Phages à ARNdb Flashcards
Comment est le génome de ces phages à ARNdb ?
Non directement infectieux, et incorporent dans les particules virales une ARNpolARNdep d’origine virale. Segmenté en 3 parties, ARN double brin linéaire.
Décrire la structure de phi6.
Particules virales enveloppées de 85nm de diamètre, couverts de spicules p3. Capside Icosaédrique de T=13.
Quelles sont les protéines responsables du compactage, réplication et de la transcription du génome ?
Il s’agit de P1, 2 4 et 7.
Rappeler pour quoi code le segment L, M et S.
L code pour tout ce qui est protéines de traduction et transcription.
M pour tout ce qui est protéine membranaire
S pour ce qui est gènes de nucléocapside.
Quels sont les trois obstacles que doit surmonter le virion quand il fait son adsorption ?
Le pili pour se rapprocher de la membrane, puis passer la membrane par fusion, puis passer la barrière de peptidoglycane.
Quelle est la particularité des protéines 1,2,4,7 ?
Ce sont des protéines précoces, capables de s’assembler en complexes de réplication vides (PC + polymerase).
Est-ce que les ARNdb se trouvent dans le cytoplasme ?
Non, ils ne sont jamais exposés. Seuls les ARNm correspondants sont relâchés dans le cytoplasme.
Qu’est-ce qui diffère avec la synthèse du transcrit L ?
Il nécessite la protéine YajQ fixée sur P1 car il transfère par un 5’GU au lieu du 5’GG des M et S.
Au niveau de la transcription, que remarque-t-on entre la phase précoce et tardive ?
A la phase tardive, seuls les transcrits m et s sont transcrits.
Quels rôles endossent la protéines YajQ ?
Essentielle pour réplication, activation de la transcription de L-
Comment a ton mis en évidence le role primordial de YajQ dans la réplication du phi6 ?
Si on la KO, les mutants sont incapables de produire des particules virales infectieuses.
Quelle particularité a la quantité de YajQ présente ?
Elle est limitée, ce qui suggère que en fin de cycle seuls m et s sont transcrits.
D’ou provient la nucléocapside précoce formée quand le virus exprime ses ARNm ?
Il s’agit des protéines des gènes précoces, qui ont été produite grâce aux ribosomes.
Les différents ARN transcrits entrent dans la capside précoce, mais par quel bout ? Et pourquoi est-ce que PC arrive à reconnaître ces ARN ?
Par l’extrémité 5’. PC arrive à reconnaître et fixer ces ARN grâce à la protéine P1.
Quels sont les seuls ARN pouvant entrer dans cette PC ?
Les ARN possédant un signal d’encapsidation, détecté par P4 et P7 qui la font rentrer.
A quoi sont dédiés les sommets de la capside virale ?
1 seul est responsable de l’encapsidation tandis que les 11 autres servent de voie d’export des ARNm.
Sous quelle forme est-ce que p1 s’assemble ?
Sous forme de pentamères.
Résumer la formation de CP.
Monomère de p1 intéragit avec hexamère de p4 et forme un intermédière, stabilisé par P7. Puis, P2 est incorporée tardivement.
Qu’estce qui flanque les régions non codantes de part et d’autre des segments ?
Il s’agit de séquences spécifiques qui constituent en des signaux d’encapsidations ou des structures protectrices tRNA like pouvant correspondre au promoteur 3’.
A quoi ressemble la structure de la RdRp OU se situe le site cataltique ?
Structure en main droite compacte. Le site catalytique se situe dans la paume.
Sur la RdRp ou se trouve le site d’initiation, et quelle est sa particularité ?
Il se trouve dans le domaine C terminal et a la particularité d’être flexible pour permettre la sortie de l’ARNdb naissant.
Quel intérêt des ions Mn2+
C’est ces ions qui sont utilisés par la pol pour faire le transfert des NTP et moduler la flexibilité des la pol.
Qu’est ce que l’heparin ?
Un médicament qui entre en compétition abec la matrice dans les premiers évènements de néosynthèse.
Comment se fait l’acquisition de membrane avec le phage phi6
P9 arrive à faire une acquisition d’enveloppe par la nucléocapside. P12 est nécessaire à la morphogénèse de l’enveloppe.
Quelles protéines participent à la lyse cellulaire ?
Protéine P5 et p10.
