Química Biológica - Enzimología

Question 1

Que quiere decir 5UI/mg?

Answer 1

1mg de proteina — en 1 minuto — va a consumir 5mM de sustrato

Question 2

Ecuacion para cambio de concentracion de producto en el tiempo:

Answer 2

Vo= d[P]/dt

Question 3

Ecuacion para desaparición de sustrato en el tiempo:

Answer 3

Vo=-d[S]/dt

Question 4

Existe un pH optimo?

Answer 4

Si, es en el que los aA involucrados estan cargados especificamente para que la enzima reaccione con el sustrato. Tambien existe una Temp optima.

Question 5

Como se relacionan la concentracion de enzimas y la actividad enzimatica?

Answer 5

A medida que aumenta la concentracion de enzimas, aumenta linealmente la actividad enzimatica.

Question 6

Que quieren decir las K? Da ejemplos.

Answer 6

K nos da idea de cuánta reacción se da. Ej si K1 es mucho mayor que K-1, quiere decir que la reaccion se da practicamente toda hacia la derecha.

Question 7

Que es Kcat?

Answer 7

Kcat y K2 son sinonimos

Question 8

K1.[E].[S]=

Answer 8

velocidad de formacion de complejo ES

Question 9

K-1.[ES]=

Answer 9

velocidad de ruptura de complejo ES

Question 10

Como se cual es la concentracion total de enzima en el sistema?

Answer 10

Es la suma de enzima libre y en complejo

Question 11

Que parametros pueden ser optimizados en una reaccion para que la actividad de la enzima sea maxima?

Answer 11

La temperatura, el pH, la concentración de cofactores

Question 12

Que es km? matematicamente

Answer 12

km=k-1.k2/k1

Question 13

Que es km? conceptualmente

Answer 13

Es la concentración a la cual la reaccion va a la mitad de su velocidad max. Me da una idea de la afinidad de esa enzima por su sustrato.

Question 14

Como saco km y vmax de linealizacion de Lineweaver-Burk?

Answer 14

La oendiente de la recta de la linealizacion es km/vmax

Question 15

Vo segun Briggs y Haldane

Answer 15

Vo=Vmax[S]/km+[s]

Question 16

Vmax segun Briggs y Haldane

Answer 16

Vmax=k2.[E]T

Question 17

Recrea grafico linealizacion lineweaver-burk

Answer 17

es el y=1/Vo x=1/[S]

Question 18

Recrea grafico linealizacion eadie hofstee

Answer 18

y=Vo x=Vo/[S]

Question 19

Cómo afectan los cambios en la presión al sistema?

Answer 19

Puede afectar la disposicion espacial de los grupos y generar sobrehidratación.

Question 20

Cómo afecta la temperatura al sistema?

Answer 20

Cuanto más sube la temperatura, más aumenta la actividad. Cuidado de no llegar a la desnaturalizacion, eso baja la actividad. Implica que hay una temp optima.

Question 21

Que es la inhibicion por producto?

Answer 21

Es cuando al subir los niveles de producto final, este se une al sitio alosterico de la enzima y actua como inhibidor enzimatico de la enzima misma que permite su existencia.

Question 22

Que es la inhibicion por sustrato?

Answer 22

Se da una disminución progresiva de la actividad a partir de [S]max porque hay tanto sustrato que el complejo EP se bloquea cuando mas de una molec de sustrato intenta unirse.

Question 23

Como funcionan los inhibidores?

Answer 23

Inhibidores enzimaticos son moleculas que se unen a enzimas y no permiten que se les una el sustrato.

Question 24

Explica regulacion alostérica - inhibidor

Answer 24

Es cuando un inhibidor enzimatico se une al sitio alosterico, esto genera que el sitio activo se modifique y ya no sea capaz de unirse al sustrato.

Question 25

Explica regulacion alosterica - activador

Answer 25

Es cuando un activador enzimatico se une al sitio alosterico generando que el sitio activo modificado “vuelva” a un estado en el que sea capaz de unirse al sustrato.

Question 26

3 caracteristicas de inhibidores (que no sea que pueden ser reversibles o no)

Answer 26

• actúan aunque esten en bajas concentraciones
• se unen tanto a la E como al complejo ES
• no desnaturalizan la proteína

Question 27

Que caracteriza la inhibición irreversible?

Answer 27

Uniones covalentes

Question 28

Explica inhibición competitiva, cómo lo soluciono, cómo varían Vmax y Km.

Answer 28

Molécula muy similar al sustrato se une al sitio activo y la enzima queda obstruida e inutil. Para solucionarlo se debe añadir mas sustrato tal de desplazar el equilibrio de la reacción hacia la izq. revirtiendo la inhibición. Vmax se mantiene igual y Km aumenta.
km’=km(1+[I]/Kic)

Question 29

Explica inhibición acompetitiva y cómo afecta a Vmax y Km.

Answer 29

El inhibidor se une al complejo ES, la enzima queda trancada sin poder formar producto a pesar de estar en complejo, queda ESI. Vmax y Km disminuyen.
Vmax’=(Vmax)/(1+[I]/Kia)
Km’=(km)/(1+[I]/Kia)
No se soluciona agregando sustrato.

Question 30

Explica inhibicion mixta y como afecta a Vmax y Km.

Answer 30

El inhibidor se une a la enzima tanto estando libre E como cuando esta en complejo ES. Por esto posee Kic y Kia.
Vmax’=(Vmax)/(1+[I]/Kia)
Km’=(km(1+[i]/Kic))/(1+[i]/Kia)
Vmax disminuye
Km aumenta o disminuye dependiendo de Kic y Kia
No se soluciona agregando sustrato.

Question 31

Explica inhibicion no competitiva y como afecta a Vmax y Km.

Answer 31

La union del inhibidor no se da en el sitio activo, sino que en otro lugar, por lo que inactiva a la enzima sin competir (porque el sustrato se le une, pero es inutil). Al mismo tiempo es mixta, porque como no depende del sitio activo no le cambia nada que este en complejo o no. Su constante es Ki.
Vmax’=Vmax/(1+[I]/Ki)
Vmax disminuye
Km se mantiene igual
No se soluciona agregando sustrato.

Question 32

Explica diferencias entre:
1. Especificidad absoluta
2. Especificidad de grupo
3. Especificidad de enlace
4. Especificidad estereoquimica

Answer 32

1. Cataliza una única reacción
2. Actúa sobre un único grupo funcional
3. Actúa sobre un único tipo de enlace sin importar el resto de la molécula
4. La enzima actúa sobre un isómero óptico en particular

Question 33

Que es la catálisis ácido-base?

Answer 33

Es cuando los grupos R de aA aceptan o ceden protones para estabilizar el estado de transición.

Question 34

Que es la catálisis covalente?

Answer 34

Es cuando los grupos R de aA interaccionan con el sustrato y forman intermediarios.

Question 35

QUE ES LA CATALISIS POR IONES METALICIOS?

Answer 35

Orientan sustratos - estabilizan intermediarios cargados

Question 36

Que es la catalisis electrostatica?

Answer 36

Excluye agua del sitio activo. Estabiliza producto intermediario.