Protéines Flashcards
Qu’est-ce qu’une protéine ?
Chaîne d’acides aminés reliés entre eux par un lien peptidique
Donner la formule du nombre de possibilités de différentes protéines en fonction du nombre de sa longueur.
20 à la puissance du nombre d’acides aminés
Quels sont les 2 fonctions toujours sur un acide aminé ?
Acide = COOH Amine = NH2
Qu’est-ce qu’un carbone alpha ?
Carbone qui porte 4 groupements différents.
Sous quelle configuration est-ce que les acides aminés formant les protéines sont ?
Configuration L
Comment appelle-t-on le groupement qui confère à l’acide aminé son unicité ?
Groupement R ou chaîne latérale
Selon quelle propriété est-ce que les acides aminés sont-ils classés ?
Leur chaîne latérale
Quelles sont les 4 classes d’acides aminés ?
- Hydrophobe ou non-polaire
- Polaire non-chargée
- Polaire basique (+)
- Polaire acide (-)
Quelle est la particularité des chaînes polaires ?
Elles forment des liens hydrogènes avec l’eau.
Comment différencier une chaîne non-polaire et une chaîne polaire non-chargée ?
Les chaînes polaires non-chargées ont tous un atome d’oxygène, sauf la Cystéine qui a un SH.
Qu’est-ce que l’enthalpie ?
Énergie nécessaire pour briser une liaison
Quelles sont les 5 types de liaisons ?
- Covalentes
- Hydrophobes
- Électrostatiques
- Hydrogènes
- Van der Waals
Donner un exemple de liaison covalente
Ponts disulfures
Décrire une liaison covalente
2 atomes partagent 2 électrons de valence
Est-ce que la liaison covalente est un lien fort ou faible ?
Fort
Décrire une liaison électrostatique
Attraction de 2 charges opposées
Décrire les forces de Van der Waals
Attraction de 2 charges partielles opposées
Décrire une liaison hydrogène
Attraction intra ou intermoléculaire d’un hydrogène à un atome négatif
Décrire une liaison hydrophobe
Attraction de 2 chaînes non-polaires dans le but d’éviter d’entrer en contact avec l’eau
Où se trouve le lien alpha-peptidique ?
Entre le C du COOH et le N du NH2 de deux acides aminés différents.
Quelle est la configuration normale d’un acide aminé ?
Trans (en diagonale)
Qu’est-ce que la structure primaire d’un acide aminé ?
Séquence des acides aminés dictée par l’ADN
Qu’est-ce que la structure secondaire d’un acide aminé ?
Conformation répétée de la chaîne polypeptidiques
Nommer les 3 structures secondaires possibles
- Hélice alpha
- Feuillet beta
- Pelote statique
En quoi consiste une hélice alpha ?
Enroulement de la chaîne polypeptidique
En quoi consiste un feuillet beta ?
Accolement de plusieurs chaînes en parallèles ou en anti-parallèles
Qu’est-ce que la configuration anti-parallèle du feuillet beta ?
C-terminale contre N-terminale d’une autre chaîne
En quoi consiste la pelote statique ?
Conformation aléatoire
Dans une hélice alpha, où se trouvent normalement les chaînes latérales ?
Vers l’extérieur pour ne pas encombrer l’intérieur
Que se passe-t-il avec l’hélice alpha si elle est amphipathique ?
Une face sera hydrophile et une autre hydrophobe qui tentera de s’enrouler ou de se coller à la face hydrophobe d’une autre molécule afin d’éviter de toucher l’eau.
Qu’est-ce que la structure tertiaire d’un acide aminé ?
Repliement en 3D qui lui confère sa fonction biologique