Oefenvragen Guyten H3 Flashcards
DNA staat voor?
Deoxyribonucleïnezuur
RNA staat voor?
Ribonucleïnezuur
Genexpressie omvat wat?
Het hele proces van transciptie, translatie tot eiwitten.
Hoeveel genen in een cel?
30.000
Hoeveel verschillende typen eiwitten kan door deze genen gemaakt worden?
Minimaal 100.000 wordt gedacht
Verklaar waarom verschillende typen eiwitten door genen in de cel gemaakt kunnen worden.
Door o.a. alternative splicing
Proteïnen zijn te verdelen in welke twee klassen?
Structurele eiwitten en enzymen
Uit welke drie delen onderdelen bestaat DNA?
Fosfaatgroep, deoxyribose en een base.
Wat is een nucleotide en welke zijn er?
Fosfaatgroep, deoxyribose en een base, de purines adenine, guanine en de pyrimidines cytosine en thymine
Welke twee types basen zitten tegenover elkaar in DNA?
A-T en C-G
Hoe zijn deze twee typen basen gebonden aan elkaar en omschrijf de eigenschap van deze bond.
Middels waterstofbruggen, 2 voor A-T en 3 voor C-G.
Hoeveel bonds tussen welke basen?
2 voor A-T
3 voor C-G
Hoeveel nucleotiden zitten er in een volle omwenteling van de helix?
ongeveer 10
Wat is een codon?
Complementaire triplets op het RNA
Teken fosforzuur, deoxyribose en de bases
Zie boek of samenvatting of doe het als je de mogelijkheid hebt.
Teken een deoxy-nucleotide met adenine
Zie boek, app of samenvatting en doe het als je de mogelijkheid hebt.
Hoe heet het proces van DNA > RNA
Transciptie
Hoe komt RNA in het cytoplasma?
Diffusie via nuclear pore
Noem twee verschillen tussen de structuur van RNA en DNA
- Ribose vs Deoxyribose
- De pyrimidine thymine is vervangen door de pyrimidine uracil
Wat is de eerste stap van translatie?
Activatie van RNA nucleotiden door RNA polymerase. Een nucleotide monophosphate moet worden opgewaardeerd naar een nucleotide triphosphate door ATP. Deze triphosphate staart bevat de energie om nucleotiden aan elkaar te linken. Als dit gebeurt, wordt de nucleotide omgezet in een monophosphate.
Noem eigenschappen (c.q. functies) van RNA polymerase (noem 4 en sub4):
- Activeert RNA nucleotiden
- Bindt aan promotor op DNA
- Ontwindt ongeveer twee omwentelingen DNA en splitst de strengen
- Beweegt over de strand en voegt geactiveerde nucleotiden toe door:
1. H-Bond te maken tussen nucleotiden.
2. RNA polymerase breekt twee fosfaatgroepen. De energie die vrijkomt wordt gebruikt om de nucleotide te ligeren aan de vorige. De fosfaatgroep van de nieuwe nucleotide wordt hierbij gekoppeld aan de ribose van de oude nucleotide (5’ > 3’).
3. Gaat door tot chain terminating sequence op DNA. RNA polymerase laat los.
4. DNA heeft affiniteit om met zichzelf te binen, RNA chain laat dus z’n H-bruggen los en kan nu naar cytoplasma via poriën..
Wat betekent het als een nucleotide geactiveerd wordt en waarvoor is dit nodig?
Als een nucleotide met een monofosfaat omgezet wordt naar een trisfosfaat middels ATP. De extra energie in de bindingen van de geactiveerde nucleotide wordt gebruikt om het te koppelen aan een reeks van andere nucleotiden, bijvoorbeeld bij translatie. Hierbij worden de twee extra fosfaatgroepen losgekoppeld en wordt de vrijgekomen energie gebruikt om de resterende fosfaatgroep van de nucleotide covalent te binden aan de (deoxy)ribose van de te synthetiseren streng.
Noem 6 typen RNA en geef een korte omschrijving
- Pre-mRNA: introns eruit geknipt in proces dat splicing heet.
- Small nuclear RNA (snRNA): controleert de splicing van pre-mRNA naar mRNA.
- mRNA
- tRNA
- rRNA
- miRNA
Hoeveel codons zijn er en hoeveel aminozuren?
4^3=64 codons voor totaal 20 aminozuren (in theorie zouden er 61 (64-3) stopcodons verschillende tRNA’s moeten zijn, maar omdat de laatste positie (wobble base) niet altijd noodzakelijk is, zijn er maar zo’n 30-40 verschillende als je kijkt naar sense-antisense binding. Dit staat niet in Guyton.)
Wat is het startcodon op RNA en waar codeert dit voor?
AUG - methionine (chain initiating codon)
Wat is het stopcodon op RNA en waar codeert dit voor?
UAA, UAG, UGA, codeert niet voor een aminozuur (chain terminating codon)
Hoeveel nucleotiden is tRNA lang?
Ongeveer 80
Wat is de vorm van tRNA?
Klaverblad
Het aminozuur bindt aan welke kant en aan welke nucleotide op het tRNA?
Aan de ribose (dus 3’ end) waar zich de hydrocylgroep bevindt. De laatste positie hier is altijd adenine.
Hoe heet het gedeelte van het tRNA dat het codon op het mRNA herkent?
Anticodon
Waar bevindt dit gedeelte zich op het tRNA
Ongeveer in het midden, onderaan het klaverblad.
Hoe binden de tRNA en mRNA?
Middels waterstofbruggen
De ribosoom bestaat voor hoeveel procent uit rRNA?
60%
Waar bestaat de rest van het ribosoom uit?
Ongeveer 75 verschillende types eiwitten, zowel structurele als enzymen.