Metabolizam nukleotida Flashcards
Koji se aktivirani oblik riboze koristi u sintezi nukleotida?
5-fosforibozil-1-pirofosfat (PRPP).
Koji je zajednički intermedijar u sintezi gvanilata i adenilata?
Inozinat.
Čime započinje sinteza purinskih nukleotida?
Sintezom 5-fosforibozil-1-amina. Riboza-5-fosfat se aktivira ATPom u PRPP i amonijak dobiven glutaminaznom aktivnošću glutamin-fosforibozilpirofosfat-amidotransferaze supstituira PPi dajući 5-fosforibozil-1-amin.
Koliko se ATP troši u sintezi inozinata?
4.
Kako se regulira sinteza purinskih nukleotida?
Inhibicija povratnom spregom: IMP, AMP i GMP inhibiraju glutamin-PRPP amidotransferazu.
GMP inhibira IMP dehidrogenazu.
AMP inhibira adenilosukcinat sintetazu.
Postoje alosteričke regulacije i sinergistički efekti.
Kojim se enzimima sintetiziraju purinski nukleotidi iz “metaboličkog otpada”?
adenin-fosforiboziltransferaza i hipoksantin-gvanin-fosforiboziltransferaza.
Odakle potječu atomi pirimidinskog prstena?
iz karbamoil-fosfata i aspartata.
Koja je razlika između Karbamoil-fosfat sintetaza I i II?
KFSI je mitohondrijski enzim, kao izvor amonijaka koristi amonijak i koristi se u ciklusu ureje. KFSII je citosolni enzim, kao izvor amonijaka koristi glutamin i kanalizira međuprodukte, tj. ne otpušta ih nego putuju kroz “tunel” do sljedećeg aktivnog mjesta, a koristi se u sintezi pirimidinskih nukleotida.
Koji je zajednički intermedijar pirimidinskih nukleotida?
Orotat.
Kako se regulira sinteza pirimdiinskih nukleotida?
BAKTERIJE: Inhibicijom povratnom spregom: CTP inhibira aspartat-transkarbamoilazu. Enzim sadrži 6 katalitičkim podjedinica (2 trimera) i 6 regulatornih (3 dimera). CTP signalizira da ima dovoljno pirimidinskih nukleotida.
ATP je antagonist CTP-a. ATP signalizira da ima mnoštvo purinskih nukleotida te su potrebni pirimidinski.
ŽIVOTINJE: inhibicija povratnom spregom karbamoil-fosfat sintetaze II. UTP deaktivira, a ATP i PRPP aktiviraju.
Kako se ribonukleotidi prevode u deoksiribonukleotide?
Koristeći ribonukleotid reduktazu. NDP-ovi su supstrati. Enzim sadrži dvije katalitičke alfa podjedinice koje imaju i alosterička mjesta za vezanje raznih nukleotida čime se regulira sveukupna aktivnost i specifičnost enzima. U dvama beta podjedinicama se nalazi tirozinski radikal važan za katalitičku aktivnost. Sadrži još i Fe3+-O-Fe3+ centar za stabilizaciju radikala.
Kako se reducira disulfidna veza u ribonukleotid reduktazi?
Pomoću tioredoksina. Nastala disulfidna veza u RR se reducira pomoću tioredoksina, koji se ratim reducira natrag pomoću tioredoksin reduktaze koja koristi FADH2. Nastali FAD se ponovo reducira u FADH2 pomoću NADPH, tako da je zapravo konačni donor elektrona u jednom ciklusu RR NADPH.
Kako se sintetizira TMP?
dUDP se fosforilira do dUTP i zatim u dUMP. Za dUMP se veže enzim timidilat sintaza te se uracil veže sa metilenom iz metilen-THF. deprotonacijom i prijenosom hidrida nastanu dihidrofolat i dTMP. nastali dihidrofolat se reducira s NADPH koristeći dihidrofolat-reduktazu.
Koji se spojevi koriste kao citostatici?
5-fluorouracil. To je suicidalni inhibitor koji se trajno veže za timidilat sintazu i postaje inaktivna.
Antifolati su inhibitori dihidrofolat-reduktaze.
U što se razgrađuju purinski nukleotidi? Koji su enzimi bitni?
U mokraćnu kiselinu. Nukleotidaza ukloni Pi sa 5’ pozicije. Zatim nukleozid fosforilaza cijepa glikozidnu vezu. Ksantin oksidaza oskidira ksantin do mokraćne kiseline (i hipoksantin do ksantina).
