Chapitre 19 - La régulation chez les eucaryotes Flashcards
Quelle est la différence principale entre la régulation chez les eucaryotes et la régulation chez les procaryotes ?
Chez les eucaryotes, il y a présence de nucléosomes ce qui nécessite le recrutement de complexe de remodelage.
Est-ce vrai de dire que le nombre d’activateurs et de répresseurs est beaucoup plus grand, et ce, pour un seul gène chez les eucaryotes ?
Oui! C’est particulièrement vrai pour les organismes pluricellulaires.
L’ensemble des sites de liaison aux régulateurs constitue ce qu’on appelle les ________ ___________.
Séquences régulatrices
Parfois, les sites de liaison sont groupés en unités appelés __________(terme anglais en français) qui peuvent activer un gène à distance , soit en amont ou en aval de celui-ci.
‘enhancers’ ou amplificateurs
Tout comme chez les bactéries, les activateurs sont constitués de deux domaines soit le ____________ __________ et le __________ _______________ qui lui interagit avec d’autres complexes protéiques (ex. Médiateur)
Le domaine de liaison à l’ADN
Le domaine d’activation
Nommez le principal mécanisme de fonctionnement des répresseurs de la transcription chez les eucaryotes :
Le ‘gene-silencing’
Qu’est-ce qu’implique le principal mécanisme de fonctionnement des répresseurs chez les eucaryotes?
Le recrutement de complexes de modification des nucléosomes
Parmi les motifs structuraux rencontrés chez les activateurs eucaryotes (domaine de liaison à l’ADN) on retrouve:
- Motif hélice-coude-hélice
- Motif à doigt de zinc
- Motif à fermeture éclair à leucine
- Motif hélice-boucle-hélice
Est-ce vrai de dire que les domaine d’activation n’ont pas de structures bien définies ?
Oui, cependant, ils ont tout de même une tendance à former des hélices en présence de la cible)
Des unités répétées, contenant de petites séquence riches en _______ _______ de même qu’un caractère hydrophobe sont communes.
résidus acides
Comme chez les bactéries, les activateurs recrutent les complexes protéiques au niveau du ________.
promoteur
Rarement les activateurs vont se lier directement à ______ _______ comme chez les bactéries.
ARN polymérase
Les activateurs eucaryotes recrutent aussi très souvent des ________ ___________ ou de remodelage de la __________ pour rendre accessible le __________.
Complexes de modification
chromatine
promoteur
Certains _________ lient des unités régulatrices (enhancers) qui sont localisées très loin du __________
(___ à ___ Kpb ou plus), en amont ou en aval
activateurs
promoteur
10 à 100
Lorsque les activateurs lient des séquences régulatrices situées très loin du promoteurs, alors qu’est-ce qui est nécessaire pour recruter le complexe protéique au promoteur?
Une courbature dans l’ADN via l’aide des protéines architecturales est essentielle
Généralement, un amplificateur contrôle l’expression de 2 gènes et plus.
Faux ! Habituellement un seul.
Qu’est-ce qui brise l’interaction entre le promoteur et l’amplificateur ?
La présence d’un isolateur
Un seul activateur est requis pour activer l’expression d’un seul gène.
Faux, parfois, plusieurs activateurs sont requis
Quel interactions a lieu parfois entre deux activateurs? Et qu’est-ce que cet interaction cause?
Il y a synergie entre les activateurs, ce qui fait en sorte que la liaison des deux activateurs a un effet plus grand que la somme de chacun d’entres eux.
La synergie peut résulter de quoi?
De la coopérativité entre activateurs pour faciliter leur liaison respective à l’ADN.
Exemple de synergie chez la levure :
Le gène ___ est exprimé uniquement à un certain stade du cycle cellulaire chez la cellule _____, mais non chez la cellule _____.
______ est un activateur qui ne peut être actif que chez la cellule ______
___ présent chez les cellules mère et fille, est actif seulement à un stade _____ du cycle cellulaire.
HO mère fille SWI5 mère SBF précis
La synergie entre différents activateurs permet un ______ nombre de combinaison pour un gène particulier.
grand
Chez les eucaryotes, est-ce vrai de dire que si un répresseur se lie à un site opérateur chevauchant le site promoteur, alors il y aura répression?
C’est faux, on peut uniquement affirmer ceci en ce qui concerne les procaryotes.
L’activation d’un gène en réponse à un stimuli extérieur implique une _____ ___ _________.
voie de signalisation
La transmission d’un signal vers _______ de la cellule mène à la _________ d’un ________ qui permet le transport de l’activateur du _______ vers le _________.
l'intérieur modification activateur cytosol noyau
Le silencing des gènes résulte des modifications des ______ et de ________
histones
l’ADN
La structure particulière des _________ associés aux __________ reconnaissent des ________ ________.
domaine
complexes motifs spécifiques
Exemple de reconnaissance des domaines :
La protéine ____ possède un chromodomaine reconnaissant spécifiquement la _________ ________ à la position ___ de ___ et favorise la condensation de la chromatine en __________.
HP1 lysine méthylée 9 H3 hétérochromatine
La formation d’hétérochromatine au niveau des télomères des chromosomes de levure est une conséquence de quoi exactement ?
Du recrutement d’un complexe histone désacétylase (SIR2) par la protéine RAP1
Nommez une autre fonction des isolateurs
Stopper la propagation de l’hétérochromatine
Est-ce la méthylation de l’ADN ou des nucléosome qui joue un rôle important dans répression complète de gènes ?
Il s’agit de la méthylation de l’ADN
Nommez les deux gènes humains pour lesquels la transcription se fait uniquement à partir d’un des deux chromosomes parentaux, mais pas les deux.
Il s’agit des gènes Igf2 et H19
Qu’est-ce qui s’occupe de s’assurer de la transmission héréditaire de l’ADN méthylé ?
(hérédité épigénétique)
Il s’agit de la méthylase de maintenance
Qu’est-ce que l’épigénétique ?
Il s’agit d’un domaine de la biologie qui étudie les modifications de l’expression génétique induites par des facteurs externes.
