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MICA > Cours 1 (Microbiologie Marine) > Flashcards

Cours 1 (Microbiologie Marine) Flashcards

1
Q

Quelle est la salinité moyenne de l’eau de mer

A

0,32% à 0,38%

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Q

Quel est le pH approximatif de l’eau de mer

A

8

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3
Q

Quelle sont les 5 chose à tenir compte dans un milieu de culture

A
  1. Source de carbone
  2. Source d’azote
  3. Température
  4. Condition atmosphérique (aérobie/anaérobie)
    5 Agent sélectif (accepteur d’e-, vitamine, source carbone, etc)
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4
Q

Quelles sont les trois types de fonds marins en ordre croissant de profondeur?

A

Plateau (continental) (200-400 m), abysses (plaines abyssales) (2000-6000 m), fosses (>6000 m)

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5
Q

Comment peut-on expliquer la présence des bactéries phototrophes seulement en surface des océans?

A

La lumière ne pénètre pas plus loin que les premières centaines de mètres d’eau. Plus on est en profondeur, plus des longueurs d’ondes ne s’y rendent pas

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6
Q

Comment s’appelle la région là où la lumière réussi à pénétrer dans l’eau

A

Zone photique

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7
Q

Quel type d’organisme réside sous les phototrophes

A

Les hétérotrophes aérobie

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8
Q

Où les bactéries anaérobies résident-elles en général?

A

Sur les fonds marins ou dans les fonds marins (sédiments)

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9
Q

Quelle est la nuance entre la photosynthèse et la chimiosynthèse?

A

La photosynthèse est la réaction menant à la production de matière organique à partir d’énergie lumineuse
La chimiosynthèse est la réaction menant à la production de matière organique à partir d’énergie chimique provenant de composés chimiques réduits

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10
Q

Quels sont les 3 composés chimiques réduits servant à la chimiosynthèse?

A

H2, H2S, CH4

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11
Q

Quel est la nuance entre les chimioorganotrophes et les chimiolithiotrophes?

A

L’un utilise de la matière organique comme réactif, alors que l’autre utilise des molécules inorganiques

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12
Q

Quel est le but ultime de la phototrophie et de la chimiotrophie?

A

Produire de l’ATP

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13
Q

D’où vient l’énergie dans l’ATP?

A

Dans la liaison phosphodiester entre le P beta et le P gamma

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14
Q

Comment régénérer de l’ATP?

A

ADP + Pi

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15
Q

Quelle est la différence entre la photohétérotrophie et la photautotrophie?

A

La photohétérotrophie est un organisme qui effectue la synthèse de matière organisme complexe à partir de composés organiques (chimiques) et à partir de lumière
La photoautotrophie est un organisme qui effectue la synthèse de matière organique complexe seulement à partir d’énergie lumineuse et de CO2, produit par l’organisme lui-même

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16
Q

Comment l’ATP est-elle produite?

A

La chaîne respiratoire permet de former un gradient de protons à travers la membrane grâce au flux d’électron des accepteurs d’électrons tels que NADH, NADPH. L’ATP synthase synthétise l’ATP

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17
Q

Vrai ou Faux?
Il existe 6 différents pigments de chlorophylle, les plus fréquents étant le rouge et le bleu

A

Faux, 7 pigments, Vert et Pourpre

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18
Q

À quoi sert les caroténoïdes?

A

Protéger les cellules contre les rayons UV (absorbent le bleu/vert)

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19
Q

Pourquoi la chlorophylle est-elle verte?

A

Car elle est composée de deux pigments qui absorbent le violet et le rouge. Elle reflète alors le vert

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20
Q

Quelle est la différence entre la photosynthèse oxygénique et anoxygénique? Chez quel type d’organisme ces deux réactions sont-elles réalisées? Nomme les molécules

A

photosynthèse oxygénique: réalisée par cyanobactéries. H2O réduit le CO2, formant du glucose et regénérant l’ATP
photosynthèse anoxygénique: réalisée par bactéries sulfureuses pourpres. H2S réduit le CO2, formant du glucose et regénérant l’ATP

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21
Q

Que sont des thylacoïdes?

A

Ce sont des petites vacuoles qui captent l’énergie lumineuse et la transforme en ATP. Elles sont présentes chez les deux types de photosynthèse

22
Q

Quelles sorte de bactérie sera le plus près de la surface entre les cyanobactéries et les bactéries sulfureuses? Pourquoi?

A

Les cyanobactéries sont plus près de la suface, car leur métabolisme (photosynthèse oxygénique) nécessite la présence d’oxygène, qui est davantage présente près de la suface marine.
Les bactéries sulfureuses quant à elles, ne nécessite pas d’oxygènes, elles vivent donc d’avantage en profondeur, là où leur nutriment, le sulfure, est plus présent.

23
Q

Quelle sorte de bactérie vit sous les bactéries sulfureuses pourpres? Pourquoi?

A

Des bactéries réductrices de sulfate. Elle réduisent le sulfate produit par les bactéries sulfureuses pourpres en H2S. Leur nutriment est l’excrément de l’autre.

24
Q

Quels sont les accepteur finaux d’e- dans l’océan? Nomme l’accepteur final et sa forme réduite, et sa profondeur:

A

Zone oxique: O2 -> H2O
Zone anoxique: NO3- -> N2, SO4– -> H2S, CO2 -> CH4

25
Q

Par quel unique type d’organisme le méthane est-il produit?

A

Les Archaea

26
Q

Combien de molécule(s) de pyruvate est/sont-elle(s) produite(s) dans la glycolyse

A

2

27
Q

Combien de molécules d’ATP sont produites chez les procaryotes vs les eucaryotes? Comment la différence s’explique-t-elle?

A

Procaryote: 38 ATP
Eucaryote: 36 ATP
Chaque molécule de pyruvate (2) doit être transporté à la mitochondrie pour que le cycle de Krebs ait lieu. Coût de 1ATP par pyruvate

28
Q

Quelles sont les 5 réactions dans le cycle de l’azote? Sous quelle(s) forme l’azote peut-elle être utilisée pour la synthèse protéique? Ce réactions se font-elles en conditions oxiques ou anoxiques?

A

Nitrification: NH4+ – NO2- –> NO3- (oxique)
Dénitrification: NO3- – NO2- –> N2 (anoxique)
Fixation: N2 –> NH4+ (les 2)
Ammonification: NH2 de protéines –> NH4+ (les 2)
Assimilation: NO3- –> NH2 (oxique)

29
Q

Qu’est ce que la réaction anamox. Quel est son résultat? Nomme une de ses utilité

A

(Anaerobic Ammonium Oxidation) Transformation de nitrite et ammonium en azote GAZEUSE et eau. Il y a perte d’azote dans l’océan. On peut s’en servir pour éliminer l’azote sous forme d’ammonium dans l’eau.

30
Q

Sous quelle forme le soufre est-il assimilé dans les protéines? En quoi est-il transformé dans une protéines

A

SO42-, SH

31
Q

Qu’est ce que la désulfuration?

A

SH –> H2S

32
Q

Qu’est ce que la réduction du soufre?

A

S –> H2S

33
Q

Qu’est ce que la disproponiation du soufre?

A

S –> SO42-

34
Q

Qu’est ce que la sulfato-réduction?

A

SO42- –> H2S

35
Q

Qu’est que l’oxidation chimiolithique?

A

Processus de transformation du H2S en So42-
H2S –> S –> SO42-

36
Q

Quel est le rôle de bactéries sulfo-oxydantes?

A

H2S –> SO42-

37
Q

Quel est le rôle de bactéries sulfo-réductrices?

A

SO42- –> H2S

38
Q

Quel est le rôle de bactéries méthanogènes?

A

Forment du méthane

39
Q

Quel est le rôle de bactéries méthanotrophes?

A

Nécessitent du méthane

40
Q

Ouù se situent les sources hydrothermales marines?

A

aux joinctions de plaques techtoniques

41
Q

Nomme quelques caractéristiques du fluide relâché par les sources hydrothermales

A

Chaud (jusqu’à 300 degrés), acide (pH = 3), anoxique, bcp soufre, bcp métaux

42
Q

Les autotrophes ne passent pas par le cycle de krebs. Quelle alternative ont-ils?

A

Cycle de Calvin

43
Q

Quels sont les deux enzymes principales participants au cycle de calvin et quel est leur rôle?

A

Phosphoribulokinase: phosphoryle le 6-R5P en 1,6-R5P
RUBISCO: transforme le 1,6-R5P en longue chaîne hydrocarbonée

44
Q

Nomme les conditions idéales des différentes bactéries extrêmophiles
Alcalophile;
Barophile;
Psychrophile;
Thermophile;
Halophile;
Acidophile;

A

Alcalophile: milieu très basique (pH 10)
Barophile: Très hautes pressions (100^6 Pa)
Psychrophile: 4^C
Thermophile: 75^C
Halophile: forte concentration de sel halophile (ex: NaCl) (15%)
Acidophile: milieu très acide (pH 3)

45
Q

De quel type d’organisme est majoritairement composé les extrêmophiles

A

Archaea

46
Q

Nomme un synonyme des organismes barophile

A

Piezzophile

47
Q

Quel est l’inverse des sources hydrothermiques. Où en retrouve-t-on?

A

Sources de fluides froids (Température = (2-4^C). On les retrouve en zones peu profonde (plateau continental)

48
Q

Qu’est ce qu’un hydrate de méthane?

A

C’est une molécule de méthane emprisonnée par une couche d’eau (glace)

49
Q

Combien de litre de méthane sont relâchés lors de la combustion d’un litre d’hydrate de méthane

A

160 L

50
Q

Qu’est ce que Riftia pachyptilia et calyptogena magnifica

A

Ce sont de organismes vivants à de très grandes profondeurs

51
Q

Qu’est ce que le trophosome chez riftis pachyptila

A

C’est un organe hautement vascularisé (explique la couleur rouge). Relation symbiotique avec bactéries sulfo oxidantes à l’intérieur. Bactéries donne nourriture à riftia

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