Chapitre 18 - La régulation Flashcards
L’étape de régulation la plus commune est celle de ?
L’initiation
Chez la bactérie, combien de séquences d’ADN contrôlent la transcription ?
2
Le site opérateur qui, pour la plupart du temps chevauche le promoteur est lié par un _______.
Il y a donc aucune ________.
Répresseur
transcription
Le site de liaison a un “activateur” qui est localisé en ________ du promoteur.
Stimulation de la ___________.
amont
transcription
Que se passe-t-il quand les sites opérateurs et répresseurs ne sont pas occupés ?
La transcription est à un niveau de base (très faible, mais constitutive)
Qu’est-ce qui cause la liaison de l’ARNpol au site promoteur ?
La liaison d’un activateur.
Qu’est-ce qui favorise l’isomérisation afin de passer de l’étape du complexe fermé à l’étape du complexe ouvert (régulation par allostérie)
L’activateur.
Est-ce vrai qu’il est rare qu’un site activateur soit localisé près d’autres sites de liaison ?
C’est faux, ce n’est pas du tout rare. On a qu’à penser au site activateur et l’interaction avec le site promoteur d’ARNpol)
Vrai ou faux : un activateur ne peut pas avoir d’interaction avec un site de liaison situé à distance.
Faux, il peut. Cependant, l’ARN devra posséder une certaine courbure induite ou pas par des protéines.
À quoi servent les protéines architecturales?
Elles facilitent les contacts à distance entre l’activateur et l’ARN pol.
Parfois, très souvent chez les eucaryotes, il y a liaison coopérative entre plusieurs activateurs pour :
Stimuler la transcription à un niveau plus élevé ou déclencher la transcription (i.e., seule la liaison de plusieurs activateurs conduit à la transcription)
Décrivez ce qu’est l’activation par allostérie ?
En modifiant la conformation de l’ARN pol ou de l’ADN au site promoteur, la régulation par allostérie active la régulation.
Qu’est-ce que régule très souvent l’activation par allostérie ?
La fonction des régulateurs (activateurs ou répresseurs)
Par exemple, CAP doit être modifiée par AMPc pour se lier au site activateur.
Qu’est-ce qu’un opéron ?
C’est lorsque des gènes contigus sur le chromosomes sont associés à des éléments de contrôle qui co-régulent leur expression.
Est-ce vrai de dire qu’en présence de glucose la concentration d’AMPc est élevée?
C’est faux, elle est basse.
CAP se lie-t-il avec son activateur lorsque la concentration de glucose est élevée?
Non
En présence de lactose, le ________ ______ ne peut pas se lier au site opérateur.
répresseur LacI
En absence de lactose, le _________ se lie au site répresseur.
répresseur
En absence de glucose, le niveau d’AMPc est ________ CAP se lie donc au site activateur.
élevé
Le site de liaison à la protéine CAP est localisée en ________ du site promoteur
amont
Le site opérateur où se fixe lacI __________ le site promoteur ce qui empêche l’ARNpol de se lier au promoteur.
chevauche
L’activateur CAP et le répresseur LACI doivent tous deux être modifiés par __________, en liant respectivement l’AMPc et l’allolactose (produit par B-galactosidase (Lac-Z)à partir du lactose), pour se fixer aux séquences régulatrices.
allostérie
La liaison de l’AMPc à CAP induit un changement de ________ et permet au domaine de liaison de l’ADN d’iteragir avec sa _________ cible.
conformation
séquence
La liaison CAP ou du répresseur Lac-I se fait par des motifs _________________ à ______ demi-sites de liaison dans chaque cas (sillon majeur)
hélice-coude-hélice
deux
Comme la plupart des activateurs de la transcription, CAP est constitué de _______ domaines distincts:
Un domaine de liaison à ________ et un domaine d’activation qui interagit avec d’autres ________.
deux
l’ADN
protéines
Dans le cas de CAP, le domaine de liaison permet le “recrutement” de ____________ au site promoteur par contact avec le domaine _____
ARNpol
alpha-CTD
Comme la plupart des activateurs de la transcription, CAP est constitué de deux domaines distincts: un domaine _______________ et un domaine_______________ qui interagit avec d’autres protéines.
liaison à l’ADN
d’activation
Est-ce qu’on peut facilement substituer les domaines de liaison à l’ADN et d’activation ?
Oui
L’expression de tous les opérons bactériens impliqués dans le métabolisme des sucres est activée par _________, via le ‘recrutement’ direct (ex. Opéron Lac) ou indirect de ________ par des interactions avec d’autres protéines (contrôle combinatoire)
CAP-AMPc
l’ARNpol
Le site de liaison à CAP au site de liaison remplace l’élément __ localisé en amont des ________ _______ _________
UP
promoteurs forts bactériens
Est-ce vrai de dire que l’expression des gènes peut être contrôlée par une sucession de facteurs (sigma) ?
Tout à fait
Qu’est-ce que MerR?
Il s’agit d’un activateur qui contrôle l’expression des gènes impliqués dans la détoxification du mercure.
Les boîte -10 et -35 du promoteur MerR sont-elles trop distantes pour permettre l’initiation de la transcription ? Si oui que se passe-t-il alors?
En présence de mercure, il y a induction d’une courbure dans l’ADN (changement de conformation de l’ADN par allostérie ). Les positions -10 et -35 sont alors en position favorable pour la formation du complexe ouvert.
En présence d’arabinose, AraC se lie aux site __ et __interagit avec la protéine CAP pour stimuler la transcription.
En asbsence d’arabinose, AraC adopte une autre conformation qui _______ la transcription en favorisant : Une __________ dans _____ qui empêche ____ de se lier et l’interaction avec l’ARNpol
I1 I2 réprime courbature L'ADN CAP
