Quorum sensing Flashcards
Quelles sont les modifications liées à la formation d’une endospore?
Modifications morphologiques
Déshydratation progressive du cytoplasme
Apparition de composés
Dipicolinate de calcium
Petites protéines spécialisées acido-solubles (SASPs)
ADN sporal
Synthèse de la thèque (paroi sporale)
Libération de l’endospore dans le milieu extérieur (endospore –> exospore)
À quoi servent les composés suivants?
Dipicolinate de calcium
SASPs
Dipicolinate de calcium: stabilise les acides nucléiques
SASPs: fixation à l’ADN
Nomme les étapes de la germination d’un spore
Activation
Par
Choc thermique modéré
Abrasion des parois
Substance chimique
Initiation
Réhydratation rapide
Processus enzymatique d’autolyse
Perte du cortex, du dipicolinate
Extrusion
Réhydratation rapide
Dégradation des SASPs
Nomme les différentes structures d’un spore libre de l’extérieur vers l’intérieur. Décris leur composition
Exosporium > Tunique > Cortex > paroi > Noyau
Exosporium: enveloppe protéique lâche
Tunique: couches protéique imperméable (résistance aux enzymes/ produits chimiques)
Cortex: Peptidoglycan modifié
Quel indicateur biologique faut-il sélectionner pour valider un traitement de stérilisation?
Le spore le plus résistant
Nomme quelques souches de bactéries sporulée qui causent des maladies graves chez l’Homme. Nomme aussi les maladies
Clostridium botulinum -> neuroparalysie
Clostridium tetani -> tetanos
Clostridium perfringens -> nécrose (gangraine)
Bacillus anthracis ->anthrax
Nomme les deux pathologies alimentaires (effets) de Bacillus cereus
Effet hématique: toxine sécrétée = céréulide: thermostable, pH acide résistance (estomac)
Effet diarrhétique: 2 toxines = hémolysine et complexe entérotoxique non hémolytique: termosensible et pH sensible.
Nomme un exemple d’utilisation de mycotoxines en biotechnologie dans les 3 domaines suivants: Production de toxines, Production d’antibiotiques et d’enzymes, Cosmétiques
Production de toxine: Utilisation de Bacillus thuringiensis pour protéger ses plantes (insecticide)
Production d’antibiotique et d’enzyme: Utilisation de micromycètes et utiliser leur capacité à produire des antibiotiques (comme les polymyxines) ou des enzymes (comme la subtilisine)
Cosmétique: Botox (toxine botulinique)
Par quoi l’initiation de la sporulation est-elle contrôlée?
Par la compétence de la cellule et par le quorum sensing (donc par la présence des molécules signal que l’on appelle auto-inducteurs)
Qu’est ce que le Quorum sensing?
Mécanisme de communication entre m-o (Système qui détecte le nombre de germes présents)
Quels sont les buts du Quorum Sensing?
Synchroniser l’activité d’un groupe de bactéries
Limiter l’utilisation superflue d’énergie en n’activant que les gènes régulés qu’au moment principe (lorsqu’en grande densité)
Comment les bactéries communiquent entres elles?
par l’intermédiaire de “molécules signal”
Quelle est/sont la/les molécule.s responsables de la communication entre les bactéries à Gram + et à Gram -
Gram + : peptide (ComX, CSF)
Gram - : homosérine lactone
Vari ou Faux?
Pour une bactérie il peut y avoir plusieurs systèmes de quorum sensing
Vrai
Quels sont les 3 facteurs important dans le QS chez les Gram - et leur rôle associé?
Les acylhomosérines lactones (AHL) = AUTO-INDUCTEUR
Lux1 = catalyse la formation d’AHL
LuxR = protéine régulatrice -> module l’expression des gènes
Comment les AHL traversent-elles la membrane?
par DIFFUSION (Gram -)
Quels sont les Médiateurs de la communication intra-espèce chez Bacillus subtillis (Gram +)
ComX
CSF
Comments les peptides autoinducteurs (Gram +) traversent-ils la membrane?
Grâce à des TRANSPORTEURS ABC = transport actif (Gram +)
Explique le système de quorum sensing chez les bactéries à Gram +.
- Maturation (du peptide auto-inducteur)
- Transport actif (vers le milieu extracellulaire)
- Détection (via un récepteur) -> activation d’une cascade de transduction du signal -> messagers secondaires (régulateur de réponse)
- Régulateur de réponse
En répresseur: si le régulateur de réponse est non phosphorylé (à basse concentration bactérienne)
En activateur: de la transcription des gènes si le régulateur de réponse est phosphorylé (à haute densité)
Par quoi le déroulement de la sporulation est-il contrôlé?
Par les facteurs de transcription sigma (σ)
Nomme les différents facteurs sigma σ et leur fonction dans la formation du préspore
Spo0A: active σE et σF, et forme le septum
σE et σF: active σG
σG: auto-active sa production et active σK
Où se situe les facteurs sigma suivant dans la cellule
σE, σF, σG, σK
σE: Cellule mère
σF: Pré-spore
σG: cellule mère
σK: Pré-spore
À quoi correspond DT? Que veut dire le D et le T
DT: temps de réduction du nombre de gènes de 90% (minutes)
D = temps de chauffage
T = température du chauffage
Vrai ou Faux?
Chaque DT est propre à chaque espèce bactérienne et à chaque milieu et varie selon la température du chauffage
Vrai
À quoi correspond Z?
Valeur d’inactivation thermique = variation de température qui modifie DT d’un facteur 10
Nomme les différents types d’agents antifongiques et leur mode d’action respectif.
Polyènes: agit sur l’ergostérol EXISTANT -> disrupts membrane;
Echinocandines: agit sur la synthèse de la chitine (paroi cellulaire);
Azoles: agit sur la synthèse de l’ergostérol (ex fluconazole);
Allylamines agit sur la synthèse de l’ergostérol;
5’-Fluorocytosines: agit sur la synthèse des acides nucléiques
Quel est la contrainte supplémentaire qu’il faut tenir compte lors de la conception d’antifongiques?
Sa toxicité pour l’Homme (les deux sont des eucaryotes)
Nomme les différents mécanismes de résistance au fluconazole chez C. albicans
Surexpression des pompes à efflux (transporteurs ABC (ATP binding cassette) et MF (major facilitator));
Mutation de la cible (ERG11);
Surexpression la cible (ERG11);
Altération de la biosynthèse de l’ergostérol;
Surexpression des pompes à efflux
Quel métabolisme souhaite-t-on exploiter par l’utilisation de micromycètes?
Le métabolisme fermentatif
À quoi servent les ferments fongiques?
Aspect du produit (par l’hydrolyse des protéines du caillé)
Goût et texture (synthèse des aromes)
Lutte contre des éventuels contaminants (contre Penicilium, Mucor et Rhizopus)
Quel est le rôle du sel dans la fabrication de la sauce soja?
inhiber la croissance et le métabolisme de la moissure
limiter la contamination bactérienne
Quelles sont les 4 sortes d’interactions entre les bactéries et les minéraux
L’acidification;
L’oxydo-réduction;
Biofilm;
Chélation
Distingue Sessile de planctonique
Sessile organisms are those that are attached to a surface and do not move around freely. For example, bacteria that form biofilms
Planktonic organisms, on the other hand, are those that are free-floating and move around in a fluid medium, such as water.
Qu’est ce qui mène au choc endotoxique chez les bactéries à Gram -
Le lipide A du LPS
Qu’est ce qu’une endotoxine vs exotoxine?
Exotoxine = sécrétée
Endotoxine = pas sécrétée. Elle est seulement libérée lors de la lyse de la bactérie
Pourquoi les endotoxines sont-elles importantes?
Composante majeure de la membrane; 45% du poids de la membrane, couvre 75% de la surface de la bactérie; résiste à la chaleur et aux irradiations; pyrogènes = provoque de la fièvre.
Comment se débarrasse-t-on des endotoxines
Par chauffage en tunnel de dépyrogénisation
Qu’est ce qu’un sidérophore?
C’est un métabolite ayant une forte affinité pour le fer permettant ainsi de l’extraire sous sa forme Fe3+ de composés composés en partie de fer.
Nomme les deux sidérophores chez Pseudomonas aeruginosa
Pyoverdine (PVD)
Pyocheline (PCH)
Qu’est ce la pollution
Cause qui pertube équilibre d’un écosystème
Vrai ou Faux?
Les m-o éliminent la pollution
Vrai
Quels sont les deux plus grand polluants organiques en France?
Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP)
Les polychloro-byphényles (PCB)
En général, quels sont les polluants inorganiques les plus fréquemment rencontrés?
Les métaux lourds comme Cuivre et Nickel
Distingue pollution localisée de pollution diffuse
Localisée: Forte polution sur petite surface ex: site industriel
Diffuse: Faible pollution sur grande surface ex: terre agricole
Vrai ou Faux
Le Fer est aussi facilement accessible par les sidérophores dans tous les composés où on le retrouve
FAUX! Très peu accessible dans l’amiante, car fer est enfoui dans la fibre de silice. Cependant, il est bien accessible lorsque dissout dans l’eau
Qu’est ce que l’aminante?
C’est une fibre minérale de silice et de magnésium dans laquelle on retrouve du fer enfoui.
D’où vient la toxicité de l’amiante
Du fer contenu dans ses fibres
Nomme quelques source d’amiantes autour de nous
Ciment, gypse, vinyle
Pourquoi l’amiante est-il dangereux?
Cause le cancer par le fer qui catalyse la formation de radicaux libre, dommageant l’ADN
Comment l’amiante est-elle traiter
99% enfouie
1% vitrifiée (une usine en France, très cher)
Nomme une solution pour se débarasser de l’amiante enfouie
Utiliser Pseudomonas aeruginosa pour manger le Fe et le Mg
Énonce l’ordre de grandeur des besoins en fer et en magnésium de P. aeruginosa. Ensuite, énonce les concentrtion de ces deux métaux dans l’amiante et discute.
Besoins: 56 µg Fe, 0,2 mg Mg
[aminante]: 50 mg Fe, 800 mg MG
Il y a un excès de Fe et de Mg dans l’amiante pour subvenir aux besoins de P. aeruginosa
Quel type de Microscopie est utilisée pour analyser les fibres d’amiante
MET-EDX
