Les mécanismes de la transcription Flashcards
Quelles sont les 4 grandes différences entre la transcription et la réplication?
- Transcription produit un brin de ribonucléotides
- ARN polymérase ne nécessite pas d’amorce
- ARN synthétisé ne reste pas apparié au brin matrice
- Transcription est moins fidèle que la réplication
Pourquoi la réplication doit-elle être plus fidèle que la transcription?
Parce que la réplication transmet le bagage génétique aux cellules filles
Combien y a-t-il d’ARN polymérases dans les cellules eucaryotes et procaryotes?
- Procaryotes: une seule
- Eucaryotes: 3
De quoi est responsable la Pol II?
Responsable de la transcription de la plupart des gènes (tous les gènes codant des protéines)
De quoi est responsable la Pol I?
Responsable de la transcription des gènes codant pour le grand précurseur des ARNr
De quoi est responsable la Pol III?
Responsable de la transcription des gènes codant les ARNt, des petits ARN nucléaires et l’ARNr 5S
Quelles sont les 3 étapes de la transcription par l’ARN polymérase?
- Initiation
- Élongation
- Terminaison
Qu’est-ce qu’un promoteur?
Séquence d’ADN qui fixe l’ARN polymérase et les facteurs de transcription requis
Qu’est-ce que la bulle de transcription?
Ouverture de l’ADN autour du point de démarrage de la transcription dans laquelle l’ADN est simple brin
Vrai ou faux.
Les 2 brins d’ADN seront transcrits.
Faux, un seul des 2 brins d’ADN sert de matrice et sera transcrit en ARN
Quelles sont les 3 étapes de l’initiation de la transcription?
- Formation d’un complexe fermé
- Transition vers un complexe ouvert
- Polymérase démarre la transcription et se détache du promoteur
En quoi constitue le complexe fermé?
Liaison de la polymérase au promoteur (l’ADN est double brin)
En quoi constitue le complexe ouvert?
Fusion des brins d’ADN (devient simple brin)
Quel facteur d’initiation est nécessaire pour convertir l’ARN polymérase minimale?
Facteur sigma
En quoi sigma convertit l’enzyme minimale?
Une holoenzyme de l’ARN polymérase
Quel est le rôle de l’élément UP?
Augmenter la liaison de la polymérase en permettant des interactions spécifiques entre l’enzyme et l’ADN
En combien de régions sigma70 peut-il être divisé?
4 régions
Quelle est la particularité de la région 4 de sigma70?
Porte 2 hélices formant un motif hélice-coude-hélice
Quelles régions de sigma70 reconnaissent respectivement les éléments -10 et -35 des promoteurs?
Régions 2 et 4
Comment se déroule la transition du complexe fermé au complexe ouvert dans l’enzyme bactérienne?
Réaction d’isomérisation, ne nécessite pas l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP
Vrai ou faux.
L’isomérisation est un processus réversible.
Faux, une fois réalisée, garantit que la transcription va démarrer
Combien de canaux l’enzyme bactérienne possède-t-elle?
5 canaux
Quels sont les rôles des canaux de l’enzyme bactérienne?
- Permettre l’arrivée des NTPs (1 canal)
- Permettre la sortie de l’ARN (1 canal)
- Permettre l’entrée et la sortie de l’ADN (3 canaux)
Quels sont les 2 changements structuraux observés dans l’enzyme bactérienne durant l’isomérisation?
- Mâchoires à l’avant de l’enzyme se referment sur l’ADN en aval
- Déplacement important de la région N-terminale de sigma
Qu’est-ce que la synthèse abortive?
L’ARN produit de courts ARN de moins de 10 nucléotides avant de se libérer du promoteur
Qu’arrive-t-il lorsque la polymérase parvient à synthétiser un transcrit qui atteint le seuil de 10 nucléotides?
Elle se libère du promoteur et passe à la phase d’élongation
Comment évolue la taille de la bulle de transcription au court de l’élongation?
Elle reste toujours constante
Quelles sont les 2 fonctions correctrices de l’ARN polymérase?
- La correction pyrophospholytique
- La correction hydrolytique
Nommer une cause courante de l’arrêt d’un ARN polymérase
Présence d’un brin d’ADN endommagé
Quelle protéine enlève la polymérase et recrute des enzymes de réparation suite à un bris?
La TRCF
Qu’arrive-t-il lors de la collision entre la TRCF et la polymérase qui pousse cette dernière vers l’avant?
- La polymérase reprend l’élongation
- La polymérase se dissocie du complexe
Qu’est-ce qu’un terminateur?
Séquence d’ADN qui conduit la polymérase en phase d’élongation à se dissocier de l’ADN et et à libérer l’ARN produit
Quels sont les 2 types de terminateurs chez les bactéries?
- Terminateurs Rho-dépendants
- Terminateurs Rho-indépendants
Qu’est-ce qu’un site Rut?
Éléments d’ARN mal définis qui nécessitent l’action de Rho
Que requierent les ARN polymérases des eucaryotes de plus que les ARN polymérase des proacryotes?
Des facteurs généraux de transcription et des facteurs supplémentaires
Quels éléments font parti d’un promoteur minimal eucaryote?
- Élément reconnu par TFIIB
- Boîte TATA
- Élément initiateur
- Éléments d’aval du promoteur
Les facteurs généraux de transcription peuvent être comparé à quelle structure chez les procaryotes?
Le facteur sigma
Quelles sont les principaux rôle des FGT?
- Aident la Pol II à se fixer au promoteur et à séparer les brins d’ADN
- Aident la Pol II à se détacher du promoteur et à débuter l’élongation
Par quoi est formé le complexe de préinitiaiton?
- Facteurs généraux de transcriptions
- Pol II
- Promoteur
Quelles étapes absentes chez les bactéries sont nécessaires à la libération du promoteur chez les eucaryotes?
- Hydrolyse d’ATP
- Phosphorylation de la Pol II
Pourquoi a-t-on besoin de l’intervention de facteurs supplémentaires pour la transcription in vivo?
Parce que l’ADN matrice in vivo est empaquetée sous forme de chromatine
Quels facteurs remplaces les facteurs d’initiations au début de la phase d’élongation?
Les facteurs d’élongation
Quel est le rôle de FACT?
Démanteler et réassembler les nucléosomes
Quelles modification doivent être apportées à l’ARN eucaryote après avoir été transcrit?
- Formation de la coiffe à l’extrémité 5’
- L’épissage de l’ARN
- La polyadénylation à l’extrémité 3’
