COURS 5 : MYCOLOGIE MÉDICALE 🧬 Flashcards
pourquoi connait-t-on uniquement 150 000 espèces de champignons alors que 2.4 millions estimées
manque d’intérêt et on ne connait pas leur conditions de croissance
distinguer micromycètes et macromycètes
micromycètes: levures et moisissures
macromycètes: champignons macroscopique, incluent ceux qu’on mange
caractéristiques des champignons, mycètes et fungi
eucaryotes
sans chlorophylle
porteur de spores
nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (hétérotrophes)
reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
paroi cellulaire chitine/glucanes
saprophytes pour la plupart
comment classe-t-on les champignons selon la morphologie (3)?
basée sur la forme de la croissance végétative, 3 types de morphologies
-levures (forme levuriforme)
-moisissures (champignons filamenteux)
-champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)
quelle est la forme la plus simple de champignon?
levures
mode de reproduction asexuée des levures
bourgeonnement (S. cerevisiae) et fission (Schizosaccharomyces pombe)
les levures pathogènes de l’Homme sont désignées par … ?
Blastoconidies (C. albicans)
décrire les moisissures
mycélium = ?
cellules filamenteuses et cylindriques souvent branchées nommées hyphes
mycélium =une masse d’hyphes
décrire les pseudohyphes
morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale
cellules levuriformes allongées et attachées
décrire les champignons dimorphiques
exemple de champignons, températures
dimorphisme = caractéristique de plusieurs champignons pathogènes endémiques comme Blsatomyces et Histoplasma
Filamenteux à 25 degrés
Levures à 37 degrés
Ce changement morphologique (morphogenèse) est une caractéristique d’identification de ces champignons au laboratoire
quel agent cause la blastomycose?
Blastomyces derematitidis
nommer 3 méthodes de reproduction fongique asexuée
1) production de spores: endospores, exospore, blastospores
2) fragmentation de mycélium: Spores formées à la suite de fragmentation d’hyphes/filaments
3) production de stolons: propagation par extension des filaments
décrire la reproduction sexuée (gamètes/contenu cellulaire) pour donner lieu à un zygote (isogamie et cystogamie)
isogamie: fusion de deux gamètes
cystogamie: fusion du contenu cellulaire
nommer les structures spécialisées où les spores se forment après la méiose de la reproduction sexuée
asques qui contiennent ascospores
basides qui contiennent les basidiospores
quelles est la caractéristique des champignons parfaits vs imparfaits
parfaits: capables de fabriquer des spores (reproduction sexuée et asexuée) alors que
imparfaits: reproduction que par des spores asexuée
quels sont les trois caractéristiques qui permettent d’effectuer la classification taxinomique?
présence ou absence de reproduction sexuée
caractères morphologiques
phylogénie moléculaire/génétique
quels sont les 5 groupes où on retrouve la majorité des champignons pathogènes?
ascomycètes
basidiomycètes
glomeromycètes
mucormycètes
mortierellomycota
concernant les ascomycètes
- %
- 2 formes retrouvées
- types de reproduction
- exemples
- Représentent 75% des champignons connus
- Levures ou filamenteux
- Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
- Exemples : Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Fusarium, Penicillium, Alternaria, Blastomyces, Histoplasma, Aleuria, Neurospora, Thaxteriella
concernant les basidiomycètes
1- type de reproduction
2- apparences
3- exemples
1- reproduction sexuée par formation des basidiospores ou des conidies
2- Sporophore/carpophore, levures, filaments, capsules
3- Cryptococcus neoformans, Boletus, Agaricus, Russula
concernant cryptococcus, que cause-t-il? transmission?
méningite et via les pigeons
quels sont les trois groupes de champignons pathogènes qui composent les Zygomycètes (ancien nom)?
Glomeromycètes, Mucoromycètes et Mortierellomycota
décrire les groupes de champignons appartenant aux Zygomycètes
-forme primitive des…
-notion de cellules coenocytiques
-reproduction
-mycorhize
-exemples
- Forme primitive des champignons
- Cellules coenocytiques (en majorité, mais exception existe)
- Formation de zygospores (reproduction sexuée), sporocystes (reproduction asexuée)
- Ectomycorhizes et endomycorhizes
- Exemples : Glomeromycètes (Glomus, Gigaspora, Rhizophagus), Mucoromycètes
(Mucor, Phycomyces), Mortierellomycota (Mortierella, Diussophora)
nommer un groupe qui ne fait pas parti des 5 groupes où on trouve des champignons pathogènes
Microsporidies
décrire les microsporidies et donner des exemples de pathogènes
pathogènes intracellulaires de plusieurs animaux
Agent de la pébrine (maladie du ver à soie), Nosema bombycis et de la Microsporidiose (Encephalitozoon)
que contient la cellules fongique (7)?
- Noyau avec membrane nucléaire
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
nombre de couches de la paroi?nommer les 3 composantes de la paroi
3 couches: Interne (chitine), intermédiaire (glucane) et externe (mannane)
décrire la membrane plasmique d’une cellule fongique
ergostérol (cholestérol fongique)
absent chez les cellules animales (du coup on peut le cibler)
permet de réguler fluidité de la membrane
nommer les 4 types de modes de vie/écologie des champignons
saprophytes: se nourrissent de la matière organique en décomposition
symbiotique: vivent en symbiose avec les racines de plantes (mycorhizes) ou algues (Lichens); ceci confère un avantage nutritif aux deux partenaires
pathogènes/opportunistes: chez plantes sont nécrotrophes ou biotrophes OU chez humain sont opportunistes ou pathogènes stricts venant d l’enviro
commensaux: champignons faisant partie de la flore des animaux, de l’Homme et des plantes. Profitent de
l’hôte sans causer de dommage. Ils peuvent être opportunistes dans certain contexte (Candida albicans )
définir une mycose
infections fongiques touchant les animaux incluant l’Homme
peuvent être superficielles ou profondes et même systémique
définir la mycologie médicale
distincte de la microbiologie médicale
consiste à isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie
à l’époque du moyen âge quel agent attaquait le cuir chevelu, la peau lisse et les ongles?
Trichophyton schoenleinii
quel agent cause le muguet?
C. albicans
quel agent a été associé à une éclosion d’infections sous cutanées chez des travailleurs miniers en Afrique du Sud (1941-44)?
lors de la deuxième guerre mondiale, il y a eu apparition de zones endémiques aux USA, quel agent et quelle maladie?
1-Sporothrix schenckii
2- Histoplasma capsulatum, agent de l’Histoplasmose
l’ère de la suppression immunitaire (chimie, VIH/SIDA, maladies auto-immunes, etc) a favorisé l’apparition de quoi?
mycose opportunistes nosocomiales
quels sont les trois découvertes importantes qui ont été faites durant l’âge d’or de la mycologie médicale?
1- développement de tests diagnostics comme mise en culture spécifiques, tests de susceptibilité aux agents antimicrobiens, séquençage ADRr et ITS
2- Développement d’antifongiques: Azoles et échinocandines
3- Avancés dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique
Concernant les avancées dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique, nommer deux initiatives qui ont été faites
1- Fungal Genome Initiative: séquençage de plusieurs génomes de champignons pathogènes de l’Homme
2- Génomique fonctionnelle fongique: Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrétomes
concernant la classification des champignons selon la pathogénèse, nommer les 5 sites d’infections primaires
mycoses superficielles, cutanées, opportunistes systémiques, sous-cutanées et endémiques
nommer deux agents associés à des mycoses superficielles,
Titea versicolor, infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
infection cutanées par Malassezia
***souvent problèmes cosmétiques
définir les mycoses cutanées et nommer un agent qui y est associé
dermatophytres, infections qui touchent la peau, les cheveux et les ongles
agent: Trichophyton tonsurans et d’autres Trychophyton
nomme deux caractères distinctifs d’une infection par Trychophyton
couche concentrique caractéristique ET infecte la couche VIVANTE de la peau, pas la morte comme dans mycoses superficielles
décrire les mycoses opportunistes systémiques et nommer des agents qui peuvent les causer
Infections de tous les organes par des champignons environnementaux
Touchent surtout les SI des immunosupprimés
AGENTS: Aspergillus fumigatus ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota comme Candida albicans
VRAI OU FAUX
Les mycoses opportunistes systémiques peuvent survenir chez des personnes saines?
VRAI, dans le cas des champignons dimorphiques
décrire les mycoses sous-cutanées et quel agents y sont associés?
Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés, IL FAUT DES LÉSIONS
agents: champignons mécanisés comme Sporothrix schenckii et Madurella mycetomatis
VRAI OU FAUX
dans le cas d’une infection par Sporothrix, la présence de noir correspond à de la nécrose?
FAUX, c’est las production de mélanine
décrire les mycoses endémiques, nommer quelques exemples de maladies/agents.
Champignons ayant une répartition géographique restreinte ET cause en majorité de l’infection pulmonaire qui peuvent évoluer en infections systémiques (exception Sporothrix par implantation)
- Histoplasmose, Histoplasma capsultum, USA, River valleys
- Blastomyces, B. dermatidis, comme en haut mais aussi CAN-QC
- Penicilliose, P. marneffei, Asie sud-est
-C. gatti, côte ouest USA et CAN
etc
VRAI OU FAUX
une majorité d’histoplasmose est retrouvé en Afrique de l’Ouest-Centrale-Sud?
VRAI
nommer des facteurs de risques qui prédisposent les patients à un taux de mortalité plus élevé après une mycose invasive
cancer, cancer du sang, transplantation de cellules hématopoïétiques ou moelle osseuse, transplantation d’organes, VIH, diabète
quel agent est responsable d’infections pulomonaire et cérébrales, d’otites, d’infections des ongles et d’allergies
quelles personnes sont affectées?
Aspergillus sp
A. fumigatus et aspergillose invasive
immunocompromises
quel agent cause des lésions cérébrales et pulmonaires et des méningites?
transporté par?
quelles personnes sont affectées?
Cryptococcus gatti
excréments de pigeons
affecte les sujets sains et immunosupprimés?
quel agent (endémique au QC) cause des infection fatales et pulmonaires, des lésions dermiques et des ostéomyélites?
à quel autre agent pathogène les lésions qu’il cause se ressemblent?
Blastomyces dermatitidis
et au parasite Leishmania
quel pathogène a été associé à une éclosion dans la Première Nation de Constance Lake dans le Nord de l’Ontario?
B. dermatidis
quel agent pathogène cause une enflure des ganglions qui peut être observé à la suite d’un voyage dans le Sud?
Paracoccidioides sp.
Paracoccidioides brasiliensis, DIMORPHIQUE END.MIQUE
quel est l’espèce de champignon est la plus prévalente (i guess dans le monde)?
Candida spp
ET SURTOUT C. albicans
pourquoi il peut être difficile de diagnostiquer C. albicans?
diversité morphologique extraordinaire
nommer une ressemblance et une différence entre les Candida spp et S. cerveisiae
ont une morphologie similaire mais s.cervisiae est saprophyte alors que candida est pathogène
quelle est la 4e maladie nosocmiale la plus connue? elle est transmise par qui? morbidité/mortalité?
candidose par C. albicans transmise par le personnel de soins
cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosupprimés
pourquoi les hospitalisations associées à des candidose peut être très couteuse (40 000$?
souvent les infections fongiques et les infections bactériennes sont confondues et donc longue durée à l’hôpital = coûts ⬆️
quel caractéristiques confère une virulence à C. albicans?
son dimorphisme soit
- forme de levure à 30 degrés (dissémination)
- des hyphes à 37 degrés (invasion/colinsation organes)
VRAI OU FAUX
C. albicans est un champignon dimorphisme?
FAUX
il forme des filaments à 37 degrés alors que les champignons dimorphiques forment des levures à 37 degrés
VRAI OU FAUX
C.albicans forme des biofilms?
VRAI, croissance multi-cellulaire, sessile (attachée) et résistante
à quel endroit du corps a été retrouvé la forme commensale de C. albicans?
intestin
VRAI OU FAUX
C. albicans effectue de la reproduction sexuée, car son génome contient tout ce qu’il faut pour l’effectuer?
FAUX, oui il a tous les gènes mais C. albicans de peut pas l’effectuer
quand on force en labo il a un mating genre une méiose et c’est terminé, bref pas efficace
VRAI OU FAUX
95% des infections à levures sont causées par C.albicans?
VRAI, le reste glabrata
quel type de mycose est fréquemment retrouvée au Canada?
vaginose à Candida
au niveau du vagin, il est important de retrouver un équilibre entre quoi et quoi?
Lactobacilles et Candida
effet d’un traitement antibiotique sur une vaginose à Candida
Lactobacilles baissent et Candida prend le dessus
pourquoi il est difficile d’éliminer les bactéries et les levures au niveau du vagin?
pH très acide, soit 3-4
quelles sont les 5 composantes du microbiote?
bacteriome, virome, mycobiome, parasites et archeome
nommer des types de mycobiomes humain
buccal, nasal, respiratoire, gastro-intestinal, vaginal, cutanée, oesophagien, dentaire
définir l’abondance relative lors de la mesure du mycobiome
distribution relative (en proportion de la population) des espèces dans le mycobiome
définir la richesse lors de la mesure du mycobiome
Nombre d’espèces trouvées dans un microbiome (richness)
définir l’équitablité lors de la mesure du mycobiome
répartition des individus dans le mycrobiome (evenness)
L’équitabilité microbienne est élevée lorsque les microbes cohabitent en propor6ons égales. Inversement, si un type de microbe domine tandis que les autres sont peu présents, l’équitabilité sera faible
On mesure la diversité microbienne d’un mycobiome en combinant les notions … et …
d’équitabilité et de richesse
nommer trois outils de mesure du mycobiome
culture microbienne: étude un champignon à la fois, pas toujours représentatif car on ne connait pas conditions croissances de tous
séquençage 18S et ITS
métagénomique complète: déterminer fonctions
quel type d’amorce est utilisé pour identifier les espèces par le séquençage de 18S et des ITS
amorces universelles dans régions bien conservées
VRAI OU FAUX
le mycobiome reflète l’état de santé d’un individu?
VRAI, mais ne permet pas d’établir causalité
que peut-on supposer si Candida est retrouvée dans les poumons?
Fibrose kystique
dans les maladies inflammatoires intestinales comme la maladie de Crohn et la colite ulcéreuse, l’inflammation pourrait être causée par quoi?
⬆️ de Candida
nommer un problème des kits d’extraction d’ADN des champignons
pas adapté à la paroi des champignons, on a besoin de plus de détergents
sachant que des agents comme Malassezia pourraient être associés au cancer, quel expériences ont été réalisées?
l’ablation du mycobiome, pourrait augmenter l’effet des chimiothérapies (par gemcitabine) (testé chez la souris)
à quel type de cancer est associée Candida?
gastro-intestinaux
ADN de Candida enrichi dans les tumeurs prédit un mauvais pronostic
VRAI OU FAUX
les champignons associés à 35 types de cancer sont intra-tumoraux?
VRAI et ils ont prédictifs de pronostic et de la réponse à l’immunothérapie
quel champignon pathogène est associé aux fourmis zombies?
Ophiocordyceps unilaterali
nommer une raison expliquant une possible fin du monde causée par les mycoses
les champignons sont les seules microbes connus qui ont causé l’extinction d’une espèce “. A Casadevall
nommer une espèce qui a été extincte par une mycose
amphibiens, chytridiomycose des amphibiens à l’échelle mondiale
Batrachochytrium dendrobatidis (Bd)
quel espèce risque de disparaître en raison de mycose
chauves-souris au nez blanc, CAN et USA
Pseudogymnoascus destructans
CDC, center of disease control and prevention
quel pathogène multi résistant est en émergence? problème?
Candida auris, premier cas de champignons transmissibles…😃
bah du coup on aura bientôt aucun traitement contre C. auris
VRAI OU FAUX
il y.a peu de cas de mycose en Afrique et Amérique du Sud?
FAUX, seulement qu’il n’y a pas vraiment d’études de prévalence sur ces continents
5 caractéristiques de C. auris
- resiste à 42 degrés
- résiste à salinité (mer etc)
- résiste à alcool 70% et autres alcool de soins intensifs
- ADORE LE PLASTIQUE
- TRANSMISSIBLE
d’où providrait C. auris?
distinction entre les souches enviro et cliniques
Inde, Bengale sur îles paradisiaques, gens qui nagent et hop
MAIS, souche environnementale ne semble pas tant pathogène alors que l’étude des souches cliniques révèlent qu’elles le sont
dans la première liste d’agents pathogènes fongiques publiée par l’OMS, caractéristiques communes aux différents pathogènes = ?
Taux de mortalité et résistance très élevés
