Plasmider Flashcards
För att plasmider ska ärvas kan olika stabilitetsfunktioner användas - vilka är de 4 huvudsakliga?
Replikationskontroll = Replikera när det behövs ett större antal plasmider, dvs. replikera vid behov
Partition funktioner = fördela plasmider i cell för att hamna jämnt fördelade i dotterceller, dvs. motverka statistiken
Killer loci = ett typ av biokemiskt minne hos celler som gör att de som tappat tidigare plasmider ska dö
Site-specific rekombination
Vilka 4 olika varianter av replikationskontroll/kopienummerkontroll finns det (“mäta” antalet kopitetal)?
Translationskontroll (copA/copT och repA).
Primer maturering (preprimer –> viss veckning för mognad –> vara primer för DNA replikation)
Transkriptionsterminering (RNA veckas på visst sätt för transkription - RNAIII motverkar detta och leder till terminering av transkription)
Pseudoknut (när den bildas –> aktivera uttryck genom att ribosom binder in - RNAI kan interagera med RNA och hindra syntes av RepA)
Iteroner är ett sätt för att utföra replikationskontroll. Hur fungerar dessa och handcuffing modellen?
Iteroner är repeats som flankerar repA genen, och RepA kan binda till dessa samt varandra. Via detta kan genen blockas då iteronerna binder till varsina RepA som sedan dimersierar (antingen samma sträng eller mellan replikerade)
hok/sok systemet används som stabilitetsfunktion (killer loci). Hur går det till?
Värden har mok-genen (innehållande toxinet hok) uttrycks –> hok-toxinet uttrycks. Plasmiden innehåller sok-genen (kortlivat antitoxin, finns bara om plasmid finns) –> litet RNA som binder till mok-RBS –> motverkar translation av hok.
Site-specifik rekombination - vad går det ut på?
Via rekombination av cer-siter i plasmiden kan en oavsiktlig dimer delas upp i två monomerer igen.
