Protein- Coding genes Flashcards
Características del ADN
- Doble cadena de nt.
- Semiconservadora
- Antiparalela
- Esqueleto de pentosas de fosfato
Formas del ADN
B = 10pb (giro a la derecha)
A = 11pb (giro a la derecha)
Z = 12pb (giro a la izquierda )
la + comun es la B
¿Qué es un gen?
secuencias de Ác. nucleicos necesarios para la síntesis de un producto génico funcional (proteína o ARN)
secuencias codificantes (exones) & no codificantes (intrones)
¿En qué sentido va la transcripción?
5’ – 3’
V/F La hebra nueva de ARN es igual a la hebra sentido (original) de ADN (5’-3’) susitituyendo A por U
verdadero
porque toma a la hebra rezagada como molde
V/F El primer nt. de la hebra de ARN es trifosfatado y a partir de ahí se pierden pirofosfatos y quedan monofosfatados
verdadero
Modificaciones postranscripcionales del ARNm
- Splicing (Remover intrones)
- se pone Cola de poli A (3’)
- se pone Caperuza (5’)
¿Qué es río arriba y río abajo?
- arriba: en la dirección del -1 (regiones reguladoras)
- abajo: en la direccion del +1 (donde inicia transcripcion “1er exon”)
Regiones promotoras/reguladoras
- Van a regular si se transcribe o no el gen llamando a los FT para que se unan
- Están antes de la caperuza (lugar -1)
¿Qué es la caja TATA?
secuencias promotora de T y A repetidas de 25pb rio arriba
Polimerasa que transcribe el ARNm
polimerasa II
¿Qué es la caja GC?
- secuencia promotora con GGGCGG
- En genes que no tienen la caja TATA (la mayoria de veces)
- Pueden estar en direccion 5’ – 3’ o viceversa (palindromica)
- se unen FT SP1, SP3 y SP4
Que son genes constitutivos (house keeping)
se transcriben todo el tiempo y en todos los tejidos
Islas CpG
P = enlace fosfodiester
- regiones con muchas C y G (sitios de metilacion)
- 100pb rio arriba
- están metiladas (hiper) → inhibe transcripcion. Desmetiladas (hipo) → promueve transcripcion
- primero se desmetila y después se une caja TATA (Indica entonces, el inicio de la transcripcion)
Caja CAAT
- están río arriba (-80 pb)
- secuencia reguladora
- puede ir en cualquier direccion (5’ – 3 o 3’ – 5’)
Potenciadores distantes
¿Qué son los potenciadores (enhancers)?
- distantes (alejados del sitio de transcripcion)
- 50kb rio arriba
- rio abajo en algun exon o intron
- especificos según el tipo celular
- reguladores tipo CIS
primer enhancer descubierto: simio
Pasos de la transcripcion
- Iniciacion
- Elongacion
- Terminacion
Proceso de transcripcion
- RNA polimerasa se une a la hebra de ADN
- se abre la cadena de ADN
- polimerasa une nucleotidos (5’ – 3’) hasta el sitio de terminacion
- suelta el ARNm inmaduro
Conformacion del ARN transcrito primario
- UTR (untranslated regions)
- M7Gppp Cap o 5’cap
- intrones
- exones
- cola de poli A
Si el ARN solo tiene cola de poli A y 5’cap se le llama…
ARN inmaduro
Enzimas que cortan y ponen la cola de poli A en el ARN primario
- Endonucleasa: corta ADN
- Poli-A polimerasa: pone cola de poli-A
¿Qué pasa si hay una mutación en exones e intrones?
- exon → mutación que más afecta función protes
-
intron → no afecta pero
1. en región promotora → no se daría el proceso
2. en region de terminacion → no se daria señal de fin
ARN recien sintetizado se le llama:
- transcrito primario
- RNA heterogeneo
- RNA precursor
Función de la adicion de 5’cap
- protege ARN de degradacion
- transporta ARN al citoplasma
- sitio de union de factor proteico (ribosoma) para la traduccion
Funcion de la adicion de cola de poli A
- 100-250 A
- Protege de degradacion
- Facilita la traduccion en ribosomas
Funcion del splicing
- eliminacion de intrones (no codificantes)
- union de exones (codificante)
