Replicatie, reparatie en recombinatie

Question 1

Hoe weten we dat DNA-replicatie een semi-conservatief proces is?

Answer 1

Bacteriën werden gekweekt met een isotoop (15N), waarbij beide DNA-strengen dus 15N bevatten. Hierna werden de bacteriën overgeplaatst en op kweek gezet met 14N. Deze gerepliceerde strengen waren lichter. Bij analyse bleek de dichtheid van het DNA van de nieuwe generatie bacteriën tussen de 15N en 14N te zitten.

Question 2

DNA replicatie: 5’ eind –> 3’ eind of van 3’ eind –> 5’ eind

Answer 2

5’ eind –> 3’ eind

Question 3

Beschrijf in 4 stappen de synthese van de lagging strand en de daarbij horende eiwitten.

Answer 3

1. RNA primer wordt gemaakt door primase.
2. Vanuit de primer plakt DNA-pol I nucleotiden aan de vormende streng.
3. De RNA primer wordt door DNA-pol I vervangen door DNA.
4. Het gat tussen (oude) RNA-primer en de nieuw gesynthetiseerde streng wordt door DNA ligase gedicht.

Question 4

DNA-pol I heeft een verkeerde nucleotide toegevoegd aan de gesynthetiseerde streng hoe wordt deze fout weggehaald?

Answer 4

DNA-pol I gebruikt tijdens het synthetiseren “proof reading”, wanneer er een fout wordt ontdekt wordt 3’ –> 5’ exonuclease geactiveerd. Deze corrigeert de fout.

Question 5

Hoe ontstaat er bij de lagging strand een kortere streng en hoe wordt voorkomen dat daarbij genen verloren gaan?

Answer 5

Een kortere lagging ontstaat doordat de laatste primer niet door DNA vervangen kan worden, de resterende RNA-primer wordt dan weggehaald door 5’–> 3’ exonuclease. DNA pol I kan dit gat niet vullen omdat er aan de 3’ kant een vrije OH mist. Om te voorkomen dat genen verloren gaan, zit er aan elk eind van chromosomen een telomeer. In plaats van dat een chromosoom korter wordt, wordt dus de telomeer korter.

Question 6

Functie telomerase

Answer 6

Het enzym werkt met RNA-molecuul samen om zo telomeren te verlengen.

Question 7

Depurinatie

Answer 7

Verwijderen van nucleotiden uit DNA

Question 8

Deaminatie

Answer 8

Cytosine wordt vervangen met uracil

Question 9

UV-licht zorgt voor mutaties, wat voor?

Answer 9

Er ontstaan thyminedimeren.

Question 10

Hoe wordt een accidental double strand break gerepareerd?

Answer 10

Het wordt gerepareerd door non-homologous end joining. Hierbij verwijderd nuclease een deel van beide uiteinden en plakt ligase vervolgens deze delen weer aan elkaar.

Question 11

Wat houdt homolgous recombination in?

Answer 11

DNA met double strand break wordt vergeleken met nondamaged DNA. Nuclease verwijderd weer een deel van beide uiteinden, maar hierbij wordt weer het juiste aantal nucleotiden toegevoegd.