Protein-coding genes 2 Flashcards
Componentes de las Splice junctions (secuencias consenso union intrones-exones)
determina donde inicia y termina el splicing
- Sitio donador (5’ del intrón. Contiene la secuencia conservada GU )
- Sitio aceptor (3’ del intrón. Contiene la secuencia conservada AG )
- Sitio ramificado (Se ubica cerca del extremo 3’ del intrón, usualmente 20-50 nucleótidos antes del sitio aceptor)
Proceso splicing
- Ataque nucleofílico 1 →ataque químico de la adenina presente en el branch site contra la G del extremo 5’ (forma lazo)
- Provoca rompimiento de la union intron-exon del sitio donador.
- Ataque nucleofílico 2 → En el sitio aceptor 3’, lo que lleva a la escisión y liberación del intrón en forma de lazo, y al empalme de los dos exones.
¿Qué es el splicing alternativo?
- mecanismo de produccion de diferentes isoformas de proteinas transcritas por un solo gen
- es diferente dependiendo de la cx en la que esté
exones con splicing A son muy comunes en el SN
Transporte del ARNm al citoplasma
ARNm + proteínas heterogéneas nucleares
complejo proteíco mensajero nuclear (mRNP)
Estructuras del núcleo que permiten la salida del ARNm al citoplasma
Poros nucleares de membrana
* Cada poro esta formado por un complejo de poro nuclear (NCP)
nucleoporinas→proteínas
ARN más abundante
ARNr
80%, nucleolo
Tipos de ARNr
- 28s (ARN pol. I)
- 18 (ARN pol. I)
- 5.8s (ARN pol. I)
- 5s (ARN pol. III)
¿En dónde se lleva la transcripcion y procesamiento del ARNr?
nucleolo
¿Cuáles son las regiones que se necesitan para la unión de la ARN pol. I durante la transcripción del ARN?
- Elemento upstream en -155 a -60
- Sitio de inicio de la transcripción→ -40 a +5
¿Qué elementos dan la iniciacion de la ARN pol. I para la transcripcion del ARNr?
- Unión de factor de activación multimérico UAF al elemento río arriba. (Compuesto por las histonas H3 y H4)
- Unión de factor trimerico y TBP al elemento central en donde interactuan con UAF
¿Dónde lleva a cabo la transcripcion del ARNr 5S, ARNt, ARNm?
núcleo
¿Por quién son reconocidas las posiciones de corte del pre-ARNr?
snoARN (small nucleolar ARN)
¿Cómo se va cortando el 45S del ribosoma (80S)?
45 se corta y se libera el 18 (este queda libre)
41 se corta y se libera 5.8 y 28
28 se corta y se asocia con el 5.8
El 5S se agrega en otro momento
subunidad menor del ribosoma
total: 40s
ARNr 18 s + 33 proteínas
subunidad mayor del ribosoma
total: 60s
ARNr 28s, 5.8s y 5s + 49 proteínas
¿Las subunidades del ribosoma cuando salen del nucleolo salen juntas?
falso
(la 5S se les une dentro del nucleolo pero salen la 60S y la 40S separadas por el NPC, solo se unen cuando llega el ARNm)
NPC: complejo poro nuclear
Factores de transcripción para ARNr-5s
- TFIIA: 5s-ARNr
- TFIIB: ARNt y 5s-ARNr
- TFIIC: ARNt y 5s-ARNr
¿Qué ARN pol. transcribe al ARNt?
polimerasa III
¿Qué cajas intervienen en la transcripción de ARNt y ARNr?
- caja C: 5s-ARNr
- caja A y B: ARNt
¿Qué cajas van a hablar a qué FT?
- Cajas A y B→TFIIB y TFIIC
- Caja C→ TFIIA para que esa atraiga a la TFIIB y TFIIC
Proceso de maduración pre-ARNt
tiene 75-80 nt
- Eliminación del intron (14 nt) → splicing
- Secuencia 5’ (16 nt) eliminada por ribonucleasa P.
- Residuo UU (3’)→ son remplazados por ACC para que se pegue el aminoácido
- Bases son modificadas
