Organisation et expression des génomes cours 1 Flashcards
Définition dogme central de la Biologie Moléculaire
Transferts d’information généraux, spéciaux et inconnus
Concept du Monde Ancestral des ARN
- ARN possède la capacité de se répliquer par elle-même (catalyse des peptides et polymérisation des acides aminés)
- ARN catalyse la synthèse des protéines
- Encode les protéines et l’ADN (remplace l’ARN pour sa stabilité)
- Protéines catalyse l’activité cellulaire
Appariements de l’ARN
- ARN peut s’apparier en structure double brin (hybrides), soit avec ARN ou avec ADN
- Paires de bases Watson-Crick = G-C, A-U
- Paires de bases Atypiques/Wobble = G-U, I-U, I-A, I-C
Utilisation de Inosine dans les paires de bases Atypiques/Wobble
Variante de l’Adénosine
Appariements moins restrictif
Utiliser dans certains ARN comme ARNt
Structures secondaires formés par l’ARN
- Hélice
- Tige boucle
- Gonflement
- Boucle interne
- Boucle à branchements multiples
Organisation génomique des procaryotes
- Nucléoïde
Pas de noyau donc la traduction et la transcription se fait au même endroit dans la cellule (co-transcriptionnelle)
Organisation génomique des eucaryotes
Chromatine (histones pour la forme compacte)
Noyau = séparation physique entre la traduction et la transcription
Transcription et maturation du mRNA dans le noyau
Transport dans le cytoplasme pour la traduction en protéine
Gènes procaryotes
- Organisé sous forme d’opérons
- ARNm polycistronique = encode plusieurs protéines différentes (+ efficace)
- Protéines de voies métaboliques communes
Gènes eucaryotes
- Chaque gène exprimé indépendamment des gènes avoisinants.
- Gènes codant (exons) et non codant (introns, UTR)
Caractéristiques du génome humain
- 1.5% du génome code pour des protéines
- ~50% du génome dérive de transposons (éléments génétiques mobiles
~75% du génome exprimé au niveau ARN = Transcriptome
Rôle des régions non codante
Rôle de régulation majeur
- Stabilité
Méthodes de séquençage ADN
- Maxam- Gilbert (Fragmentation)
- Sanger (Utilisation de dNTPS)
- Électrophorèse capillaire (Utilisation de ddA, détection fluorescent)
Méthode de Maxam-Gilbert
- Fragmentation du brin matrice par enzyme de restriction
- Tubes:
1. Diméthyl sulfate (DMS) = G
2. Acide formique = A+G
3. Hydrazine= T+C
4. Hydrazine + NaCl = C - Séparation sur gel d’électrophorèse
Méthode Sanger
Utilisation de didéoxyribonucléotide “défectueux pour arrêter la réaction de l’ADN polymérase 1 selon la base
(ddATP, ddTTP, ddCTP, ddGTP)
- Séparation sur gel d’acrylamide
Méthode d’électrophorèse capillaire (automatisation de Sanger)
Réaction avec ddA, ddC, ddG, ddT (fluorescence)
- Electrophorèse
- Détecteur de la fluorescence puis chromatogramme
