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La réplication de l'ADN Flashcards

1
Q

Combien de temps dure environ la réplication de l’ADN?

A

10h

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Q

Quels éléments sont nécéssaires à la réplication de l’ADN?

A
  • dNTP
  • Jonction amorce:matrice
  • ADN polymérase
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Q

En quoi consiste la matrice dans jonction amorce:matrice?

A

Le brin-mère simple brin

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Q

En quoi consiste l’amorce dans la jonction amorce:matrice?

A

Brin complémentaire au brin-mère

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Q

Quel groupement effectue une attaque nucléophile sur le groupement phosphate du dNTP?

A

L’extrémité libre 3’-OH de l’amorce

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6
Q

D’où provient le dNTP qui s’ajoute à l’amorce?

A

Du noyau

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7
Q

Vrai ou faux.
La liaison entre le dNTP et l’amorce peut se faire même si les bases ne sont pas appariées entre elles. (Ex: Ajout d’un A sur un C)

A

Vrai, mais la liaison sera 10 000x plus efficace si la base est appariée

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8
Q

Quels sont les 2 activités de la paume de la main de l’ADN polymérase?

A
  • La polymérisation

- L’exonucléase

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9
Q

Quels sont les rôles des ions métalliques divalents présents dans la paume de la main?

A
  • Modifier l’environnement chimique du 3’-OH et du dNTP
  • Un des ions rédiut le 3’-OH en 3’-O
  • L’autre ion stabilise les phosphates B et Y
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10
Q

Quel est le rôle de l’exonucléase?

A

Vient couper les nucléotides mésappariés

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11
Q

Quel est le rôle des “doigts” de la main de l’ADN polymérase?

A

Lors d’un appariement correct, les doigts se referment sur le dNTP

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12
Q

Quel est l’effet de la fermeture des doigts sur le dNTP?

A
  • Rapprocher le nucléotide des ions métalliques

- Augmenter la vitesse de catalyse

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13
Q

Qu’est-ce qui empêche tout appariement d’un dNTP avec la 2eme base?

A

La rotation de 90 degrés induite entre la 1ère et la 2ème base de la matrice

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14
Q

Quel est le rôle du pouce de la main de l’ADN polymérase?

A
  • Maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale
  • Permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat
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15
Q

Pourquoi l’ADN polymérase est dite processive?

A

Parce qu’à chaque liaison à son substrat, elle catalyse l’ajout de plusieurs nucléotides

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16
Q

Qu’est-ce que la fourche de réplication?

A

L’endroit où l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaire

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17
Q

Dans quel sens se fait la réplication?

A

5’ - 3’

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18
Q

À quoi sert la primase?

A

Créer des petits ARN qui servent d’amorces

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19
Q

Quel est le rôle de la RNase H?

A

Dégrade spécifiquement les ARN appariés à l’ADN, sauf le dernier ribonucléotide

20
Q

Pourquoi la RNase H ne peut pas enlever le dernier ribonucléotide?

A

Parce qu’il peut seulement cliver la liaison d’un ribonucléotide (ARN-ARN)

21
Q

Quel enzyme enlève le dernier ribonucléotide?

A

L’exonucléase 5’

22
Q

Quel type d’énergie les hélicases utilisent-elles?

A

L’ATP

23
Q

À quoi servent les protéines SSB?

A

Se lient à l’ADN simple brin pour empêcher le réappariement, la dégradation et la formation de boucles

24
Q

Vrai ou faux.

Les SSB sont spécifiques.

A

Faux, car elles ne forment pas de liaisons hydrogènes avec les bases

25
Q

Quel est le rôle de la topoisomérase dans la fourche de réplication?

A

Éliminer le surenroulement généré par l’hélicase

26
Q

Quelle est la processivité des Pol α, ε et δ?

A

Pol α possède une processivité faible alors que les deux autres ont une processivité élevée

27
Q

Quels brins synthétisent respectivement les Pol δ et ε?

A

δ: Brin discontinu

ε: Brin continu

28
Q

Quel est le rôle principal de l’anneau coulissant?

A

Augmenter de beaucoup la processivité de l’ADN polymérase

29
Q

Quel est le rôle des poseurs d’anneaux coulissants?

A

Catalysent l’ouverture et le positionnement des anneaux coulissants

30
Q

De quoi est formé l’holoenzyme de l’ADN Pol III?

A
  • 2 noyaux d’ADN Pol III
  • 2 protéines T
  • Complexe Y (poseur d’anneaux coulissants)
  • Anneau coulissant
31
Q

De quelles structures est formé le répliosome?

A
  • L’holoenzyme d’ADN Pol III
  • L’hélicase
  • La primase
32
Q

Où se déroule normalement l’ouverture initiale de la double hélice pour y fixer l’hélicase?

A

Dans des séquences internes des chromosomes

33
Q

Comment se nomment les sites spécifiques où débute la réplication?

A

Origines de réplication

34
Q

Combien y a-t-il d’origines de réplication chez les procaryotes et les eucaryotes?

A
  • Procaryotes: Très variable

- Eucaryotes: 1/30 kpB

35
Q

Quels sont les 2 composants de l’initiation?

A
  • Le réplicateur

- L’initiateur

36
Q

Quelles sont les 2 parties du réplicateur?

A
  • Site de liaison des protéines initiatrices

- Séquences facilement déroulées (A:T riches)

37
Q

Qu’est-ce que l’initiateur?

A

Protéine qui reconnaît spécifiquement une séquence du réplicateur

38
Q

Qu’est-ce que le réplicateur?

A

Séquences d’ADN suffisantes pour l’initiation de la réplication

39
Q

Quels sont les 3 rôles des initiateurs?

A
  • Se lient à l’ADN du réplicateur
  • Viennent dérouler/déformer la région adjacente à leur site de liaison
  • Recrutent les protéines nécéssaires à l’initiation de la réplication
40
Q

Quels sont les 2 événements distincts de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes et à quel moment se déroulent-ils?

A
  • Sélection des réplicateurs (phase G1)

- Activation des origines de réplication (phase S)

41
Q

Qu’est-ce qui forme le complexe pré-réplicatif?

A
  • Le réplicateur
  • L’initiateur
  • Les poseurs d’hélicase
  • Les hélicases
42
Q

Comment se déroule la fin de la réplication dans les chromosomes circulaires?

A

La topoisomérase II vient séparer les chromosomes filles enlacées une dans l’autre

43
Q

Comment se nomment les extrémités des chromosomes linéaires?

A

Les télomères

44
Q

Comment est organisée l’extrémité des chromosomes linéaires?

A

Répétitions bicaténaires possèdant une extrémité 3’ monocaténaire

45
Q

Quelle enzyme est recrutée par la structure des télomères?

A

La télomérase

46
Q

Que fait la télomérase?

A

Vient allonger l’extrémité 3’ monocaténaire

47
Q

Pourquoi y a-t-il la formation de boucles T aux extrémités des chromosomes?

A

Permet de garder intact l’extrémité monocaténaire du télomère

intro gén (9 decks)

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