propriétés biologiques des peptides et protéines Flashcards

1
Q

les peptides et les prot sont-ils hydrosolubles ?

A

± : dépend du nombre et proportion d’AA polaire et apolaires

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2
Q

ex de prot hydrosolubles ?

A
  • albumines
  • globines (héomglobine, myoglobine) ect
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3
Q

ex de prot insolubles dnas l’eau ?

A
  • collagène
  • troponines
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4
Q

de quoi sépend la solubilité d’une prot ?

A
  • de sa séquence =>proportion d’AA polaires et apolaires
  • de sa structure spatiale =>fibreuse , globulaire
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5
Q

par quoi peut être influencé la solubilité d’une prot ?

A
  • influence du pH
  • influence de la T°
  • rôle des détergents
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6
Q

comment est la soloubilité d’une prot en fonction du pHi ?

A

elle est minimale à son pHi => plus le pH est éloigné du pHi de la molé plus celle-ci est hydrosoluble

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7
Q

que ce passe-t-il pour la liaisons au fur et à mesure que la T° ↗︎ ?

A

il y a rupture des liaisons : les plus faibles détruites en 1er puis les autres suivent =>destruction strucutre IIaire, IIaire, IVaire mais pas de modification structure Iaire donc séquence est conservé

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8
Q

que ce passe-il pour la structure si on a chaleur ?

A

elle se déroule et devient longue chaîne d’AA = phénomène de dénaturation par la chaleur

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9
Q

les détergents c’est quel types d’agents ?

A

agents tensio-acitf qui solubilisent mole peu voire totalement insolubles dans l’eau en créant film hydrosoluble autour d’elles =>destruction liaison hydrophobes

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10
Q

comment le détéregent va à créer un film hydrosolubes ?

A

fixe queues hydrophobes sur la molé hydrophobes et expose ses tête hydrophile qui permet création film. hydrosolubles

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11
Q

la masse moléculaire c’est quoi ?

A

une propriété physique que l’on étudie

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12
Q

que permet la masse moléculaire ?

A
  • identification des prot
  • choix des techniques préparatrices
  • modélisation de systèmes
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13
Q

quelles sont les ≠ méthodes se basant sur comparaison de molé étudiée avec molé connue ?

A
  • PM min
  • Ultracentrifugation
  • Gel filtration
  • Électrophorèse sur gel de polyacrylamides
  • spectométrie de masse
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14
Q

que va-t-on faire avec méthode du PM minimal ?

A
  • considération l’un des composants ayant une fiable représentation dans la composition de la prot et on imagine qu’il n’est présent qu’en un seul exemplaire au sein de cette prot
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15
Q

formule avec le PMmini ?

A
  • Matome = % x PM mini
  • PMréel = PMmini x Nb atomes dans la prot
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16
Q

que va faire l’ultracentrifugation ?

= centrifugation à très forte vitesse de rotation

A

sédimentation des macromolé=>prot

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17
Q

la vse de sédimenttaoin est fonction de quoi ?

A

taille et densité des molécules à séparer

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18
Q

À quoi est proportionnel la vse de sédimentation ?

A

à PM des molé

19
Q

que permet la vse de sédimentation ?

A

permet de déterminer nature de diverses molé en fonction de leur vse de sédimentation

20
Q

pourquoi la méthode avec ultra centrifugation est moins utilisé ?

A

elle est extremement sensibles, longue et fastidieuse

21
Q

c’est quoi le ppe de gel filtration au tamisage molécualire ?

A

filet avec mailles de taille connu : substance constituant gel forme pores ayant même diamètre donc de porosité connu

22
Q

que ce passe-t-il quand on dépose sur le gel un mélange de molé ?

A
  • petites pénètrent dans les mailles et ont donc un volume de
    distribution très grand (elles vont mettre plus de temps à
    sortir du gel)
  • les plus grandes sont exclues du gel et sortent immédiatement.
23
Q

que peut-on affirmer avec la méthode de gel filtration ou tamisage moléculaire ?

A

plus la molé prend de temps à sortir plus elle est petite

24
Q

comment on va pouvoir déterminer la masse molaire d’une molé par filtration sur gel ?

A
  1. Calibration par des molécules standards de PM connu.
  2. Mesure du volume d’élution (ou vitesse d’élution) d’une protéine inconnue et calcul
    du PM
25
Q

que combine l’électrophorèse sur gel ?

A

migration électrophorétique dans un champ électique=>fonction de la charge de la molé et tamisage molé =>fonction du PM de la prot

26
Q

comment peut être la cuve avec une électrophorèse sur gel ?

A

verticale ou horizontale : pour électrophorèse verticale les dépots se font entre deux plaques de verre et migrenst sur un gel

27
Q

À quel pH on travaille avec la méthode d’électrophorèse du gel ?

A

à un pH où tous les pep et les prot seront chargés de la même façon =>seule la masse moléculaire interviendra dans la igration

28
Q

la technique d’électrophorèse sur gel est-elle svt utilisée ?

A

oui en pratique médical courante opur analyser le sérum humain

29
Q

que permet l’électrophorèse sur gel ?

A

quantifier les ≠ prot présentes

30
Q

c’est quoi comme technique la spectrométrie de masse ?

A

particulièrement fiable

31
Q

en quoi consiste la spectrométrie de masse ?

A

en mesure directe du nbre d’atomes et de grpe d’atomes de la molé protéique après bombardement électronique

32
Q

la spectrométire de masse est quel type de méthode ?

indice : génocie de masse c’est …

A

destructive on casse la molé par bombardement électronique

33
Q

quel est le ppe de la spectrométrie de massse ?

A
  • on sépare les ions selon le rapport : masse moléculaitr(M)/ charge élec (Z)
  • quantifi l’abondance de chaque espèce
  • il fuat espeèce et vide important
34
Q

résume des étapes de la spectrométrie de masse ?

A
  1. laser casse molé qui se fragmente
  2. fragmetns sont ionisés
  3. puis on fait migrer dans le vide les ≠ ions ainsi obtenus
35
Q

quel est le but de la spectométrie de masse ?

A
  • mesure de la masse moléculaire d’une substance
  • obtention de données structurales sur la ou les molé = détermination des atomes la ou les constituant
36
Q

spectrométrie de masse

l’appareil est-il capble de séparer les ions formé suite à une substance ionisée se trouvent dans un état excité qui provoque sa fragmentation ?

A

oui grâce champs magnétiques pour les détcter/caractériser qualitativemnt et quantitativement

37
Q

peut on réussir à étudier macromolé PM<100000 avec spectrométrie de masse ?

A

oui c’est maintenant possible onpeut même déterminer le PM à une unité près

ce champ d’application était classiquement limité à l’étude des petites molécules
organiques (PM < 2 000).

38
Q

quels sont les incovénient non négligeables de la spectrométrie de masse ?

A
  • appareillage est onéreux, ce qui représente un coût pour les hôpitaux
  • technique spécialisée qui fait appel à du personnel qualifié
  • technique peu adaptée à l’analyse de routine (bien qu’en amélioration)
  • On assiste à une destruction de l’échantillon, qui n’est donc plus utilisable
39
Q

est-ce que les prot sont capables d’absoirber des molé ?

A
  • oui du fait de laur taille
  • absorbe les colorants
40
Q

comment on peut utiliser les colorants pour mettre en évidences la presence de prot ?

A

en se fixant sur les prot : colorant spécifiques à prot

41
Q

Pour quoi sont utilisé les colorants sépcifiques pour les prot ?

A

localiser molé après séparation

42
Q
A
43
Q

que permet la coloration du gel par un colorant absorbeé ?

A

permet d’obtenir un spectre par spectrophotométrie.