Mécanisme de la transcription Flashcards
1
Q
Quelles sont les différences entre la réplication et la transcription de l’ADN?
A
- Dans la transcription, le brin est constitué de ribonucléotides
- ARN polymérase ne requiert pas d’amorce
- L’ARN ne reste pas apparié au brin matrice d’ADN, l’enzyme déplace la chaîne naissante.
- La transcription est moins fidèle que la réplication
2
Q
Quel est le nombre d’erreur pour la réplication et la transcription?
A
Réplication : 1erreur/10 000 000 nts
Transcription : 1erreur/10 000 nts
3
Q
Pourquoi il y a-t-il moins d’erreurs lors de la réplication?
A
Parce qu’elle doit assurer la transmission fidèle du matériel génétique aux cellules filles et toute erreur deviendrait permanente dans le génome, ayant des conséquences désastreuses.
4
Q
Vrai ou faux. L’ARN polymérase réalise les mêmes réactions dans toutes les cellules, autant chez les eucaryotes que chez les procaryotes
A
Vrai
5
Q
Combien il y a-t-il d’ARN polymérase chez les bactéries?
A
Une seule
6
Q
Combien il y a-t-il d’ARN polymérase chez les eucaryotes et quel est leurs noms?
A
3, il y a Pol I, Pol II et Pol III
7
Q
Quel est le rôle de Pol I?
A
Transcrit les précurseurs de l’ARNr
8
Q
Quel est le rôle de Pol II?
A
Transcrit la plupart des gènes (tout ceux qui codent pour des protéines)
9
Q
Quel est le rôle de Pol III?
A
Transcrit l’ARNt et l’ARNr 5S
10
Q
Quelles sont les 5 sous-unité des polymérase procaryotes?
A
Bêta, bêta’, alpha’, alpha’’, omega
11
Q
Quelles sont les 5 sous-unités des polymérases eucaryotes?
A
RPB1, RPB2, RPB3, RPB11, RPB6
12
Q
Qu’est-ce que le promoteur?
A
C’est une séquence d’ADN qui fixe l’ARN polymérase et les autres facteurs d’initiation requis.
13
Q
Quelles sont les 3 étapes de l’initiation de la transcription?
A
- Formation du complexe fermé (ADN = double-brin)
- Formation du complexe ouvert (ADN = simple-brin)
- La polymérase démarre la transcription et se détache du promoteur
14
Q
Vrai ou faux. L’ARN polymérase synthétise de longs ARN.
A
Faux, des courts de 10 bases
15
Q
Que se passe-t-il si l’ARN est plus grand que 10 bases?
A
L’ARN polymérase est libérée et on entre en phase d’élongation
16
Q
Quels sont les rôles de la polymérase bactérienne?
A
- Déroule l’ADN devant elle
- Réassocie les brins derrière le complexe
- Dissocie les chaines d’ARN de la matrice durant la progression
- Corrige les erreurs potentielles.
17
Q
À quel endroit l’ARN polymérase minimale peut initier la transcription chez les bactéries?
A
N’importe où sur l’ADN. Seulement vrai in vitro.
18
Q
Quel est le but de l’addition d’un facteur d’initiation?
A
De convertir l’enzyme minimale (a2bb’w), donnant l’holoenzyme de l’ARN polymérase (a2bb’ws)
19
Q
Quel est le rôle de l’holoenzyme de l’ARN polymérase (sigma)?
A
D’initier la transcription uniquement aux promoteurs
20
Q
Quel est le facteur sigma le plus courant chez E.coli?
A
sigma70
21
Q
Qu’est-ce qu’une séquence consensus?
A
Séquences d’ADN similaires entre les promoteurs
22
Q
Quelles sont les 2 régions clés où sigma70 et l’ARN polymérase se fixent?
A
-35 (35 nucléotides avant le début du gène) et -10 (10 nts avant le début du gène)
23
Q
Vrai ou faux. Les promoteurs forts ont des séquence le plus loins du consensus.
A
Faux. Le plus près.
24
Q
Qu’est-ce que l’élément UP?
A
Permet l’intéraction spécifique supplémentaire entre l’enzyme et l’ADN (augmente la liaison de la polymérase)
25
Vrai ou faux. Certains promoteurs sigma70 n'ont pas d'élément -35
Vrai, et la région -10 est allongée dans ce cas.
26
Qu'est-ce qu'un élément discriminateur?
Séquence d'ADN située en aval de l'élément -10
27
Combien de régions porte sigma70 et que font-elles?
4 régions. Régions 2 et 4 reconnaissent les éléments -10 et -35 et la région 4 porte 2 hélices formant le motif hélice-coude-hélice.
28
Que sont les 2 hélices de la région 4?
La première est un grand sillon d'ADN de l'élément -35 et la deuxième est située en travers au dessus du sillon pour établir un contact avec le squelette d'ADN.
29
Par quelle région est reconnue l'élément -10?
Par l'hélice alpha (région2)
30
Par quelle région est reconnue l'élément -10 allongé?
Par la région 3 (hélice alpha)
31
Par quelle région est reconnu l'élément discriminateur?
Par la région 1.2
32
Par quoi est reconnu l'élément UP?
Par le domaine C-terminal de sous-unité alpha de la polymérase (alphaCTD)
33
alphaCTD est relié à quoi et comment?
À alphaNTD par des ponts flexibles.
34
Que nécessite la transition du complexe fermé vers le complexe ouvert?
La modification structurale de l'enzyme et la séparatopm des brins d'ADN pour exposer le brin matrice et le brin sens au niveau des positions -11 à +3.
35
Quels sont les 5 anneaux du complexe ouvert?
Le canal d'entrée des NTPs au centre actif,
le canal de sortie de l'ARN et 3 autres canneaux permettant l'entrée et la sortie de l'ADN
36
Quelles sont les régions sigma qui lient l'ADN et où se situent-elles?
Les régions sigma 2 et 4, et elles sont exposées à la surface de l'enzyme sans être enchâssées.
37
Quels sont les 2 changements structuraux observés chez le complexe ouvert?
La fermeture des machoires et le déplacement des régions N-terminales sigma (1.1)
38
Où est situé sigma 1.1 dans un complexe fermé?
Dans le foyer catalytique
39
Où est situé sigma1.1 dans le complexe ouvert?
Il est déplacé.
40
À partir de où se sépare le brin d'ADN dans le centre catalytique?
À partir de +3.
41
Qu'arrive-t-il au brin sens dans le complexe ouvert?
ll quitte le site actif par le canal NT
42
Qu'arrive-t-il au brin matrice dans le complexe ouvert?
Il suit le parcours en passant par le centre catalytique puis par le canal du brin matrice
43
À quel endroit se reforme la double hélice?
En -11
44
Qui initie la synthèse d'ARN à l'aide de l'ADN matrice?
L'ARN polymérase.
45
Quel est le défi que doit surmonter l'ARN polymérase pour initier la transcription?
Elle débute souvent la transcription par A, qui se lie à T via 2 liens H, mais elle doit établir des intéractions spécifiques avec le 1er ou le 2eme nucléotide, maintenant un ou les 2 fermement permettant une attaque chimique du NTP entrant.
46
Qu'est-ce que le modèle d'excursion transitoire?
Ce sont des cycles de translocation de l'ARN polymérase avant/arrière.
47
Qu'est-ce que le modèle Inchworming?
Modèle stipulant qu'il existerait un élément flexible de la polymérase, permettant au site actif de se déplacer vers l'aval en synthétisant des courts transcrit avant de se rétracter dans le promoteur.
48
Qu'est-ce que le modèle de compression?
L'ADN en aval est tiré et replié à l'intérieur de l'enzyme et l'ADN s'y accumule sous forme de boucles simple brin.
49
Qu'impliqu la libération du promoteur?
De briser des intéractions polymérase-promoteur et noyau de la polymérase sigma.
50
Qu'est-ce que la transcription abortive?
Phase initiale de transcription produisant des courts transcrits (moins de 9 nucléotides)
51
Qu'arrive-t-il à l'ARN naissant?
Il ne peut pas rester contenu dans la région où il s'hybride à l'ADN, alors il commence à s'insérer dans le canal de sortie ARN.
52
Quel est le rôle de la région du linker 3/4?
Imite l'ARN, joue un rôle de mime moléculaire. Éjecté lors de l'élongation
53
Qu'est-ce qui est responsable de la diminution de la force de liaison de sigma à l'enzyme?
L'élongation
54
Que se passe-t-il lors de la libération du promoteur?
L'empilement de l'ADN dans l'enzyme est inversé et l'ADN est ré-enroulé, réduisant la bulle de transcription de 22-24 nucléotides à 12-14 nucléotides.
55
Pour quelles actions le ré-enroulement de l'ADN fournit de l'énergie?
Pour rompre les intéractions polymérase-promoteur et pour libérer le noyau de l'enzyme du facteur sigma.
56
Que permet la compression?
Entreposer et mobiliser l'énergie durant l'initiation de la transcription.
57
Que permet la libération d'énergie?
Permet à la polymérase de se détacher du promoteur et de séparer sigma de l'enzyme.
58
Vrai ou faux. La taille de la bulle est constante lors de l'élongation.
Vrai.
59
Vraui ou faux. Des erreurs d'incorporation surviennent lors de l'élongation.
Vrai
60
Quelles sont les 2 fonctions correctrices de l'ARN polymérase?
La correction pyrophospholytique et la correction hydrolytique.
61
Qu'est-ce que la correction pyrophospholytique?
Catalyse enlèvement d'un ribonucléotide incorrect par incorporation PPi pour incorporer d'autres nucléotides.
62
Qu'est-ce que la correction hydrolytique?
Lorsque l'enzyme recule d'un ou plusieurs nucléotides et clive l'ARN.
63
Quelle serait une cause courante de blocage?
Un brin d'ADN endommagé.
64
Quelle est la conséquence d'un arrêt?
Cela peut obstruer d'autres polymérases essayant de transcrire ce gène, ce qui peut être catastrophique.
65
Quel est le rôle de la TRCF?
C'est une machinerie qui enlève la polymérase bloquée et recrute des enzymes de réparation (endonucléases Uvr[A]BC)
66
Quel est le mécanisme d'action de TRCF?
Lie l'ADN double brin en arrière de la polymérase et utilise un moteur ATPase pour se déplacer sur l'ADN. Il rencontre l'ARN polymérase bloquée, poussant la polymérase vers l'avant. Cela permet de soit reprendre l'élongation ou de se dissocier du complexe ternaire
67
Quel est le rôle des terminateurs?
De conduire la polymérase en élongation à se dissocier de l'ADN et à libérer l'ARN
68
Quels sont les 2 types de terminateurs chez les bactéries?
1. Rho-dépendant qui nécessite une protéine Rho pour provoquer la terminaison
2. Rho-indépendant qui provoque la terminaison sans autres facteurs
69
Qu'est-ce que Rho?
C'est un anneau de 6 sous-unités identiques
70
Que fait Rho?
Il se fixe à l'ARN simple-bin dès qu'il sort de ARNpol aux sites rut. Rho possède une activité ATPase.
71
Qu'est-ce qu'un site rut?
70 nucléotides sans structures secondaires riches en C situé près de la fin du gène.
72
Vrai ou faux. Rho est capable de lier l'ARN aussi en traduction.
Faux.
73
À quel endroit ARNpol prend un pause et pour quelle raison?
À un site RSPS situé à 100nt en aval du site rut, et parce que ARNpol est plus rapide que Rho, il doit prendre une pause pour que Rho le rattrape.
74
Quels sont les 4 rôles précis de Rho?
1. Pousserait la polymérase en avant
2. Arracherait l'ARN de la polymérase
3. Atteint le duplexe hybride ARN-ADN et sépare l'ARN de l'ADN
4. Induirait un changement de conformation de la polymérase.
75
Quel autre nom donne-t-on au terminateur Rho-indépendant?
Terminateurs intrinsèques
76
Quelles sont les 2 parties essentielles d'un terminateur intrinsèque?
Une séquence répétée inversée (elle peut s'apparier avec elle même) et une séquence riche en paires A/T
77
Quelle est la conséquence d'avoir des courtes séquences répétées inversées?
La formation d'une structure tige-boucle.
78
Vrai ou faux. Le mécanisme de terminaison se produit directement au niveau de l'ADN.
Faux. C'est au niveau de l'ARN.
79
Quelle est la conséquence de la formation d'une structure en forme de tige-boucle?
La désorganisation du complexe d'élongation et donc la terminaison (arrêt de transcription).
80
Quelle est la conséquence d'avoir environ 8 paires de bases A/T répétées?
Une série de liaisons A/U faibles facilite le détachment de l'ARN polymérase, mettant fin à la transcription
81
Qu'est-ce qui remplace les fonctions de sigma chez les eucaryotes?
Les facteurs généraux de transcription (FGT)
82
Quels sont les 2 rôles de FGT?
Aide Pol II à se fixer au promoteur et séparer les brins d'ADN
Aide Pol II à se détacher du promoteur et engager l'élongation
83
Qu'est-ce que le promoteur minimal?
Le plus petit ensemble d'éléments de séquence nécessaire pour assurer l'initiation de la transcription par la machinerie de Pol II in vitro.
84
Combien il y a-t-il de nucléotides en amont ou en aval du site d'initiation de la transcription?
Entre 40 et 60.
85
Quelles sont les 4 catégories de séquences régulatrices pour la transcription efficace in vivo?
1. Éléments proximaux du promoteur
2. Les séquences activatrices en amont (UAS)
3. Les enhancers ou amplificateurs
4. D'autres éléments comme silencers, éléments frontières et isolateurs.
86
Qu'est-ce qui doit être formé pour positionner correctement l'ARN pol II sur le promoteur du gène?
Un complexe de préinitiation (PIC)
87
Quel est le rôle de la boîte TATA dans l'initiation de la transcription?
Courte séquence d'ADN située à 30 nts avant le début du gène qui sert de point d'ancrage pour l'assemblage du PIC
88
Qu'est-ce que la TBP?
C'est une protéine qui se fixe sur la boîte TATA
89
Qu'arrive-t-il lorsque TBP se lie à TATA?
Il y a la création d'une plateforme stable qui aide à recruter les facteurs généraux de transcription et l'ARN polymérase II
90
Que comprend le complexe de préinitiation complet?
Tous les facteurs généraux de transcription (FGTs) et l'ARN pol II
91
Qu'est-ce TFIID et quel est son rôle?
C'est un complexe de protéines qui reconnaît et se fixe à TATA. Il est essentiel pour le démarrage de la transcription car il permet l'assemblage du complexe de préinitiation.
92
Quelles sont les 2 sous-unités de TFIID?
TBP et TAFs
93
Qu'arrive-t-il lorsque le complexe TBP-TATA est formé?
Ils attirent d'autres FGTs, soit
TFIIA
TFIIB
TFIIF
TFIIE
TFIIH
94
Qui ouvre l'ADN pour permettre à Pol II de commencer la transcription?
TFIIH
95
Quel est le mécanisme d'action de TFIIH?
Il possède une activité hélicase (enzyme qui déroule l'ADN), donc il obtient de l'énergie en hydrolysant de l'ATP, permettant d'ouvrir la double hélice d'ADN au niveau du promoteur
96
Quelles sont les 2 étapes supplémentaires que doivent faire les eucaryotes par rapport au bactéries pour transcrire l'ARN?
1. Hydrolyse de l'ATP
2. Phosphorylation de la Pol II
97
À part pour ouvrir l'ADN, pourquoi une deuxième molécule d'ATP est nécessaire?
Pour aider Pol II à se libérer du promoteur et avancer sur l'ADN.
98
Qu'est-ce que CTD?
Queue spécifique de l'ARN polymérase II qui doit être modifiée avant la transcription par l'ajout de groupements phosphates (phosphorylation)
99
De quoi est composée la queue CTD?
D'une répétition de 7 acides aminés (Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser). Cette répétition apparaît 52 fois et sont des sites de phosphorylation.
100
Que permet la phosphorylation de CTD?
Permet à Pol II de se libérer des facteurs pour commencer l'élongation de l'ARN.
101
Quel type de structure la TBP utilise pour se fixer et pour quelle raison?
Structure en feuillet bêta et pour reconnaître le petit sillon de la boîte TATA.
102
Dites où TBP se lie et pourquoi c'est atypique.
Se lie au petit sillon de la boîte TATA et c'est atypique étant donné que la plupart des protéines se fixent au grand sillon en utilisant une hélice alpha.
103
Expliquer comment TBP reconnaît TATA.
Elle reconnaît la capacité de la séquence TATA à se plier facilement sous son action à cause de son abondance en A/T, la rendant plus souple.
104
Grâce à quoi TBP stabilise son interaction avec l'ADN?
Grâce à 2 résidus phénylalanine qui s'insèrent entre les bases aux extrémités de la séquence TATA, stabilisant la déformation de l'ADN.
105
Qu'est-ce qui renforce l'ancrage de TBP sur l'ADN?
L'armature de l'ADN porte une charge négative. TBP contient Lys et Arg qui sont chargés positivement. Le tout crée une intéraction électrostatique forte.
106
Que provoque l'intéraction entre TBP et l'ADN?
Cela provoque un élargissement du petit sillon, lui donnant une configuration presque plane en repliant l'ADN d'un angle de 80 degrés. Cela facilite le recrutement d'autres protéines pour démarrer la transcription.
107
De quoi dépend la spécificité?
Des chaîne latérales de 2 résidus phénylalanine.
108
À quoi la TBP doit être associée pour fonctionnier?
À une dizaine de TAFs
109
Quel complexe forme TBP et TAFs liés ensemble?
TFIID
110
Nommez 2 TAFs spécifiques qui jouent un rôle important dans la reconnaissance des séquences du promoteur.
TAF42 (TAF2) et TAF62(TAF6)
111
Quels sont les rôles de TAF2 et TAF6?
Ils se lient à des éléments spécifiques du promoteur, comme Inr. Aide à stabiliser l'ancrage du complexe TFIID sur l'ADN.
112
À quoi ressemblent structuralement TAF42 et TAF62?
À des histones.
113
Où retrouve-t-on TAF2 et TAF6 chez les levures?
Dans le complexe SAGA
114
À quoi ressemblent les TAF2 et TAF6 chez la drosophile et comment cela décrit leur rôle?
Ils forment une structure ressemblan au tétramère H3/H4, qui est un composant du nucléosome. Cela signifie que les TAFs stabilisent la région du promoteur en agissant comme des histones pour recruter Pol II (pas prouvé)
115
Quel est le premier FGT à se fixer sur le promoteur pour initier la transcription?
TFIID
116
Quelles sont les 2 fonctions de TFIIA?
1. L'intéraction entre TFIIA-TBP/TFIID élimine l'intéraction de répresseurs avec TBP qui empêche la formation de PIC
2. Agit comme co-activateur pour certains activateurs.
117
Quels sont les 2 gènes qui encodent TFIIA?
TFIIA alpha/bêta (TOA1)
TFIIAy (TOA2)
118
Vrai ou faux, TFIIA intéragit avec l'ADN.
Faux. Avec TBP
119
De combien de chaînes polypeptidique est formée TFIIB?
une seule, contrairement aux autres qui en ont plusieurs
120
Quel est le rôle de TFIIB?
Joue un rôle de pont entre TBP et ARN pol II, aidant à positionner Pol II au bon endroit pour démarrer la transcription.
121
Quels sont les 2 régions auxquelles TFIIB se lie?
-BRE (vers extrémité 5' du promoteur)
-Région en aval de la boîte TATA (vers extrémité 3' du promoteur)
122
À quels endroit pénètre TFIIB dans Pol II?
Dans le canal de sortie de l'ARN et dans la gorge du site actif de Pol II.
123
Vrai ou faux. TFIIB joue un rôle crucial dans le recrutement et l'activation de Pol II.
Vrai
124
Combien de sous-unité possède TFIIF chez l'humain?
2 (RAP74 et RAP30)
125
Combien de sous-unités possède TFIIF chez la levure?
3 (Tfg1 (RAP74) et Tfg2(RAP30)) et Tfg3
126
Quelle sous-unité de TFIIF n'est pas essentielle chez la levure?
Tfg3
127
Que permet la liaison de Pol II avec TFIIF?
Stabilisation du complexe ADN-TBP-TFIIB
128
Quel serait un rôle de TFIIF?
Contribuerait à maintenir l'enroulemen serré de l'ADN.
129
Quel est le rôle de TFIIE?
De recruter et réguler TFIIH
130
Quels sont les rôles de TFIIH?
De contrôler la transition du complexe de préinitiation fermé à ouvert en utilisant de l'ATP
Fusion du promoteur et dans le détachement de Pol III du promoteur
Impliqué dans la réparation de l'ADN (excision de nucléotides NER)
131
Vrai ou faux. TFIIH est plus gros et plus complexe que les FGTs
Vrai, il a 10 sous-unités
132
Nommez 2 sous-unités de TFIIH
XPD et XPB
133
Quels sont les rôles de XPD et XPB?
Activité ATPase (hélicase) et activité protéine kinase (CTD-kinase)
134
Qu'est-ce que NER?
Mécanisme de réparation cellulaire qui enlève et remplace les bases d'ADN endommagées.
135
Vrai ou faux. La transcription requiert le même nombre de protéines in vivo et in vitro.
Faux. In vivo, la transcription requiert des protéines supplémentaires, comme le médiateur.
136
Que nécessite la transcription et la régulation à des niveaux élevés?
Des protéines régulatrices, un complexe médiateur et une enzyme de modification des nucléosomes.
137
Pourquoi la transcription est-elle plus complexe in vivo?
L'ADN matrice in vivo est empaquetée dans la chromatine, ce qui complique la liaison au promoteur de la Pol II et de ses facteurs associés.
138
Qu'est-ce que le médiateur?
Protéine consituée de beaucoup de sous-unités qui facilite l'initiation en régulant l'activité CTD kinase de TFIIH.
139
À quoi est associé le médiateur?
à une queue CTD de Pol II et les autres faces sont en intéractionn avec des activateurs liés à l'ADN.
140
Vrai ou faux. SI on supprime une sous-untié du médiateur, la transcription est bloquée.
Faux. Chaque sous-unité du médiateur est impliquée dans la régulation de gènes spécifiques, donc seulement ceux touchés seront supressés.
141
Qu'est-ce que la phase d'élongation?
Lorsque Pol II se libère du promoteur et initie transcription en progressant sur l'ADN pour allonger la molécule d'ARN.
142
Vrai ou faux. Les facteurs qui ont aidés au recrutement de Pol II ne sont plus nécessaires, donc ils sont débarassés.
Vrai
143
Quels facteurs remplacent les FGTs et le médiateur?
TFIIS et hSPT5
144
Vrai ou faux. Lors de l'élongation, l'ARN est mature.
Faux, Il faut recruter d'autres facteurs d'élongation pour assurer sa maturation.
145
Où vont les enzymes impliquées dans la maturation de l'ARN?
Elles se fixent à CTD de pol II pour être transportés au bon endroit au bon moment.
146
Quelle forme de CTD préfèrent les enzymes de maturation?
La forme phosphorylée de CTD
147
Où se situe CTD pol II?
À côté du canal de sortie de l'ARN
148
Vrai ou faux. CTD pol II est plus long que pol II
Vrai. 7 fois plus long.
149
Pourquoi est-il important que CTD soit long?
Parce que cela lui permet de lier plusieurs composants de la machinerie d'élongation et de maturation pour les mettres en contact avec l'ARN.
150
Quel est le rôle de la kinase P-TEFb?
Elle est recrutée par des activateurs de transcription qui stimule l'expression des gènes et son rôle est d'aider Pol II à bien progresser sur l'ADN pendant l'élongation
151
Quel est le rôle de la Serine dans l'élongation?
CTD de pol II contient une séquence de 7 acides aminés, donc la sérine en position 2. P-TEFb ajoute un groupement phospate sur celle-ci, étant un signal pour faire de l'élongation.
152
Pourquoi P-TEFb recrute TAT-SF1?
Puisque c'est un facteur qui stabilise Pol II en élongation et qui facilite le cuplage transcription-maturation de l'ARN.
153
Quel est le rôle de la famille ELL?
Ils se lient à Pol II en phase d'élongation et suppriment les arrêts temporaures de l'ezyme, améliorant la processivité de Pol II.
154
Quels sont les rôles de TFIIS?
Stimule le taux d'élongation en diminuant le temps de pause de Pol II.
Contribue à la vérification de séquences par Pol II
Stimule l'activité RNase de la pol II pour éliminer les bases incorrectes par l'hydrolyse limitée de l'ARN.
155
À quoi est comparable le rôle de TFIIS?
à la correction hydrolytique stimulée par Gre.
156
Qu'est-ce le facteur FACT?
C'est un hétérodimère de 2 protéines, Spt16 et SSRP1
157
Quel est le rôle de FACT?
L'ADN est enroulé autour de nucléosomes, pouvant bloqué Pol II. FACT réorganise temporairement le nucléosome pour que Pol II puisse passer sans le détruire.
158
Quel est le rôle de Spt16?
Il se lie aux dimères H2A-H2B et les stabilise.
159
Quel est le rôle de SSRP1?
Il se fixe sur le tétramère H3-H4, permettant à FACT de réorganiser les parties du nucléosome temporairement.
160
Quel est le mécanisme d'action de FACT?
Il retire un dimère H2A-H2B, ce qui assouplit la structure du nucléosome. Cela fait de la place à Pol II pour qu'il passe et transcrit l'ADN. Une fois Pol II passé, il remonte le nucléosome en réinsérant H2A-H2B
161
Comment se nomme l'activité permettant à FACT de replacer H2A et H2B?
Chaperon d'histone
162
Quelles sont les 3 modification que subit l'ARN eucaryote une fois transcrit?
1. Formation de la coiffe à l'extrémité 5'
2. Épissage de l'ARN
3. Polyadénylation à l'extrémité 3'
163
Qu'est-ce la coiffe 5'?
Modification apportée à l'extrémité 5' de l'ARNm. Elle est constitué de guanine méthylée qui est attachée via une liaison 5'-5'
164
En quoi la liaison 5'-5' de la coiffe est importante?
Elle est différente des liaisons classiques 3'-5' dans l'ARN, ce qui protège l'ARNm de la dégradation par les enzymes.
165
Quelles sont les 3 étapes de l'ajout de la coiffe 5'?
1. Retrait d'un phosphate à l'extrémité 5' de l'ARN
2. Ajout du nucléotide GMP
3. Méthylation du GMP
166
À quel moment les enzymes responsables de la coiffe se mettent au travail?
Dès que l'ARN commence à sortir du canal de sortie de Pol II.
167
Que font les enzymes responsables de la coiffe?
Elles déphosphorylent Ser5 du CTD, provoquant la dissociation de la machinerie d'assemblage de la coiffe et elles phophorylent Ser2 du CTD, ce qui active la machinerie d'épissage.
168
Quels sont les rôles de la coiffe?
- Stabiliser l'ARNm (Protection contre ribonucléase)
- Export de l'ARnm dans le cytoplasme
- Recrutement de ribosomes.
169
Qu'est-ce que la polyadénylation?
L'ajout d'une longue queue de nucléotides adénine à l'extrémité 3' de l'ARNm, permettant l'export de l'ARNm.
170
Quel est le signal qui déclenche la polyadénylation?
Quand Pol II transcrit la séquence AATAAA, elle devient AAUAAA dans l'ARNm.
171
Quels sont les 4 évènements causés par la trancription AAUAAA?
1. Clivage de l'ARNm
2. Ajout d'un grand nombre de résidus adénine à son extrémité 3'
3. Dégradation de l'ARn encore associée à l'ARN Pol II
4. Terminaison de la transcription
172
Quels sont les 2 complexes protéiques transportés par Pol II (CTD) lorsqu'elle s'approche de la fin d'un gène?
CPSF et CstF
173
Quel sont les rôles de CPSF?
-Clive ARN en aval du signal AAUAAA.
- Recrute Poly-A-polymérase qui ajoute 200 As à l'extrémité 3'ARN clivé, menant au recrutement des PABP, permettant l'export de l'ARNm mature au cytoplasme.
174
Vrai ou faux. Pol II s'arrête immédiatement après le clivage et la polyadénylation de l'ARN.
Faux.
175
Qu'est-ce que le modèle torpille?
Une enzyme suit la polymérase sur la matrice d'ADN et dégrade la seconde molécule d'ARN transcrite. Lorsqu'elle atteint Pol II, elle provoque la dissociation de la polymérase du gène, mettant fin à la transcription.
176
Vrai ou faux. L'extrémité libre de la 2eme ARN est dépourvue de coiffe.
Vrai
177
Par qui est reconnue la 2eme ARN chez la levure et chez l'huamin?
Levure : Rat1
Humain : Xrn2 et positionnée par Rtt103 (CTD)
178
Vrai ou faux. Rat1 est très processive et rattrape donc Pol II.
Vrai
179
Vrai ou faux. La terminaison requiert des intéractions spécifiques entre Rat1 et Pol II.
Faux
180
Quel serait le rôle de Rat1/Xrn2?
Il pousserait Pol II vers l'avant et/ou arracherait le transcrit naissant.
181
Quelle est la différence entre Pol II et Pol I/Pol III?
Initient la trancription sur des promoteurs distincts et transcrivent des gènes distincts de Pol II. Ils codent des ARN spécialisés et non des protéines.
182
Vrai ou fauxl. TBP est universelle et est impliquée dans l'initiation de la trancription par Pol I, Pol II et Pol III
vrai
183
Pol I trancrit pour quoi?
L'ARNr
184
Quelles sont les 2 parties du promoteur de l'ARNr?
Le promoteur central et l'élément de contrôle en amont (UCE)
185
Quels sont les 2 facteurs requis pour l'initiation de la transcription par Pol I?
SL1 et UBF
186
Quel est le rôle de SL1?
Comprend TBP et 3 TAFs qui fixent le promoteur central
187
Quel est le rôle de UBF?
Lie UCE et recrute SL1. Sitmule la transcription en recrutant Pol I.
188
Quelles sont les 3 formes du promoteur de Pol III?
1. Contiennent boite A et B séparées par de courts éléments.
2. Portent boîte A et C
3. Portent boîte TATA
189
Que nécessite la transcription par Pol III?
Des FTGs en plus de la Pol III.
Pour gène d'ARNt = TFIIIB et TFIIIC
POur gène d'ARNr 5s = TFIIIB, TFIIIC et TFIIIA
190
Vrai ou faux. La pol III utilise la TBP comprise dans la TFIIIB
Vrai
191
Combien de sous-unités possède le médiateur chez l'homme et la levure?
Plus de 20
192
Quelle sous-unité du médiateur est indispensable pour la transcription des gènes Pol II in vivo?
Srb4/Med17
193
Comment sont organisés les médiateurs chez l'homme et la levure?
En modules, qui peuvent être dissociés l'un de l'autre in vitro.
194
Vrai ou faux. Il existe différentes formes de médiateurs.
Vrai
195
