organisation structurale des peptides

Question 1

quelles sont les différentes organisation structurale des peptides ?

Answer 1

• structure primaire
• secondaire
• tertiares
• quaternaires

Question 2

À quoi correspond la structure primaire ?

Answer 2

l’ordre dans lequel les AA sont liés les uns aux autres =enchainement de la séquence pepq de NH₂ vers COOH

Question 3

comment est donnée la structure primaire ?

Answer 3

par les noms des AA
* ex: Met-Glu-Gly…

Question 4

C’est quoi la structure secondaire ?

Answer 4

• 1er niveau de structuration dans l’espace d’une chaîne pepq
• disposition spatiales des liaisons pepq
• orientation successive des ≠ plans des liaison pepq
• rotation des plans de chacune des liaisons pepq vis-à-vis de ses voisines

Question 5

par quoi est définie la structure secondaire ?

Answer 5

par la valeur de 2 angles ɸ et ψ =angles dièdres

Question 6

structure secondaire

à quoi correspond le ɸ ?

Answer 6

angle de rotation autour de la liaison peq entre le NH et le C𝛼

Question 7

structure secondaire

À quoi correspond l’angle ψ ?

Answer 7

angle de rotation entre le C𝛼 et le C du carbonyle

Question 8

structure secondaire

que déterminent ψ et ɸ ?

Answer 8

déterminent la configuration du pep dans l’espace

Question 9

que ce passe-t-il pour l’angle ɸ dans le cas de la Proline ?

Answer 9

il est bloqué ➩molé est cyclique ➤formation de coudes dans les pep

Question 10

structure secondaire

est-ce qu’on peut avoir n’importe quel valeurs de ψ et ɸ ?

Answer 10

non car intervention de nbrse notion d’encombremnt et de collision entre les atomes

Question 11

structure secondaire

que permet la table de Ramachandran ?

Answer 11

répartition des pep en fontion de la valeur des angles

/!\ spécifiques à la structure secondaire

Question 12

structure secondaire

pourquoi la table de Ramachandran ne reflète pas la réalité ?

Answer 12

ctne valeurs d’angles étant presque impossible et ctne totalement absente

Question 13

structure secondaire

comment se forme les repliement de la molé ?

Answer 13

liaisons hydrogène se font entre le H d’un NH d’une liaison pepq et l’O du CO d’une autre liaison pepq (au sein d’une même chaîne peptidique). Cette formation de liaison H entre le groupement CO (légèrement chargé -) et le groupement NH (légèrement
chargé +) va formé repliement de la molé

Question 14

structure secondaire

que permet les repliement de la molé pour la chaine polypepq ?

Answer 14

permet d’établir un tour ds la chaîne polypepq

Question 15

structure secondaire

quelle est l’unique type de liaisons pour les structures secondaires ?

Answer 15

les liaison H entre 2 liaisons pepq sont l’unique type de liaison

Question 16

structure secondaire

À quoi on va s’interesser quand on parle de structure secondaire des pep ?

Answer 16

pas aux AA mais à leur forme

Question 17

structure secondaire

quels sont les ≠ types de structure secondaire ?

Answer 17

• les hélices
• le feuillet plissé, ou feuillet β
• les coudes qui permet de relier hélice et feuillet

Question 18

structure secondaire

comment est la structure de la chaine pepq quand on a une hélice 𝛼 ?

Answer 18

structure en hélice stabilisé par liaison H entre les CO et H des NH de liaison pepq

Question 19

structure secondaire

comment sont la majorité des hélices rencontrées dans les prot naturelles ?

Answer 19

c’est des hélices 𝛼 généralemnt droite et plus rarement gauche

Question 20

structure secondaire

combien on d’AA par tour de spire d’hélice 𝛼 ?

Answer 20

3,6 et hauteur du pas de l’helice = 5,4 Å= 0,54 nm

Question 21

structure secondaire

comment sont les résidus R dans une hélice 𝛼 ?

Answer 21

ils émergent en surface

Question 22

structure secondaire

dans quelle types de prot sont retrouvés le feuillet β ?

Answer 22

dans prot fibreuse ou fibrillaires

Question 23

structure secondaire

comment se passe formation du feuillet β ?

Answer 23

liaisons H entre groupes NH et CO connectent chaque AA d’un brin à l’AA de l’autre brin, stabilisant ainsi la chaîne en feuillet.

Question 24

structure secondaire

comment peuvent être le feuillet β .

Answer 24

• parallèle
• antiparallèle
  sekon sens des ≠ chaines reliées et satbilisé par liaison H

Question 25

# structure secondaire comment sont les brins si on a un feuillet antiparallèle

Answer 25

2 brins s'alignent dan sdes sens opposés

Question 26

# structure secondaire comment sont les brins qunad le feuillet est parallèle ?

Answer 26

2 brins adjacent s'alignent dans le même sens

Question 27

# structure secondaire que peut-on avoir à extrémités des portions de chaines .

Answer 27

repliemnts à 180° = coudes

Question 28

# structure secondaire que permettent les coudes ?

Answer 28

* feuillets plissés intra-chaines * portions déordonées ou désorganisées

Question 29

# structure secondaire entre qui les coudes β peuvent exister ?

Answer 29

* 2 feuillets β * 2 hélice 𝛼 * 1 feuillet β et 1 hélice 𝛼

Question 30

# structure secondaire que peuvent entrainer certains AA ?

Answer 30

orientent formations de structures secondaires

Question 31

# structure secondaire est-ce que c'est possible d'avoir un structure exclusive càd : que ques hélice 𝛼 ou feuillet β ?

Answer 31

structure protéique jamais exclusive toujours un mélange d'hélices 𝛼 et de feuillets β

Question 32

# structure secondaire est-ce-qu'on peut vaoir un mélange de pls structures secondaires dnas une même séquence ?

Answer 32

oui = structures super-secondaries

Question 33

# structure secondaire À quoi correspon un structure super-secondaire ?

Answer 33

À une organisation en domaine= répétition d'une même strucutre secondaire dans une partie de la molé

Question 34

À quoi correspond la structure tertiaire ?

Answer 34

arragment global de la chaîne polypepq dans l'espaces

Question 35

# structure tertiaire de quoi s'accompag,e arrangement globald e la chaîne polypepq dans espace ?

Answer 35

apparition de structures =globulaires, fibreuses …

Question 36

# structure tertiaire que permettent les domaines dus aux repliements protéiques ?

Answer 36

permettent à des AA éloignés dans structure Iaire de se rapprocher dans la structure IIIaire | via des ponts disulfures entre les SH de 2 cystéines par exemple

Question 37

# structure tertiaire qui va stabiliser structure tertiaire ?

Answer 37

liaisons électrostatiques (salines) et liaisons hydrophobe relient résidus à interieurs

Question 38

# structure tertiaire comment sont les liaisons dans la structure tertiaire?

Answer 38

intra-chaines

Question 39

# structure tertiaire comment peuvent être la structure des prot ?

Answer 39

compactes, globulaire ± sphérique contrairement aux chaines pepq

Question 40

# structure tertiaire que permet la structure globulaire ?

Answer 40

* exposer à la surface les AA hydrophiles ou polaires qui rendnet prot hydrosoluble * replier molé de façon à se que parties éloigné se retrouvent

Question 41

# structure tertiaire est-ce possible que site actif d'une enzyme peut être formé de zoens très lointaine sur strucutre priamires amis très proches en 3D ?

Answer 41

oui parfois

Question 42

# structure tertiaire que fait la structure fibrillaire ?

Answer 42

insère les résidus hydrophiles à interieur et expose les résidus hydropohobes à ext =>surface liposoluble

Question 43

# structure tertiaire quelles sont les ≠ liaisons que peut avoir la structure tertiaire ?

Answer 43

* liaisons covalentes * liaisons non covalente ☞liaison ionique ☞liaison hydrogène ☞liaison hydrophobe

Question 44

# structure tertiaire_ ex de liaisons covalentes ?

Answer 44

ponts disulfures entre les résidus SH de 2 cystéones

Question 45

# structure tertiaire que permettent les liaisons covalentes ?

Answer 45

liaisons oslides primordiales pour structure saptiales de la molécule : elles la stabilisent

Question 46

# structure tertiaire_liaisons non covalentes entre qui et qui se font les liaisons hydrogènes ?

Answer 46

ici entre radicaux au chaine latérale ex: OH de Ser et Thr, COOH de Glu et Asp, AA basiques, etc

Question 47

# structure tertiaire_liaisons non covalentes ex d'interactions hydrophobes par les résidus d'AA à cahines non polaires ?

Answer 47

* Ala * Val * Gly * Leu * Ile * Phe * Trp

Question 48

# structure tertiaire_liaisons non covalentes que tendent à faire les résidus d'AA à chaine non polaire des interactions hydrophobes ?

Answer 48

exclure molé d'eau et à se regrouper

Question 49

# structure tertiaire_liaisons non covalentes sur quoi repose les liaisons ioniques ?

Answer 49

calence électrique + engendrent formations ponts salins sensibles aux variations de pH

Question 50

par quoi se définit la structure quaternaire ?

Answer 50

* association de pls chaînes polypepq identiques ou non dnas une même prot * organisation dans espaces de ces ≠ chaines entre elles

Question 51

# structure quaternaire comment sont les liaisons qui stabilisent la structure quaternaire?

Answer 51

même que celle de la structure tertiare mais **inter-chaines**

Question 52

# structure quaternaire comment peuvent être les liaison de la structure quaternaire ?

Answer 52

* covalente: pont disulfure * non covalente : liaison hydrogène,ionique, interaction hydrophobes

Question 53

# structure quaternaire pour qui on parle de structure quaternaire ?

Answer 53

les prot car les pep ne contiennent qu'une seule chaines