Reparacije DNK Flashcards
Podjela
Prereplikativne i postreplikativne
podjela prereplikativnih
fotoreaktivacija i desinteza
fotoreaktivacija
lezije koje su nastale UV zračenjem
oporavke in situ
Primjer kod UV zraka
popravke s evrse samo kada su ocuvani mehanizmi popravka
Talasna duzina 280 nm ce djelovati na one molekul ekoje je mogu apsorbirati a to bi bili purini i piramidini (org molekuli sa prstenom )
objasni fotoreaktivaciju
ako se u DNK lancu nadu dva timina obrazju se timin dimeri, a nasuprot njih nece se pri replikaciji vezivati komplimentarni nukleotidi pa nastaju gepovi
kako nastaju gepovi
tako sto nasuprot t dimera (dva timina) prirlikom replikacije ne veze s ensita
ako bakterije u cijoj je dnk t dimer sta ce se desiti
monomerizacija dimera pod utjecajem dnevne svjetlosti
kada je enzim koji monomerizuje dimer aktivan
pod dnevnom svjetloscu
bakteriej koje imaju ovaj gen phr+
koje imjau mutiran i ne mogu ovim sistem popravke d amonomerizuju onda imaju phr -
dealkilacija
lezije nastale alkilizirajucim agensima (alkil - guanin)
kako se desava dealkilacija
da li covjek ima taj proces
da , dok fotoreaktivaciju nema logicno
proces : NG (nitrozoguanin) - alikilrajuci agens metilira guanin u DNK vezujuci CH3 grupu za atom kiseonika u polozaju 6
kao se to popravlja(metilizirani guanin)
sad metilizarani guanin ne moze da se takav veze za citozin , kidaju se vidinicne veze na tom dijelu
medutim enzim alkil -transferzaza ima u sastavu aminokiselinu cistein koja ce vezati CH3 grupu (metil grupu)
njacesci nacin oporavke ostecenih DNK
eksciizioni nacin - isjecanje nukletida i isijecanje isijwcanje modifikovanih baza
MMR reparacija
pogresne baze mismatch repair
enzimi BER reparacionog sistema
Pol 1 , ligaza (DNK) , glikozilaza , AP endonuklaza
enzumi NER rep sistema
UvrA,B , C , Pol1 , ligaza , helikaza
enzimi MMR
specifican
DNK pom 3 , ligaza , SSB
oligonukletisno isijwcanje
na mjestu gdje je doalo do mutacije
UvrABC
jedino endonuklaza koja je sposobna da izvrsi istovremeno zasjecanje na dva mjesta ( sa obe strane lezije), oslobadajuci osteceni fragment
lezija
ostecenje
Kokejnov sindrom
ubrzano starenje(progerija), nizak rast , gluhonijemost
autsomni recsivno
genska mutacija na hromosmu 5 , segment q12 i hrom 10 segment q11
problem je u izostajanju reparacien i timr ubrzano stari
ko uklanja abaaznu dezoksiribozu
AP endonukaza i AP egzonuklazaž
endo - raskida fosfodiestersku vezu uzvodno 5’ ili 3’ od Ap mjesta
egzo - hidrolizuju fosofodiestersku vezu nishodno od AP mjesta
kkao se zamjenjuju nukleotidi
reperativnom sintezom - polimeraza 1