Protein- Coding genes Flashcards

1
Q

Características del ADN

A
  • Doble cadena de nt.
  • Semiconservadora
  • Antiparalela
  • Esqueleto de pentosas de fosfato
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Formas del ADN

A

B = 10pb (giro a la derecha)
A = 11pb (giro a la derecha)
Z = 12pb (giro a la izquierda )

la + comun es la B

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

¿Qué es un gen?

A

secuencias de Ác. nucleicos necesarios para la síntesis de un producto génico funcional (proteína o ARN)

secuencias codificantes (exones) & no codificantes (intrones)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

¿En qué sentido va la transcripción?

A

5’ – 3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

V/F La hebra nueva de ARN es igual a la hebra sentido (original) de ADN (5’-3’) susitituyendo A por U

A

verdadero

porque toma a la hebra rezagada como molde

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

V/F El primer nt. de la hebra de ARN es trifosfatado y a partir de ahí se pierden pirofosfatos y quedan monofosfatados

A

verdadero

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Modificaciones postranscripcionales del ARNm

A
  1. Splicing (Remover intrones)
  2. se pone Cola de poli A (3’)
  3. se pone Caperuza (5’)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

¿Qué es río arriba y río abajo?

A
  • arriba: en la dirección del -1 (regiones reguladoras)
  • abajo: en la direccion del +1 (donde inicia transcripcion “1er exon”)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Regiones promotoras/reguladoras

A
  • Van a regular si se transcribe o no el gen llamando a los FT para que se unan
  • Están antes de la caperuza (lugar -1)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

¿Qué es la caja TATA?

A

secuencias promotora de T y A repetidas de 25pb rio arriba

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Polimerasa que transcribe el ARNm

A

polimerasa II

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

¿Qué es la caja GC?

A
  • secuencia promotora con GGGCGG
  • En genes que no tienen la caja TATA (la mayoria de veces)
  • Pueden estar en direccion 5’ – 3’ o viceversa (palindromica)
  • se unen FT SP1, SP3 y SP4
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Que son genes constitutivos (house keeping)

A

se transcriben todo el tiempo y en todos los tejidos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Islas CpG

P = enlace fosfodiester

A
  • regiones con muchas C y G (sitios de metilacion)
  • 100pb rio arriba
  • están metiladas (hiper) → inhibe transcripcion. Desmetiladas (hipo) → promueve transcripcion
  • primero se desmetila y después se une caja TATA (Indica entonces, el inicio de la transcripcion)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Caja CAAT

A
  • están río arriba (-80 pb)
  • secuencia reguladora
  • puede ir en cualquier direccion (5’ – 3 o 3’ – 5’)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Potenciadores distantes

¿Qué son los potenciadores (enhancers)?

A
  • distantes (alejados del sitio de transcripcion)
  • 50kb rio arriba
  • rio abajo en algun exon o intron
  • especificos según el tipo celular
  • reguladores tipo CIS

primer enhancer descubierto: simio

17
Q

Pasos de la transcripcion

A
  • Iniciacion
  • Elongacion
  • Terminacion
18
Q

Proceso de transcripcion

A
  • RNA polimerasa se une a la hebra de ADN
  • se abre la cadena de ADN
  • polimerasa une nucleotidos (5’ – 3’) hasta el sitio de terminacion
  • suelta el ARNm inmaduro
19
Q

Conformacion del ARN transcrito primario

A
  • UTR (untranslated regions)
  • M7Gppp Cap o 5’cap
  • intrones
  • exones
  • cola de poli A
20
Q

Si el ARN solo tiene cola de poli A y 5’cap se le llama…

A

ARN inmaduro

21
Q

Enzimas que cortan y ponen la cola de poli A en el ARN primario

A
  • Endonucleasa: corta ADN
  • Poli-A polimerasa: pone cola de poli-A
22
Q

¿Qué pasa si hay una mutación en exones e intrones?

A
  • exon → mutación que más afecta función protes
  • intron → no afecta pero
    1. en región promotora → no se daría el proceso
    2. en region de terminacion → no se daria señal de fin
23
Q

ARN recien sintetizado se le llama:

A
  • transcrito primario
  • RNA heterogeneo
  • RNA precursor
24
Q

Función de la adicion de 5’cap

A
  • protege ARN de degradacion
  • transporta ARN al citoplasma
  • sitio de union de factor proteico (ribosoma) para la traduccion
25
Q

Funcion de la adicion de cola de poli A

A
  • 100-250 A
  • Protege de degradacion
  • Facilita la traduccion en ribosomas
26
Q

Funcion del splicing

A
  • eliminacion de intrones (no codificantes)
  • union de exones (codificante)