires de chromosomes homologues rejoignent des pôles opposés du fuseau de microtubules (protéolyse coésine) et 2 kinétochores attachent chaque paires de chromatides soeurs au même pôle du fuseau de microtubules. (monovalent)
127
Décrivez l'attachement monovalent lors de la méiose I.
Les paires de chromosomes homologues résistent à la force d'attraction du fuseau à cause des connexions physiques induites par la recombinaison entre ces paires. Après la disparition de cette cohésion lors de l'anaphase I, les paires sont divisées et dirigées vers les pôles opposés de la cellule. La cohésion est maintenue au centromère.
128
Quelle est la différence entre la méiose I et la méiose II?
Il n'y a pas de réplication d'ADN avant la ségrégation.
129
Que se passe-t-il lors de la méiose II?
La deuxième ségrégation des chromosomes. Après l'éimination de la cohésion des centromères, il y a 4 jeux de chromosomes dans la cellule (possédant une seule copie par chromosome) pour former 4 cellules haploïdes.
130
Vrai ou faux. La chromatine peut avoir 2 formes.
Vrai
131
Décrivez les 2 formes de la chromatine.
1. Fibres avec diamètre de 10nm, moins compacte
2. Fibres avec diamètre de 30nm, plus compacte, repliés sous forme de grandes boucles.
132
Quelle est la première étape de la compaction de l'ADN?
L'ADN se condense en nucléosomes. Compaction par un facteur 6X.
133
Comment nomme-t-on l'ADN que l'on retrouve entre les nucléosomes?
l'ADN internuclésomique
134
Comment nomme-t-on l'ADN le plus fortement lié au nucléosome?
l'ADN du coeur
135
L'ADN est enroulée combien de fois autour de l'octamère d'histone?
1,65 fois.
136
Par quoi ont été purifié les nucléosomes?
Par la nucléase micrococcale (MNase)
137
Quel est le rôle de la nucléase micrococcale?
Elle clive l'ADN libre de protéines mais pas l'ADN associé à des protéines.
138
Combien de pb possède un nucléosome minimal?
147pb
139
Vrai ou faux. La longueur de l'ADN internucléosomique est variable chez différentes espèces, mais constante chez une même espèce.
Vrai. Elle est plus constante chez une même espèce.
140
Chez toutes les cellules, il existe des segments d'ADN non compactés en nucléosomes. Quels sont leurs rôles?
Expression des gènes, réplication et recombinaison
141
Quels sont les 5 histones exprimés en abondance chez les eucaryotes?
H1, H2A, H2B, H3 et H4
142
Quelle histone n'est pas une histone de l'octamère?
L'histone H1
143
Vrai ou faux. Les histones de l'octamères sont en quantité égales dans la cellule.
Vrai
144
À quoi se lie l'histone H1?
À l'ADN internucléosomique
145
Est-ce que l'histone H1 est plus ou moins abondante que les autres?
2 fois moins abondantes que les autres
146
Qu'est-ce qu'une histone?
Ce sont des petites protéines chargées positivement autour desquelles l'ADN s'enroule puisqu'elle est chargée négativement.
147
Pour quelle raison les histones sont chargées positivement?
Parce qu'elles ont une forte proportion d'acides aminés chargés positivement, dont au moins 20% sont des résidus lysines ou arginines.
148
Quelle région est conservée dans toutes les histones de l'octamère?
le domaine globulaire des histones (domaine de repliement)
149
Qu'est-ce que le domaine de repliement?
3 régions en hélice séparées par moins de 2 boucles non structurées, permettant la formation de structure intermédiaire moins organisée du nucléosome.
150
Quelle partie des histones est spécifique à chaque histone?
L'hétérodimère en tête à queue
151
Quels types d'histones forment des hétérodimères?
H3 et H4, qui forment un tétramère H3-H4
152
Vrai ou faux. H2A et H2B sont incapable de former des hétérodimères.
Faux, elles sont capables, mais elle ne peuvent pas former de tétramères.
153
Quelles sont les étapes de la formation d'un nucléosome?
1. Assemblage ordonné entre l'ADn et tous ses constituants
2. Tétramère H3-H4 se lie à l'ADN
3. 2 dimères H2A-H2B s'associent au complexe ADN-H3-H4
154
Vrai ou faux. Les histones de l'octamère possèdent une extension N-terminale.
Vrai
155
Par quoi est mis en évidence la présence de l'extension N-terminale des histones de l'octamère?
Par la digestion à la trypsine
156
Est-ce que les queues N-terminales sont nécessaires à l'association de l'ADN avec l'octamère?
Non
157
Par quoi sont ciblés les extensions N-terminales des histones de l'octamère?
par des modifications altérant la fonction individuelle d'un nucléosome, comme la phosphosylation, l'acétylation ou la méthylation des résidus sérine,lysine et arginine.
158
Qu'est-ce que l'axe de la dyade?
La double-axe de symétrie du nucléosome, qui est une ligne dessinée au milieu du disque passant de 12 à 6h.
159
les histones du tétramères H3-H4 intéragissent avec quelle partie de l'ADN?
Les 60 pb centrales
160
Avec quelle partie de l'ADN intéragit la partie N-terminale de H3?
Forme la 4eme hélice qui intéragit abev les 13 dernières pb de chaque extrémité de l'ADN
161
Avec quelle partie de l'ADN intéragissent les dimères H2A-H2B?
Ils sont chacun associés avec 30 pb d'ADN de part et d'autres des 60 pb liés par H3-H4
162
Que cause l'association du tétramère H3-H4 avec la partie centrale et les extrémités de l'ADN?
Cause des courbures et des tensions considérables de l'ADN, facilitant l'accès aux dimères H2A-H2B
163
Combien il y a-t-il de sites de contact entre les histones et l'ADN et quand cela se produit-il?
14, cela se produit à chaque fois que le petit sillon de l'ADN touche l'octamère d'histone.
164
Quelle type de liaison se retrouve souent entre l'histone et l'ADN et comment cela affecte-il sa forme?
Il y a un grand nombre de liaisons H (environ 40). Ces liaisons sont à l'origine de la force qui permet la courbure de l'ADN, qui est facilité par la nature basique des histones qui masquent la charge - des phosphates.
165
Où émergent les 4 queurs H2B et H3?
Entre les 2 sillons de l'ADN
166
Où émergent les queues N-terminales H2A et H4?
Au-dessous ou au-dessus des 2 hélices d'ADN, mais pas au travers de celle-ci
167
Que permettent les queues des histones?
Dirigent l'enroulement de l'ADN vers la gauche (surenroulement négatif)
168
Quelles sont les 2 conformations chromatiniennes?
Euchromatine et hétérochromatine
169
Qu'est-ce que l'hétérochromatine?
Marquage dense avec nombreux contrastes et apparence condensée, zone de faible expression de gènes.
170
Pourquoi l'hétérochromatine est importante?
Pour la suppression d'expression génique.
171
Qu'est-ce que l'euchromatine?
Faible marquage et structure ouverte, régions avec des niveaux d'expression génique élevé
172
Quelle est la ressemblance et la différence entre l'euchromatine et l'hétérochromatine?
L'ADN est condensée en nucléosomes dans les 2 cas et la différence réside dans l'assemblage, ou non, des nucléosomes en structures complexes.
173
Quelle étape se produit lorsque les nucléosomes sont formés?
La fixation de l'histone H1
174
Vrai ou faux. L'histone H1 est chargée positivement.
Vrai
175
Quel est le rôle de l'histone H1?
Intéragit avec l'ADN internucléosomique pour resserrer l'association de l'ADN avec le nucléosome.
176
À quels endroits se lie H1 pour resserer l'ADN?
Un bout se lie dans l'ADN internucléosomique et le deuxième au milieu des 147 pb associés aux nucléosomes, augmentant la quantité d'ADN associé au nucléosome.
177
Vrai ou faux. La présence de l'histone H1 rend l'ADN plus compact
Vrai
178
Que forment les séries de nucléosomes?
Des fibres de 30nm à partir de l'ADN nucléosomal
179
Vrai ou faux. Lors du second niveau de compaction de l'ADN, elle devient plus accessible aux enzymes dépendantes de l'ADN.
Faux. Elle devient moins accessible.
180
Quels sont les 2 modèles de représentation pour la fibre de 30nm?
Le modèle solénoïde et le modèle en zigzag
181
Qu'est-ce que le modèle solénoïde?
C'est lorsque l'ADN nucléosomal forme une superhélice contenant environ 6 nucléosomes par tours
182
Où est enfoui l'ADN internucléosomique ?
Au centre de la superhélice et il ne passe jamais à travers l'axe de la fibre.
183
Qu'est-ce que le modèle en zigzag?
C'est un modèle alternatif qui repose sur l'organisation en zigzag que prennent les nucléosomes après l'ajout de H1. La fibre de 30 nm est la forme compactée de ces séries de nucléosomes en zigzag.
184
Que nécessite la conformation zigzag?
Nécessite le passage de l'ADN internucléosomique bien droit au travers de l'axe central de la fibre.
185
Quel type d'analyse priviligie le modèle solénoïde?
La microscopie électronique ou par diffraction aux rayons X.
186
Quel type d'analyse favorise le modèle en zigzag?
Par diffraction aux rayons X.
187
Pourquoi les 2 modèles pour la fibre de 30nm peuvent être correct?
Parce que la taille de l'ADN internucléosomique varie entre les différentes espèces donc la forme de la fibre 30nm peut être différente.
188
Qu'est-ce qui est nécessaire à la formation de fibres de 30nm?
Les queues N-terminales des histones.
189
Quel est la fonction des queues N-terminales?
Stabiliser la fibre de 30nm par interaction entre les nucléosomes adjacents.
190
Avec quoi intéragissent les queues N-terminales H2A, H3 et H4?
Avec le coeur du nucléosome adjacent.
191
De combien de fois est compactée l'ADN par les nucléosomes et le H1?
40X
192
Quel est le rôle de la matrice nucléaire?
Retenir à leurs bases les boucles de 40 à 90 kb formées par les fibres de 30nm.
193
Quelles sont les 2 classes de protéines dans la matrice nucléaire?
La topoisomérase II et les protéines SMC.
194
Quel est le rôle de la topo II?
Fait partie du mécanisme de fixation de l'ADN à la base de ses boucles.
195
Quel est le rôle des protéines SMC?
Composant clé dans la machinerie qui condense et assemble les chromatides soeurs durant la duplication des chromosomes.
196
Quels sont 2 variants d'histones qui altèrent la fonction du nucléosome?
H2A.X et CENP-A
197
Quel est le rôle de H2A.X?
Variant de H2A qui devient phosphorylé lorsque l'ADN chromosomique subit une cassure double-brin. Il recrute ensuite des enzymes de réparation de l'ADN au site du dommage
198
Quel est le rôle de CENP-A?
Variant de H3 associé à l'ADN du centromère ayant une queue N-terminale plus longue que H3, offrant de nouveaux sites de fixations pour d'autres protéines (comme celles constituant le kinétochore)
