Protein-coding genes 2

Question 1

Componentes de las Splice junctions (secuencias consenso union intrones-exones)

determina donde inicia y termina el splicing

Answer 1

• Sitio donador (5’ del intrón. Contiene la secuencia conservada GU )
• Sitio aceptor (3’ del intrón. Contiene la secuencia conservada AG )
• Sitio ramificado (Se ubica cerca del extremo 3’ del intrón, usualmente 20-50 nucleótidos antes del sitio aceptor)

Question 2

Proceso splicing

Answer 2

• Ataque nucleofílico 1 →ataque químico de la adenina presente en el branch site contra la G del extremo 5’ (forma lazo)
• Provoca rompimiento de la union intron-exon del sitio donador.
• Ataque nucleofílico 2 → En el sitio aceptor 3’, lo que lleva a la escisión y liberación del intrón en forma de lazo, y al empalme de los dos exones.

Question 3

¿Qué es el splicing alternativo?

Answer 3

• mecanismo de produccion de diferentes isoformas de proteinas transcritas por un solo gen
• es diferente dependiendo de la cx en la que esté

exones con splicing A son muy comunes en el SN

Question 4

Transporte del ARNm al citoplasma

ARNm + proteínas heterogéneas nucleares

Answer 4

complejo proteíco mensajero nuclear (mRNP)

Question 5

Estructuras del núcleo que permiten la salida del ARNm al citoplasma

Answer 5

Poros nucleares de membrana
* Cada poro esta formado por un complejo de poro nuclear (NCP)

nucleoporinas→proteínas

Question 6

ARN más abundante

Answer 6

ARNr

80%, nucleolo

Question 7

Tipos de ARNr

Answer 7

• 28s (ARN pol. I)
• 18 (ARN pol. I)
• 5.8s (ARN pol. I)
• 5s (ARN pol. III)

Question 8

¿En dónde se lleva la transcripcion y procesamiento del ARNr?

Answer 8

nucleolo

Question 9

¿Cuáles son las regiones que se necesitan para la unión de la ARN pol. I durante la transcripción del ARN?

Answer 9

• Elemento upstream en -155 a -60
• Sitio de inicio de la transcripción→ -40 a +5

Question 10

¿Qué elementos dan la iniciacion de la ARN pol. I para la transcripcion del ARNr?

Answer 10

• Unión de factor de activación multimérico UAF al elemento río arriba. (Compuesto por las histonas H3 y H4)
• Unión de factor trimerico y TBP al elemento central en donde interactuan con UAF

Question 11

¿Dónde lleva a cabo la transcripcion del ARNr 5S, ARNt, ARNm?

Answer 11

núcleo

Question 12

¿Por quién son reconocidas las posiciones de corte del pre-ARNr?

Answer 12

snoARN (small nucleolar ARN)

Question 13

¿Cómo se va cortando el 45S del ribosoma (80S)?

Answer 13

45 se corta y se libera el 18 (este queda libre)
41 se corta y se libera 5.8 y 28
28 se corta y se asocia con el 5.8

El 5S se agrega en otro momento

Question 14

subunidad menor del ribosoma

Answer 14

total: 40s
ARNr 18 s + 33 proteínas

Question 15

subunidad mayor del ribosoma

Answer 15

total: 60s
ARNr 28s, 5.8s y 5s + 49 proteínas

Question 16

¿Las subunidades del ribosoma cuando salen del nucleolo salen juntas?

Answer 16

falso
(la 5S se les une dentro del nucleolo pero salen la 60S y la 40S separadas por el NPC, solo se unen cuando llega el ARNm)

NPC: complejo poro nuclear

Question 17

Factores de transcripción para ARNr-5s

Answer 17

• TFIIA: 5s-ARNr
• TFIIB: ARNt y 5s-ARNr
• TFIIC: ARNt y 5s-ARNr

Question 18

¿Qué ARN pol. transcribe al ARNt?

Answer 18

polimerasa III

Question 19

¿Qué cajas intervienen en la transcripción de ARNt y ARNr?

Answer 19

• caja C: 5s-ARNr
• caja A y B: ARNt

Question 20

¿Qué cajas van a hablar a qué FT?

Answer 20

• Cajas A y B→TFIIB y TFIIC
• Caja C→ TFIIA para que esa atraiga a la TFIIB y TFIIC

Question 21

Proceso de maduración pre-ARNt

tiene 75-80 nt

Answer 21

1. Eliminación del intron (14 nt) → splicing
2. Secuencia 5’ (16 nt) eliminada por ribonucleasa P.
3. Residuo UU (3’)→ son remplazados por ACC para que se pegue el aminoácido
4. Bases son modificadas