Orga Du Génome Oublis Flashcards
Précurseur 45S
13kb, donne du 18S, du 5,8S et du 28S, transcrits dans le nucléole, forment des blocs de 44kb avec un espaceur qui fait 30kb
( En tandem)
ARN 5S
Petit gène, 2000 copies sur chr 1
Nb de gènes codants des polypeptides
20 000
Taille moyenne d’un gène
27kb soit 1340 pb d’exons
=> 9 exons + 8 introns
Exon moyen
145pb
Intron moyen
3370 pb
% pseudogènes
1%
% CNG
1%
Taille CNG
<100 pb
% seq répétées
<50% du genome
Nb exemplaire de seq mobiles
3 000 000
( Transposition, utile pour la structuration du genome)
LINE ( %, taille et famille)
20% du genome
6 kpb
Seule famille active = L1 ( code la reverse transcriptase)
SINE ( %, taille, famille)
13% du genome
Element complet de 100 à 400pb
Seule famille active sui peut de déplacer= famille ALU, retrouvée dans les introns, qui utilisent la reverse transcriptase des L1 pour se deplacer
Retrotransposons à LTR ( 8%, famille)
8% du genome, retrovirus endogène, codent la reverse transcriptase, famille HERV, inactif chez l’homme
Transposons ( %)
3%
déplacement par copier coller, couper coller
Seq hautement répétées groupées %
= ADN satellite
6-7% du génome
ADN satellite centromerique (% et taille)
= ADN alpha
3-5 % de l’adn de chaque chro, motifs de 171pb pour former des blocs
ADN satellite telomerique (taille et blocs)
6pb TTAGGG pour former des blocs de 10-15 kb
ADN mini satellite hypervariable (taille et nb de répétitions)
9-24 pb répétés 1000 à 2000 fois
Blocs partout dans le genome, source de polymorphisme
ADN microsatellite( %, taille et répétition)
2,5 % du genome
Motif de 1-4pb répétés 5 à 50 fois partout dans le genome
Dinucleotide ADN microsatellite le plus frequent et % du génome
Dinucleotide (CA)n
=> 0,5%
% introns
30 %
Genome nucleaire % codant
- de 2%
ADN mit nb copie et taille
5 à 10 copies par mito,
Environ 16 000 pb