Nucléotides et acides nucléiques Flashcards
Une chaîne d’acides nucléiques commence et fini par quel bout?
Commence par le bout 5’ et fini par le bout 3’.
Dessiner la structure du ribose et du désoxyribose ainsi que la position de leurs carbones.
Réponse dans mon cahier.
C’est quoi la différence entre un nucléotide et un nucléoside?
Un nucléotide est composé d’une base azotée, d’un sucre à 5 carbones et un à trois groupes phosphates.
Un nucléoside est composé d’une base azotée, d’un sucre à 5 carbones et pas de phosphate.
Dessine une adénine, une guanine, une thymine, une cytosine et un uracile avec ou sans une ribose ou un désoxyribose.
Réponse dans mon cahier.
C’est quoi la différence entre un purine et une pyridimine, ainsi que la différence entre les différentes purines et pyridimines?
Une purine a deux cycle et une pyridimine a un cycle.
Purines: La guanine a un double lien O en haut, tandis que l’adénine a un NH2 en haut.
Pyridimines: La cytosine a un NH2 en haut, la thymine a un O en haut et un CH3 sur le côté droit et l’uracile c’est la même chose que la thymine sans le CH3 à droite.
Dessiner les positions sur une base azotée purine ou pyridimine.
Réponse dans mon cahier.
Dessine un nucléotide triphosphate et identifier les phosphates alpha, beta et gamma.
Réponse dans mon cahier.
Expliquer la structure chimique d’un brin d’ADN.
C’est l’assemblage de plusieurs nucléotides en double hélice.
Vrai ou faux: La polymérisation d’un brin d’ADN dans la nature se fait dans la direction 3’ à 5’?
Faux, elle se fait dans la direction 5’ à 3’.
Qu’est-ce que veut dire la direction 5’ à 3’ en termes moléculaires?
La phosphate alpha (PO4) qui est sur le carbone 5’ du sucre du nucléotide se colle au OH en 3’ du nucléotide précédent.
Vrai ou faux: l’hélice est de pas droit?
Vrai.
Les deux hélices d’ADN sont parallèles ou antiparallèles?
Les deux hélices sont antiparallèles.
Combien de ponts H entre le A et T et entre le C et G.
Entre le A et T, c’est deux ponts H avec une liaison moins forte. Entre le C et G, c’est trois ponts H avec une forte liaison.
C’est quoi la formule qui permet de mesurer l’ADN?
Nb. de paire de base (pb) x Masse de l’ADN (660g/mol.pb) = mesure de l’ADN.
L’ADN absorbe les rayons UV et cette absorbance permet quoi?
D’évaluer la concentration dans une solution.
L’ADN est dénaturer par quoi?
Par la chaleur.
C’est quoi le terme qui permet de renaturer l’ADN et dans quelle condition se fait cette renaturation?
L’hybridation permet de reformer les hélices quand il est refroidi.
Dessiner l’ADN avec le sillon majeur et le sillon mineur.
Réponse dans mon cahier
Une absorbance de 1DO correspond à quelle concentration d’ADN double-brin?
50ng/ul.
C’est quoi le Tm?
La température à laquelle 50% des molécules d’ADN présentes sont dénaturées.
C’est quoi la formule pour trouver le Tm?
Tm = (nG/C x 4) + (nA/T x 2)
La réponse est en degré celsius.
Qu’est-ce qui est essentiel pour la synthèse du dTMP à partir de l’UMP?
L’acide folique.
Expliquer quel produit est transformer en quel produit dans l’étape de dUMP au dTMP et transformer par quoi?
Le 5, 10-Methylenetetrahydrofolate est transformé en 7, 8-Dihydrofolate par le thymidylate synthase. Le dUMP est transformé en dTMP par le thymidylate synthase.
Que veulent dire les lettres A, C, G, T, U, R, Y, M, W, S, K, B, D, H, V, N pour lire une séquence en nucléotides?
A = adénine
C = cytosine
G = guanine
T = thymine
U = uracile
R = A ou G
Y = C ou T
M = A ou C
W = A ou T
S = C ou G
K = G ou T
B = CGT
D = AGT
H = ACT
V= CGA
N = CTGA
Sur quoi s’appuie la réplication d’une molécule d’ADN et elle procède dans quelle direction?
S’appuie sur le bout 3’ d’une amorce et procède en direction 5’ à 3’.
Nommer et différencier les trois types d’ARN.
ARN messager (ARNm): message codé pour la structure primaire des protéines
ARN de transfert (ARNt): transporteur d’acides aminés vers le ribosome, où les polypeptides sont synthétisés
ARN ribosomique (ARNr): infrastructure du ribosome, en coopération avec plus de 80 protéines
C’est quoi un anticodon?
Une groupe de trois nucléotides dans la structure des ARNt. Joue un rôle important dans la traduction de l’ARNm.
Où s’accroche l’anticodon et l’acide aminé sur l’ARNt?
L’anticodon s’accroche sur le bas de l’ARNt et l’acide aminé s’accroche sur le bout 3’ en haut de l’ARNt en direction 5’ - 3’.
Dessine l’appariement de l’anticodon au codon.
Réponse dans mon cahier.
Expliquer le principe général de la synthèse chimique de l’ADN.
Se fait du sens 3’ à 5’ contrairement à la synthèse de l’ADN. Il faut commencer par décrocher l’oligonucléotide. Ensuite, il faut enlever le dimethyltrityl du bout 5’ du dernier nucléotide. Il faut enlever les cyanoéthyles des groupements phosphores et, finalement, enlever les groupements protecteurs des A, C et G.
C’est quoi une endonucléase?
C’est une enzyme qui coupe l’ADN en reconnaissant une séquence précise. Laisse un bout 3’ OH et un bout 5’ PO4.
C’est quoi une ligase?
Une enzyme qui recollent l’ADN coupé grâce à une extrémité 5’ PO4 et 3’ OH. Assemble des bouts complémentaires.
C’est quoi un site de restriction?
C’est une séquence particulière de nucléotides qui est reconnu par une enzyme de restriction comme un site de coupure dans la molécule d’ADN.
Une paire de base a une masse de…
660g/mol.
Vrai ou faux: l’ADN a 10 paire de bases par tour.
Vrai.
Comment s’effectue la traduction des protéines?
L’ARNm quitte le noyau pour aller dans le cytoplasme. L’ARNm se fixe au ribosome et le ribosome commence à lire l’ARNm par groupe de trois bases azotés. Au fur et à mesure que l’ARNm se fait lire, ça crée des chaînes d’acides aminés grâce à l’ARNt qui les transporte ensemble. Lorsque la synthèse est terminé, la chaîne d’acide aminé est libérée dans le cytoplasme et s’enroule pour devenir une protéine.
C’est quoi la fonction des sites A, P et E du ribosome?
Le site A: Se lie à l’ARNt qui transporte le nouvel acide aminé à ajouter à la chaîne polypeptidique.
Le site P: Contient l’ARNt avec la chaîne polypeptidique en croissance.
Le site E: C’est le site de seuil, contient l’ARNt sans acides aminés qui est libéré par le ribosome.
Expliquer comment la puromycine agit comme antibiotiques et même comme poison.
Elle inhibe la traduction de l’ARNm car sa forme ressemble à l’ARNt, ainsi la chaîne popypetide sera transmit à la puromycine ce qui mettra fin à son élongation. Cela attaque à toute la traduction du corps, ce n’est pas cibler, ainsi cela détruit les cellules car elles ne peuvent plus synthétiser de protéine.
Indiquez le mécanisme par lequel 5-fluorouracile peut agir comme drogue anti-cancéreuse. Quel effet secondaire s’attend-on à rencontrer avec ce produit?
Le 5-fluorouracile est un inhibiteur de l’enzyme thymidine synthetase, qui permet la conversion dUMP en dTMP, lequel sera converti en dTTP. Si l’enzyme ne peut plus permettre la formation de dTMP, il y aura une carence en dTTP et la synthèse de l’ADN ne sera plus possible. Cela empêche les cellules de se diviser. Les cellules cancéreuses ainsi que les cellules normales seront affectées. Peut s’attendre à des diarrhée ou de l’anémie.
Considérant le mécanisme de synthèse des pyrimidines, quel argument permet d’appuyer la théorie selon laquelle l’ARN serait apparu avant l’ADN.
L’UMP est à la base de la synthèse de toutes les pyrimidines, incluant le dTTP.
Dessiner un brin d’ADN.
Réponse dans mon cahier.
