Prijenos geneticke informacije kod eukariota Flashcards
Od čega su građeni kromosomi?
Kromosomi su građeni od kromatina što je kompleks nukleinskih kiselina (DNA) i proteina u jezgri stanice.
Koji je prvi korak u kondenzaciji genetičkog materijala. Opiši sudionike takvog kondenziranja.
Prvi korak je namatanje DNA oko histona čime nastaje nukleosom. Histon ima oktamerni dio oko kojeg se namata oko 150 pb DNA, a nenamotan dio do sljedećeg nukleosoma je dug cca 50 pb. Osim tog oktamernog dijela histon ima još jednu podjedinicu- H1 koja sprječava disocijaciju nukleosoma.
Objasni kako calico mačke služe kao primjer epigenetike.
Calico mačke su trobojne mačke te su najčešće ženke. Imaju dva spolna XX kromosoma, jedan koji nosi gen za crnu, a drugi za žutu boju. (Bijela is a whole new level…) U stanici je aktivan samo jedan X kromosom dok drugi tvori tzv. Barrovo tjelešce. S obzirom na to da je takva inaktivacija nasumična, negdje će ostati aktivan X kromosom s genom za žutu, a negdje za crnu boju. Epigenetika se odnosi na promjene kromatina koje se prenose na stanicu kćer, a nisu vezane uz samu genetičku informaciju te ovo služi kao primjer kako se takva nasumična inaktivacija prenosi na stanice kćeri i uzrokuje različitu obojenost.
Što su telomere? Kako se kod replikacije sprječava kraćenje kromosoma u svakoj diobi na 3’ kraju?
Telomere su ponavljajući slijedovi nukleotida na krajevima kromosoma. S obzirom na to da DNA-polimeraza treba RNA-klicu, postoji problem kako replicirati 3’ kraj kromosoma (telomerni dio.) Taj problem rješava telomeraza koja ima RNA u svojoj strukturi te sintetizira dodatni rep na 3’ kraju lanca kalupa što omogućuje sintezu potrebnog dijela telomera, a ne njihovo skraćivanje.
Kako tumori mogu utjecati na replikaciju telomera?
Općenito, somatske stanice se ne mogu dijeliti u beskonačnost zbog skraćivanja telomera. Ipak, u spolnim stanicama do toga ne dolazi pa se one mogu dijeliti u beskonačnost, a neki tumori također mogu imati sposobnost beskonačnog dijeljenja zbog neskraćivanja telomera.
Koje su najveće razlike u zreloj mRNA kod eukariota u odnosu na prokariote?
Zrela mRNA kod eukariota dorađena je na svom 5’ i 3’ kraju. Na 5’ kraj dodaje se metilgvanozin-trifosfatna kapa, a na 3’ kraj poliadenilatni dio. Nadalje, zrela eukariotska mRNA se dosta razlikuje od primarnog transkripta jer tijekom sazrijevanja dolazi do izrezivanja introna koji su nekodirajući dijelovi mRNA.
Postoji li samo jedna RNA polimeraza kod eukariota? Ako da, koje su uloge onih koje postoje, a ako ne, zanemari drugi dio pitanja. :)
Naravno da postoje.
RNA-polimeraza I sintetizira 5.8S, 18S te 28S rRNA, RNA-pol II sintetizira mRNA te RNA-pol III sintetizira tRNA te 5S rRNA.
Koji načini izrezivanja introna postoje?
Introni se mogu izrezivati sami ili uz pomoć spliceosoma. Samoizrezujući introni mogu pripadati jednoj od dvije grupe. Grupa I koristi gvanozin koji vrši transesterifikaciju uz pomoć koje se izrezuje intron, dok grupa II nukleofilni napad na fosfatnu skupinu vrši preko -OH skupine adenozina u intronu- Na taj način se oslobađa intron strukture lasa. Ukoliko introni nisu samoizrezujući, to može katalizirati ogromni kompleks spliceosom koji koristi snRNA i snRNPove za svoju aktivnost (prepoznavanje mjesta cijepanja itd.)
Zašto je bitan alternativni splicing?
On omogućava veliku raznolikost te tkivnu specifičnost sinteze zrele mRNA iz koje će konačno biti sintetiziran određeni polipeptid.
Na koji način miRNA reguliraju translaciju?
Drosha izrezuje male ukosnice iz većih transkripata te zatim dicer generira miRNA iz takvih ukosnica. miRNA se zatim veže na RISC (RNA induced silencing complex) koji veže i mRNA te ovisno o podudarnosti miRNA i ciljne molekule inhibira translaciju ili potiče hidrolizu mRNA.
Kako se regulira homeostaza željeza?
Dva bitna proteina za održavanje homeostaze željeza jesu transferin i feritin. Transferin prenosi željezo do tkiva koje ga nemaju, a feritin ga skladišti. Bitnu ulogu ovdje ima citosolna akonitaza koja sadrži Fe-S kluster (sjeti se CLK!). Ukoliko nema željeza, Fe-S kluster se razgrađuje te ona služi za vezanje za mRNA. Vezanjem na mRNA za translaciju feritina dolazi do njene inhibicije, a vezanjem na mRNA za sintezu transferina ju stabilizira i štiti od degradacije.