régulation de la transcription eucaryotes Flashcards
Quels sont les mécanismes de régulation transcriptionnelle conservés chez les eucaryotes?
- Mécanismes de régulation transcriptionnelle conservés de la levure aux mammifères
- Recrutement des complexes protéiques sur les gènes par les activateurs eucaryotes
- L’intégration du signal et le contrôle combinatoire
- Les répresseurs transcriptionnels
- La transduction du signal et le contrôle des régulateurs transcriptionnels
Ces mécanismes sont fondamentaux pour comprendre la régulation de l’expression génique chez les eucaryotes.
Qu’est-ce qui caractérise les activateurs eucaryotes?
Les activateurs eucaryotes sont des protéines qui lient l’ADN et facilitent ou empêchent l’initiation de la transcription de gènes spécifiques en réponse à des signaux appropriés
Ils recrutent la machinerie transcriptionnelle et interagissent avec d’autres protéines régulatrices.
Quelles sont les modifications des nucléosomes et leur impact sur la transcription?
Les modifications des nucléosomes rendent la machinerie transcriptionnelle accessible à un substrat partiellement masqué
Cela influence l’expression des gènes en complexifiant l’action des activateurs et des répresseurs.
Comment les éléments régulateurs varient-ils entre les gènes bactériens, de levure et humains?
Chez les eucaryotes, il y a plus de sites de liaison et plusieurs sites individuels, tandis que les bactéries ont des éléments régulateurs plus simples
Les séquences régulatrices peuvent s’étendre sur 1000 nucléotides en amont ou en aval du promoteur.
Qu’est-ce qu’un enhancer?
Un enhancer est une séquence régulatrice qui contient plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité, permettant des actions à distance par des boucles d’ADN
Cela facilite l’interaction entre protéines régulatrices et les promoteurs.
Vrai ou Faux: L’activation à distance par les enhancers nécessite des isolateurs.
Vrai
Les isolateurs bloquent l’activation du promoteur induite par les activateurs liés à l’enhancer.
Quel est le rôle de Gal4 dans la transcription chez la levure?
Gal4 est un activateur eucaryote qui active la transcription des gènes de galactose chez Saccharomyces cerevisiae
Il lie quatre sites situés 275 pb en amont de la transcription.
Quel est le motif de liaison à l’ADN des activateurs eucaryotes?
Les activateurs eucaryotes possèdent un domaine de liaison à l’ADN distinct, souvent de type hélice-coude-hélice
Ce motif est crucial pour la reconnaissance des sites spécifiques sur l’ADN.
Qu’est-ce qu’un domaine en doigt à zinc?
Un domaine en doigt à zinc est une structure protéique qui se replie pour lier l’ADN, composée d’environ 30 acides aminés
Il est caractérisé par la présence de cystéines et d’histidines qui stabilisent la structure.
Complétez: Les protéines à homéodomaine contiennent une région _______ conservée.
60 AA
Cette région est essentielle pour leur fonction dans l’embryogenèse et la régulation génique.
Quel est le rôle des motifs hélice-boucle-hélice?
Ils sont impliqués dans la reconnaissance de l’ADN et sont présents dans plusieurs régulateurs eucaryotes
Ces motifs permettent la liaison à des séquences spécifiques et sont cruciaux pour la régulation de l’expression génique.
Vrai ou Faux: Les régions activatrices des activateurs eucaryotes ont des structures définies.
Faux
Les régions activatrices peuvent former des structures en hélice induites par la liaison à l’ADN, mais elles n’ont pas de structures définies.
Quels types d’acides aminés sont souvent présents dans les régions activatrices?
Glutamine, proline et acides aminés acides
Ces régions sont moins universelles mais jouent un rôle clé dans l’activation de la transcription.
Quelles sont les fonctions des protéines régulatrices eucaryotes?
Elles sont impliquées dans diverses fonctions cellulaires telles que la différentiation cellulaire, la stabilité des chromosomes et la régulation de l’expression génique
Des exemples incluent MyoD, CBF1/CPF1, et myc.
Quel est le rôle du complexe Médiateur?
Le complexe Médiateur recrute la machinerie transcriptionnelle et interagit avec l’ARN polymérase
Il joue un rôle clé dans l’initiation et l’elongation de la transcription.
Qu’est-ce qu’un activateur dans le contexte de la transcription?
Un activateur stimule la transcription en liant l’ADN par une surface et l’ARN polymérase par une autre face.
Les activateurs peuvent recruter des modificateurs du nucléosome.
Quels sont les facteurs nécessaires à l’initiation ou à l’élongation de la transcription?
Médiateur et TFIID.
Ces facteurs aident à l’initiation de la transcription chez les eucaryotes.
Comment les activateurs interagissent-ils avec la machinerie transcriptionnelle?
Les activateurs interagissent avec un ou plusieurs complexes et les recrutent sur les gènes.
Ils peuvent agir à distance.
Quel est le rôle des acétyltransférases dans la transcription?
Elles ajoutent des groupements chimiques sur les queues des histones, provoquant une perturbation locale de la structure de la chromatine.
Cela permet d’ ‘desserrer’ l’ADN.
Quel type de modifications sur les histones est associé à l’activation transcriptionnelle?
Acétylation.
Les bromodomaines de TFIID se fixent mieux aux nucléosomes acétylés.
Quels sont les deux types de modificateurs de nucléosomes mentionnés?
- Déplacent
- Remodèlent
Exemples incluent HAT et SWI/SNF.
Quelles protéines sont recrutées par les activateurs pour l’initiation de la transcription?
- TBP
- SAGA
- TAFs
Ces protéines sont essentielles pour des promoteurs spécifiques.
Qu’est-ce qu’un enhancer?
Une séquence d’ADN qui augmente le taux de transcription d’un gène.
Les activateurs peuvent interagir avec les enhancers pour activer des gènes à distance.
Quel est le rôle des isolateurs dans la transcription?
Ils bloquent l’activation par des enhancers en inhibant la communication entre l’enhancer et le promoteur.
Les isolateurs n’inhibent pas directement les activateurs d’autres gènes.
Qu’est-ce qu’un locus de contrôle (LCR)?
Un groupe d’éléments régulateurs nécessaires pour la régulation appropriée de certains groupes de gènes.
Par exemple, les gènes de globine humaine ont un LCR.
Quelles sont les étapes de la régulation transcriptionnelle chez les eucaryotes?
- Recrutement des complexes protéiques par les activateurs
- Intégration du signal et contrôle combinatoire
- Action des répresseurs transcriptionnels
- Transduction du signal
Ces mécanismes sont conservés des levures aux mammifères.
Quel est l’effet synergique des activateurs sur l’expression génique?
L’effet de deux activateurs agissant ensemble est supérieur à la somme de chacun agissant seul.
Cela se produit souvent dans des conditions où la liaison de l’un dépend de la liaison de l’autre.
Comment la coopérativité est-elle cruciale pour l’intégration du signal par les activateurs?
Elle permet aux activateurs de recruter des modificateurs de nucléosomes et d’agir ensemble pour activer un gène.
Par exemple, Swi5 et SBF interagissent pour activer le gène HO.
Qu’est-ce que l’enhanceosome de l’interféron-β humain?
C’est une structure formée par des activateurs recrutés qui lie les sites d’ADN enhancer et le promoteur, activée dans les cellules sous infection virale.
Comprend des protéines comme HMGA1, CBP, NF-kB, IRF, et d’autres activateurs.
Quels sont les types d’activateurs impliqués dans l’enhanceosome?
Les activateurs incluent :
* NF-kB
* IRF
* Jun/ATF (AP-1)
* CREB-binding protein (CBP)
* High-mobility group protein (HMG-I/HMG-Y)
Ces protéines jouent un rôle essentiel dans la régulation de l’expression génique.
Qu’est-ce que le contrôle combinatoire?
C’est un mécanisme où plusieurs activateurs interagissent avec des gènes, impliquant plus de régulateurs que chez les bactéries.
Par exemple, le gène A est contrôlé par 4 signaux, tandis que le gène B l’est par 3.
Quels mécanismes de régulation transcriptionnelle sont conservés chez les eucaryotes?
Les mécanismes comprennent :
* Recrutement des complexes protéiques
* Intégration du signal
* Contrôle combinatoire
* Répresseurs transcriptionnels
* Transduction du signal
Ces mécanismes sont observés depuis la levure jusqu’aux mammifères.
Comment fonctionnent les répresseurs transcriptionnels chez les eucaryotes?
Ils peuvent recruter des modificateurs du nucléosome et ont des effets opposés à ceux des activateurs.
Les répresseurs recrutent des enzymes comme les histone désacétylases.
Quel est le rôle de Tup1 dans la répression du gène GAL1 chez la levure?
Tup1 recrute des histone désacétylases qui désacétylent les nucléosomes à proximité du promoteur GAL1.
Cela inhibe l’initiation de la transcription du gène GAL1.
Quel est le modèle de répression par glucose impliquant Mig1?
Mig1 interagit avec Tup1 pour réprimer la transcription de GAL1 en réponse à la présence de glucose.
Cela démontre comment les nutriments peuvent influencer l’expression génique.
Quels sont les deux types de GRE (Glucocorticid Responsive Element)?
Les deux types de GRE sont :
* GRE activateur
* GRE répresseur
Ces éléments régulent l’activité transcriptionnelle en fonction de la présence de ligands.
Comment les signaux influencent-ils les régulateurs transcriptionnels?
Les signaux peuvent provoquer des changements conformationnels, libérer des régions activatrices, ou induire la migration vers le noyau.
Chez les eucaryotes, ces mécanismes sont souvent plus complexes que chez les bactéries.
Qu’est-ce que l’inhibition de NF-kB par IkB?
IkB maintient NF-kB inactif dans le cytoplasme en le liant, et est phosphorylé par la kinase IKK pour libérer NF-kB.
Cela est déclenché par des signaux tels que le tumor necrosis factor.
Qu’est-ce que la voie de transduction du signal STAT?
C’est une voie où le ligand active le récepteur, entraînant la phosphorylation et la migration de STAT vers le noyau pour lier l’ADN.
STAT est un activateur de transcription important dans la réponse cellulaire aux signaux externes.
Quelles sont les caractéristiques des activateurs eucaryotes?
Les activateurs eucaryotes nécessitent souvent un contrôle combinatoire et interagissent avec d’autres protéines pour fonctionner efficacement.
Ils ne fonctionnent pas seuls et leur activité dépend de la présence d’autres facteurs.
Quel est le rôle de la phosphorylation de Rb dans le cycle cellulaire?
La phosphorylation de Rb permet la prolifération cellulaire en libérant E2F, qui contrôle l’entrée en phase S du cycle cellulaire.
Rb est une protéine clé dans le contrôle du cycle cellulaire chez les mammifères.
Vrai ou Faux: Les activateurs et les répresseurs sont recrutés séparément sur l’ADN.
Faux
Ils peuvent être recrutés ensemble pour former un complexe sur l’ADN.
Complétez: Les domaines de liaison à l’ADN (DLA) et les domaines d’activation (DA) sont _______.
[distincts et interchangeables]
Quel est l’effet de la liaison d’un ligand sur les récepteurs nucléaires?
La liaison d’un ligand libère le récepteur, permettant sa migration vers le noyau.
Cela permet au récepteur d’exercer son rôle en tant qu’activateur ou répresseur de transcription.
