Partie 4 - Chapitre 4 Flashcards
Les chaînes d’ADN sont _________.
Anti-parallèles
Au pH physiologique, les acides nucléiques sont des _________.
polyanions
Rappel :
Nommez les purines
Adénine et guanine
Rappel :
Nommez les pyrimidines
Cytosine et thymine
Nommez les formes tautomériques qui prédominent à l’équilibre :
Céto et amino
Pour ce qui est de l’ADN-B :
Combien il y a d’acides aminés pour un tour complet?
10.5
Pour ce qui est de l’ADN-B :
Quelle est la distance qui sépare les deux hélices?
20 Amstrongs (2nm)
Pour ce qui est de l’ADN-B :
La hauteur du sillon mineur est de :
1.2 nm
Pour ce qui est de l’ADN-B :
La hauteur du sillon majeur est de:
2.2nm
Qu’est-ce qui cause la migration d’une base azotée à l’extérieur de l’hélice ?
Les enzymes impliquées dans la recombinaison et la réplication de l’ADN.
Qu’est-ce qu’il y a de plus dans le grand sillon par rapport au petit ?
Il y a un donneur d’hydrogène, ce qui favorise les interactions faibles.
Nommez le sens du pas pour chaque type d’ADN:
ADN-Z: Gauche
ADN-A: Droite
ADN-B: Gauche
Nommez le diamètre pour chaque type d’ADN:
ADN-Z: 18
ADN-A: 26
ADN-B: 24
Nommez le nombre de paire de base par tour d’hélice:
ADN-Z: 12
ADN-A:11
ADN-B:10.5
Nommez la hauteur par tour pour chaque type d’ADN:
ADN-Z: 46
ADN-A:25
ADN-B:33
Nommez l’inclinaison des pb pour chaque type d’ADN:
ADN-Z: -9
ADN-A: -1.2
ADN-B: 19
Qualifier le grand sillon pour chaque type d’ADN:
ADN-A : Très étroit et très profond.
ADN-B : Large et profond.
ADN-Z: Inexistant
Qualifier le petit sillon pour chaque type d’ADN:
ADN-A: très large, superficiel
ADN-B: Étroit, profond.
ADN-Z: Très étroit et très profond.
Nommez quel type de liaison glycosidique se trouve dans chaque type d’ADN:
ADN-A : Anti
ADN-B: Anti
ADN-Z: Anti(pyr), Syn(pur)
Par quoi peut-on suivre la dénaturation de l’ADN ?
Par l’effet hyperchrome
Qu’est-ce qui interagie avec les groupements phosphates anionique et qui augmente la Tm ?
Les cations.
Nommez exactement la formule permettant de trouver la température de fusion (Tm)
T m = 41,1 X G+C + 16,6 log [Na+] + 81,5
où le X est équivalent au signe de multiplication
Dans la topologie de l’ADN, que signifie LK
Il s’agit du nombre d’enlacement
Dans la topologie de l’ADN, que signifie T
Il s’agit du nombre de torsion
Dans la topologie de l’ADN, que signifie W
Nombre de supertorsion ou «supertour»
Dans les cellules, l’ADN est toujours superenroulée de manière
Négative
Qu’est-ce qui est nécessaire pour catalyser les réactions de topoisomérase?
Le groupement OH d’une tyrosine (ou deux)
Est-ce que le superenroulement de l’ADN affecte sa migration électrophorétique ?
Absolument !