caractérisation d'un peptide Flashcards
À quoi correpson la caractérisaition d’un pep ?
à la détermination de la séquence d’un enchainement pepq
par quels méthodes peut on déterminer la séquence d’un enchainement pepq ?
- hydrolyse totale
- analyse de la séquence
☞méthode enzymatique
☞” chimiques
☞séparation et détermination des ≠ AA
À quoi aboutit l’hydrolyse totale ?
=méthode chimique
à une composition brute totale par libération de tous les AA
comment peut se faire l’hydrolyse totale ?
- par chaleur à 105 °C
- via un acide ex HCl 6 N ou 1/2
que pourra-t-on faire après hydrolyse totale ?
identifier et quantifier en % chaque AA à exception du Trp qui est totalement détruit
quel est l’inconvénient de l’hydrolyse totale ?
elle ne permet pas de connaitre l’ordre des AA dans le pep =>les liaisons sont détruites : structure primaire n’est pas conservé
analyse de la séquence
que ce passe-t-il lors de la méthode enzymatique ?
- rupture d’une liaison pepq sous action enzyme =peptidase
analyse de la séquence_méthode enzymatique
comment peuvent être les peptidase ?
- des exopepase
- endopepases
analyse de la séquence_méthode enzymatique
c’est quoi des exopepase ?
enzyme qui coupent par extremité avec une action récurrent mais aps au-dela de 3 à 4 AA à chaque fois
analyse de la séquence_méthode enzymatique_exopepase
que va-t-on retourve en fonction de l’extrémité ?
- aminopepase
- ou des caboxypepases
analyse de la séquence_méthode enzymatique_exopepase
à partir d’où clivent les aminopepase ?
clivent via le NH₂ de l’extrémité N-terminale
analyse de la séquence_méthode enzymatique_exopepase
À aprtir d’où clivent les carboxypepase ?
à partir de l’extrémité C-terminale
analyse de la séquence_méthode enzymatique_endopepase
c’est quoi les endopepase ?
enzymes qui coupent une liaisons pepq situ”s à l’interieur de la chaîne pepq
analyse de la séquence_méthode enzymatique _endopepase
les endopepase stils sépecifiques à un, pls AA ?
oui
analyse de la séquence_méthode enzymatique_endopepase
quels sont les endopepases ?
- trypsine
- chymotrypsine
- pepsine
- bromure de cyanogène
analyse de la séquence_méthode enzymatique_endopepase
Où clive la trypsine ?
après les AA basique =Lys et Arg
analyse de la séquence_méthode enzymatique_endopepase
Où clive la chymotrypsine ?
après les AA aromatiques = Phe, Tyr et Trp
analyse de la séquence_méthode enzymatique_endopepase
Où clive la pepsine ?
avant les AA aromatiques =Phe et Tyr, Trp exclu