ARN polymérase et synthèse des ARN cours 2 Flashcards
Grandes étapes de la synthèse des ARN
Initiation
Élongation
Terminaison
*plusieurs ARN polymérase se suivent= chaine de production
Initiation
- ARN polymérase se fixe à l’ADN
- Déroulement de l’hélice
- Synthèse de chaîne de 2 à 9 bases puis relâchées
Élongation
Synthèse de l’ARN avec appariements avec un brin ADN
Terminaison
ARN polymérase et ARN relâchés
ARN polymérase bactérienne
4 sous-unités
alpha, beta, beat’, sigma
Sous-unité alpha
2, liaison ADN et assemblage (promoter binding)
Sous-unité beta
1, liaison nucléotides
Sous-unité beta’
1, liaison ADN matrice
Sous-unité sigma
Reconnaissance ADN (initiation)
Type ARN polymérases Eucarytotes
I= ARNr
II= ARNm
III= petits ARN
Sous-unité ARN polymérase eucaryote
hRPB1= rôle régulateur, maturation de l’ADN
Liaison ARN polymérase bactérienne
Cherche un promoteur spécifique
Reconnait et un forme un complexe avec l’ADN
Dénaturation de l’hélice (déroule)
- Facteur sigma reconnait des séquences spécifiques à -35 et -10 (en amont)
Technique: Empreinte ADNase I
- Identifie le site de liaison d’une protéine sur l’ADN
- Protéine propre à la séquence protège la séquence du site de liaison
Empêche la séquence d’être clivé par l’ADNase - Création d’une zone de protection sur le gel (absence de fragment de certaines tailles
Technique: Empreinte au DMS
Permet de définir le site de liaison d’une protéine sur l’ADN et de révéler la capacité d’une protéine à induire un désappariement de bases sur l’ADN
Composantes de la bulle transcriptionnelle ARN poly II en élongation
- Attache
- Entonnoir
- Ion catalytique Mg2+
- Gouvernail
- Pont
- Mur
Attache
Portion de RPB2 qui piège l’ADN dans le sillon, donne processivité infinie.
Entonnoir
Ouverture permettant l’entrée des NTPs
Ion catalytique Mg2+
Fait partie du centre actif , lie le P qui joint les derniers NTPs ajoutés dans l’ARN
Gouvernail
Portion de l’attache qui aide à maintenir la bulle transcriptionnelle et à dissocier l’hybride ARN-ADN, afin de permettre reformation de l’hybride ADN-ADN.
Pont
Élément mobile impliqué dans la translocation, par des pas de 1 nt, de l’ADN matrice et de l’ARN en cours de synthèse.
Mur
Portion de RPB2 qui dirige l’ARN et l’ADN en dehors du centre actif avec un angle de 90°
Terminaison transcriptionnelle chez les bactéries
- Séquence palindromique forme structure tige- boucle qui agit comme ‘terminateur’
- Rho: Protéine hélicase qui agit sous forme d’hexamère.
- Reconnait site de liaison sur l’ARN et migre en direction 5’ vers 3’.
- Rejoint la polymérase au niveau du terminateur et déroule l’hybride ARN-ADN à la bulle transcriptionnelle.
Terminaison de la transcription chez les eucaryotes
Clivage et de Polyadénylation de l’ARN à l’Extrémité 3’