Partitiviridae-Valeria Casasbuenas Flashcards
Familia Partitiviridae-Nicho ecológico y taxonomía
Están asociados a infecciones persistentes de sus huéspedes fúngicos, protozoarios y vegetales. Dependiendo el género cambia su hospedero.
Género:
- Alphapartitivirus (plants, or ascomycetous or basidiomycetous fungi.)
- Betapartitivirus (plants, or ascomycetous or basidiomycetous fungi)
- Gammapartitivirus (ascomycetous fungi)
- Deltapartitivirus (plants)
- Cryspovirus (apicomplexan protozoa)
Familia Partitiviridae-Morfología y estructura
Diámetro de alrededor de 25 a 43 nm.
Viriones con geometrías icosaédricas y simetría T=1. No poseen envoltura vírica.
Dentro de cada partícula se empaquetan una o dos moléculas de ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRP).
Familia Partitiviridae-Material genético.
Poseen dos segmentos genómicos esenciales, dsRNA1 y dsRNA2, cada uno de los cuales contiene un ORF grande en la molécula de ARN de cadena positiva.
El más pequeño de los dos segmentos genómicos dsRNA suele codificar la proteína de cubierta (PC).
El más grande suele codificar la ARN polimerasa asociada al virión.
Los segmentos lineales de dsARN se encapsulan por separado. También pueden estar presentes segmentos adicionales de dsARN (satélites o defectuosos).
Familia Partitiviridae-Enfermedades asociadas.
Mosaico del tabaco del hongo (TMV): Infecta a hongos fitopatógenos. Puede causar daños en plantas, incluyendo el mosaico y el marchitamiento en una variedad de cultivos, lo que puede tener impactos económicos en la agricultura.
Trastornos fúngicos: Al infectar una variedad de hongos fitopatógenos y causar diversos trastornos en las plantas, como mosaicos, necrosis, retardo en el crecimiento y otros síntomas.
Familia Partitiviridae-Datos interesantes (Replicación)
Replicación:
1. El virus penetra en el citoplasma.
2. La transcripción del genoma dsARN por la polimerasa viral se produce en el interior del virión, de modo que el dsARN nunca queda expuesto al citoplasma. Este transcrito de cadena positiva se utiliza como molde para la traducción.
3. Los ARN (+) se encapsulan en la partícula virión, dentro de la cual se transcriben para dar moléculas de ARN (-) con las que se emparejan en bases para producir genomas de ARNds.
4. Los maduros se transmiten a una nueva célula por intercambio citoplasmático, esporogénesis o anastomosis hifal.
Familia Partitiviridae-Termino que no logré coprender
Geometrías icosaédricas: Tiene el aspecto de un poliedro y presenta veinte caras triangulares.
Simetría T=1: En los virus no se habla de formas sino de simetrías. La simetría es la disposición de la nucleocápside en el espacio y de acuerdo con ello se observan distintos tipos: simetría helicoidal, icosaédrica, compleja y binaria.
Cápsides víricas: La parte central del virus es el genoma o nucleoide, que se encuentra rodeado por una cubierta proteica denominada cápside. En algunos virus se agrega otra estructura más externa, la envoltura y los virus que la poseen se clasifican como virus envueltos.
RdRP: RNA dependent RNA polymerase (RdRp) is one of the most versatile enzymes of RNA viruses that is indispensable for replicating the genome as well as for carrying out transcription.
ORF: Es una porción de una secuencia de ADN que no incluye un codón de terminación
Familia Partitiviridae-Referencias
Vainio, E. J., Chiba, S., Ghabrial, S. A., Maiß, E., Roossinck, M. J., Sabanadzovic, S., Suzuki, N., Xiè, J., & Nibert, M. L. (2018). ICTV virus taxonomy Profile: Partitiviridae.
Journal of General Virology, 99(1), 17–18. https://doi.org/10.1099/jgv.0.000985
Philippe Le Mercier, Chantal Hulo, Patrick Masson (content); Edouard de Castro (software). (n.d.-b). Partitiviridae ~ ViralZone. https://viralzone.expasy.org/168
Family: Partitiviridae | ICTV. (n.d.).
https://ictv.global/report/chapter/partitiviridae/partitiviridae
Del Área De, R. M. G. (2023, February 20). Virus II: estructura de un Virus - El Blog de Genotipia. Genotipia. https://genotipia.com/virus-estructura/
Venkataraman, S., Prasad, B. V. L. S., & Selvarajan, R. (2018). RNA Dependent RNA Polymerases: Insights from Structure, Function and Evolution. Viruses, 10(2), 76. https://doi.org/10.3390/v10020076
Marco abierto de lectura. (n.d.). Genome.gov. https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Marco-abierto-de-lectura
Detección y caracterización del virus meridional del tomate (STV). (2021). [PhD]. Universidad Politécnica de Valéncia.
Pregunta 1 - Juana Castillo:
Más allá de su reproducción, ¿Cómo se transmite el virus?
Se transmiten:
Por vía intracelular a través de semillas (plantas)
Ooquistes (protozoos) o anastomosis hifal
División celular y esporogénesis (hongos)
No se conocen vectores naturales.
Laura Gomez - ¿que significa que tenga una simetria T=1? ¿La proteina de cubierta es considerado una capside o parte de?
En los virus no se habla de formas sino de simetrías. La simetría es la disposición de la nucleocápside en el espacio y de acuerdo con ello se observan distintos tipos: simetría helicoidal, icosaédrica, compleja y binaria. En este caso es T=1 lo que índica que es geometría icosaédrica. En este caso este virus tiene cápside vírica diferente a la parte central del virus que es el genoma o nucleoide, este se encuentra rodeado por una cubierta proteica la cual es la cápside. En algunos virus se agrega otra estructura más externa, la envoltura y los virus que la poseen se clasifican como virus envueltos. Este virus tiene cápside pero no envoltura.
Pregunta 3: Ana Martínez:
¿Cómo funciona esta interacción biológica que describes en las enfermedades asociadas?
