Chapitre 18 - La régulation

Question 1

L’étape de régulation la plus commune est celle de ?

Answer 1

L’initiation

Question 2

Chez la bactérie, combien de séquences d’ADN contrôlent la transcription ?

Answer 2

2

Question 3

Le site opérateur qui, pour la plupart du temps chevauche le promoteur est lié par un _______.
Il y a donc aucune ________.

Answer 3

Répresseur

transcription

Question 4

Le site de liaison a un “activateur” qui est localisé en ________ du promoteur.
Stimulation de la ___________.

Answer 4

amont

transcription

Question 5

Que se passe-t-il quand les sites opérateurs et répresseurs ne sont pas occupés ?

Answer 5

La transcription est à un niveau de base (très faible, mais constitutive)

Question 6

Qu’est-ce qui cause la liaison de l’ARNpol au site promoteur ?

Answer 6

La liaison d’un activateur.

Question 7

Qu’est-ce qui favorise l’isomérisation afin de passer de l’étape du complexe fermé à l’étape du complexe ouvert (régulation par allostérie)

Answer 7

L’activateur.

Question 8

Est-ce vrai qu’il est rare qu’un site activateur soit localisé près d’autres sites de liaison ?

Answer 8

C’est faux, ce n’est pas du tout rare. On a qu’à penser au site activateur et l’interaction avec le site promoteur d’ARNpol)

Question 9

Vrai ou faux : un activateur ne peut pas avoir d’interaction avec un site de liaison situé à distance.

Answer 9

Faux, il peut. Cependant, l’ARN devra posséder une certaine courbure induite ou pas par des protéines.

Question 10

À quoi servent les protéines architecturales?

Answer 10

Elles facilitent les contacts à distance entre l’activateur et l’ARN pol.

Question 11

Parfois, très souvent chez les eucaryotes, il y a liaison coopérative entre plusieurs activateurs pour :

Answer 11

Stimuler la transcription à un niveau plus élevé ou déclencher la transcription (i.e., seule la liaison de plusieurs activateurs conduit à la transcription)

Question 12

Décrivez ce qu’est l’activation par allostérie ?

Answer 12

En modifiant la conformation de l’ARN pol ou de l’ADN au site promoteur, la régulation par allostérie active la régulation.

Question 13

Qu’est-ce que régule très souvent l’activation par allostérie ?

Answer 13

La fonction des régulateurs (activateurs ou répresseurs)

Par exemple, CAP doit être modifiée par AMPc pour se lier au site activateur.

Question 14

Qu’est-ce qu’un opéron ?

Answer 14

C’est lorsque des gènes contigus sur le chromosomes sont associés à des éléments de contrôle qui co-régulent leur expression.

Question 15

Est-ce vrai de dire qu’en présence de glucose la concentration d’AMPc est élevée?

Answer 15

C’est faux, elle est basse.

Question 16

CAP se lie-t-il avec son activateur lorsque la concentration de glucose est élevée?

Answer 16

Non

Question 17

En présence de lactose, le ________ ______ ne peut pas se lier au site opérateur.

Answer 17

répresseur LacI

Question 18

En absence de lactose, le _________ se lie au site répresseur.

Answer 18

répresseur

Question 19

En absence de glucose, le niveau d’AMPc est ________ CAP se lie donc au site activateur.

Answer 19

élevé

Question 20

Le site de liaison à la protéine CAP est localisée en ________ du site promoteur

Answer 20

amont

Question 21

Le site opérateur où se fixe lacI __________ le site promoteur ce qui empêche l’ARNpol de se lier au promoteur.

Answer 21

chevauche

Question 22

L’activateur CAP et le répresseur LACI doivent tous deux être modifiés par __________, en liant respectivement l’AMPc et l’allolactose (produit par B-galactosidase (Lac-Z)à partir du lactose), pour se fixer aux séquences régulatrices.

Answer 22

allostérie

Question 23

La liaison de l’AMPc à CAP induit un changement de ________ et permet au domaine de liaison de l’ADN d’iteragir avec sa _________ cible.

Answer 23

conformation

séquence

Question 24

La liaison CAP ou du répresseur Lac-I se fait par des motifs _________________ à ______ demi-sites de liaison dans chaque cas (sillon majeur)

Answer 24

hélice-coude-hélice

deux

Question 25

Comme la plupart des activateurs de la transcription, CAP est constitué de _______ domaines distincts:
Un domaine de liaison à ________ et un domaine d’activation qui interagit avec d’autres ________.

Answer 25

deux
l’ADN
protéines

Question 26

Dans le cas de CAP, le domaine de liaison permet le “recrutement” de ____________ au site promoteur par contact avec le domaine _____

Answer 26

ARNpol

alpha-CTD

Question 27

Comme la plupart des activateurs de la transcription, CAP est constitué de deux domaines distincts: un domaine _______________ et un domaine_______________ qui interagit avec d’autres protéines.

Answer 27

liaison à l’ADN

d’activation

Question 28

Est-ce qu’on peut facilement substituer les domaines de liaison à l’ADN et d’activation ?

Answer 28

Oui

Question 29

L’expression de tous les opérons bactériens impliqués dans le métabolisme des sucres est activée par _________, via le ‘recrutement’ direct (ex. Opéron Lac) ou indirect de ________ par des interactions avec d’autres protéines (contrôle combinatoire)

Answer 29

CAP-AMPc

l’ARNpol

Question 30

Le site de liaison à CAP au site de liaison remplace l’élément __ localisé en amont des ________ _______ _________

Answer 30

UP

promoteurs forts bactériens

Question 31

Est-ce vrai de dire que l’expression des gènes peut être contrôlée par une sucession de facteurs (sigma) ?

Answer 31

Tout à fait

Question 32

Qu’est-ce que MerR?

Answer 32

Il s’agit d’un activateur qui contrôle l’expression des gènes impliqués dans la détoxification du mercure.

Question 33

Les boîte -10 et -35 du promoteur MerR sont-elles trop distantes pour permettre l’initiation de la transcription ? Si oui que se passe-t-il alors?

Answer 33

En présence de mercure, il y a induction d’une courbure dans l’ADN (changement de conformation de l’ADN par allostérie ). Les positions -10 et -35 sont alors en position favorable pour la formation du complexe ouvert.

Question 34

En présence d’arabinose, AraC se lie aux site __ et __interagit avec la protéine CAP pour stimuler la transcription.
En asbsence d’arabinose, AraC adopte une autre conformation qui _______ la transcription en favorisant : Une __________ dans _____ qui empêche ____ de se lier et l’interaction avec l’ARNpol

Answer 34

I1 
I2 
réprime 
courbature 
L'ADN
CAP