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MICA > Quorum sensing > Flashcards

Quorum sensing Flashcards

1
Q

Quelles sont les modifications liées à la formation d’une endospore?

A

Modifications morphologiques
Déshydratation progressive du cytoplasme
Apparition de composés
Dipicolinate de calcium
Petites protéines spécialisées acido-solubles (SASPs)
ADN sporal
Synthèse de la thèque (paroi sporale)
Libération de l’endospore dans le milieu extérieur (endospore –> exospore)

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Q

À quoi servent les composés suivants?
Dipicolinate de calcium
SASPs

A

Dipicolinate de calcium: stabilise les acides nucléiques
SASPs: fixation à l’ADN

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3
Q

Nomme les étapes de la germination d’un spore

A

Activation
Par
Choc thermique modéré
Abrasion des parois
Substance chimique
Initiation
Réhydratation rapide
Processus enzymatique d’autolyse
Perte du cortex, du dipicolinate
Extrusion
Réhydratation rapide
Dégradation des SASPs

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4
Q

Nomme les différentes structures d’un spore libre de l’extérieur vers l’intérieur. Décris leur composition

A

Exosporium > Tunique > Cortex > paroi > Noyau
Exosporium: enveloppe protéique lâche
Tunique: couches protéique imperméable (résistance aux enzymes/ produits chimiques)
Cortex: Peptidoglycan modifié

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5
Q

Quel indicateur biologique faut-il sélectionner pour valider un traitement de stérilisation?

A

Le spore le plus résistant

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6
Q

Nomme quelques souches de bactéries sporulée qui causent des maladies graves chez l’Homme. Nomme aussi les maladies

A

Clostridium botulinum -> neuroparalysie
Clostridium tetani -> tetanos
Clostridium perfringens -> nécrose (gangraine)
Bacillus anthracis ->anthrax

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7
Q

Nomme les deux pathologies alimentaires (effets) de Bacillus cereus

A

Effet hématique: toxine sécrétée = céréulide: thermostable, pH acide résistance (estomac)
Effet diarrhétique: 2 toxines = hémolysine et complexe entérotoxique non hémolytique: termosensible et pH sensible.

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8
Q

Nomme un exemple d’utilisation de mycotoxines en biotechnologie dans les 3 domaines suivants: Production de toxines, Production d’antibiotiques et d’enzymes, Cosmétiques

A

Production de toxine: Utilisation de Bacillus thuringiensis pour protéger ses plantes (insecticide)
Production d’antibiotique et d’enzyme: Utilisation de micromycètes et utiliser leur capacité à produire des antibiotiques (comme les polymyxines) ou des enzymes (comme la subtilisine)
Cosmétique: Botox (toxine botulinique)

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9
Q

Par quoi l’initiation de la sporulation est-elle contrôlée?

A

Par la compétence de la cellule et par le quorum sensing (donc par la présence des molécules signal que l’on appelle auto-inducteurs)

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10
Q

Qu’est ce que le Quorum sensing?

A

Mécanisme de communication entre m-o (Système qui détecte le nombre de germes présents)

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11
Q

Quels sont les buts du Quorum Sensing?

A

Synchroniser l’activité d’un groupe de bactéries
Limiter l’utilisation superflue d’énergie en n’activant que les gènes régulés qu’au moment principe (lorsqu’en grande densité)

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12
Q

Comment les bactéries communiquent entres elles?

A

par l’intermédiaire de “molécules signal”

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13
Q

Quelle est/sont la/les molécule.s responsables de la communication entre les bactéries à Gram + et à Gram -

A

Gram + : peptide (ComX, CSF)
Gram - : homosérine lactone

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14
Q

Vari ou Faux?
Pour une bactérie il peut y avoir plusieurs systèmes de quorum sensing

A

Vrai

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15
Q

Quels sont les 3 facteurs important dans le QS chez les Gram - et leur rôle associé?

A

Les acylhomosérines lactones (AHL) = AUTO-INDUCTEUR
Lux1 = catalyse la formation d’AHL
LuxR = protéine régulatrice -> module l’expression des gènes

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16
Q

Comment les AHL traversent-elles la membrane?

A

par DIFFUSION (Gram -)

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17
Q

Quels sont les Médiateurs de la communication intra-espèce chez Bacillus subtillis (Gram +)

A

ComX
CSF

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18
Q

Comments les peptides autoinducteurs (Gram +) traversent-ils la membrane?

A

Grâce à des TRANSPORTEURS ABC = transport actif (Gram +)

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19
Q

Explique le système de quorum sensing chez les bactéries à Gram +.

A
  1. Maturation (du peptide auto-inducteur)
    1. Transport actif (vers le milieu extracellulaire)
    2. Détection (via un récepteur) -> activation d’une cascade de transduction du signal -> messagers secondaires (régulateur de réponse)
    3. Régulateur de réponse
      En répresseur: si le régulateur de réponse est non phosphorylé (à basse concentration bactérienne)
      En activateur: de la transcription des gènes si le régulateur de réponse est phosphorylé (à haute densité)
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20
Q

Par quoi le déroulement de la sporulation est-il contrôlé?

A

Par les facteurs de transcription sigma (σ)

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21
Q

Nomme les différents facteurs sigma σ et leur fonction dans la formation du préspore

A

Spo0A: active σE et σF, et forme le septum
σE et σF: active σG
σG: auto-active sa production et active σK

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22
Q

Où se situe les facteurs sigma suivant dans la cellule
σE, σF, σG, σK

A

σE: Cellule mère
σF: Pré-spore
σG: cellule mère
σK: Pré-spore

23
Q

À quoi correspond DT? Que veut dire le D et le T

A

DT: temps de réduction du nombre de gènes de 90% (minutes)
D = temps de chauffage
T = température du chauffage

24
Q

Vrai ou Faux?
Chaque DT est propre à chaque espèce bactérienne et à chaque milieu et varie selon la température du chauffage

A

Vrai

25
Q

À quoi correspond Z?

A

Valeur d’inactivation thermique = variation de température qui modifie DT d’un facteur 10

26
Q

Nomme les différents types d’agents antifongiques et leur mode d’action respectif.

A

Polyènes: agit sur l’ergostérol EXISTANT -> disrupts membrane;
Echinocandines: agit sur la synthèse de la chitine (paroi cellulaire);
Azoles: agit sur la synthèse de l’ergostérol (ex fluconazole);
Allylamines agit sur la synthèse de l’ergostérol;
5’-Fluorocytosines: agit sur la synthèse des acides nucléiques

27
Q

Quel est la contrainte supplémentaire qu’il faut tenir compte lors de la conception d’antifongiques?

A

Sa toxicité pour l’Homme (les deux sont des eucaryotes)

28
Q

Nomme les différents mécanismes de résistance au fluconazole chez C. albicans

A

Surexpression des pompes à efflux (transporteurs ABC (ATP binding cassette) et MF (major facilitator));
Mutation de la cible (ERG11);
Surexpression la cible (ERG11);
Altération de la biosynthèse de l’ergostérol;
Surexpression des pompes à efflux

29
Q

Quel métabolisme souhaite-t-on exploiter par l’utilisation de micromycètes?

A

Le métabolisme fermentatif

30
Q

À quoi servent les ferments fongiques?

A

Aspect du produit (par l’hydrolyse des protéines du caillé)
Goût et texture (synthèse des aromes)
Lutte contre des éventuels contaminants (contre Penicilium, Mucor et Rhizopus)

31
Q

Quel est le rôle du sel dans la fabrication de la sauce soja?

A

inhiber la croissance et le métabolisme de la moissure
limiter la contamination bactérienne

32
Q

Quelles sont les 4 sortes d’interactions entre les bactéries et les minéraux

A

L’acidification;
L’oxydo-réduction;
Biofilm;
Chélation

33
Q

Distingue Sessile de planctonique

A

Sessile organisms are those that are attached to a surface and do not move around freely. For example, bacteria that form biofilms
Planktonic organisms, on the other hand, are those that are free-floating and move around in a fluid medium, such as water.

34
Q

Qu’est ce qui mène au choc endotoxique chez les bactéries à Gram -

A

Le lipide A du LPS

35
Q

Qu’est ce qu’une endotoxine vs exotoxine?

A

Exotoxine = sécrétée
Endotoxine = pas sécrétée. Elle est seulement libérée lors de la lyse de la bactérie

36
Q

Pourquoi les endotoxines sont-elles importantes?

A

Composante majeure de la membrane; 45% du poids de la membrane, couvre 75% de la surface de la bactérie; résiste à la chaleur et aux irradiations; pyrogènes = provoque de la fièvre.

37
Q

Comment se débarrasse-t-on des endotoxines

A

Par chauffage en tunnel de dépyrogénisation

38
Q

Qu’est ce qu’un sidérophore?

A

C’est un métabolite ayant une forte affinité pour le fer permettant ainsi de l’extraire sous sa forme Fe3+ de composés composés en partie de fer.

39
Q

Nomme les deux sidérophores chez Pseudomonas aeruginosa

A

Pyoverdine (PVD)
Pyocheline (PCH)

40
Q

Qu’est ce la pollution

A

Cause qui pertube équilibre d’un écosystème

41
Q

Vrai ou Faux?
Les m-o éliminent la pollution

A

Vrai

42
Q

Quels sont les deux plus grand polluants organiques en France?

A

Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP)
Les polychloro-byphényles (PCB)

43
Q

En général, quels sont les polluants inorganiques les plus fréquemment rencontrés?

A

Les métaux lourds comme Cuivre et Nickel

44
Q

Distingue pollution localisée de pollution diffuse

A

Localisée: Forte polution sur petite surface ex: site industriel
Diffuse: Faible pollution sur grande surface ex: terre agricole

45
Q

Vrai ou Faux
Le Fer est aussi facilement accessible par les sidérophores dans tous les composés où on le retrouve

A

FAUX! Très peu accessible dans l’amiante, car fer est enfoui dans la fibre de silice. Cependant, il est bien accessible lorsque dissout dans l’eau

46
Q

Qu’est ce que l’aminante?

A

C’est une fibre minérale de silice et de magnésium dans laquelle on retrouve du fer enfoui.

47
Q

D’où vient la toxicité de l’amiante

A

Du fer contenu dans ses fibres

48
Q

Nomme quelques source d’amiantes autour de nous

A

Ciment, gypse, vinyle

49
Q

Pourquoi l’amiante est-il dangereux?

A

Cause le cancer par le fer qui catalyse la formation de radicaux libre, dommageant l’ADN

50
Q

Comment l’amiante est-elle traiter

A

99% enfouie
1% vitrifiée (une usine en France, très cher)

51
Q

Nomme une solution pour se débarasser de l’amiante enfouie

A

Utiliser Pseudomonas aeruginosa pour manger le Fe et le Mg

52
Q

Énonce l’ordre de grandeur des besoins en fer et en magnésium de P. aeruginosa. Ensuite, énonce les concentrtion de ces deux métaux dans l’amiante et discute.

A

Besoins: 56 µg Fe, 0,2 mg Mg
[aminante]: 50 mg Fe, 800 mg MG
Il y a un excès de Fe et de Mg dans l’amiante pour subvenir aux besoins de P. aeruginosa

53
Q

Quel type de Microscopie est utilisée pour analyser les fibres d’amiante

A

MET-EDX

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