Régulation transcription - procaryotes Flashcards
Quels sont les signaux extracellulaires qui régulent l’expression des gènes procaryotes?
Molécules dans le milieu de culture
Comment appelle-t-on les régulateurs positifs?
Activateurs
Comment appelle-t-on les régulateurs négatifs?
Répresseurs
Qu’est-ce que le niveau basal de transcription?
Transcription sans les protéines régulatrices
Quelle est l’étape limitante du niveau basal de transcription?
La liaison de l’ARN Pol
Comment se fait la répression de la transcription par un répresseur?
Le répresseur se lie sur un site recouvrant en partie le promoteur et empêche l’ARN pol de se lier
Comment s’appelle le site où se lie le répresseur sur l’ADN?
L’opérateur
Comment s’appelle le site où se lie l’activateur?
Site de liaison de l’activateur
Comment se fait l’activation de la transcription par un activateur?
L’activateur se lie sur un site proche du promoteur et interagit avec l’ARN Pol pour le rapprocher du promoteur
Quels autres mécanismes un activateur peut-il emprunter pour réguler la transcription?
- L’allostérie
- Permettre l’échappement efficace vers l’étape d’élongation
Par quels autres moyens la régulation négative peut-elle s’effectuer?
- Inhibition de la formation du complexe ouvert
- Échappement du promoteur
Qu’est-ce que la régulation coopérative?
Plusieurs régulateurs interagissent entre eux ou avec l’ARN. Certains gènes sont actifs lorsque plusieurs régulateurs sont présents simultanément
Qu’arrive-t-il chez les bactéries si l’environnement manque de glucose?
La bactérie se trouve une autre source de carbone, comme le lactose
Quels sont les gènes de l’opéron lac?
LacZ, LacY et LacA
Pourquoi dit-on que les gènes lac sont polycistroniques?
Parce que la transcription donne un seul Arnm qui contient les 3 gènes
Pour quelle protéine code lacZ?
La B-galactosidase, enzyme qui coupe le lactose en galactose et en glucose
Pour quelle protéine code lacY?
La lactose perméase, protéine transmembranaire qui importe le lactose dans la cellule
Dans quelles conditions la cellule a-t-elle besoin de produire les gènes lac?
- Absence de glucose
- Présence de lactose
Quelles sont les 2 protéines régulatrices impliquées dans les gènes lac?
- Activateur: CAP
- Répresseur: répresseur lac
Sur quel site se lie CAP?
Sur le site CAP
Sur quel site se lie le répresseur lac?
Sur l’opérateur
Quel signal transmet CAP?
Le signal du glucose
Quel signal transmet le répresseur lac?
Le signal du lactose
En résumé, quelle est l’action de l’activateur CAP?
Recrute l’ARN Pol sur le promoteur
Quelle partie de l’ARN Pol lie l’activateur CAP?
La queue C-terminale
Quel changement CAP introduit-il sur l’ADN?
Une torsion
Qu’est-ce qui favorise l’activation des gènes lac par CAP?
- Baisse de glucose dans la cellule
- Hausse de l’AMPc
- Liaison de CAP à l’AMPc et activation des gènes lac
Comment le répresseur lac réprime-t-il la transcription?
- Recouvre une partie du promoteur
- Empêche physiquement l’ARN pol d’interagir avec le promoteur
Sous quelle forme se lient habituellement les régulateurs bactériens?
Sous forme d’homodimères
Sous quelle forme se lien le répresseur lac?
Sous forme de tétramère
Quel est le ligand allostérique du répresseur lac?
Le lactose
Qu’arrive-t-il lorsque le lactose se lie au répresseur lac?
Le répresseur change de conformation et ne peut plus se lier à l’ADN
Pour quoi codent les gènes gal?
Pour des enzymes impliqués dans le métabolisme du galactose
Sous quelles conditions les gènes gal sont-ils exprimés?
Lorsque le galactose est présent et que le glucose est absent
Quel activateur est commun aux gènes gal et lac?
CAP
Par quelle sous-unité sigma de l’ARN pol est reconnu la majorité des promoteurs d’E coli?
Sigma 70
Qu’arrive-t-il lors du choc thermique d’E Coli?
Sigma32 remplace sigma70
Qu’est-ce qu’une croissance lytique?
La bactérie croit jusqu’à ce qu’elle explose
Nommer 2 activateurs qui fonctionnent par allostérie plutôt que par recrutement pour activer la transcription?
NtrC et MerR
Quel est le rôle de l’activateur NtrC?
Contrôle les gènes impliqués dans le métabolisme de l’azote
Qu’est-ce que l’antiactivation?
Un activateur devient répresseur en absence de ligand
Qu’est-ce que le bactériophage landa?
Virus qui infecte E. Coli
Qu’est-ce que la croissance lysogène?
Intégration de l’ADN du phage dans le chromosome bactérien, répliqué à chaque division cellulaire
Qu’est-ce que l’induction lysogène?
Passage de l’état lysogène à lytique?
Quels sont les 2 gènes à l’étude du bactériophage landa?
- cl
- cro
Quels sont les 3 promoteurs du bactériophage landa?
- PR
- PL
- PRM
Quels sont les promoteurs forts du bactériophage landa?
PR et PL
Quel gène transcrit le promoteur PRM?
Le gène cl
Par quel gène est codé le répresseur landa?
Le gène cl
Quels sont les deux rôles du répresseur landa?
- Répresseur
- Activateur
Quel est le rôle de la protéine cro?
Répreseur
Quels sont les sites opérateurs sur lesquels la protéine cro et le répresseur landa peuvent se lier?
OR1, OR2 et OR3
Qu’est-ce que produit la réponse SOS?
Production de protéines de réparation qui ne sont pas présentes normalement
Que provoquent les lésions de l’ADN?
L’activation de RecA
Quel est le rôle de RecA?
La destruction du répresseur LexA
Pourquoi RecA dégrade également le répresseur landa?
Parce que le répresseur landa ressemble beaucoup au répresseur LexA
