Peter Carlsson - Utvecklingsbiologi Flashcards
Vad ger en cell dess egenskaper?
Summan av alla proteiner som finns i cellen. Det som styr detta är att olika gener uttrycks. Genuttryck regleras främst på transkriptionsnivå.
Enhancer och promotorer
Vid en gen, binder transkriptionsfaktorer som aktiverar eller inhiberar transkription.
Zygot
Äggets och spermiens haploida kärnor smälter ihop och bildar en diploid kärna, alltså en zygot.
Fluga zygot
DNA:t i zygoten replikeras snabbt upprepade gånger, och embryot fylls av kärnor. Dock sker ännu ingen celldelning, och alla kärnor delar cytoplasma. Detta kallas syncytium.
Fluga syncytium
Flera kärnor i en och samma cytoplasma. Stadiet efter zygot. Kärnorna täcker insidan av embryots vägg, medan de centrala delarna bara innehåller cytoplasma. Detta gör kommunikationen mellan kärnorna mycket enklare, eftersom de extracellulära stegen kan hoppas över.
Fluga oocyt och nurse cells
Flughonan producerar ägg i foliklar. Cellerna inne i folikeln är produkter av meios, och därför haploida. En av dessa celler blir äggcell (oocyt), övriga blir nurse cells. Nurse cells producerar mRNA, proteiner och metaboliter som äggcellen fylls med.
Fluga fördelning av saker från nurse cells till oocyt
Fördelas inte jämnt. Ett exempel är Bicoid, som transkriberas i nurse cellerna. Det hamnar i den anteriora ändan av ägget. Denna plats är förutbestämd. Andra mRNA placeras också ojämnt. Dessa mRNA kommer translateras när ägget befruktas. De kallas maternella gener.
Fluga Bicoid mRNA
Transkriberas i nurse celler. Hamnar anteriort i oocyten. När det translateras kommer proteinet att diffundera och bilda en koncentrationsgradient, högst i den anteriora ändan och lägst i den posteriora ändan. Bicoid proteinet är en transkriptionsfaktor. Eftersom kärnorna inte är omslutna av cellmembran, går det direkt in i kärnorna, binder till DNA och aktiverar transkriptionen av gener som har bindningsställen för Bicoid. Liknande gradienter bildas av andra maternella proteiner, som ofta är transkriptionsfaktorer.
Fluga exempel på hur maternella proteiner fungerar
Saufen är ett RNA-bindande protein som fixerar vissa mRNA på rätt ställe i ägget.
Nanos är dels en transkriptionsfaktor, och dels binder det till Hunchback mRNA och inhiberar dess translation.
Hunchback mRNA är jämnt fördelat, men translateras bara i framändan eftersom Nanos förhindrar detta i bakändan.
Fluga koncentration Bicoid
Flera geners transkription aktiveras av Bicoid, men kräver olika koncentration av Bicoid-proteinet. Därför kommer olika målgener att uttryckas i olika delar av embryot. En substans som triggar olika utvecklingsprogram beroende på koncentration kallas morforgen.
Morfogen
En substans, tex Bicoid, som triggar olika utvecklingsprogram beroende på koncentration.
Fluga Bicoid trösklar
Eftersom Bicoid-koncentrationen bildar en gradient kommer dessa koncentrationströsklar motsvaras av distinkta positioner längs embryots längd-axel.
Fluga Bicoid konc öka/minska
Om Bicoid koncentrationen ökas eller minskas i ett experiment, kommer gränsen för uttryck flyttas bakåt eller framåt på oocyten, så att gränserna alltid motsvarar samma Bicoid koncentration.
Fluga gap genes
Maternella transkriptionsfaktorer, tex Bicoid och Nanos, reglerar transkriptionen av de första embryogenerna som uttrycks, sk gap genes. Beroende på vilka bindningsställen för tf som finns i gap genernas promotorer kommer de att transkriberas i olika delar av flugembryot. Även gap generna kodar för tf. Detta gör zoneringen mer detaljerad.
Fluga tf DNA sekvenser
Varje tf har sin egen favorit DNA-sekvens som den binder till. Vilka gener den kan reglera bestäms av ifall genens promotor eller enhancer möjliggör bindning. Sekvenser som är en perfekt match med tf:s preferens kommer att binda mer effektivt, och fungerar även vid låg koncentration. En sämre sekvens kräver högre koncentration.