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LEVURES🍄🍻🥖 > OURS 4 : LEVURES MORPHOLOGIES, ORGANISATIONS CELLULAIRES ET FONCTIONS > Flashcards

OURS 4 : LEVURES MORPHOLOGIES, ORGANISATIONS CELLULAIRES ET FONCTIONS Flashcards

1
Q

quelle est la particularité du cycle de vie de S. cerevisiae?

A

deux formes, soit diploïde ou haploïde

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Q

S. cerevisiae présente un cycle biologique avec une croissance végétative prédominante, favorisant la forme ….

A

diploide

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3
Q

pourquoi la forme diploïde est meilleure que la forme haploïde chez S. cerevisiae?

A

La forme diploïde permet à la levure de s’adapter aux variations du milieu et de résister efficacement aux stress endommageant l’ADN

vu que 2 copies du même gène ça prend plus d’effort pour les enlever

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4
Q

lors de stress extreme, nommer 3 stratégie adoptées par S. cerevisiae pour se protéger

A

la quiescence, la croissance pseudohyphale pour l’exploration du milieu, ou la sporulation

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5
Q

à quel moment S. cerevisiae passe de la forme diploide à haploide 6

A

après la sporulation elle se divise sous forme haploïde assurant la diversité génétique et la capacité de revenir à une forme diploïde

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6
Q

quelle méthode a joué un rôle clé dans la caractérisation de nombreux gènes de levure, favorisant ainsi la croissance de la biologie moléculaire de la levure?

A

la transformation

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7
Q

quelles sont les trois méthodes pour observer la morphologie des levures, laquelle est la plus utilisée?

A

coloration (la plus utilisée), microscope et enzymes

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8
Q

nommer les structures visualisées par ces colorants:

Bleu de méthylène
Aminoacridine
F-C ConA
Blanc calcofluor
DAPI
Rouge neutre
Iodine
Rhodamine

A

Bleu de méthylène = toute la cell, bleu

Aminoacridine = paroi cell, potentiel surface

F-C ConA = paroi cell, mannane

Blanc calcofluor = anneau chitine paroi cell

DAPI = noyau (ADN fluo) et mitochondrie (fluo rose/blanc)

Rouge neutre = vacuoles en rouge/violet

Iodine = glycogène en rouge/brun

Rhodamine = mitochondrie

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9
Q

quelle méthode permet de voir l’utrastructure des organises et l’architecture macromoléculaire?

A

microscopie électronique (balayage, transmission et force atomique)

et marquante des structures

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10
Q

distinguer les trois types de microscopie électronique

A

balayage = 3D
transmission: 2D, coupes très fines pour voir structure internes
force atomique - voir formes, épaisseur, ex paroi

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11
Q

quels sont les trois principaux morphotypes de levures?

A

1- Syncytium avec un cytoplasme contenant plusieurs noyaux, observé chez des espèces comme Ashbya gossypii.

2- L’arrangement ‘normal’ d’un noyau-une cellule avec une division nucléaire et cellulaire étroitement couplée.

3- Endo-bourgeonnement, un processus où les cellules filles se forment à l’intérieur des cellules mères, généralement lié à la formation de spores et non utilisé pour la reproduction dans les levures

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12
Q

VRAI/FAUX
il y a un lien entre la morphogenèse (plasticité morphologique) et les stimuli?

A

VRAI, plasticité morphologique cruciale pour l’adaptation des levures à divers environnements

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13
Q

selon ces conditions, quelles morphologie/phénomène observe-t-on:

1-conditions difficiles
2-reproduction sexuée
3-manque de nutriments
4-stress/manque de nutriments

A

1-Levures diploïdes subissent une méiose pour produire des spores haploïdes (ascospores) résistantes aux conditions difficiles

2-Cellules haploïdes de types sexuels opposés (a et α) fusionnent pour former une cellule diploïde

3-État quiescent ou dormant afin de permettre la survie jusqu’à ce que les conditions s’améliorent

4-favorise la formation de structures filamenteuses

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14
Q

quelles sont les 3 composantes de l’enveloppe de S. cerevisiae?

A

intérieur vers extérieur de la cellule

membrane plasmique, espace périplasmique et paroi cellulaire

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15
Q

nommer des rôles de la membrane plasmique

A

Contrôle, transport, ancrage protéines & communication

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16
Q

nommer des rôles de l’espace périplasmique

A

Stockage des enzymes, transport & transformation

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17
Q

nommer des rôles de la paroi cellulaire

A

Protection, adhésion & structure

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18
Q

particularité de la paroi cellulaire des levures

A

la levure peut régénérer complètement sa paroi cellulaire une fois qu’elle a été dépourvue de celle-ci

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19
Q

VRAI OU FAUX
l’enveloppe des levures est similaire à celles des bactéries et mammifères

A

FAUX d’où le fait que les aspects structurels et fonctionnels de l’enveloppe cellulaire de la levure ont suscité un intérêt précoce

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20
Q

la paroi cellulaire des levures est importante pour 3 choses, soit?

A

forme de la levure, résistance au milieux hypotoniques ET interaction/récepteurs/enzymes/perméabilité des cellules

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21
Q

VRAI OU FAUX
la chitine est une composante mineure de la paroi et est donc moins essentielle?

A

FAUX, elle est vraiment importante pour les levures, rôle structural et de signalisation

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22
Q

la chitine est un polymère de ..?

A

N-acétylglucosamine (NAG)

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23
Q

VRAI OU FAUX
la paroi cellulaire des levures a des propriétés uniques et peut donc être ciblée/antifongiques?

A

VRAI

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24
Q

quelle composante de la paroi se situe dans une partie vraiment plus épaisse?

A

GAG, Galactosaminoglycane

chez candida/aspergillus je pense…

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25
VRAI/FAUX La capsule est similaire à la paroi
FAUX
26
chez quels types de levures retrouve-t-on beaucoup la capsule?
basidiomycètes
27
selon quelle caractéristique varie la composition des capsule? donner des exemples
selon genre/espèce - phosphomannane (Hansenula, Pichia, Pachysolen) - b-mannanes (Rhodotorula) - hétéropolysaccharides (Cryptococcus, Lipomyces, Candida, Trichosporon) - sphingolipides (Hansenula)
28
nommer 4 fonctions de la capsule
- Protection - Adhérence - Reserve - Pathogénicité
29
que sont les sphéroplastes?
cellules de levure dont la paroi cellulaire a été retirée à l'aide d'enzymes lytiques en présence de stabilisateurs osmotiques, sans affecter leur viabilité ni leurs autres fonctions cellulaires
30
différence en sphéroplaste et protoplaste
sphéroplaste = paroi partiellement dégradée, cellule encore protégée protoplaste = paroi totalement dégradée, cellule vraiment fragile
31
VRAI OU FAUX la membrane plasmique des eucaryotes supérieurs est similaire à celle des levures?
VRAI
32
composition de la membrane plasmique des levures (4)
Phospholipides, glycolipides, protéines et stérols estérifiés (ERGOSTÉROL)
33
nommer des fonctions de la membrane plasmique des levures (il y en a vraiment beaucoup, nommer quelques unes)
- Protection physique de la cellule - Contrôle de la stabilité osmotique - Contrôle de la biosynthèse de la paroi cellulaire - Ancrage pour les composés du cytosquelette - Barrière de perméabilité sélective -ATPASE pour transport actif SÉLECTIF - Fonctions liées au transport dans l'endocytose et l'exocytose - Localisation des composants des voies de transduction des signaux - Sites de reconnaissance cellulaire et d'adhésion cellulaire.
34
qu'est ce que le cytosquelette?
réseau complexe de protéines fibrillaires pour former l’ossature de la cellule
35
VRAI OU FAUX le cytosquelette est très stable en raison de ses fonctions importantes de maintien?
FAUX, très instable et donc changements dynamiques et rapides
36
quelles sont les trois protéines qui composent le cytosquelette?
1.Les microtubules : les plus épais 2.Les filaments d'actine : les plus fins 3.Les filaments intermédiaires: les plus stables et les plus rigides
37
nommer 4 rôles du cytosquelette
- Forme de la cellule - Transport - Mouvements internes & déplacements - Division cellulaire
38
le cytoplasme est le site pour?
Site central des activités cellulaires et du trafic intracellulaire.
39
composition du cytoplasme, le liquide et ce qu'il contient
Liquide colloïdal aqueux, légèrement acide (pH ~5,2), contenant : * Des composés de faible et moyenne masse moléculaire (protéines, glycogène, macromolécules solubles). * Des entités macromoléculaires (ribosomes, protéasomes, particules lipidiques).
40
nommer les 3 fonctions associées aux enzymes principales du cytoplasme
* Glycolyse * Synthèse des acides gras * Biosynthèse des protéines
41
nommer 2 fonctions essentielles du cytoplasme
* Maintien de l'intégrité cellulaire. * Formation et contrôle du cytosquelette
42
décrire le noyau: forme, localisation, membrane nucléaire
forme = presque sphérique, 1.5 um localisation = centre ou un peu excentré dans la cellule membrane nucléaire = double membrane (int/ext) qui sépare le nucléoplasme du cytoplasme
43
nommer les 3 grandes structures du noyau et leur fonction
1. pores nucléaires: rôle au niveau des canaux pour import/export entre noyau et cytoplasme 2. continuité membranaire: membrane nucléaire externe est en conLnuité avec le réticule endoplasmique 3. corps et pôles séparateurs: rôle au niveau de l'ancrage des microtubules continus et discontinus pour la division cellulaire
44
décrire le nucléole du noyau, à quel moment il est visible?
région dense visible en interphase et disparaît pendant la mitose
45
nommer les 3 fonctions principales du nucléoles
* Site de synthèse et maturation des ARNr * Assemblage des sous-unités ribosomales * Participe au traitement de l'ARN pré-messager
46
décrire la chromatine du noyau
Réseau d’ADN associé à des protéines appelées histones
47
euchromatine vs hétérochromatine
Euchromatine : * Chromatine moins condensée. * ADN accessible, favorisant l’expression des gènes. Hétérochromatine : * Chromatine plus dense. * ADN moins accessible, expression des gènes réduit
48
de quoi est constitué le programme génétique de la cellule?
chromosomes nucléaires
49
nommer 3 rôles fonctionnels du noyau
1.Stockage et réplication de l’ADN : Conservation du matériel génétique. Duplication de l’ADN lors de la division cellulaire. 2.Transcription et maturation des ARN: Synthèse des ARN à partir de l’ADN (transcription). Modification et maturation des ARN (pré-ARNm, ARNr, ARNt). 3.Contrôle génétique : Régulation de l’expression des gènes pour les fonctions cellulaires.
50
décrire le RE en 3 points
Organite clé dans la STABILITÉ, la MODIFICATION et le TRANSPORT DES PROTÉINES
51
décrire vite fait les fonctions de synthèse et de transport du RE
synthèse= production de protéines transmembranaires et des lipides cellulaires + fabrication de prot destinées à la sécrétion transports = emballage des protéines qui bourgeonne (vesicules) et transfert vers GOLGI
52
3 rôle de l'appareil de Golgi
1. traitement : modifie chaines d’oligosaccharides des protéines N-glycosylées 2. tri: distribution des protéines vers leurs destinations finales (VÉSICULES/TRANSPORT) 3. transport rétrograde: Élimination des protéines mal repliées ou modifiées, crucial pour l’homéostasie cellulaire
53
quelles sont les trois types de vésicules de transport entre RE et Golgi?
1.COPII : ER → Golgi. (transport antérograde). 2.COPI : Récupération rétrograde du Golgi vers l’ER. 3.Vésicules revêtues de clathrine : Transport dans la voie sécrétoire tardive.
54
nommer des caractéristiques générales des vacuoles
- forme sphérique homogène, nombre varie selon la cellule - délimitée par mb plasmique - 30% volume cellulaire - DYNAMIQUES: compartiment unique ou plusieurs petits (on dit compartiments pré- vacuolaires, endosomes pré- vacuolaires ou endosomes tardifs) - INTÉGRÉES à la voie ER-Golgi
55
VRAI OU FAUX les vacuoles se forment par la croissance et la séparation de compartiments préexistants, plutôt que par une synthèse de novo?
VRAI
56
nommer 3 grandes fonctions des vacuoles
1. traffic des protéines, réception des protéines qui viennent de Golgi, mb plasmique ou autophagie (UNE DÉCHARGE) 2. protéolyse non spécifique: dégradation de protéines et libération de produits nécessaires à la cellule 3. fonctions physiologiques: stockage acide aminés basiques, cations ET régulation homéostatique dans cytosol
57
nommer les 4 composante de la structure mitochondriale
- MOM (mb ext): barrière et abrite enzyme pour métabolisme lipides - MIM (mb int): contient cytochromes pour chaine respiratoire; ATP synthase) - IMS (esp inter. mb): entre les 2 mb - MATRICE: lieu cycle acide citrique + a ADN mitochondrial et machinerie de synthèse des protéines, ribosomes mitochondriaux
58
VRAI OU FAUX Les mitochondries adopteront différentes morphologies en fonctions des conditions dans lesquelles les cellules de S. cerevisiae sont cultivées?
VRAI
59
que font les mitochondries en conditions aérobies vs anaérobies?
aérobie : principalement impliquées dans la respiration et la synthèse d'ATP + grandes et efficace mais qt limitée anaérobie: respiration altérée en l'absence d'oxygène mais fonctionnelles autres fonctions comme: production métabolites pour fermentation, gestion stress oxydatif, synthèse acide gras/lipides et régulation métabolisme énergétique
60
à quelle classe d'organites appartiennent les peroxysomes?
microbodies
61
VRAI OU FAUX les peroxysomes contienent du matériel génétique et de la machinerie de traduction?
FAUX, dépendent de protéines codées par le noyau
62
deux facteurs d'induction des peroxysomes
* Hydrocarbures (H-(CH2)n) ou acides gras dans les milieux de culture (levures). * Méthanol (levures méthylotrophes).
63
quel est le principal rôle des peroxysomes? nommer deux choses importantes
β-oxydation des acides gras: Les peroxysomes assurent l'oxydation exclusive des acides gras chez les levures ET contiennent catalase et oxydase ET participent au cycle du glyoxylate
64
1. en conclusion, quels sont les 3 organites impliqués dans le traitement des prot, leur distribution et leur dégradation? 2. lesquels (2) pour les organismes supérieurs ?
1. ER, Golgi et vacuole 2. mitochondrie et peroxysome
65
VRAI OU FAUX Les levures ont des besoins nutritionnels assez complexes?
FAUX, peuvent croitre dans une simple solution aqueuse qui a des sucres, sel d'ammonium, minéraux et vitamines à pH 5.5
66
croissance optimale de la levure dans un pH de ... à ...
4.5-6.5
67
VRAI OU FAUX Les levures absorbent les sucres simples et donc pas les sucres complexes ?
VRAI, pour les sucres complexes elles doivent d'abord les dégrader (simplifier)
68
VRAI OU FAUX Les acides aminés servent aussi de sources de carbone?
VRAI, milieux peptones utilisés pour essais de fermentation
69
nommer deux sources de carbone particulières
hydrocarbures et méthanol
70
2 rôles de l'azote (2e besoins nutritionnel)
synthèse des protéines et acides nucléiques
71
nommer 4 sources d'azote assimilables
sels d'ammonium acides aminés purines/pyrimidines urée
72
milieu utilisé pour les essais d’assimilation d’azote?
YCB, yeast carbon base qui ne contient aucune source d'azote, pas riche donc on peut vraiment voir si la levure est capable de le synthétiser
73
3e besoin nutritif des levures? nommer des exemples
éléments minéraux en mix (pas un par un) potassium (croissance, fermentation et sporulation), magnésium (stabi a. nuc), fer (respi/hème), zinc, cuivre, sodium
74
4e besoin nutritif des levures
facteurs de croissance, vitamines
75
quels sont les deux FT nécessaires à S. cerevisiae (sinon elle ne pousse pas)?
biotine et acide pantothenique
76
milieux de culture généraux vs sélectifs
généraux: malt extract, yeast extract, peptones, YPD (LE + RICHE), YNB (voir assimilation carbone) et YCB (voir assimilation azote) sélectifs: Ade et Ura/Leu/Trp (permet sélection souches auxotrophes)
77
expliquer le principe du milieu Ade
pas capable de synthétiser l'adénine on clone un dropout avec tout sauf adénine si transfo réussi, levure sera cap de pousser
78
formule du métabolisme
métabolisme = Assimilation biochimique (anaboliques) + Dissimilation (cataboliques) aussi réactions enzymatiques (rx réduction + rx oxydation)
79
quels sont les deux moyens pour transporter des sucres?
1. canaux, perméases: permettent la pénétration des molécules à travers les membranes tout en restant inertes (pas chgmts conformationnels) 2. transporteurs: catalysent l'absorption des solutés et subissent un changement de conformation (diffusion facilitée donc pas d'énergie et transport actif, need énergie) chgmt conformationnels
80
nommer les 2 types de transports des sucres, leur différence
passif: diffusion libre et facilitée = dans un sens (+ vers - concentré) actif: se fait dans les 2 sens
81
type de transport du glucose, fructose, mannose, galactose VS maltose
maltose = actif, vs le reste = par diffusion
82
que se passe-t-il avec la pectine, les lipides, protéines, chitine, etc?
dégradés par des enzymes car ne peuvent pas être assimilés
83
décrire la voie de la glycolyse (Embden-Meyerhof) en général
décrit l'oxydation du glucose en pyruvate avec la production d'ATP et de NADH
84
où se passe la glycolyse?
cytosol, cytopalsme
85
VRAI OU FAUX la glycolyse se fait en anaérobie?
vrai
86
glycolyse en présence d'oxygène vs en absence en termes de pyruvate
En présence d'oxygène, le pyruvate est ensuite oxydé en dioxyde de carbone CO2. En l'absence d'oxygène, le pyruvate peut être fermenté en lactate ou en éthanol.
87
réaction nette de la glycolyse genre ce qu'on a avant et après
Glucose + 2 NAD+ + 2 Pi + 2 ADP = 2 pyruvates + 2 ATP + 2 NADH + 2 H2O
88
que génère le cycle des acides tricarboxyliques? (acide citrique)
génère du NADH en oxydant des groupes acétyle en CO2 Et FADH2
89
lieu du cycle de l'acide citrique
mitochondrie, oxydation des atomes de carbone des groupes acétyle dans l'acétyl-Coa les convertissant en CO2
90
à qui est transféré l'acétyl-Coa pour former l'acide citrique?
oxaloacétate
91
chaque tour du cycle de Krebs produit quoi?
4 NADH, 1 FADH & 1 GTP = 15 ATP ET VU QUE 2 PYRUVATES ENTRE DANS LE CYCLE ÇA FAIT 30 ATP ***GLYCOLYSE = 2 ATP + 2 NADH ***TOTAL = 38 ATP
92
à quoi serviront les électrons stockés dans le NADH ET FADH2
seront utilisés ultérieurement pour produire de l'ATP via la phosphorylation oxydative, processus requérant directement l'oxygène de l'atmosphère
93
qui fournit les atomes d'oxygène nécessaires pour convertir les groupes acétyle en CO2?
l'eau
94
décrire le transport des électrons selon NADH ou FADH
NADH donne électron au complexe 1 et un H+ est pompé, électron va au complexe 3 puis 4 (électrons y sont pompés aussi) FADH même principe mais électron va direct au complexe 2
95
dans quelle condition la fermentation est-elle effectuée? quels sont les 2 résultats possibles après obtention du pyruvate?
en absence de O2 éthanol + CO2 OU lactate
96
regènère-t-on de l'énergie dans la fermentation?
non, le NAHD est réduit et le NAD est réutilisé dans la glycolyse
97
comparer le rendement énergétique de la respiration vs la fermentation
⭐️fermentation: ATP prod direct: 2 ATP produit via glycolyse, les NADH produits durant la glycolyse ne contribuent pas à la prod d'ATP car sont réutilisés pour générer NAD (durant conversion pyruvate ➡️ éthanol) TOTAL= 2 ATP ⭐️respiration aérobie: ATP prod direct: 2 ATP durant glycolyse et 2 GTP cycle de Krebs ATP prod indirect via NADH/FADH2: 10 NADH DONC 30 ATP ET 2 FADH = 4 ATP TOTAL = 38 ATP
98
qu'est ce que l'effet Pasteur?
l’aérobiose entraine une baisse de la consommation de sucres et une diminution de la fermentation baisse de consommation de sucres quand conditions aérobiques levure va prioriser la respiration à la fermentation car plus rentable (38 vs 2 ATP)
99
décrire l'effet Crabtree
suppression de la respiration par haute concentration de glucose cellules continuent à fermenter qu'il y ait de l'oxygène ou non
100
Cabtree positif vs négatif
positif: fermentation même en présence d'oxygène (glycolyse et fermentation), préférence pour la fermentation même si oxygène négatif: respiration aérobie même avec des concentrations élevées de glucose (respiration mitochondriale) + pas de répression de la respi si trop de glucose
101
que fournit le cycle du glyoxylate?
fournit les différents éléments intermédiaires pour le cycle des acides tricarboxyliques (Krebs) assure donc le bon fonctionnement de ce cycle
102
par rapport à sa variante (cycle acides tricarboxyliques), le cycle du glyoxylate produit une enzyme supplémentaire qui est?
isocitrate lyase
103
que permet de former le cycle du glyocylate? et pour quoi?
malate qui est le précurseur de la gluconéogenèse
104
où se trouvent les enzyme du cycle du glyoxylate?
peroxysomes
105
décrire la gluconéogenèse
⭐️⭐️⭐️ anti// à la glycolyse (donc même enzymes genre) ****retenir que ça je pense Synthèse du glucose à partir de composés non glucidique précurseurs: Glycérol, éthanol, lactate, acides amines, autres intermédiaires du cycle de Krebs dépend de ATP comme donneur d'énergie et du NADH comme pouvoir réducteur Carbohydrates de stockage : La néoglucogenèse convertit le pyruvate en glucose, mais aussi des sucres de réserve (tréhalose et glycogène
106
où a lieu la voie des pentoses phosphates?
cytoplasme
107
rôle de la voie des pentoses phosphates?
Génère du NADPH et du ribose-5-phosphate pour faire ARN/ADN
108
2 phases de la voie des pentoses phosphates
oxydative: prod NADPH non-oxydative: prod de ribose-5-phosphate et régénérer glucose-6-phosphate
109
fonctions de la voie des pentoses phosphates
Fournit des molécules nécessaires à la biosynthèse (acides aminés, acides gras, alcools sucrés et coenzymes nucléotidiques (NAD, NADP, FAD,...) et à la défense contre le stress oxydatif
110
nommer différents types de lipides des levures et des exemples
- Lipides de membrane: phospholipides et sphingolipides - Lipides de stockage: triglycérides (réserve énergie), stérides -Stérols, ergostérol - Lipides libres: acides gras et mono- et diacylglycérols - Lipides liés aux protéines: GPI (glycosylphosphatidyl- inositols) - Lipides spécialisés Dolichols : Glycosylation des protéines. Polyprénols : Précurseurs des isoprénoïdes
111
où a lieu l'utilisation des acides gras dans la levure?
peroxysome
112
fonction principale des peroxysomes
en gros l'acétyl-Coa est transp à mitochondrie pour cycle de Krebs catabolisme / bêta oxydation: prod de H2O2 et du coup peroxysomes ont une catalase qui le dégrade pour pas nuire à la cellule
113
3 exemple d'utilisation des acides gras
- La synthèse membranaire - Le stockage d'énergie - La modification des protéines
114
rôle de l'egsotérol (stérol des levures)
important pou fluidité de la membrane, protection contre les stress enviro et dans la signalisation cellulaire
115
décrire la biosynthèse de l'ergostérol
acétyl-coa devient acide mévalonique dans la vacuole/mitochondrie dans la vacuole: acide mévalonique devient farnesyl pyrophosphate dans le RE squalene devient ergostérol
116
cible thérapeutique de l'ergostérol
azoles ciblent synthèse ergostérol en inhibant enzymes spécifiques
117
principe de l'effet killer
Certaines levures produisent des toxines qui tuent d'autres souches sensibles tout en restant immunes (toxines killer)
118
quels facteurs influencent la production de toxines killer (3)?
pH acides température énergie cellulaire nécessaire
119
nommer 4 modes d'action des toxines killer
fixation cellule cible perturbation mb inhiber synthèse protéique apoptose fongique
120
nommer 3 champs d'application des levures killer
biotech, médecine et écologie microbienne

LEVURES🍄🍻🥖 (6 decks)

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