Régulation De L'expression Genique Flashcards
Trois mecanismes epigenetiques
Methylation ADN
- residu methyl sur cytosine en 5’
- DNMT1 (nouveau brin) acquière brin ancien et DNMT3a et 3b (de novo)
Modification post-traductionnelle des histones
Intervention des ARN non codant
Anomalie methylation
ICF: maladie grave et rare, AR, mutation du gène pour DNMT 3b. Retard mental et anomalie faciale
Syndrome X fragile: expension triplet CGG en 5’UTR du gène FMR1 (hypermethylation, repression)
Cancer: hypo ou hyper
Code des histones
Regulation du degré de condensation
- acetylation: LYSINE (H2a, H2b, H3, H4), gène actif
- methylation: lysine ET arginine (H3, H4)
Methylation H3-Lys9: ADN silencieux
Methylaton H3-Lys4: ADN actif
Connexion entre methylation ADN et protéines des histones
Proteines MBP dont MeCP2 fait parti.
MeCP2: represseur de transcription
° chromatine relache et ADN actif
° methylation site CpG de l’ADN
° recrutement p° MeCP2 pour former un complexe
° recrutement co-represseur et histone desacetylase
° demasquage charge positive de l’histone
° interaction forte entre ADN et histone
° condensation chromatine: transcription inactive
-> Sd de Rett
Domaines des régulateurs trans
2 essentiels:
- liaison à l’ADN:
° proteines helice-tour-helice (liaison ADN par helice C-ter)
° protéine à doigt de zinc (feuillet beta anti-parallèle et feuillet alpha qui interagit avec ADN) eg: SP1 et H.steroidiennes
° proteine leucine zipper: motif de dimerisation et non liaison à l’ADN. Eg: CREB (p° de liaison de l’AMPc), AP1 (heterodimere Fos-Jun ou homodimere Jun-Jun)
° protéine helice-boucle-helice: dimere
- domaine de transactivation
Facultatifs:
- domaine liaison aux hormones
- domaine de dimerisation
3 mécanismes de répression en trans
Compétition au niveau du site de fixation sur l’ADN
Masquage du domaine de transactivation
Action directe du facteur represseur sur le complexe de pre-initation
Exemple d’une voie de transduction du signal AMPc
Fixation ligand sur R. Avec adenylate cyclase sur face IC
Activation adenylate cyclase synthetisant AMPc
AMPc active PKA
PKA est transloque dans le noyau et phosphoryle CREB qui se dimerise et peu fixer élément de reponse (CRE) avec coactivateur CBP dote d’une activité histone acetyltransferase decondensant la chromatine
Active les gènes cibles
Homeostasie du fer
Surcharge: IRE-BP prend une conformation non affine - ne peut pas se fixer à IRE
° traduction de ferritine, stockage du fer
° absence de liaison de IRE-BP, ARNm sensible aux endonucleases -> dégradation
° concentration diminue
Carence en fer: IRE-BP prend une conformation affine pour IRE
° fixation IRE-BP bloque traduction de ferritine
° complexe IRE et IRE-BP bloque endonuclease, augmentation transferrine
Concentration augmente