épissage Flashcards
Quelles sont les trois étapes de la maturation de l’ARN?
Formation de la coiffe à l’extrémité 5’, épissage, polyadénylation à l’extrémité 3’
Ces étapes sont essentielles pour la maturation de l’ARN eucaryote avant son exportation.
Que sont les exons?
Toute région maintenue dans l’ARN mature, qui peut être codante ou non
Comprend les séquences codantes et les régions non traduites.
Quelle est la différence entre les introns et les exons?
Les exons sont les séquences codantes, tandis que les introns sont les séquences non codantes entre les exons
Les introns sont éliminés lors de l’épissage.
Comment le nombre d’introns par gène varie-t-il?
Il varie énormément; rarement plus d’un seul intron par gène dans la levure, et plus l’organisme est complexe, plus il a d’introns
Cela reflète la complexité génétique des organismes.
Quelle est la taille typique des exons et des introns?
Exons environ 150 bases, introns jusqu’à 800 000 bases
Exemple: Gène DHFR a 31 kb avec 6 exons de 2 kb.
Quelle est la première étape de l’élimination des introns?
La transcription ne reconnaît pas les introns; ils sont donc inclus dans le pré-ARNm
La traduction se fait en continue et ne discrimine pas les introns.
Quelles sont les séquences spécifiques aux jonctions intron/exon?
Site d’épissage 5’ (séquence GU) et site d’épissage 3’ (séquence AG)
Ces séquences sont essentielles pour le splicing correct.
Qu’est-ce que la chimie de l’épissage?
Deux réactions de trans-estérification successives
Ces réactions sont cruciales pour le processus d’épissage.
Qu’est-ce qu’un spliceosome?
Un complexe d’environ 150 protéines et 5 ARN, similaire en taille au ribosome
Il joue un rôle clé dans l’épissage de l’ARN.
Quels sont les rôles des snRNP dans le spliceosome?
Reconnaissent le site d’épissage 5’ et le site de branchement, catalysent les réactions de clivage et de ligation de l’ARN
Les snRNP sont des petites ribonucléoprotéines nucléaires.
Qu’est-ce que l’auto-épissage?
Un mécanisme rare où les introns s’éliminent eux-mêmes sans ARN externe ou protéines
Cela implique que l’intron se replie en une configuration précise.
Quels sont les problèmes potentiels lors de l’épissage?
Des erreurs peuvent se produire dans la reconnaissance des sites d’épissage
La longueur des introns par rapport aux exons pose des défis pour la machinerie d’épissage.
Comment le spliceosome prévient-il les erreurs d’épissage?
S’assemble préférentiellement aux sites voisins d’exons et utilise des protéines SR pour le recrutement
Ces protéines lient des séquences amplificatrices d’épissage exoniques.
Qu’est-ce que l’épissage alternatif?
L’ARN peut être épissé de différentes manières pour générer des ARNm différents
Jusqu’à 75% des gènes humains subissent un épissage alternatif.
Quels types d’épissage alternatif existent?
Exon éliminé, exon allongé, intron retenu
Ces variations peuvent aboutir à des protéines différentes à partir du même pré-ARNm.
Quel est le rôle des amplificateurs exoniques d’épissage?
Recrutent des protéines de la machinerie d’épissage au niveau d’un site d’épissage proche
Les protéines SR jouent un rôle clé dans ce processus.
Qu’est-ce que l’édition de l’ARN?
Modification de la séquence d’un ARN après sa transcription et avant sa traduction
Cela peut impliquer l’insertion, l’enlèvement ou la modification de bases individuelles.
Pourquoi le spliceosome ne peut-il pas se lier à l’intron?
Parce qu’il est encombré
Exemple de hnRNP1
Qu’est-ce que l’édition de l’ARN?
Modification de la séquence d’un ARN après sa transcription et avant sa traduction
Quels sont les deux mécanismes impliqués dans l’édition de l’ARN?
- Désamination d’adénines ou de cytosines
- Insertion ou délétion d’uridine par un ARN guide
Quel est un exemple d’édition de l’ARN par désamination?
La désamination du C dans le codon CAA donne un UAA (codon stop!)
Qu’est-ce qu’ADAR?
Adenosine deaminase acting on RNA
Comment les désaminases reconnaissent-elles les séquences spécifiques?
Par une séquence spécifique ou une structure secondaire particulière de l’ARN
Sur quelles bases l’édition par désamination se produit-elle?
- Cytosines
- Adénosines
L’inosine est reconnue comme quoi lors de la traduction?
Comme une guanine
Où se produit l’édition de l’ARN par insertion de U?
Dans les mitochondries de trypanosomes
Quel est l’impact des U insérés sur le cadre de lecture?
Décalage du cadre de lecture de -1 à bon cadre de lecture
Quelle est la longueur typique des ARN guides (ARNg)?
40-80 nucléotides
Quelles sont les trois régions des ARN guides?
- Extrémité 5’ à ancrage
- Région d’édition
- Extrémité 3’ à région poly-U
Quel est le rôle de la région poly-U dans les ARN guides?
N’est pas clair
Que se passe-t-il lors de l’appariement de la région d’ancrage?
Un A non apparié où les U seront insérés
Quel type d’enzyme est impliqué dans la coupure des régions d’ARN mésappariées?
Une endonucléase
Quelle est la proportion des ARNm matures dans le noyau?
1-5% des ARN dans le noyau
Quelles sont les étapes de maturation de l’ARN?
- Addition de la coiffe
- Épissage
- Polyadénylation
Comment se fait le transport de l’ARNm du noyau vers le cytoplasme?
Procédé non passif
Quelles protéines peuvent inhiber le transport de l’ARN?
Certaines protéines inhibent le transport
Comment se fait la sélection des bons ARN à être transportés?
Certaines protéines favorisent le transport
Quel est le rôle des pores de la membrane nucléaire dans le transport?
Permet le passage de molécules < 50 kDa
Quels types de protéines restent associées à l’ARNm après l’épissage?
- Protéines liées aux jonctions entre les introns (snRNP)
- Protéines SR (régulateurs de l’épissage)
