Peter Carlsson - Kvantitativ genetik

Question 1

Fördelning/påverkan av de flesta egenskaper

Answer 1

De flesta egenskaperna uppvisar kontinuerlig variation, är ofta normalfördelade, påverkas av fler än en gen, och såväl arv som miljö.

Question 2

Varför är de flesta egenskaperna normalfördelade?

Answer 2

På grund av att flera alleler är additativa. Exempel: färgen på en blomma. A=adderar färg, a=adderar ingen färg. AA=röd, Aa och aA=rosa och aa=vit. Eftersom de i mitten blir mer sannolika, blir kurvan normalfördelad. När flera faktorer (genetiska och/eller miljöfaktorer) påverkar en egenskap additivt blir egenskapen normalfördelad.

Question 3

Hur räknar man ut extremfenotyperna?

Answer 3

n gener ger 2n+1 fenotypiska klasser. Extremfenotyperna utgör 1/4^n av alla individer.

Question 4

Värden för normalfördelning

Answer 4

Medelvärdet och spridningsmåttet. Kan ha samma medelvärde men olika spridningsmått.

Question 5

Tumregel för normalfördelning

Answer 5

Ca 2/3 av alla individer ligger i intervallet medelvärdet +/- en standardavvikelse.
Ca 95% av alla individer ligger i intervallet medelvärdet +/- två standardavvikelser.

Question 6

Gen-miljö-interaktioner

Answer 6

Genetiska skillnaders konsekvenser för en egenskap kan bero på miljön.
Tex risken att blir kirminell, risken att få anorexi, och risken att användande av cannabis under tonåren utlöser en svår psykos.

Question 7

Heritabilitet

Answer 7

Andelen av den fenotypiska variationen inom en grupp individer som orsakas av den genetiska skillnaden mellan individerna.

Question 8

Vad påverkas heritabilitet av?

Answer 8

Hur stor genetisk variation som finns i populationen och hur homogen miljön är.
I ett teoretiskt extremfall är alla individer genetiskt identiska, och då beror all variation på miljöfaktorer. Heritabilitet=0.
I ett annat teoretiskt extremfall har alla individer en helt identisk miljö, och då är all observerad variation orsakad av genetiska skillnader. Heritabilitet=1.
I praktiken ligger heritabiliteten alltid mellan 0 och 1.

Question 9

Räkna ut heritabilitet

Answer 9

Heritabilitet = V(g) / V(f)
V(g) = fenotypisk varians orsakad av genetiska skillnader.
V(f) = fenotypisk varians orsakad av miljöfaktorer.

Question 10

Genome-Wide Association Scans

Answer 10

GWAS. Ett sätt att identifiera gener (QTL = quantitative trait locus) vars variation påverkar kvantitativa egenskaper.